ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Aa.chr1_LTR-Copia_21 RetrotransposonsLTRLTR-Copia37217959181796289-
Aa.chr1_LTR-Copia_22 RetrotransposonsLTRLTR-Copia98917964251797413-
Aa.chr1_LTR-Copia_23 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10317974371797539-
Aa.chr1_LTR-Copia_24 RetrotransposonsLTRLTR-Copia17218061001806271+
Aa.chr1_LTR-Copia_25 RetrotransposonsLTRLTR-Copia60418066181807221+
Aa.chr1_LTR-Copia_26 RetrotransposonsLTRLTR-Copia64418074381808081+
Aa.chr1_LTR-Copia_27 RetrotransposonsLTRLTR-Copia100618081041809109+
Aa.chr1_LTR-Copia_28 RetrotransposonsLTRLTR-Copia11119254371925547+
Aa.chr1_LTR-Copia_29 RetrotransposonsLTRLTR-Copia65019256891926338+
Aa.chr1_LTR-Copia_30 RetrotransposonsLTRLTR-Copia131019263981927707+
Aa.chr1_LTR-Copia_31 RetrotransposonsLTRLTR-Copia52319281781928700+
Aa.chr1_LTR-Copia_32 RetrotransposonsLTRLTR-Copia43919286691929107+
Aa.chr1_LTR-Copia_33 RetrotransposonsLTRLTR-Copia28720415312041817-
Aa.chr1_LTR-Copia_34 RetrotransposonsLTRLTR-Copia313920473292050467-
Aa.chr1_LTR-Copia_35 RetrotransposonsLTRLTR-Copia21120505542050764-
Aa.chr1_LTR-Copia_36 RetrotransposonsLTRLTR-Copia134124639152465255-
Aa.chr1_LTR-Copia_37 RetrotransposonsLTRLTR-Copia62324653112465933-
Aa.chr1_LTR-Copia_38 RetrotransposonsLTRLTR-Copia11324661492466261-
Aa.chr1_LTR-Copia_39 RetrotransposonsLTRLTR-Copia15128460392846189-
Aa.chr1_LTR-Copia_40 RetrotransposonsLTRLTR-Copia8728468132846899-

< 2 3 4 5 6 > Total 1427


Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_21

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

372

Start:

1795918  

End:

1796289

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_21

AGAAGTATTAAGATGCACGATGGGTGATCAGCCCTGCAACATCTCAACATTCTAAANNNNNNNNTTCATTTATTCGAATTCTATTTGCCTCATGAAAACCCATATATTAGTTTATCTTATGAGCAAACAACACATGACAAATCATTATGAAGAATCTTCTGGTTCTTCAATGATTGTTTACATATCTTACTTTTCGCATCACTATTGAATCGTAATGGTCTAACCGATTCATGCCAAACAATGATATGTTTTATAAACTTCTGGTTTACTGTATCTTTTCATCTCCATTCTATGAATCTTTGTGTAGTACAATACAAGTAGTTTCACGAAAATACTTTTGCTCTTGGGAAATACTTGTAATTTAAAGGCATT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_22

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

989

Start:

1796425  

End:

1797413

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_22

TTTATGTTATGAAGGATTCGTATGAACATAGTTTTATGAATCTTCTGGATTCATTTACTTAGTTTTAGTGTGAACATAATCTTATGGATGTTCCACTTATTATGGTATGTGGGATTCTTTAACTCTCCCCCTCGAAATGATAACACTGATTTTATCAATCTTATACTGAATCCCTTTTTAGAATCAATAACATTCCCTTCGCGGGACATGTATTCTATCTTAGATCCTTCTATCTTTTGAGACTTATGAGAATAAATGCATAAATATGTCAAATACATTCCCATATGCAATAATATCCATGTGTTCTTCTGGAACATTCATATATATGCTATTCTTGAGCATTCAATAAGCTTTATACTACTTTGTATTATACTCCCATAGATTATTTCATTTACAAAATGATTCGAATATCTTTGACTTATTACCATCTCTATTTTCTCACTTCCGGTGAAAATATGAGTTCATGATAGAGACTCTTCGAGATCTCGATCTCGATCTTGACCATGACCACATTCACATTTACAACCAATTCTATAGCAATTTCTTTAACACTATTAGTGTTGTCTTTTTCTTCCGTATTATATGATATCACATTCGCTTCAGGGAATGGAGTTTAACAACCAATACATGATATATGATTTTTATCAATAGCTCATTATTTTGTTCAATGTCAATGAGATAACATATAAGTTTTGAAACTTCTTAAACCTCTTTTACAATTTGTGTTTACTGGACAACATTTTCATCCGAGGTAAATATATTTTCTCTAGCGTATATACACTAGTGATATTATCTCCACATAATATAAACTCATGACATTCACTTACAGACTTCAGGTCTTGTAACTTATATTTACCAATCATATTGATCTTTAGAAAATATTACATTCTAGTGATCATTCGTTTCCGTAAGAATTGCTCCTTGCTCTTACTAACTTGTAAATCTTAATGGTCAAGCAGTAAACATTATCTTCTGGATATGTTACTTGT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_23

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

103

Start:

1797437  

End:

1797539

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_23

TGATCATAATCTTATGGATATGTCACTTATGGTCTGTGAGATTATATTATTCTCTCTATCGATGATGAAATTTTAGGTTCATCCATCTCGAATTAAATCTCAC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_24

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

172

Start:

1806100  

End:

1806271

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_24

AGTCTCGAGAGTATCGTAGATATTAGTTCGTAACAATCGTTTGTTCGAGTATCTACGAACACGATTAGTTTGTGGTTTTATCCTGGGACTCGGAATCTCATAAACCCGTCACACTGCGGGAGATTCTTAGAGTTAAAGAAAGAGATTTCGTATCTCGACTCTACTCTTTGTC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_25

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

604

Start:

1806618  

End:

1807221

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_25

ATGTGGCAAAAGAAGATGCACTTCTATCTGACCACCCTCAATCTGGAAAAGTACATCCGCGAGGACTGTCTTTCCCTCCCAGCAGATAATATTGATTTTCGGGCACTTGCAAGTATGGATGCGTGGAGACACGGTGACTTTCTAAGCAAGGGCTACATCTAGAGTCGTCTGGTTGACCAGTTGTTCAACGTGTAACGCTGCCACATCTAAGGAACTGTGGGACTCTCTGGATAAGAAGTAGCGTTCAGAAGATGTTGGATCAAAGAAGAATGGTGTGGCAAAATTCAAGAAGTACAGGATGGTGGATTCTCGTCTCTTGATGGAACAAGTTGACGAGGTGCATAACCTTCTCCATGAGATTCATGCTGAGGGCATGAGACTGTGTGAAACCTATCAGGTTGCTTGTATGATCAAAAAGCTTCCGCCAGGATTCACAGATTTCAAGAACTACCTGAAGTTGAAGAGGAAGTGGATTATCATGGAGAACTTGATCAGACGACTTTGGATTGAATCCACAAACAGCGTGAACCTCGAAGCTGCAAGTGCTCAGATTCTTGAGAACGATGTGAATTTGGCTGAATACCAGACTGCTAAGAAACAAAAG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_26

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

644

Start:

1807438  

End:

1808081

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_26

TGTAGCAGGAATCTGGGTTGGCCAAGAAAATGTGGGGGGGAGATTTGCTTACCACAAATTACATTCTCAACAAAATACCTCATAAAGTAACTGGAAAAACTCCATATGAACTTTGGAAAGGTAATGTACCTTCGTACAAATACCTGAAAGTGTGGGGGTGCTTGGCAAAAACAGCAATTCCACTTCCAAAGAAAGTTACAATAGGCCCAAAGCCGGTAGATTGCATTTTCATCGGATACGCGCATAATAGTAATGCTTGTCGGTTTCTTGTTCATAAGTTTGATATATCAACTATCAAGGTAAACACCATAATGGAGTCAAAAAATGCTTCATTCTTTGAAAATGTGTTTCCCTATAATGATATGCAAAGTAATAAACGGACTCGTGAACAACGAGATGCGGATATCCCTTGAAACGAAGCAAGTAGCTCAGGCACTGCTCTCAATGATGAAATTGAAGAAGTAGATGAACCTATATGCATCTCGTAAAGAGAAAGATTTGGGCTCAGAATTCTTGTTGGTGTTTCTAGTAGCAAACGAGCCAAAAACATATATGGACGCGCCTTCTTGGAAAGAAGCAGTTAATAGTGAGATGAATTCCATCATGCAAAACAATACTTATGAAATAACTGATATGCCACAAAG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_27

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1006

Start:

1808104  

End:

1809109

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_27

GGCATACACTATGGTAAAGAACCAGCGGTTCTAGAAGGCTATAGTGATGCCAATTGGATTTTGGAATCTAGAAACTCGAAATCAACAAGCAGATATATCTTTACGCTTGGCGGTGGAGCCGTATCCTGAAAATCTTCCAAACAAACTTTACTGGCTAGATCAACCATGGAGTCCGAGTTCATAGCTTTAGACAAAGCTGGAGAAAAAGCAGAGTGGCTTTGCAACTTCTTGGAAGATATCCGAATGTGAAAAAAACTAGTGCCAGTTGGTAAATCTCGTCACATTAGAAAGCGACACAAAACCATTCGGTAACTGATCTCAACTGGAGTACTCACGATAGACTATATCGAATCGACAGAAAACTTAGCAGATCCGTTTACAAAAAGTTTGCCTCGAGATCAAGTTGTTAAATTATCAAAAGGAATGGGTTTAAAACCTATAACCTAAGATGACGTTTGATGGATATCTCACATATGTGACTGGAGATCCCAAGATCTAGGTTCAAAAGGGACAACAAAATCAAACTGATTCAGAATTGTACACTGTAACGACAATGTCTATAGCCAGTTCTTAGGATAATGAACAGTGTTATGTGTGTGTGTGATAAGGTTAAGCTGTGGTTTTTAATGATTCATTAACTTTGAGATATATGTGAAATGATACAGAAAACATCTTATAACAAAGTTAATGGCAGATCACCTAGTGAGTGTGAAATGGGGCTGTTTCTAGGAGAATGAAGGTCAGGCTATATTCTCCAAGTTCACTCATGATAACCAGGACATGTTCAAGGCCAAATGAATACAGTAGAGAACTGAGCTCTACGAGAAAATGTCGTTATGCAGGAATGATTCATGTTGTCTAGGTTTACATAAAAATTTGATTGGTTCAAGAACACCATGTTCACCAACTGGCCAAGTAAACCCGACAGAGATAAAAGATGATTGGTTCAAAGCTGAAAAACACTACCTCTCAGATAGAGTTGCATTTTCGCATATTCTCGAATGTC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_28

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

111

Start:

1925437  

End:

1925547

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_28

AGTAAACATGGAACCTACTCATGGAAGGTTTGAGATGGAAAGATTTGATGGTAAAGGTGATTTTGGATTGTGGAAATTCAAGATCATGGGACAGTTAGAAATCCAAGGCTT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_29

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

650

Start:

1925689  

End:

1926338

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_29

TAAGGTTGATCCTCTTAGAGCTGAGAAGGATTTGCGAGTGAGAAATCTATTAGCTACTTGTCTTAGTGATCAGATCTTGAGAAAAGTTATGAATGAGACTTCAGCTTTAGGGATGTGGAAGGCTCTTGAAAGGGATTATCAAACTAAGACTCTCCCAAATAGGATCTATCTTAAGCAGCAGTTTGCAGGGTTTAAGATGGAGGAAAATAAGACTATAGAGGAGAATCTTGATTCTTTCTTGAAACTGATTGCTGATCTTGCAAGTCTTAACATAAATGTTAATGAAGAAGATCAAGCAATTCAGATTCTTACTAGCTTACCTTCAATGTATGAACCACTTGTCCATACCCTAAAGTATGGCACAGGCAAAGATACATTGACAGTAAGAGAAGTCACTGAGGCAGCTTATGCTAAGGAGGTAGAGCTCAGACAGAAAGGCATGCTAAACAGGTCAAAAGGTTCAGTTGCGGGTCTGTTCATTGGAGAAAGAGGCAGGCCTCAACAAAGAAATGGTAAACAGTACAGAGGCAGATCTCAGAGTAAAGGAAGGCCTAAGTCTAGACCTAAGAATGCAAAAGGTTGTTGGTTATGTGGGAAAGAAGGCCACTGGAAAAGGAACTGTCCTGAAAGAAAAGGGTCTGAAAATCAAC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_30

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1310

Start:

1926398  

End:

1927707

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_30

GCTAAATATGACCCAGCAAATCCCTCAGTTCTGATGGCTACAATCACAGAAGAAAGTCATTGTGAGAGAGATGAGTGGATTCTAGATTCAGGAGCTACGTTTCATATTACTCCTTGCAAGGATGTGTTGTTTGATCTACAGGAGTTTGATGGTCAACAGGTTCAGATGGCAAATAACACTTTCTGCCGTGTTAAAGGTATGGGTAAGGTAAAGGTTATAAACTCAGAAGGTATTGAAGTGGTTCTGTCTGAGGTAAGATACATGCCAGAAGCAGGTAAGAATCTTATTTCACATGGTTTACTGGAAAGGTCTGGATGCTGGTATGAAGGGAGAAACTTCAGGGTCCAGTTTTACAAAGATGATCAGAAGGTTCTAGCTGGTGATTACAGAAATGGTTTGTACTACTTAGATGGAACAGTCTCTAAGGGTTCAGCCCTAGTGGTCAGTCCAGGAAAAGATAGGACATCTTTGTGGCATTCCAGGCTTGGACACATCAGTGAGAAAGGTTTGAAGATTCTGGTAAAAGGAGGTTACATTAGTGAGAAAGAGGTATCTGATTTGGACTTCTGTGAGAATTGTGTTTTAGGGAAGTCTCACAAATAGAGTTTCCCTAAAGGCAAACATATTTCCCAAGATGTTCTTGAGTATGTACACTCAGACTTATGGGGTTCTCCCTCTGTTCCAGAGAGTCTAAATGAATGCAAGTATTTCTTAACTCTCATTAATGACCTATCTACAAAGGTTTGGATTTATTTCTTGAGAGCCAAAAGCGAGGTGTTTGAAAATTTCAAAGAGCGGAAGGCTGAGGTGGAAACTAGTTCAGGAAAGAAACTAAAGTGTCTAAGGACTGATAATGGTTTAGAGTTTTGCAATAATCAGATGGATCAGCTGTGTACAGAAACTGGGGTTAAAAGACACAGGACCTGCAGTTATACCCCTCAACAAAATGGAGTTTCAGAGCGCATGAACCGAACTATCATGGATAAGGTTAGGTGTATGCTCTCTGAAACAGGTTTGGAGCAGAAGTTCTGGGTTGAAGCAGCTTCAACTGCAGTGTATCTCATAAATAGATCACCTAGTTTTGCCATCGAGTTTAAACTACCAGAAGAAGTGTGGTCAGGAAGGAAGCAGAATCTATCTTATCTCAAAAGATTCAGGTGTAATGCTTTTGTCCATACTGTTCAGGCTAAGACAGAGCCTAGATCAATTAAGGGTGTGTTCATGGGATATCCTAAAGGTATAAAGGGATACAGGATTTGGATTCCAGAGATTGAGAAGTGTGTTATAAGTAGAGATGTGGTGTTCTACGA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_31

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

523

Start:

1928178  

End:

1928700

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_31

ACGAACCACTTACGTATGGTGAGGCCAGAGCAAGTTTAGACTGGATTAAATGACTAGGAGGCATGAAAGAAGAGATGGATTCTTTATATAAGAATGAGACCTGGGTTCTAGTGAACAGGCCAGATGACAAAATGGTCATTGGAAACAAGTGGATTTACAAGAGAAAACAAGGCATTCCAGGTGTGGAAGATCCTAGGTTCAAAGCCAAACTTGTAGCAAAATGGTTTTCTCAAATAGAAGGCATTGACTACAATGAGGTATTTGCTCCTGTTATTAAACATGTTTCTATTAGATTAATGTTGTCTCTAGTGGTTGCAGAAGATATGGAGCTAGAACAGATGAATGTAAAAACAACTTTTCTGAATGGAGTTCTTGAAGAAGAGATCTATATGGAACATCATGAGGGTTTTGAGATCAAAGGCAAAGAAAAGAAAGTTTGTTTGCTGAAAAAATCGTTGTATGGACTAAAGCAGAGTCCTAGGCAGTGGAACAAAAGGTTATTCTGATTCAGATTTTGCTGCAG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_32

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

439

Start:

1928669  

End:

1929107

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Copia_32

AAAAGGTTATTCTGATTCAGATTTTGCTGCAGACCTTGACAAGTGAATGTCAATTACAGGTTATGTTTTTCAAATAGGTGGTAATACTATCAGTTGGCGATCAGGGTTACAACATATAACTACTCTATCTACAACAGAAGCAGAGTATGTATCACTTACAGAAGCAGTCAAGGAGGCAATGTGGTTAAAAGGTTTCTGCTCAGAACTCAGGATTTCAAACAACAGTGTTAAGGTTTACTGCGATTCACAGAGTGCTATTTGTCTAGCTAAGAACAGTGTTCATCATGAAAGAACTAAGCATATCGATACAAGGTTAAACTTTATCAGAGATGTGATTGCGCAGGGTGAAATTTCAGTTCATAAGATACACACCAAAGTTAATCCGGCTGATCTAATGACTAAGTCCTTACCTGGACCGAGGTTTGAAGAGGGACTGGGT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_33

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

287

Start:

2041531  

End:

2041817

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_33

TCCATCGGTACATGTGACAAGTTACAATCGTCCATTCCCGTCTCACACAGGATTTTGTGCGCATACCTTTCTTGTTTCAAACTGATGCCACATTCTTGTTGATGCACTTCAATTCCAAGATAGTACCTGAGCTTTCCAAGATCACTCATCTCAAACTTTGTCGCCATTTCCCTTTTGAACTCAACAATTGATTTTAACGAAGACCCTGTTACAAGCAAATTGTCAACGTATACAGCTATTATAAGGAGATCGTCTTCTTTCTTCCTTTGATATAGAGATGGTTCTTT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_34

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

3139

Start:

2047329  

End:

2050467

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_34

CGTATACAGCTATTATAAGGAGATCGTCTTCTTTCTTCCTTTGATATAGAGATGGTTCTTTTAAGCAGCGGTAGAAATTTAGTTCCTTGAGGATTTTGTTTAGTTTGTCATTCCAAGCTCTAGGTGCTTGCTTTAACCCGTAGAGAGCCTTTTCTAGTTTATAGACTTTGTTTTCACTTCCTGAAATCACGAATCCTTCTGGTTGAGTAACATAGACTTCTTCCTTTAGTTCACCATGCAAGAACGCGGTTTTCACATCGAGATGGTGAATTTCCCAGCTTCTTGAGGCCGCTAAGGAAATGATAAAACGAACGGTTTCTATGCGTGCTACTGGTGCAAATACCTCATCATAATCGATGCCATGTTTTTGAACATACCCTTTTGCTACTAATCGCGCTTTATGCTTGTTAATACTTTCATCGGAATTGCGTTTGATCTTAAAAATCCATTTCAATCCAATAGGTTTCACTCCGAGTGGAAGATCAACCAGATTCCATGTTTTGTTTCTTCTAATCGATGAAAGCTCATCCTCACATGCTTCTATCCAGATTCTGTCCTCTTTTGCTTCACTGAAATCCCAAGGTTCATCATTAACTATTGTTAAAAGTCTCTCACACTCTGTTTCGGCAATGTGAATATAGTCGTTCAAATATGTGGGCTTTACTCTAAGTCTTGTTGATCTTCTTAATTGATCAATATCACCGTCATCGTGTTGTTCTTCCCCATCTTCGTCGTCCTCTTCTTCTTCTACCACACCATCATCTTCTTCATTTGTTGCATTAGTATTTTCTTCTGTCTCGGGAGCAATAATCTCTGTGCTCACGGACTCTTTATTCCTAGATTCTCCTAGACCAACAACAAATGTTCCAGATTCTACAGCATCTTCCTTCTTATCAATCCAGTACCAGCTCTTGCCCTCATCAAAGACTACATCACGGGACACACAAATCTTCTTGGTTGTAGGATCGAGAAGACGATATGCCTTAGATCCAGGTTCTGTTCCTAGGTGTATTAAGACTTTTGATCTGTCGTCAAGCTTTTTCCTTCCAACTGCTTCTGTTCTCGCATAGCTAAGACACCCAAACACTCTTAAATGCTCAATATTTGGCCTTTTTCTTTTAAGCACTTCATATGGGGTTTTACCAATTACTGATCTTGTTCCAACTCTATTGATCAAGTAAGTAGCATGTCTCACAGCTTCTCCCCATAGATAGTTAGGTAGACTCATATGCTTCAAGATGCTTCGAGTCATCTCCAAAAGGGTTCTATTACGCCTCTCGACCACACCATTCTGTTGTGGAGAGTATGGTGCAGTTAGGTGTCTTCTGATTCCATACTTATCACAGAAATTTTGGAATTCATGAGACATAAACTCTCCACCTCTATCCGTTCTAAACGTTCTTACAATGGCTCCAGTTTCTTGTTCAGCAAGTTTCTTGAAAATTTTGAATTTATCAAGAGCTTCACTTTTCTCCTTTAAGAGAATTGTCCACATGTATCGTGAATAATCATCAATAATCACGAATATGTACCTTTTATGGGCTGGAGTTGGTGGTGAAATAGGACCACAAAGGTCTCCATGAACTAATTCTAGGACTTGGGTAGCTCGATATGAAGCTGTCTTTGGAAAGGATTCTCTTGTTTGTTTTCCAAGCAAACATGACACACACGTCTCTCTCTCAACCTCCATATTTGGTATGCCAATCACTAGTTCTTTGTTAATCATCATCTTCATTGTATCAACGTTAATATGGCCCAACCGTGCATGCCATTTGGTTGACTCTGTCGAAGAAGTCAGCTGCAAACACTTGAAGTTTTCGACTTCAAGATTAACTTTATACAAACGATTTCTCGATCTCATGGTCTCTATGAGTAAGCCGCCCAAACGATCATAAATCCTTAATAAACTTTCTTTCATTCGTACCTCGCAACCCGCTTCGGTGGCTTGACCAAGACTTATAATATTGCTTTTAAGATCCGGTATAAAGTATACTTTGCTTAGTACCTTCTTCTCTCCGTTTGCGAATATGAAACGAATCGAGCCTTTGCCTTGTATGTTAATACGTGAATCATCTCCAAATCTCACCATTCCCGTGACTGTTTCATCAAGGTTAGAGAAGAAGTCTCGATTTCCACTCATATGATTACTAGCGCCATTGTCGAGATACCACACATTCTTTGTGTCTAAGTCAGCTTCAAAGCTATTTGGTTTTACCTTCTTCTCATTAAGATAAACTACCTCATGCATCATTAACTCATCTGCCTCGTGAGTCTCATCCATCGTTTTCTTTTCAAGAGTTTCTTGAAGCTTTAGTAATCTATCAGGACAATTTGATGCATAGTGACCTATTTTATCACAACGATAACATGTTATAGAGGATGCATCTTTCTCCTTGTCTTGACCTAAACTTTGTGATCCGTTACCGTAGCCATAACGACCACGGCCTCTTCCTCTCCAATATCCTCTTCCTCCTCGTCCTCTTCCTCTGTTTCCACCGTTTCTTTCATGAGAATCTCTTTGATAATCAGTGTTCGCATACATCAACTTTTCTTGATCTTCGCTTTGTTCCTCTTCCTCTTCGTTGACTCTTTCTTCGTATGCTTTCAGTCTTCCAACGATATCTTCAAAGCTAGTTCTGTTTAGGTCAAGTACCTGTTCAAGAGAGGCCACGATGTGAATGTATTTCTTCCGGGGTAAGCTTTTTAGGAATTTCTTCACGAGTTTTGATTCCTCTATGGATTCTCCAAGAGACGCAGATTTTGATGAGATTTCTGAGAGTTTTCCCACGAATACGTCGATGGTGTCGGTCTCTTTCATCTTGATCCTATCAAATTCTGCCATCAATGTTTGCAACCTAGCCTCTTTTACCCTATCAGCTCCGATGTGTCTTGCTTTGATTGCTTCCCAAACTGCTTTGGAGGTGTCAAGGTCTCCAACTTGTAATATCAAGGCTTCTGGTATGGATTGAAATAACAAAGCAATTGCCATGTTATTTTTGTCGTCATCCTTTATACCTGGTTCTATTGTCTCCCATACCTTGTTCACCTTAAGAGCAATCTTCATTCTCATTGACCAAACGGTGTAGTTGGAGGAATTCAACATTGGACACTTGATAGAGGAGGGTCCAATCTCCTTGGA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_35

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

211

Start:

2050554  

End:

2050764

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_35

AATAAAGTCACACAAATCACAATAAGAAATTACTCTTCTTATTAATCTTAAGGGAAATAGCTCAAAACCTTAACTCCAAACTTCTAAGTTATGCAACAACCTTGCATCTCCTTATATAGTTTCTCAAACCTAAACCTATTTGATTACATATTTTCTATATATGTTTAGATAACTCCTAAACATATTATTCTAATCCTAATCTCTCTAGGAT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_36

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1341

Start:

2463915  

End:

2465255

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_36

TTAATGTGTCTTTGTAGAGCTCTTGCTCATAAAAAACAACATTCCTACTTACAGTAGTCTTACCTTCATTGACAAACCTTACCTTATACCCTTTAGTCCCTCTGGGATAGCCAATGAATATTCCTTTTTCAGATCTTGGACTTGTCTTGTCCTGTATAGTGTGAACATAGGCAGAACACCCAAACCTTCTGATGTGAGATAGATCACACTTCTTTCCAGTCAAAACTTCTTCAGGTACCTTAAACTCAATAGATGAATTAGGTGACCTGTTAATCAAGTAGACAGCAATAGAAGTAGCCTCAGCCCAGAATTCCTTTCCCAAACCAGTCTCAGCCAACATACTTCTTACCTTATCCATGATAGTCCGATTTAACCTCTCTGCAATCCCATTCTGCTGAGGGGTGTAAGAACAAGTTCTATGTCTTTTGATACCCGAAGTTTTACACAACTCATCAAACTGATTATTGCAAAACTCCAATCCATTATCGGTACGTAAACACTTTATCTTCTTTCCTGTTTGAGTTTCTACTGATTTCTTCCATTCTTTGAATTTATCAAAGGCTCCATCTTTTGTTGACAGGAAATATACCCAAGCCTTCTTGGAGTAGTCATCAATGAAACTGATGAAGTACCTGCTACCACTTAGACTTTCTGGATTTGAGGGAGAACCCCAAAGGTCAGAGTGGATATACTCCAAAACATCCTTGGTGGTATGCTTCCCTGCAGGGAAACTCAACCTGTGAGCCTTGCCAAACACACAGCTTTCACAAAAGCTAAGTCCTTCTAACTTTACTTTTGTTAGATGACCTTGTTTTTTCAGTATAGTCATCTGCTTTGAACTCATGTGACCTAACCTTGAGTGCCATAGATTTGCATCACTCTCATCTATATTAACTGCATTTGCTTCTGCTTTAATTACTTTAGCTTGTAGGAAATAGAGACCATTTTTCCATTTTGCTGAGAACACCTTTTTCTTATCCTTGTAGTACTGTTGAATGCCATCACCACCTTCATATGTGACCCCACTTTGATCCAACATACCTACTGAGATTAGACTTTTGTCAAAAGCAGGGACATACCTGACATCATTAAGTATCACCTCAGTCTTATCAGGATTTTTGATTCTGATCTTTCCCATTCCTTTAACTTGACTGATACTTTTGTTCGCCATTCTGACCTTAGTCCCTTCAAACTCTTTCAGGTCATATAAGATGTCTTTGTCTGGTGTCATGTGGAAAGTGCATCCGGAGTCTAGTATCCATTCTCCTGTAGCTGGTTCAGTACTCACAGTGAGTACCATAGGTTCAGGTAACTCAAAAACAACATTTGCTGAATTTTCTG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_37

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

623

Start:

2465311  

End:

2465933

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_37

CAACATTTGCTGAATTTTCTGAGCTTGTTTTTCCTTTGTTAGGACATTCTCTTTTCCAATGACCCTCTTTTCCACATATGAAACAGGCTCCTTTTGTTCCCTGGTTGAACCTAGGTTTAGACTTCGATCTACCTCTGCTGTTGGACCTGCCCCTGTACCCATTCCCTTTGTTATGATTTTGCCTGTTGTTTGACCTGCCTCTGGAATTCACAAACAGACTGTCTGCGCTAGAAGAACCTCGATGTAACTTTCCTTTTTGTTTTAATTCCATCTCCTTATCATATGTTGCACTGGTTACTTCGCTGACAGTTATTGTTTCCTTTCCAGTTCCATACTTCAAAGTGTGCACTAGAGGTTCAAAAGCAGGTGGTAAACTGGACAGGAGCTGAATGGCCTGATCTTCTTCAGACACTTCCACTTTAAGGCTAGCCAGGTCAGCTATGAGCTTTAAGAAGGTATCCACATTGTCTTCTATACTCTTACTCTCTTCCATTTTGAAACTTGCAAATCTCTGCTTGAGATATATTCTGTTTGGCAGTGATTTGGTTTGATGTTCTGTTTCCAGGGCCTTCCATATACCCAAAGCAGTACTTTCTTTCATCACTTTTCTCAGAATACGATCA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_38

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

113

Start:

2466149  

End:

2466261

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_38

TAAACCTTGTATTTCAAGCTGTCCCAGGAGCTTGAACTTCCATAACCCAAAATCACCAGAACCGTCAAACTTTTCCATCTCAAATCTTCCTGGAGTTGGATCCATCGTTGCTA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_39

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

151

Start:

2846039  

End:

2846189

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_39

TAAGATAAATTTAAGAACAAATTCAGAATTACAATACTAAATTACAAAGATGAAAATGAATTGTAGAGGCGAGACGAATCTCTTTCCTTAAATCTTTAAACGCCCCGTAGTGTGACGGTTTCATAGCGATAAGATTCCCAGGATACAACTG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Copia_40

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

87

Start:

2846813  

End:

2846899

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Copia_40

CCAAGTCATCGACTTTGGACCAACATTTCTCATTCAAACGAATGCCGTTTTTGATAAATGAATACACTAGCTCATAGTGCTCATTAC