ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
SI_C100167_LTR-Caulimovirus_1 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1643166+
SI_C107593_LTR-Caulimovirus_2 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1751175-
SI_C114047_LTR-Caulimovirus_3 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1751175-
SI_C114929_LTR-Caulimovirus_4 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1767182+
SI_C130673_LTR-Caulimovirus_5 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus16225186+
SI_C149133_LTR-Caulimovirus_6 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2701270+
SI_C155749_LTR-Caulimovirus_7 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3511351+
SI_C160121_LTR-Caulimovirus_8 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus5822583-
SI_C161407_LTR-Caulimovirus_9 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus450188637-
SI_C172795_LTR-Caulimovirus_10 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus329609937-
SI_C179065_LTR-Caulimovirus_11 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus35710321388+
SI_C180511_LTR-Caulimovirus_12 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus147311473-
SI_C186043_LTR-Caulimovirus_13 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1823141836-
SI_C189621_LTR-Caulimovirus_14 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus5227631284+
SI_C192407_LTR-Caulimovirus_15 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1549071060-
SI_C192559_LTR-Caulimovirus_16 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus221612216+
SI_C195557_LTR-Caulimovirus_17 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus54222082749+
SI_C196879_LTR-Caulimovirus_18 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus20010331232+
SI_C196879_LTR-Caulimovirus_19 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus91812372154+
SI_C198645_LTR-Caulimovirus_20 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9431943-

< 1 2 3 4 5 > Total 19


Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C100167_LTR-Caulimovirus_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

164

Start:

3  

End:

166

Strand:

+

>SI_C100167_LTR-Caulimovirus_1

AAAAAAAAAAAAAAAATAAATGAGATATTCCAGGATCAACCGGATATTCAAGAAAAATTAACTAAATTGTTAATATCAAGAAACTGATAATGATTATTCAATAAATAAAATAGGAAATTCAAGTGATTCTTCTATAGAATCACAAGAATTTTCAGACAACTTAT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C107593_LTR-Caulimovirus_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

175

Start:

1  

End:

175

Strand:

-

>SI_C107593_LTR-Caulimovirus_2

TTCTTGATAAAGGTTTTATTGCTATTTGAATAAGTCCAAAACTGATATAATTAAATCCTTTATGTTTGTATTTTTCAAGCGCGATTGATGATAATAATTTAATTTTTTCAAATTCATTTGGAAGAGATAATGTTTGCTCATGTTCTTTTATTGCATATGCTGTTTTAAAATCAAA

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C114047_LTR-Caulimovirus_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

175

Start:

1  

End:

175

Strand:

-

>SI_C114047_LTR-Caulimovirus_3

ATTACAGTCGTTTCTTTGAAATATATTGGTTACAAATATATCTTTATACCATTTAAAGTCTCCTAATGTAGGATATCTTAAATTGGTTAATATAATTTTTTGCTTTCTAATTTTTCTGCTGGATTTCCAATAAAATGCATTGTTACGGTATGAATTAATATTTCTACAGCATTTT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C114929_LTR-Caulimovirus_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

176

Start:

7  

End:

182

Strand:

+

>SI_C114929_LTR-Caulimovirus_4

TTCAAATAGCAATAAAACCTTTATCAAGAATTGGAATCGATGCACCTATACTTATGCTATTAAGAGATAAAACTCTACTAAAATTTGAAGACTCCCTCCTTGGAGCAGTACATACTAATGTGTATAATGGGACAGTTTATTTTAATTGTGCACCTAATTTTCAAGTAAGTTTACAT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C130673_LTR-Caulimovirus_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

162

Start:

25  

End:

186

Strand:

+

>SI_C130673_LTR-Caulimovirus_5

ATCCACATCCCCAGACAAATTCCAAGAAATGAGTTAATCAAGATACTTCCAGAGTCATGGGTAACAAACTATGAAAAGCTCCATGAAAGCAGCATGCCAATCCAATCCGTATATTCCTCCATCCATATAAGAAAAGATGGAGCCATCGAGATAGCTTTCAAA

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C149133_LTR-Caulimovirus_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

270

Start:

1  

End:

270

Strand:

+

>SI_C149133_LTR-Caulimovirus_6

AAATTAAAACAACCATGTGTTCGTTCTGCTAACAATATGGATACAATAAACTTAATCCACCATCAAGGATCAAACGATTAAAATATAGGCACATAAAATCTAATCATATAAAATGTTACCATAAAGATAAAAAAATTTAATAAAAAACCAACCAATCATTATTATTCAAAAAATAATAAAAATATAAACCAGAAAATAAACAAAAAGTAGTATGTTGGAATTGTAAAAGACCTGGACATAAATCCACAAAATGTAAAAAAAAAAAAAAAA

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C155749_LTR-Caulimovirus_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

351

Start:

1  

End:

351

Strand:

+

>SI_C155749_LTR-Caulimovirus_7

AAAAAAAAGTAAACATCCCATTTTTTATATGGTTCGAAATCTATTTAATAAAAAACAATATTAATTATTCATTGAAATCAATTAATACTAATTCATCTTTAAGACATTATGGGAACAAGTTGATGGAAACAAAATCAAATCACTGCATCACCACTAAAAGATTTTAAAATAAATACCTCTAATAGACAAATTATAGTCACACCATTTAAAACAGGTGCCAATAGAAATGATAAAGATCAAGTAATAATTCAAGATATCAAATCAATATATGAACAGAATAATAACCAAAGTCAGATATTATACATAATTTCAAAACAAGTAGACTATATTGATAACAAATTAAGTAACAAT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C160121_LTR-Caulimovirus_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

582

Start:

2  

End:

583

Strand:

-

>SI_C160121_LTR-Caulimovirus_8

TTATCATTTCTATTGGCACCTGTTTTAAATGGTGTGACTATAATTTGTCTATTAGAGGTATTTATTTTAAAATCTTTTAGTGGTGATGCAGTGATTTGATTTTGTTTCCATCAACTTGTTCCCATAATGTCTTAAAGATGAATTAGTATTAATTGATTTCAATGAATAATTAATATTGTTTTTTATTAAATAGATTTCGAACCATATAAAAAATGGGATGTTTACTTTTTTTTTCTACCAAATTTTCATACAAATTTTCTCTTAAATTGAACGTTTCTTAGTAAATGTTTAAAATACCAGTCTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTCTTTTGAATAGAAGTCTTTTTTTTAATATATTCTTTATTGATTTCAAATTTTTTCCTTATAACATTTATAGATTTAAAATCTGATGGTGTAGGAGATGTGGGATATGTATCTTGTTCTGGTTCAGCAATATGTGTTTTAAATTTGATTGAATTATCTATTTTAATATTTTGATTCACACTTTCTGTTTCTGAGTCTTGCACTAGATTGATCAGTGCGAAATTCAGAAAAGGAAGCTCTCGATGGAGATTGATATTCTGAG

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C161407_LTR-Caulimovirus_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

450

Start:

188  

End:

637

Strand:

-

>SI_C161407_LTR-Caulimovirus_9

TTTGAAAGCTATCTCGATGGCTCCATCTTTTCTTCTATGGATGGAGGAATCTACGGATTGGATTGGCATGCTGCTTTCATGGAGCTTTTCATAGTTTGTCACCCATGACTCTGAAAGTAGCTTGATTAACTCATTTCTTGGAATTTGTCTGCGGATGTGGATGCATGACGGACTGTGCTTTGACTCTAGCTGTATTAACAGCGCATCCTCTGTATCTCTTGGAAGGCTTAAGTCCATAGCATGATTCTGGACTCTGTAAGCTATCTGGTGGTGAAGTGTCGCTGCATATGTATTGCCGATTTGTGGAGCGCCCGTAATTTGCAACTGGATTTGCATGTTTTGATAAATTTGTGGATCTTCGAGTGCCACGTTGAAATTTGGGAATAGTGTAACAAACACTGTTCCTGCATTTAATGTTGTCTGGAGGGTTGCAATGCAAGCATGCTGGTA

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C172795_LTR-Caulimovirus_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

329

Start:

609  

End:

937

Strand:

-

>SI_C172795_LTR-Caulimovirus_10

TATTGTATATACTGTTTTAAAATCAAATGTACCAATTTGATATATATTTTATGGATTGATATGTGGTAGTTGAATTTTTGATATTTCATTATTAAAAGAAGTTATTTTAGTCATTTGAATTAATTGTTGTACTTGAACTAGAAGCTGCATGTTTAAGTTTAAAAAGTTTTCTGAACGACAACGCCATGACTAATCTAAACTTAAACATATACTAGAAGAAATATTAACCGGTTCTAGGTCGATACAACTATGGCTTACCAACGGTTTTACGGTCTCTCATGGACTTGCTGCCTAGAACATCTTTAGCAACAGTGTCTCGTCGAAGTGGT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C179065_LTR-Caulimovirus_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

357

Start:

1032  

End:

1388

Strand:

+

>SI_C179065_LTR-Caulimovirus_11

ATATTTCAAAAAAAAATAAAATTTATAAAAAGAAAAATGGTATCAGACGCTAAAAGATATTCTGCATCATTTTGTTAAAAAAGTTTTTTAAAACGATTTCACCAAAATCTTAATCCAACTTAAGCTCTTCTAGACCAATCCTTACCACTCCGGCGAGACACTAGGGGTGTTCCAGGCAGCAAGTTCATGAGAGGCCGTAAGACTGTTGGCAAGCCATAGTTGTGTCGACCCAGAACCAGTTATTATCCCTTTTAGTATGTGTTTAAGTCTAGATTAGTCATGGCGTCATCGTTTAGTTCAAGTACAACAATTAATTCAAGAGAAATAATGACTAAAATAACTTCTTTTAATAATGAA

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C180511_LTR-Caulimovirus_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1473

Start:

1  

End:

1473

Strand:

-

>SI_C180511_LTR-Caulimovirus_12

TCGTCGATGTATATCAGCGCATTATGAATGAGAGGCTTGAATATCTTCAGCATCGCTTGCTGGAAAAGCGATGGTGCTGTCTTTAATCCAAAAGGTAGAAAGTTTCATTGTAGATTTCTATTCGGTAGACATAATGCAGTCTTGTATCGTTCCTCAGGATGAACACCAAGTTGCCAAAATCCCGATTTGAGATTGAACTTTGAAAATATTGTTGCTTCTTGTAGATGTTGGAGGAGCGCTTTCTTGTTTGGAAGTGGAAACTTGACATCTTGTCGGAATTAATTTAGTGGTTTCTAGTCGATAACCAGGCGAAGATTTCCTCTAACATGTTCTGCTTGATTGTTGACATAGAATGCCTTGCATGCCCAAGGTGAATTTGTTGCGGACACTATTCCTTGACTTGCTAGTTGATCGCATTCATCATTTGCTTGTTTCAGTAGAGTAGGTGGCATTCCGGCATGACTAGATTTCATTGGAGTTATGTGGATGTTTTCTTTGAACGGCAAAGAGACGAAGAACTCTGGATTTAGCCATAATGGATTGTTGCATTCCCTAAGAAAATCTGTGTGGGAGCCTGCACAGGATGTTACTGTTAATTCTTCTTTGATCCTTATGAATTCCTCGGAGACAAAACCTTCAATTGTGAATAGTCGTGGTACGATCATAAAGGCTTTATAAAAATGCTTCCATTTTATCCCTCTTGGTTCGATTGATATATTGAATTTCTTCTTCAATGCGTAATAAGAATCCCATCCAAGTATTAAATCTTTTCCTGGTGCATTGGATCCAAATATTTCCGTAGTAATTTGGCAACCAGGGAAAAGCTCGAGACTATCGGTTTTTAATTGAGTTTGATGGTTAATAATCGAGAATTAGGAACCCAAAGTTCTTGTTGATGGGGCAACCATATCAACGTTGGGAGTATTTTTGGATTCATTATTGTTGTATGAGCTCCTGTGTCGATGAACGCAACTGCGTGAACTGGGTCTTCGTCGCGAGAGGGATAACAAATTTTCACTGGCAAATGTGAATTTCATCTTGCTTGGGCAATTGAGTAATCTTGAAACAGCAATCGTCGTCTTCTCCGGTGGAGGATGAATCAGAAGAGTCTTCGTACTATGAGTAACCGCAAATCGCATCATTTTCATCACTGTCATATGACAGAACTGACTCTAAATCGTGACCTTCGGGATCAATATCAGGTGCAATATCGGAGATAGAGTTGATCAGGTATTGTTTCTTCTTCCTTGATCTGTTCGGGCAGTTCTTGGCAAAGTGGGATTCTTTCTGATAGAGAAAGCATTCGGTTGGCTTCTTGAAGCTTCGTTTCTAGCGGAAGAACCTCTTGCGCCGAAATCTTGTTGGGTGTTTAGAGAACCGTTTTTTGAACCTCCTTCTTCTGCCATGTGTATCACACGAACATGATTTTTTGGACTTTGAATAATTAATTAACAGATCAGGTCGGGCACATAT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C186043_LTR-Caulimovirus_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1823

Start:

14  

End:

1836

Strand:

-

>SI_C186043_LTR-Caulimovirus_13

AATCTTGTTGGGTGTTTAGAGAACCGTTTTTTGAACCTCCTTCTTCTGCCATGTGTATCACACGAACATGATTTTTTGGACTTTGAATAATTAATTAACAGATCAGGTCGGGCACATATTCTGAATAATTGCTTTGATTTATCCATGAATGCCATCCAGAACTCCTTCTGTTTGCAGAGTTTGTCAAGGGTTCTAAATACATGCTGCTGAATTTGGCGAATCAAGATTTCTTCAATATTTTTACTTTGGTCTCTAATGTATAATTTTGTCTGTTGACTTAGATAGTCGTCTATGGACGAAAGATATACATGCTTTAGGCTTGGATTATTTAGGCCGTTGAGAGCATAATACCTTCTTGTTTGTCTTTCGAAGTGTTTCGCAAGATCTCTTTTCTTCAATGAACAAAACTTTGCGTCAAATAGTTCTTCTTGAAGTTTTTCTTTCTGGTGCGTAGGTGTACCAGTGTATTCTCTATGGATTTCGCCGAGAAGTAACAATATTGTTGTTTGATAGACTTGTTGTTGTCGGTATTCGCCTATAGAGTTCCACCATTCTTTGAGTGCTCCAGATAGCCTTGCCGTGAACTGTTGGATGACTGTATGTAGAGGGGATGAAATCGCTTCCAAATTCATCCACGCATGAAATTCGTTAAGACGATCATTCCATTTATCGAAAGAAATATCATCGAACGTAAATTCCATGATTTTTGAAGCGAACTGCCTCGTTTTTTATTTCTTGTCTAGGAGGAACATAATTCATCTCTTCATCGCTAGAATAGACTTCATTAATATCTGCTTCTTCCTTCGGGACATTTGATTATTCACCTATTGCAAATTTTCTTGGGAGAGACTCGAGTATCGTAGTCACTCGAACTTGTGTCTGAGATGTGACTGATCTTTGCAATTGGCCGTGTAGATGAAGTCTGGTGATTATCGTGAGTTTTTGTTCCTTGAACTGTTTCAGCCGTTTTTTTACCGAGAATTTCGAGCAGTTTGGCCATTGAGAATTCGATTATCCCAATGTTTTTTCCTTTCTTCTTTTTATCGTCAACGGATTCGTGACTGGAAGAAGATGTGATGGTTGGCCTTTTTGTTGGATGTACTCGAAATTTGGCTTCCTTTTGCCTCCGGGGTTTTGGTCGAGACGGTTTTGGCCTTGGATTAATGATTGGAGTCGAGCTATAACGAGATGTTAGCTTCATCCGATGATAGGAAGCCAGGCAATGGGCCTCTTGTAGTCTGGTTCTGATAGCTTGAGAGGAATCCTGGAGAGTGAGGTCCTTGGTACATTGGCATTCGTGAGGACATACTCCCAAAAGGGTCGAAGTATGTGTCTGCTTTCTTTTGATTATGAATCATGCTTTCCAGGCTCCTTTTGGAGGTCTATCAACTGGAGCTTCAAATTAACTGTTTCTGCTTATTTATTGCGGAATTGAGCAGTATCTACCAACATTTTTTTTGCCATTGTCATCATTTCATGATAAAGATTGGTAAGACGGTCGTGTATTTCCATAATTGAACTTTGGAGACTGAGTAGCCTTTTATCGTAGCCTTCCGTCAGTTTATCAACTTTGTAATTTATTCTGAAAAATATTGATTTTGGGCTAGAGAATTCTCTGTATGCCTGTTGAGAACCTTTTCTACTTGACTTAGTTGGTCATGATCAGAAGCATCAATGGCTTTGGGGAGAATTTTTGGAGTATGAGGGATGTTATCCCTAATGAAGTATTATGGTGGAGGGAAATTTTCTGGTGGATTCATCATCATAATTTGTATGTCTGGCTCTTTCTTTCGATCAGAGTATTGGACGATGAAATCGTACTT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C189621_LTR-Caulimovirus_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

522

Start:

763  

End:

1284

Strand:

+

>SI_C189621_LTR-Caulimovirus_14

ATTTCATAACACCCCTATAAATTTTGAACCAAAAATTATTTCAAGAATAATTGAACAAATTGATGAAATTATATTATTACAATTTGGATTAAAACGAGAACCACTACCACCTACAATTACTTCATATAATTCAAGAGCCTCTTTCTATGAATATTATTCTCACTCAAGAGCTTCTTTTTCTGTATACCGTACTGGTTAAGCAGTGCATATTCAGAAAAAATGCATAAACCAAAATATAAATTCGAGATAATTCAATTAAATTTAAAGCTCCTATAGGTGAACCTAAAAAGAAAACATATCCCATATACCCTACACCATCATATTTTTTTATTACATAATTGGCATAATCAAAGAATTTGAGATTGATAAAATATATTAAAGAAGATTTCTATTAAAAAATGAAGAAAAACGTAACTGGTATTTTATAATGTTCATTAAGCAAGAATAGTTTAACCTAAGAGAAAATTGGTATCATACATATTGTACGGTATTAAAGAATTAAATATTATATTTTTATATCGT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C192407_LTR-Caulimovirus_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

154

Start:

907  

End:

1060

Strand:

-

>SI_C192407_LTR-Caulimovirus_15

CGTGTTGATCATTGTATTGATAAACCATTCATGTTTATCTAAAATAATGGACAGAATCACGATTTATGACTGGAAAAGAGAGATTAAAATTTATGAAGATGTTTGAAGGTCTGGAAAATTTAAAACCTTAAAGAAACATTTTTAGATCGAGAAA

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C192559_LTR-Caulimovirus_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2216

Start:

1  

End:

2216

Strand:

+

>SI_C192559_LTR-Caulimovirus_16

GCCTTCACATCTCGATATGGTTCAACCCCGATAATAAATCCAAACCAAAACCGTCTCGGCCAAAAGCCCAAAGAAAAAAGGGAGCATAGTTTCAAGTACATCCAACAAAGAGGCCAACCATCACATCTTCTTCCAGTCACGAATCCGTTGACGATAAAAAGAAAAAAGGAAAAGACATTGGGATAATCGAAATCTCAATGGCCAATCTACTTGATACTCATGGAAAAACAACGGCCGAGCCAGTACAAGAAAAGAAAACTCATGTTGGTGATCAAGTTTCCATTTCACGACAAATTGCAAAAATTAGTCATCTCTCAGACTCGAGTTCTGGTGAATCAGATACTAGTTCTGAAGATGAATCTCTCCCAATGAAATTTGCAATAGGCGAAGGATCAAACGTCCCAAAAGAAGAACCAGACATTAATGAAGTCTATTCAAACGATGAAGAGATGAATTATGTTCCTCCGAGACAAGAATTACCAACAAGACAGTTTGCTTCAAAAATCATGGTATTTACGTTCGATGATATTCCTTTCGATAAATGGAATGATCGTCTTGACAAATTTCATGCATGGATGAACTCGGAAACAATTTCATCTCCTCTACATACGGTCATCCAACAATTCACGGCAAGATTATCTGGAGCACTCAAAGAATGGTGGAACTCTCTAGGAGAATATAGACAGAAACAAGTCTATCAAACGACCATACCATTGCTTCTAGGAAAAATTCACAGAGAATTCATTGGCACACCTACTCACCAGAAAGAAAAACTTCAAGAAGAATTATTTGCCACAAAATGTTGGTCACTGAAGAAAAGAGATCTTGCTAAATAGTTTGAAAGGCAAACAAGAAGATATTACGCTTTCAACGACCTCAATAATCCAAGCCTGAAGCATGTATATCTTTCGTCCATAGATGACTACCTAAGTCCACAGACGAAATTATACATTAGAGACCAGGGTCAAACTATTGAAGAAATCTCAATTGGTCAAATTCAGCAGCATGTTTTCAGGACTCTCGACAAACTCTGCAAACAGAAAAAATTCTGGATGGAATTCATGGTTAAATCAAAGCAATTATCCAGAATATGTGCTCAACCTGATCTCTCGATCAAATGTTCGAAGTCTAAAAAGTCATGTTCATATGATACACACAACAGAAGAAGCAAGTTCAAGAAATGGTCCTCAAAGCACCCAACAAGATTCCGACGCAAGAGATTCTTCTGCAAAAAACGAAGCTTCAAGAAGGCAACCAAATGCTTTCTCTGTCGAAAAGAATGACACTTTGCAAAGAACTGTCCAAACAGATCAACAAAAAAGAAGCAATATCTAATCAACTCGATCTCCGAGATAGCACCTGATATTGATCTCGAAGGTCACGATTTGGAGTCAGTATTGTCATATGACAGTGACGACAATGATGCCATTTACGGTTACTCGGATTACAAAAATTCCTCAGAATCATCCTCATCTGAAGAAGACGACGATTGTTGTTTCAAGATAACTCAGTTGCCCAAGCAAGACGAAATTCAAACTCCACATTTACCAGTGACGATCTTCGATCCCTCTTGAAAAGAAGACCCCGTTCACGCTGTTGCATTCATCGACACAGGAGCTCATACAACAATAATGAATCCAAGAATACTCTCGCCTTCGATGTGGTTGCCCCATCAACAAAAATTTCGAGTTGCAAATTATGGATCATTAACCATCAAACTCAAGTCAAAAACGATTACTATTGAGCTTTTCCCCGGATGCCAAATCACTACTGAAATTCTTGGATCCAATGCATCAGGAAAGGATTTGATACTAGGATGGAATGCCTATTACGCATTGAAAAAAAAATTCGATACATCAATTGAACCACGAGGGATCAAAATGGAAGAGTTTTTTCAAGGCCTTTAAAACCGTGCCACGATTATTCACAATTGAAGGTTTCGTCTCTGAAGAACTTATAAGGATAAAAGAAGAATTAACAACGACATCCTGTGCAGAATCCCACACAGATTTTCTCGGAAAATGCAAGAATCCATTATGGCTAAATCCGGAGTTCTTCGTCTCCTTGCCTTTCAAAGAAAATGTCCATACAACTCCAACAAAAGAAAGTCATGCTGGAATGCCACCTACTCTTCTGTAGCAAGCCAATGATGAGTGCGATCAACTAGCAAATCAAGGAATAGTCTCTACAACTAATTCACCTTGGACATGCAAAGC

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C195557_LTR-Caulimovirus_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

542

Start:

2208  

End:

2749

Strand:

+

>SI_C195557_LTR-Caulimovirus_17

AGAAAACAAAGAAAAAAATGACTGGTATTTTAAGACATTTACTAAGCAAGAAACCTTCAATTTACGAGAAAAAATGGTATGAAAATATGATAGAAAAAGAAGTAAACATCCCATTTTTTATATGGTTCAAAATCTATTCAATAAAAAATAATATTAATTATCCATTTAAACAATTAATACTAGTTCATCCTTAAGTCAATTATGGGAACAAGTTGATGGAAACAAAATCAAATCAATACATCCCCCACTAAAAAAATTAAAAATAAATATCCACAATAGACAAATTATAGCCACATCATTTAAAACAGGAGCCAATAGAAATGATAAAGATCAAATAATAATTCAAGATGTTAAATTAATATATGAACATAATAATTACCAAAGTCAGATTACACACAATTTCAAAACAAGTAGATCATATTGACAACAAATTAAGTAAAAATGATAATAATGTCACATTCCAACAAAGATCATTAGTTCACCATCTCTTTTCATCAACCACCACACCTATTTTCAAACCAATTACAAGGCAAGTTAAGTTT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C196879_LTR-Caulimovirus_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

200

Start:

1033  

End:

1232

Strand:

+

>SI_C196879_LTR-Caulimovirus_18

TCCATCGATTCTTAATTTGTTATTTATACTCTTCCAAAAAACAAAACCCGTTCTTCCTCTTCTAATATTAATTCTCTATATGAGATTGAATATGTTTCAGGAGATAAATTGTCTGAAACTACTCTCTCTCTGGTAAAACCATATGAATACTTTGCAAAAAAGTATAGCGCTTTTTCTGTGAAAGGCATTCGTGAACTCAT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C196879_LTR-Caulimovirus_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

918

Start:

1237  

End:

2154

Strand:

+

>SI_C196879_LTR-Caulimovirus_19

CCATCTTCAAACCGAAAGGTTATAAAGTATGTCCAGTCCAACAAATTCTCATTCTGCCAGCTTCTGACTACCGAAGAAGAACAATTCGTCTCACAAAACATTTTGGAGAACCTATTAAGGTTGTGGCAGAACATGGCTATACTCACCTCCACTTTGGTGTAATAAGAATTAGTTTGATCTTACATGCACAAAAAGGTCATCCAATTATAGCTTGCATAACTTTAATCGACTCTCGGTTAGAGTCATTACCGATAAGCTTGTATTGGAATAGTCCACACAACATTAAATGCATGAACCATGTTTATAACACTGTTTTCAAACTTTAATGTTTCGTTACAAGATCCACATCTTTTAAAGACGTTCAAGGTCCAGCTCGACTACCAGAGAACCTATGCAAAAAAAGATTGTGGTGGCTACCACATCACATCACCAGATTGTCTATTGCATCCAATATCATGTTCTTGATCTTGTGTTACCCTTACATGATGAAGCACTATATCTCGAAGTCACATCAATGTCTCAAGCACCCAACTCTATACAGATTTCCTGACAAATATATCACGAAGAATTACTGCTTCGACTACCAGAATCATGGGTGATAAGTTATGAACAGCTACATCAAGCTACCCAGACACCTATTCAGTTGTCAAAAGTCAACTTTCATTTCCGAAATGATGGAACAACCGAAATCAAGTTCGAAAACCTCGATCATCGTCATTCCGGAGACAACTGTCCACTCAATTTGCGATACAAATTGATGAACAAGACTTCAATGGTTCAATTAAGCAACAAGTTCTCAAACCGATTTCTTTTGGTCAAGATGGAGTGGTAGTCTATCCTTTCATAGATAAGGAGGTACATCAATACTTTTAAGTTTCCTCATGTACTGCTTGCTTAGAAGTACACTATGAATCAGAT

Sisymbrium irio (v1.0)

ID:

SI_C198645_LTR-Caulimovirus_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

943

Start:

1  

End:

943

Strand:

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>SI_C198645_LTR-Caulimovirus_20

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