ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
ChrB02_LTR-Caulimovirus_81 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2462688174526881990-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_82 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7582688398126884738-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_83 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2892688474326885031-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_84 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3102690855126908860-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_85 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4012708795027088350+
ChrB02_LTR-Caulimovirus_86 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3012723590827236208-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_87 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus32894639499346398281-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_88 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus25694639834746400915-
ChrB02_LTR-Caulimovirus_89 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus6204640258346403202-
ChrB03_LTR-Caulimovirus_90 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus8391176116211762000+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_91 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1851624615016246334-
ChrB03_LTR-Caulimovirus_92 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus6492984923029849878+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_93 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus15962985023029851825+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_94 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus6252985217229852796+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_95 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus32433456603434569276+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_96 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus32973456928734572583+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_97 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus8373457474334575579+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_98 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus24723457582234578293+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_99 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9093457830434579212+
ChrB03_LTR-Caulimovirus_100 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus21493457921534581363+

< 5 6 7 8 9 > Total 43


Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_81

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

246

Start:

26881745  

End:

26881990

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_81

AGGGTTTTTGAAGTATTCATATGGGTTTACTAGGGAAGGGTAGTTTTAGGTAATTGGTCGTCCGAACATATTCGATTTCATATAGGAATTTATATTAGAGGATGATGAACGGCTTTTATTTCTGGGTAAGGTTGAAATAGCAAAAGGAGAATCAATCAAGTAGGATTTGAGGTAGTCATCATGAGGAAATTGTTTTCAGATTTCTTAAATCAATCAGTGATAAACCATGATTCTGTCACAAGCCTT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_82

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

758

Start:

26883981  

End:

26884738

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_82

GAAGTCTTCTTCATCGACTTGGATGGTGAATTGTGTGAATAATTGTTTTCTCAAGGACGACGATCTTGGCTTTTCAAATTTGATCTCCTTCGCTCCATCCTTCGAGTGAAAGCTGACTTCGAGGATTGTATAGGCGATAGGGTAGCTTGATGGAGCTTCTCATAACTTGTCACCCATGATTCTGGCAATCGTTTGAGTAGTTCTTCGCGAGAGATCTGCCGAGGGATTTGTATTGAGCTAGGCGCTTGAGATGCGATGAGACTTCGAGGTATAGTGCTTCATCGATGAGGGTAAAACAAGATCAAGAGCGTGATCTTGAATTCTGTAAACGATTTGGTGATGTAGCGGGCTACTACACTCTTTTCTTGCATAGGTGTCTCGATTAGTTGAAGCTGAACCTTGAGCGTCTTCAATAGATTTGGATCTTGCAATGAGACATTAAAGTTTGGAAACAATGTAACGAATACTGTCCCTGCATTTAATGTTGTTTGAACTGTTCCGATGCAAGCCTGCTGGTATGACTTTAATCTGGAGTCTATCAACGCAATTCGGGCTATGACAGGTAGACCTTTTCTAGCATGTAAGGTCAAGCCAATTCTTACTACACCAAAATGAAGGTGAGTATAGCCTTGCTGCTGCCACAACTGGTAGGTTCTCCGGATGTTCAAAGAAATGAACTGCTCTTCTTCGGTGGCTGGAACTTGACAGACGAGAATCTGCTGGATTGGACATACTCCATCACCTTCGCTGGAAGATGG

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_83

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

289

Start:

26884743  

End:

26885031

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_83

ATGAGCTCGCGAACTCCTTTGACGGAGAAGGCGCTGGGTTTTTTTGCGAAGTATTCATATGGGTTTACTAGGGGAAGGGTAGTTTTAGGTAATTGGTCGTCCGGAACATATTCGATTTCATATAGGGAATTTATATTAGAGGATGATGAACGGCTTTTATTTCTGGGTAAGGTTGAAATAGCAAAAGGAGAATCAATCGAAGTAGGATTTGAGGTAGTCATCATGAGGAAATTGTTTTCCAGATTTCTTAAATCAATCAGTGATAAACCATGATTCTGTCACAAGCCTT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_84

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

310

Start:

26908551  

End:

26908860

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_84

GGTGTCCCGATGAATTCTCTGTGGATTTCTCCTAGAAGCAATGGAATTGTTGTTTGATAAACATGTTGCTGTATGTATTCTCCGAGGGAGTTCCACCATTCTTTAAGTGTGCCGGATAGTCTCGCCGTGAATTGTTGAATTACTAGATGCAGGGAGACGTAATGGCTTCTGAATTCATCCATGAATGGAATTCATCCAATCGATCATTCCATTTGTCGAAGGGAATGTCGTCGAACGTAAATACCACGACTTTTGAAGAAAAATGTTTATTAGGAATTTCTTCTCTTGGAGCTGCATAATTCATTTCTTC

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_85

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

401

Start:

27087950  

End:

27088350

Strand:

+

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_85

GAAGAGTCCCTACCTAAACAGTTCGCAATTGGTGAAGGATCAAGTATTCCTAAGAAAGAGCCAAGTATTAACGAACTTTACTCAAGGGATGAAGAAATGAATTATGGAGCTCCAAGAGAAGAAATTCCTAATAAAAGTTTTTCTTCAAAAGTCATGGTATTTACGTTCGACGACATTCCTTTCGACAAATGGAATATTCCATTGGATGAATTCCATGCATGGATGAATTCGGAAGCCATTACGTCTCCCCTGCATCTAGTAATTCAACAATTCACGGCGAGACTATCCGTCGCACTTAAAGAATGGTGGAACTCCCTCGGAGAATATAGACAGCAACAAGTTTATCAAACAACAATTCCATTGCTTCTAGGAGAAATCCACAGAGAATTCATCGGGACACC

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_86

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

301

Start:

27235908  

End:

27236208

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_86

ATATTATTATATCATCTATATATACTGAACTAAATTCTTCGTATCTGGTTAAATTATTATCCATAAATTGCTGAAATATTCCTGGGGCTTGTTTTAAGCCAAATGGTAATACATTCCACTCAAAGTGTTTTTGAGGTGGGCATGTAAAAGCCGTTAATGGTTTAGTATTCTCATGAAGTCGGATTTGCCAATATCCCGACTTTGCATCAAGCGCTGAGAAATACTTAGCTCCTCTTTAATTTTTTAATTAAGTATTCCTTCCTAGGCAGGTTTTGGGCATTACCTATTGTTGCTTCATTTA

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_87

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3289

Start:

46394993  

End:

46398281

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_87

AAAGGGGTATGGATTTTGATATGGTTTGGATATCGGTTTCGGTTTGTTTGGATATCTGAAAGTATTTTGGATATTGGTTGAGAACAACGGTCGAGATTGTATTTTTCCCACCATTTGATTCTGTATTCTCTGATTAGGGAGTATGGCATGTCAGGTAGAGCGAGTTCTAGGCTAAAAAGCCACGAACAGATCCACGGTATTCCCATGTCAATGTGGAAAGCGATCTTGGTAATTGGTCCCACTGGTTGGTCAGGTACTTGTTTCTTGTAGTAAGGGAAAGAAGTCTTGATGATCTCTGGTGGATAAATTTGATCTGATGGTCCAAGCCAGTACCACCATTCGTTGAACCATCCTGGGATGTTTTTGTTGCATTTTTGGTCGAAGGAGAGAAACCAAGAGTGGTCATAGGATTTGACGTAGAAGGTTCTGAAGAAGGCATTTTGATAGTCCACATATGAATATCCTTTAATGTGGTAGCCCGGTGTTGAGAATGGTTTGATAGTGTGGTGGTGGATAAACCCGAGGTCTTGAATAGAAGCGGACTTCATAAGATTTTACATGTTGAGTAGGAGGGTTTATTCTGTCTGGGTAGTGGGTAATTTCTACTGATCCAGAGTCTACTAGAATATACTCATAGAAAGTTCTGTTTTTGGTTAGGTTGTCGGTTGGATAAAGGCTATCATCGTAGAAGACTCTGTTGGTAAAGGTTTGTAACTGTCTGAGGTTTATTGGTTTTGTAAAGTGGGTGGTCATTAGGTGTTGTTTTTGTGGCTTAGTATAGTAGGCTGATTTTTGGGTAGGATTTGGAGTAGGGTTCGAGTTTTCGCCTTTGGTTTCAGTAGTTACTGCTTTTGAGTAGGATAAAGGGGGAAATTCGGCGAGAACCGTAAAAGGGTTTTGAGTAGTTTGTGATTTTCCTTGTAGGTGAGGTTGGTTTTTGATATAGTCTGAAGCTGTCATAGGTTTTGCTTCTTGGATCACTCATCTTGAATATGTTGTTGAATATCTGTTTTTCCTGTAAATATTCTCGTTAGAAAGTCCGGTAAAGAGTTATTCTCTCCTTTAATATATTGAATATCAAAATCAAATCTGATAAAATTGCTTGCCATCTAGCAAAAATTTGCTTTGAAACTAAATTTTTAACGTCTTTTGTAAAATTTCTTTTGCTGACTTCTGATCAACTCGTAATAAAACCTTTTATTAATCAAATCATCTTGAAATTTAGATATACAATTAACGATAGAAAGAACTTCTTTTTTGATGGTGGAATAATTTTTTTGCGGTCCTAACCAGACACATGAGTGGAATCTAACTATAGACTCTTGACTTGACCCGAGAGTTTTGTTTTAGGATTCCTCCGTAACCTATTTCGAAGCATCTGTTTCTACTATCATATCAGCTTCAGGTTTGGTAAAGATAAACAAGGAAGGGTTTTGATCTTTTGCTTAATTTGTCTAACTAGAAGGGTATGTTGACTAGACCATGGTTTGGGATTTTTTTGGAGTCTCTGAAATAATGGTTGTATCGTCTTTCTGAGGTTTGGTATGAAATGGAAACATAGTTAAGACATCCTAAAATCTTCAGTAGTTGAGTTTTTCTCTTAATTCGTCAGGGAATTTTCCTGCGAATTCGATTGATCTTGAGATAGGTGTAATAGTTCCTTGATATATATTATGTCCTAGGAATCTTATTTTTGTTTGAAATAAAGACATTTTCTTTGCTGATATCACTAAGCCATGTTGTTTTACTATATTTAAAAATGTATATATATGACTGATATGTTGATCTATCGATGTTGAATATACAAGTACGTCATCAATATAGACAATGGTGAATTTTGAGTAATTATTGAATATATCATTCATGATGTGTTGAAATTCAGAAGGTGCATTTTTAAGTCCAAATGGCATTACGTTCCATTCGTAGTGTCCAAATGGTACCGTGAACGCTGTTTTATACTTATCTTGTTCATGAATTTGAATTTGCCAAAACCCGCTTTTCATATCGAATTTTGAATAGATCTTTGCGTTATAAAGTCGTTTTAATAAATCTCGTTTATTAGGTATTGGGTATCTAATCCACTGTAATACGTCATTTAGGGGTTTATAGTTGATTACTAATCTTGGTACACCACGTTCTTTTTCGGCTTGATTATTAACATAAAATGCTGAACAGCTCCAAGGGGATTTGGATGGTCTAATTAATTTTTTATCTAGTAAATCTTTTATTTCTTTTTTACAATGTTCTAATGATTCTTTGTTCATTTGTATAGGTCGCGCTTTAGTTGGTATCTTTTTCTCGTTAAATTCTTTTATATATGGGAGTTCAACCATGTGTTGTTTTCTTTCCCAAAATGCATTTGGTAAATCCGAGCATACTTGAGTTAAAAGATCATTTTCTATAGATTTTATTTTACTTATTATATATGGTGTCTTAAGTTTTTCTTCTATTTTTTTATGTGTTATTTCATCTTGTAAATATTGGATATGATTTTGTTTTCCTTTTATTAAGTTAATTGTTTTTTGAATTGTATTTTGTTGGAGAAGTAAAACTTCTTTTGTTTTCATTGGTGATAAAAATTCAAATAATAATTTTGTTCCTACAACTTTAGTGGTTATACCTTTTTCTGTTACTTTGAACGGATATATTTGGGTAAAAAATGGAGTTCCTAATATTACTTCTTGCGTTAGGTTTTTAACTAGGATAAATTGATTTTGAAACAATATCCTTGATTACATATTTTTGCAAGGTAATTTGTACTGTACTTTCAAATTACTACCATTAGCCACTTAATCTTTCTGTTGTTTTTCATAGTATTTTGTTGGTATTACTCCTTCACGGATGCAATTATAATCTGCTCCAGTATCCATTAGTGCAATAATATTTATTTTAAAATCATGTCCAATGTGTAAAGTAATATTTGTATACCATTTTTGATAATTAATTTTATTAATTATCTGAATATAATCTTCATTTTTTTGGACTTCTGTTTCATCATTATTTTCTATATTTTGATTACTTGTTGATGCTTGACAATTGTTCTTCACTTCGACTAATGATAATCTTGCATTTATTTGTAATTGTTTTAATTCTTGTTGATTAACTGTTATTTGTAATTCTTTAACTTGTTTTTTTAATTGTTTAACTTCATTTTGTAATTCTCCTGTAGTTACTTGTTTAAACAAACTTTGAGTTGGATATTTTTCAAATATTTTGTTTAGGCTGAAAGGTTGTGGTGTAGATAATTGGTTTTCTTGATATATTATATCTTTTAATTTTATTAGATATT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_88

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2569

Start:

46398347  

End:

46400915

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_88

TTAGTTATTACATTAATTACTTTACAATTGCATAGGTTTTCAGATAACTCTTGTAATTCTTGGAAGAGTCACTTGAATTTTCTATTTCGCTTATTGAATAATCACTATCTGTTTCTTGGATAATTCGATTCTGATATTAACAATTTAGTTAATTTTTCTTGGATTTCTGGTTCATCTTGAAATATTTCATTTATTTTCTTCTTCATTTTACATTCTGTAGATTTATGTCCAGGTCTTTTACAATTCCAACATACTATCTTTTGTGTATTTGGTCTATATTTTCTGTTATTCTTTGAATAATATTGATTGGTTGGTTTTTTGTTAAAATTTTTATACTTTTGATAATTTTTAATATTATTAGATTTCCCCTGTCGGTATTTTAATCTTTTAACTCTTGATGGTGGATTAAGTCTTTGATAACCATATTGTTCCTGAGAATGAACCCATAGTTAATCTAAATTTAAAATTATCGTTGCAGCGTTTTTTATCTTTTTGTTCTTGGCATATTGCTAACCCTTCTTTTTTAATGAATGCAAACAATTGACCATATGTAATTGTGTTCCAGGGGATAGGTTGTCCTCCGGAATAATCTTTTAGTTTATTGATTACCCTTTCGCAAAGTGGCAATCTGAGATAAACCGTTCTTTCGAAAGGTTGGTTACAATCGTTTCTTTGGAATATGTTAGTTACAAAATATCTTTATACCATTTAAAATCTCCTAATGTTGGACATCTTAAATTAGTTAGTATGATTTTTTTACTTTCTAATTCTTCTGCTGGATTACCAATAAAATGCATTGTCAAAGTATGGATTAGTACTTCTACCGCATTTTGATGTTCTATTTCTTCAGAGAAACCATCTTCGCCTTCTTGTCTTTTTATTTCTCGTGGTTAATTATTGAATTTTGAGTAACTACGTCTAGTGAATTATCCCACCAATATTTTAATGCTCCATTAAACCCAGTTATTAACATAATACATGCTTGTTTATCAGAATTACCTCTAGCTTTAAATGCTATAGCGGCTATTCCCATTTCTTGAAATAAATTCATTATTTCATATTCTGAACGATCCATCAATATTCCACTCATATATACCTTCTCCAGTGTATACCTTATTAGAATATTTATGATGTTCTTCGAATAATAGATCGGTGGAGTATGTCGTGGGTAATAAGGTTTTTAGATCGCATTATTTTATTTTTTATTCGAATAATCTCTTGAATATCATTTTCTGACTGAGATTGTCTGGATAGATTCATTATCAATTTAGATCTATAATATTAATTCCTTTATTTTTATCTAGTTTATCTAGTCTAGTTGCAATTGATTTTAAAATTTCATTCTCAGGAAATTTGACTTGTCTTGTTATAGGTTTAAAGATTGGAGTGGATATAGAGGAAAATGGGTGTTGAGTATTTTGATTAAACTGATCCAATTGATTGCTTTCATGGGTATTTAATTTATTGTCTATGTTGTCTACTTGTTTAGAAATTGTATATAATAATTGACTTTGGTAATTATTTTGTTGATATATTGATTTAATATCTTGTAAAATTATTGGGTCTTTGTCATCTTTATTGGCTCCTGTTTTAAAAGGTGTGGCTATTATTTGTCGATTTGAAGTATTTATTTTTAGATCTTTTAGTGGTGGATGGATTGATTTAATCTTATTTCCATCTACTTGTTCCCATGCTTGACTTAAAGATGAACTTGTATTAATTGTTTTAAATGGATACTCAATAGTACTTGCAATTGAATATGTTTCAACCATATAAAAAATGGAATATTTATTTCCTTTAGTATCATGCAATTATACCATTTTTCTCTAAATTCAATAGTTTGTTGTTTAGTAAATGTTCTAAAATACCAATTACGTTTTTCTTCATTTTCTTTTGAGTAGAAGTCTTCTTTGATATATTGCTTATTAATTTCATAATCTTTTGTTATGACATTTACAGATTTAAAATCCGATGGTGTTGGAGACGTTGGATACATATCTTGTTCTGGTTCAGCTATAGGTGCTTTAAATTTAATTGAGTTATCTTGTTTAATATTTTGGTTTACACTTTCGTTTGAATCTGCACTAGAGTTACGGTCGCGATATTCAGAAAATGAAGCTCTTGAATGATATGAAGTAATTCTTGGTGGAAGTGGTTCTCTAAATGACCCAAATTGTAATATTATTTTTCCATTTCTTTGTTCAATTATCTTTGAAATATTTTTTTGCTCGAAATTTCTAGGTGGTTGAGTTATATCAATTTTCCATTGATCCGGAGTAGTTATTTCATCCCATTTTAATTGTTTAGGAGTGTATGTAGCAGTTGGAGTATCTTTACTATGAACAACTAAAATTGTTGTTTCTCCTTTGTCATCTTGTAGTAAACATCTTGGGTTAAATTCAGAAGTTGATTGCTTAAAATAAATCCTATAGAGTAATAAATATCCATGTCTTTCATTTTGGAATTTAATTTCTGGTAAATGAACTTTTAATGTTAAAGTATTGAGTATAGTTGGGTCATGTAGACTTACTTGAAAATTAGGAGCACAGTTAAAATAGACTGCTCCATT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB02_LTR-Caulimovirus_89

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

620

Start:

46402583  

End:

46403202

Strand:

-

>ChrB02_LTR-Caulimovirus_89

GCTCCATTACATAAATTGGATTGTACTGCTCCTAGAAGAGAATCTTCAAATTTTAATAGAGTTTTATCTCTTAATAGCATAAGTATTGGAGAATCTATTCCAGTTCTTGATAAAGGTTTTATAGCAATTTGTATTAAACCAAAATGGATGTAATTAAATCCTTTTTTTCTATATTTATCTAAAGCGAGAGAAGATAATAGTTTAATTTCTTCAAATTCATTTTGAAGAGATAAAGTTTGCTCATGTTCTTTTATTGAATAAGCTGTTTTGAAATCAAAAGTTCCAATTTGATATATATGTTCTGGATTAATATGAGGTAGATGGTCTTTTGTTATTTCTTGATTAAAGGAATTTATTTTCGAAACAATTTCTCTTGAATTAATTGTTGCATATGATGTAGAAGTTGATGCATGTTTTGGTTTAAAGAGTTTCCTAAACGAAGACGCCATGACTTATACCAATTTTAAACTCATACTAGAATGATACTAACCGATTCTACGATGACACAATCAAGGCTTGCCAACGGTCTTACTGCCCTCTCTAAGGTCTTGCTGCACGGAACACCTACAGATACAATGTTTCGGGTAGACGGTAAGGATCTATCTAGAAGTGTTTAAAAT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_90

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

839

Start:

11761162  

End:

11762000

Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_90

GAAGGCCATGCTGTTTGGTCAAAAGATAACACATTCATTATTCCAGAAGGCCATGATCAAGATATTCGAACCAATCCTCTTAAATGCCTTAGTGTACATTGACGATATTCTCCTGTTCTCTCCCGACATTGACTCTCATACTCGCATATTGAAGAAATTTCATGATATCATACAACAACATGGTATCATGCTCTCAGAAAAAGGAGATGGTTACTGTAGAAACAGAAATTGATTTCCTTGGCAGAGGGACAATACCATCTCCAGCCCCACATTAGATCACTCAATGAATTTCCAGATGAAAAACTGACTTTCAAGCAAGTACAACCATTCTCTGGAATTGTTAATTACATAGCTGACTTCATCTATGACCTTGCAAAACCCAGATCAATCATTAACACAACTCAAAAAAGATGTTCCTCCATGGAATCAGAAATGTAAGAAGCAGTAAAAGAACTCAAGCGGATATCAAAGATACTTCCATCACTAAAAATTCCGTCTACCAGTAAAAGAATACTTCAGACAGATGCAAGTGATTGCTATTGGGGTGATACTTTACTGGAAGAAGATGCAAAAGGAAAATGACACGTATGTGGTTACAAGAGTGGAGTTTTCAAAGAAGGTGAAAAACACTATCACTCATGTACAAAGAAATTATTGCAGTAAAAAGGCATTGAGATGTTCGAATATCATCTGGTGGGCCAGCACTTCCTCATTGAAATGGACATGTCATATTTTTCAAAGATGATACAATTCAAACAGAAGGTCTTGCCTCAAGTGCAATTACTCAGATTTGCTAGCTGGTTTTCCCAATTAAAATTTGACGTCAAGCATTTCAAAGG

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_91

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

185

Start:

16246150  

End:

16246334

Strand:

-

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_91

GCAATCAAAAGAATTGGTCCTGTACATAAACTAGATTCAACTGATCTTAACAAAGAATCTTCAAATACTTTAAATTGTATGTCTCTTTAAATAGCTAATATTGAAGTATTTAACCCTTCTTTTGATAGTGGTTTTATACCGACTTGGACCAAACCAATATGAATATATTTAAAATTCTTCTTTCT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_92

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

649

Start:

29849230  

End:

29849878

Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_92

AAATTTCCTGACCTAATTAAGAGAAAAACTCAACTACAAAGATTTTTAGGATGTCTTAACTATGTTTCGATTTCCTACCAAACCTCGGAAAGACGATACAACCATTATTTCGAGACTCCAAAAATCCCAAACCATGGTCTAGTCAACATACCCTTCTAGTTAGACAAATTAAGCAAAAGATCAAAACCCTTCCTTGTTTATCTTTACCAAACCCTGTAGCTGATATGATAGTAGAAACAGATGCTTCGAAATAGGTTACGGAGGAATCCTAAAACAAAACTCTCGTGGTCAAGTCAAGAGTCTATAGTTAGATTCCACTCGGTGTCTGGTTAGGACCACAAAAAATTATTCCACCATCAAAAAGAAGTTCTTTCTATCGTTAATTGTATATCTAAATTTCAAGATGATTTGATTAATAAAAGGTTTTATTACGAAGTTGATCAGAAGTCAGAAAAGAAATTTTACAAAAGACGTTAAAAATTTAGTTTCAAAGCAAATTTTTGCTAGATGGCAAGCAATTTTATCAGTATTTGATTTTGATATTCAATATATTAAAGGAGAGAATAACTCTTTACCAGACTTTCTAACGAGAATATTTACGTGGAAAACAGATATTCAACAACATATTCAAGATGAGTGATCCAAGAAG

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_93

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1596

Start:

29850230  

End:

29851825

Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_93

AAATTTCCTGACCTAATTAAGAGAAAAACTCAACTACAAAGATTTTTAGGATGTCTTAACTATGTTTCGATTTCCTACCAAACCTCGGAAAGACGATACAACCATTATTTCAGAGACTCCAAAAATCCCAAACCATGGTCTAGTCAACATACCCTTCTAGTTAGACAAATTAAGCAAAAGATCAAAACCCTTCCTTGTTTATCTTTACCAAACCCTGTAGCTGATATGATAGTAGAAACAGATGCTTCGAAATAGGTTACGGAGGAATCCTAAAACAAAACTCTCGTGGTCAAGTCAAGAGTCTATAGTTAGATTCCACTCGGTGTCTGGTTAGGACCACAAAAAATTATTCCACCATCAAAAAGAAGTTCTTTCTATCGTTAATTGTATATCTAAATTTCAAGATGATTTGATTAATAAAAGGTTTTATTACGAAGTTGATCAGAAGTCAGAAAAGAAATTTTACAAAAGACGTTAAAAATTTAGTTTCAAAGCAAATTTTTGCTAGATGGCAAGCAATTTTATCAGTATTTGATTTTGATATTCAATATATTAAAGGAGAGAATAACTCTTTACCGACTTTCTAACGAGAATATTTACGTGGAAAACAGATATTCAACAACATATTCAAGATGAGTGATCCAAGAAGCAAAACCTATGACAGCTTCGGACTATATCAAAACCAACCTCACCTACAAGGAAAATCACAAACTACTAAAACCCTTTTACGGTTCTCGCCGAATTTCCCCTTTATCCTACTCAAAAGCAAGAATTCATGAAACCAAAGGCTAAAACTCGAACCCTACTCCAAATCCTACCCAAAAATCAGCCTACTATACTAAGCCACAAAACAACACCTAATGACCACCCACTTTACAAAACCAATAAACCTCGACAGTTACAAACCTTTACCAACAGAGTCTTCTACGACGATAGCCTTTATCCAACCGACAACCTAACCAAAACGAACTTTCTATGAGTATATTCTAGTAGACTCTAGATCAGTAGAAATTACCCACTACCCGCAGAATAAACACCTCCTACTCAACATGTAAAATCTTGCGAGTGCGCTCTATTCAAGACCTCGGGTTTATCCACCACCACACTATCAAACCATTCTCAACACCGGCTACCACATTAAAGGATATTCATATGTGGACTATCAAAATGCTTTCTTGAACCTTCTACGTCAAATCCTATGACCACTCTTGGTTTCTCTCCTTCACCAAAATGCAACAAAACATCCGTGATGGTTCAACGAATGGTGGTAATGGCTTGGACCATCGATCAAATTTATCCACCGAGATCATCAAGACTTCTTTCCCTTACTATAAGACACAAGTACCTGACCAACCAGTGGGACCAATTACCAAGATCGCTTCCACATTGACATGGGAATACCGTGGATCTGTTCGTGGCATTTTAGCCTAGAACTCGCTCTACGACATGCCATACTCCCTAATCAGAGAATACAGAATCAAATGGTGGGAAAAATACAATCTCGACCGTTGCTCCTAACCAATATCCAAAAATACTTTCAGATATCCAAACAAAACCAAACCGATATCCAAACCATATCAAAATCCATACCCCTTT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_94

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

625

Start:

29852172  

End:

29852796

Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_94

AGTATATTCTAGTAGACTCTAGATCAGTAGAAATTACCCACTACCCGGACAGAATAAACACCTCCTACTCAACATGTAAAATCTTGCGAGTGCGCTCTATTCAAGACCTCGGGTTTATCCACCACCACACTATCAAACCATTCTCAACACGGGCTACCACATTAAAGGATATTCATATGTGGACTATCAAAATGCTTTCTTCAGAACCTTCTACGTCAAATCCTATGACCACTCTTGGTTTCTCTCCTTCACCAAAATGCAACAAAACATCCTGTGATGGTTCAACGAATGGTGGTAATGGCTTGGACCATCGATCAAATTTATCCACCGAGATCATCAAGACTTCTTTCCCTTACTATAAGACACAAGTACCTGACCAACCAGTGGGACCATTACCAAGATCGCTTCCACATTGACATGGGAATACCGTGGATCTGTTCGTGGCATTTTAGCCTAGAACTCGCTCTACCTGACATGCCATACTCCCTAATCAGAGAATACAGAATCAAATGGTGGGAAAAATACAATCTCGACCGTTGCTCCCTAACCAATATCCAAAAATACTTTCAGATATCCAAACAAACCGAAACCGATATCCAAACCATATCAAAATCCATACCCCTTT

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_95

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3243

Start:

34566034  

End:

34569276

Strand:

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Brassica carinata (v1.0)

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ChrB03_LTR-Caulimovirus_96

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Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

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Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_96

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Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_97

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_97

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Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_98

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_98

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Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_99

Class:

Retrotransposons

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LTR

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Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_99

AATATCTAATTAAATTAAAAGATATAATATATCAAGAAAACCAATTATCTACACCACAACCTTTCAGCCTAAACAAAATATTTGAAAAATATCCAACTCAAAGTTTGTTTAAACAAGTAACTACAGGAGAATTACAAAATGAAGTTAAACAATTAAAAAAACAAGTTAAAGAATTACAAATAACAGTTAATCAACAAGAACTAAAACAATTACAAATAAATGCAAGATTATCATTAGTCAAGTGAAGAACAATTGTCAAGCATCAACAAGTAATCAAAATATAGAAAATAATGATGAAACAGAAATCCAAAAATGAAGATTATATTCAGATAATTAATAAAATTAATTATCAAAATGGTATACAAATATTACTTTACACATTGGACATGATTTTAAAATAAATATTATTGCACTAATGGATACTGGAGCAGATTATAATTGCATCCGTGAAGGAGTAATACCAACAAAATACTATGAAAAAACAACAGAAAGATTAAGTGGCTAATGGTAGTAATTTGAAAGTACAGTACAAATTACCTTGCATAAAAATATGTAATCAAGGATATTGTTTCAAAAATCAATTTATCCTAGTTAAAAACCTAGCAAGAAGTAATATTAGGAACTCCATTTTTACCCAAATATATCCGTTCAAAGTAACAGAAAAGGTATAACCACTAAAGTTGTAGGAACAAAATTATTATTTGAATTTTTATCACCAATGAAAACAAAAGAAGTTTTACTTCTCCAACAAAATACAATTCAAAAACAATTAACTTAATAAAAGGAAAAAAAATCATATCCAATATTTACAAGATGAAATAACACATAAAAAATAGAAGAACAACTTAAGACACCATATATAATAAGTAAAATAAAATCTATAGAAAATGATCTTTTAACTCAAGTATG

Brassica carinata (v1.0)

ID:

ChrB03_LTR-Caulimovirus_100

Class:

Retrotransposons

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LTR

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Strand:

+

>ChrB03_LTR-Caulimovirus_100

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