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Aa.chr1_LTR-Gypsy_22 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy21517831561783370-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_23 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy23517835931783827-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_24 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy38117900411790421-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_25 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy41818041511804568+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_26 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy26924634342463702+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_27 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy68826358512636538+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_28 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy19926366482636846+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_29 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy19526371022637296+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_30 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy58127916312792211-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_31 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy15935357103535868-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_32 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy93235361323537063-
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< 2 3 4 5 6 > Total 2847


Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

396

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1783052

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-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_21

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

215

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1783370

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_22

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

235

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Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_23

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

381

Start:

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1790421

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-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_24

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_25

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

418

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1804568

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+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_25

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

269

Start:

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2463702

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_26

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

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>Aa.chr1_LTR-Gypsy_27

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

199

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2636648  

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2636846

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_28

AATCTCAAGGGAATCAAAACTATCAAGGACAATGTAGCTCTTCTCAACCACCACTTAAAGATGATGAAACAAGGCTTCTACTTAAGCAAATTCTAGAGGGACAAGGAAAGGGAGCTATTGAGCTAAACAAGAAGATGGTATAGATACACAACAACGTTGATGGAGCTTATAATGACCTTAATACTAAGATCGAACATCT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

195

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Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_29

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

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581

Start:

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2792211

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_30

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

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Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_31

ATGGCATTGCAATAGTTCTTTGGATTCTCTTCTGCTTTTCCCAGGAGAAATCCATTTTGGCTTCTTACTGCTTCGGCCGTTTGAGCTATTTGGTTATCGGCGTTCTTCATGTGTGATTTCATCACGTCGATCTTGCCATTCACGTCGGTGTACATAGTA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

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Start:

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3537063

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_32

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

235

Start:

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3538198

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_33

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

349

Start:

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Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_34

TGATATATCATGTTTTTACCAGATTTTGATCATGATTTAACCCGGTTTTATCGAGTCTTTTCGGTGTTTTTCGAGTGTTTTAGAGTCTTTGCAGGTCTGTGTACGTGTGGAGCTTAATTGGTGATTATGGAGCAATGTTGGAGCATTGAGGAAAAAGGAGTTGAAGTCGCTAGGACGGATTTTCAATTGCCGTCAGATATTGGTGTCGATCGACACTAGGAGGTGTGTCGATCGACACAGGCCCATAACGAAAAGTCTTTCCAGTTTTGAAGATTTCCTTTTGGCACCAGAACTTTCAGAAGTTTACAATAAAAGCCCATCACGAATTTGAGGCTTTATATGTAGTTTT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

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Length:

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Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_35

AGATTTTTCGAATCCTTTGTTTCACTTTCTGTATCTCTTTTATATGTAGTATTATTCAGTCATGATTTGTTTTGCATCCATGTCTGAGTAGTTCTCTTGTTAGGTTTAGGGTTATTCGAAAGGATCAAAGATGAATTGTTTGATTAAATTTACTTGTTAGGATTATCTCATTGGTTCTTCATCTAGATTGTTTTAACTCTAATTTAGGATTCGCGACCCCAAACTAGATATCCTAGGTTAATAAATTGACACGGAAGTGTAATTAATTAACTTGAACTAGATCTTAGATGAGCAAAATTTCATATTCGCAAAGGAATTTGGTTTATGGATTTTGTGAACAAATTGAACTTAGATTTAATGCTTGCTTAAATTGATTGAGTTCACAAAGGAATTTGGCTTTCTAGAGTTTAGGCATAGTTAGTTTTCGCAACTGAAGTTTGTTAATTATACCTTAGTGTTTCAAGTTCGAGAACGGTTCTTAATTAAATCCTGACATCTTTTAATCTGCAATTTTGATTTATCTTGAGAATTTCCTGAAAACCTAGCTTTTTGTTTAATTGAATCTTAAGAAATCAACAATCTTTCTGTGTTTTGAATTGTCATTGCATTTACATTACATTATTTGCTTAGCTTGGTTCGAAGTCATACATCCTATCATTTGATTTGACTCCCATTGATTCGACCCCTACTACGATGACCTCTTAATTTGAGAGAGTCTACCTCAGGGTTAAATTTG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Gypsy

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Start:

3544112  

End:

3544238

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_36

AATCACTTATAGGATTTTGATTATAGAATTTAGACTAAGTATTATTTTTATTTTGTTACTAATTTGGGATTTCTTTTCTTTTGTTTTTGGTGTTTCCGGTGTATGCAATCTCGCAAAACCAGGAGCA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

691

Start:

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3545305

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_37

GAACCAATGCACTTTGGGTGATTACAACCGTCCTGAAGAGTACTATGCCAACAAGGCAGCGATTCGGCCTCCAGGATTTCGTAGGAGGGACTTTGAATTGAAGCCTGCATATTTCTCTTTAGTGGCTCAACATCAGTTCCATGGGCACCCAACCGAGCATCCCATGGATCATCTGAAGACTACATCCTATGTAAGCTCTTCCCCTACTCTCTTGCTGGAGAGGCTGTCTCTTAGCTGAAATAGTTGGAGCCTGGCTCATTGACAACTTGGAATGACACCAAGAATACTTTCTTGAACCATTTTTACGATGAGTTGCGTTCAAAGGATCTGCGAGCTAAGATCTCAACATTCTCTCAGGGGCCAACCGAAGCCTTCAAAGCTTCATGGGAGCGTTTTAAAGGTTACCACGGGTTCACATAGGTTCAGCTGTTGAGTATCTTCTTCAGAGGAATAGATTGGAGACATCAGATGACTATAGATTCTGCTAGTAATGGGGATTTCAAAACAAGATTTCCAGCTGACTGTCTCATGCTCATCAAGAACGTGGCTTCAAGCAACCGTACGAAGAAGATTGATGAGGAGAGACGGAAAGAAGCAGGTATTTCAGGTGGAGTTGAGATTACTGAGGTGAAGGCTGATTCGGTTCACAACCTTTTAATGGGGAAGAAAGCGCTTCATTTTGCTCAGGAAG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

272

Start:

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End:

3545774

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_38

TGATATGCTCAAATTTAATCCTGAGCTACTCTCTCAAATTAAGAGGTCGTCGTAGTAGGGGTCGAATTACTGGGAGTCAAATCAAACGATATGATGTTCGACTTCGAATTGACATAAGCGAATAATGTAAAGTAAAAGAAAAAACAATTCGAAACAGTGAAAGATTTGTTGATTTCTTAAGATTCAATTAAACAAAAAGCTAGGTTTTCAGGTAATTCTCAGGATGAATCAAAATTGCAAATTAAACAATGTCAGGATTTAATTAAGAACCA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

293

Start:

3545919  

End:

3546211

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_39

GCTCACCTAAGATCTAGTTCAGGCTAGTCAATTACACTTCCGTGTCAATCTATCAATCTAAGATATCCAATTTCAGGTCGCGAATCCTAAATCAGAGTTAAAGCAATCTAGGTGAAGAACCAATGAGATAATCCTAACAAGTGAATTTAATCTAACAATTCATCTTCAATACTTTCGAAAAACCCTAAACCTAACAAGAGAACTACTCATACATGGATGCAAAGCAAATCATAACTGAATAATACTACATAAAGAAAAAGATAAGAAAGAGATACAAAGGGTTCGAAGAATCT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

255

Start:

3546453  

End:

3546707

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_40

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