ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
R1_LTR-Cassandra_1 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra32419189031919226+
R1_LTR-Cassandra_2 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33619193451919680+
R1_LTR-Cassandra_3 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34821676042167951+
R1_LTR-Cassandra_4 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34434879523488295+
R1_LTR-Cassandra_5 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra32240689604069281-
R1_LTR-Cassandra_6 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra32543004184300742+
R1_LTR-Cassandra_7 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34843014304301777+
R1_LTR-Cassandra_8 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31447814714781784+
R1_LTR-Cassandra_9 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31547819194782233+
R1_LTR-Cassandra_10 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34760193576019703-
R1_LTR-Cassandra_11 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34862503536250700-
R1_LTR-Cassandra_12 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra33763941486394484-
R1_LTR-Cassandra_13 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra29063946346394923-
R1_LTR-Cassandra_14 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra31685346978535012+
R1_LTR-Cassandra_15 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra29085351318535420+
R1_LTR-Cassandra_16 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra36285355278535888+
R1_LTR-Cassandra_17 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra34987570428757390-
R1_LTR-Cassandra_18 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra37187574968757866-
R1_LTR-Cassandra_19 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3251033949010339814-
R1_LTR-Cassandra_20 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3361065244610652781-

< 1 2 3 4 5 > Total 57


Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

324

Start:

1918903  

End:

1919226

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_1

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

1919345  

End:

1919680

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_2

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

348

Start:

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End:

2167951

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_3

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

344

Start:

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Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_4

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

322

Start:

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End:

4069281

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_5

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

325

Start:

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4300742

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_6

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

348

Start:

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4301777

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_7

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

314

Start:

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End:

4781784

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_8

AAAAAAATTAGATTCAACTACCAACATCACTAAAATGCGCATATCTTTTCCGACACAAATCTGTTTAAAATTCAGAAATTAAGTGTGTTTGAAGTGGAACAATAAAAAGATTAATGATCTATCAAAAAGTGATTCACGATAGCATACAAGTAAAGTCAAAGTACAGAGAAATGTTATGTGGTAATTGTAGGATCACTAAACAATAATTTCAAACTTTTAAAAAATTAACTAACCGACCGTCGGATGAGAAAGGACCGAAGGTCCAAGTGAACGTGCATAAGTGGTCCATTAATCATGACGGTCGGAACGCTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

315

Start:

4781919  

End:

4782233

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_9

TTAACAGAATCGATATGGTTAACTATATCTCCAAAATGCGTTAACTTTTTCATCACACATCTGTTTCAAATTCTAGAGTTAAGTGTAGTTTAATTAGGTAATGGAAGAATATGTAATTTATCGTAAAGTGATTCGCAATAACATGCGAGTGAAATCGAAGCACGTGAAAAAAGTCATATGGTGATTGTAAAAACAGTAAACAATAGTTTTGAGTCTCTGAAAAAATTAACGAATTGGCAGTCGAATGAAATGAGACTCATAGACCAAGTAAGCGGACGTGGATGGTTCATTAATCGTAGACGATAGAATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

347

Start:

6019357  

End:

6019703

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_10

TGTAACGCCCGACCCGCCCATGGCAAATGAGCCATCCACGCCGGCTCTCTCGGTCCGTGGATCCCATTCCATCCCACGGTCGGTCGTTAATTTTCTAAGGCTCGAAATTATTATTTACTGACCCTACAATCACCACCCGACCTTTCCCTGTGCTTTGGCCTCACTTACACGGTATCGCGAATCACTTTCCGATAGGTCACCCATCATTTCACTACTTCAGCTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGATAAGTCAACTTTGGTGACATAGGTAGTCAAATCAATTCTTTTAAGCATTTCCGTATATCACAATTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

348

Start:

6250353  

End:

6250700

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_11

TGTAACGCTCCGACCCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGCTCGCTCGGCTCGTGGGCCCCATCCCATACGACGGTCGATCGTTAATTTTCCAAGGCTCGAAATCATCGTTTACTGACCCTGCAATTACCACATGACATTTCCCCGTGTTTTGGCCTCACTCACACGGTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTTTACTACTCTAGCCCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTAAACGGATATGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTAGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCTTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

337

Start:

6394148  

End:

6394484

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_12

TAACATTCCGACCACTAGTGGGTTTACTACATTTGATCACTCGGACTGTAGTCCTATTTTTTGTGACTACTGGTGTGTTAGTTTCTGAGAGTTTTGAAAGTTTTATTACTGATTTTACATACAATTACATGATTTTCCTTATTTTGAATTCACTTACACGATATCATGAATTACTTTTCGATAGATCATCTATCATTTCATTAATCCAGTTCAATCACGCATAACTCTGGATTTTTAAAAAGATGCGTGACAAAAAAATAGATAAATGCACTTTGATAATACTTATAGTCAAATCAATTTTTAAGTATTTCCATAAACCACAAATTGGGATGTTATA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

290

Start:

6394634  

End:

6394923

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_13

CCTACATCCGCTCCCTCGGACTGTGGTCCATTCCATGCAACGGATAATGCGTTAATGTAGAAGCTCAAAAGTTTTGTTCACTAACCTTACAATCACCGCATTATCTTTTCCGTGTTTTGATCTCATTCACACGATATCGCGAAACAATTCCGATAAATTATTCATGTTTTCACTACTCCAACCCAAAAACGCTTAAATCTGAAGTTTAAATTGATGTGTGACCAAAAAATTAAGTGCACTTTAATGACATAAATAGTTAAATCAGTTATTTTAAGTTTTTCATATACCAC

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

316

Start:

8534697  

End:

8535012

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_14

TTTAAAGAGAATTGATTTGGCTATCTATGTCATCAAAATTGACTTACATTTTTCGTCACACATCCGTTTAGAATTCCAGAGTCAACCGAGTTTGGACTGGAGTAGTGAAAGGATATATGACATATCGGAAAATAATTTTCGATACCGTGCGAATGAGGCCAAAACACGTGGAAATGTCATGTGATAATTGCAGGGTCAGTAAATAATGATTTCGAATTTTTGAAAAAATTAACGGATTGACCGTCGGATCGGATGGGCTCACGGGCCGAGAAAACGGCGTGGGTGGCCCATTAACCGTTGGCGGTCGGGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

290

Start:

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End:

8535420

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_15

GTTGTGATATGTCAAAAGGTTTAAAAGAATTGATTTAGCTATCTAAGTCACCAATGTTGACTTACCTTCATGCATGGATTGGAGTAATGAAAGATGGATGACCTATCAGAAAGTGATTCGCGATACCGTGCGAGTGAGGACAAACTATGAGGAAAGGTCGGGTGGAGATTACAGGATCAGTAACAATGAATTTGAGCTTTGGAAAATTAACGGACCGACCTTGGATGGGGCCCACTGGCCGAGAGAGCGGTCGTGGCGGCCTATTAGCCATGGGCGATCGGAGCGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

362

Start:

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End:

8535888

Strand:

+

>R1_LTR-Cassandra_16

TGTAACATCCCGAGTTGTGATATATGAAAAAGACTTAAGATAATTGATTTGACTATCTATGTCATCAAAGTTGATTTACATTTTCCGTCACTCATTCGTTTAGAACTCCAGAGTAAAGCATGTTTGGGTTGGAGTACTGAAAGGATGGGTGATCTATCGGAAAGTAATTTGTGATACCGTACGAGTGAAGCCGAAACCAAAACCATATAGGAAAAAATTATATGGTGATTGTAAAGTCAGTAAACAATGATTTTGAGTTTTTGAAAAAAAATTAATGGATTGACCATCAGATATGATGGGACCCATAGACCAAGAGAGCAGATGTAAGTGGCCCATTAACCATGGACGGCCTATACGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

349

Start:

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8757390

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_17

TGTAACGCCCCGACCCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGTTCTCTCGGCCCGTGGGCCCCATCCCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTTCCCGTGCTTTGACCTCACTCGCATGCTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTTTCAGGATGTATTCCGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

371

Start:

8757496  

End:

8757866

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_18

TGTAACGCCCCGACCCGCCCACGGCTAATGGGCCACCCACGCCCGTTCTCTCGGCCCGTGCCCATCCTGAGNCGCCAACTCAACTCAAACTTCATCCGACGGTCGGTCGTTAATTTTTCCAAGGCTCGAAATCATTGTTTACTGACCCTGCAATCACCACCCGACCTTTTCCCGTGCTTTGACCTCACTCGCATGCTATCGCGAATCACTTCCCGATAGGTCACCCATCCTTCCACTACTCCAGCTCAAGCACGCTTAACTCTGGAGTTCTTTCAGGATGTATTCCGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTCTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAACTCGGGATGTTACA

Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

325

Start:

10339490  

End:

10339814

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_19

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Raphanus sativus (v1.0)

ID:

R1_LTR-Cassandra_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

336

Start:

10652446  

End:

10652781

Strand:

-

>R1_LTR-Cassandra_20

TGTAACATCTCGACCGTCCACGGTTAATGGGTCACCCACGCCCATTCTCTCGGCCAGTGGATCTCATCCCACCCGACGGTTGGTCGTTAATTTTTCCAAAGACTCGAAATCATTGTCTACTGACCCTACAATCACCACCCGACCTTTTCCCGTGCTTTGGCCTCACTTACACGATATCGCGAATCACTTTCCGATAGGCCACTCATCCTTTCACTATTCCAGCCTAAGTACACTTAATTCTGGAGTTCTAAACGGATGTGTGACGGAAAAGGTAAGTCAACTTTGGTGATATAGGTAGCCAAATCAATTTTCTTAAGCCTTTTCACATATCACAAC