ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
LA_C56601_LTR_1 RetrotransposonsLTRLTR11220412152+
LA_C11335_LTR_2 RetrotransposonsLTRLTR103125227+
LA_C11939_LTR_3 RetrotransposonsLTRLTR532126657+
LA_C12445_LTR_4 RetrotransposonsLTRLTR3641364+
LA_C15709_LTR_5 RetrotransposonsLTRLTR46677542+
LA_C16637_LTR_6 RetrotransposonsLTRLTR447501947-
LA_C1927_LTR_7 RetrotransposonsLTRLTR1771177-
LA_C20001_LTR_8 RetrotransposonsLTRLTR2528731124-
LA_C22325_LTR_9 RetrotransposonsLTRLTR3497031051-
LA_C22399_LTR_10 RetrotransposonsLTRLTR53365597-
LA_C23059_LTR_11 RetrotransposonsLTRLTR182429610+
LA_C23877_LTR_12 RetrotransposonsLTRLTR432290721+
LA_C23891_LTR_13 RetrotransposonsLTRLTR2211221+
LA_C24327_LTR_14 RetrotransposonsLTRLTR87461547+
LA_C24685_LTR_15 RetrotransposonsLTRLTR6057981402-
LA_C24729_LTR_16 RetrotransposonsLTRLTR211454664+
LA_C26213_LTR_17 RetrotransposonsLTRLTR616361976-
LA_C27119_LTR_18 RetrotransposonsLTRLTR9214721563+
LA_C27301_LTR_19 RetrotransposonsLTRLTR34910181366-
LA_C27751_LTR_20 RetrotransposonsLTRLTR53857594+

< 1 2 3 4 5 > Total 7


Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C56601_LTR_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

112

Start:

2041  

End:

2152

Strand:

+

>LA_C56601_LTR_1

CATATGTTGTGGAACGTTTCCCTTGCCTTGTAAGTTAAAGTTATGGATTTTAATAATGTGTCCATACTTATTAAACGTGTAACCAGATAAAGCTGAAGATGTTCATAAACCG

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C11335_LTR_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

103

Start:

125  

End:

227

Strand:

+

>LA_C11335_LTR_2

ACCACTTGATTTTTTCTGTAAGTGTCAAAAAAAGAATAGGTAGTTTCGAAAGAATCAAGGAGTTTGAAGTGGTAATGTTCACCACAGAATTAGAAAGCACCAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C11939_LTR_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

532

Start:

126  

End:

657

Strand:

+

>LA_C11939_LTR_3

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Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C12445_LTR_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

364

Start:

1  

End:

364

Strand:

+

>LA_C12445_LTR_4

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Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C15709_LTR_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

466

Start:

77  

End:

542

Strand:

+

>LA_C15709_LTR_5

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Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C16637_LTR_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

447

Start:

501  

End:

947

Strand:

-

>LA_C16637_LTR_6

AACTAAGTGCCATATCGAGTCGATATAACTACGTGACTTCACTAAGTCACGCATGCTATAAAATATACGCTAGACATGGAGAATTACGGAACCCCAAAATGCACCACGGCCACCATAGTATCTAAGAACGACTAGCATATCAATATAAAAAGATACTCACCGTGATCCGCTGAGTCCCGCTCCTCTCTCCGACGTCTACGCCTCTGATACTCACTCCTAGTGCGGTCATATCTCACCTCAGCAGTAATGCCCCTCGAACTCGAGTTAATCTCGGCTAGTTGAGGACAGTCTCTCCGAATATGTCCCACCTCCTGGCAGTAATAACACACTGAATCTGTCCTCGGGCACTCTGCCACAACATGTCCTCTAACACCGCACCTATAGCAGCGTATCATCGTCTCGGCCGCTCTGGAGGTACCACCCTGCTCATGCCTCGGCTCGTCCTGA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C1927_LTR_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

177

Start:

1  

End:

177

Strand:

-

>LA_C1927_LTR_7

ACATATAAACTAGACATAGAGAATTACGGAACTCCAGAATCCACAACAGTTCACCATAGTATCTAAAACAACCAAGTATATCAACTTACAAAGATACTCACCGTGCTCCACTGAGTCCCGCTCCTCTCTCTGGCGTCTACGTCCATGATAGTCACTCCCAGCACGGTCGTGTCTAGC

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C20001_LTR_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

252

Start:

873  

End:

1124

Strand:

-

>LA_C20001_LTR_8

ACTAAGTGCCAACTCGAGTCGATATAACTACGTGACTCCACTAAGGCACGCCTGCTATAAAATATACGCTAGACATGGAAAATTACGGAACCCCAAAATCAACCACGGCCATTATAGTGTCTAAAAACGACTAACATATCAATATAAAAAGATACTCACCATGATCCGCGGTCATGTCTCACCTCAGCAGTAATGCCCCTCGAACTCGAGTCAATCACGGCTAGTCGAGGACAGTCTCTCCAAATGTGTCCC

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C22325_LTR_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

349

Start:

703  

End:

1051

Strand:

-

>LA_C22325_LTR_9

AACCAAGTGCCCTCTCAAGTCGATACAACCACATGACTCCACTAAGTCACGCCTACTATAACATATATATATGAGACATGGAGAATTACGGAACTCCAGAATCCACCACAGTCCAACGTAGTATCTAAAACAACTATGTGTATCAACATAAAAAGATACTCACCGTGGTCCGCTGCGTCTCGCTCTTCTCTCCGACGTCTACGCCTCTGATACTCACTCCCGGTGTGGTCACGCCTAACCCCAGCAGCAGTGCTCCTCAATCTAGAGTCCAACCCGACTAGCTGAGGACAATCTCTCCGAATATGTCCCGTCTCTTGGCAGTAATAACACACCGGATCTGTCCTCCGGC

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C22399_LTR_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

533

Start:

65  

End:

597

Strand:

-

>LA_C22399_LTR_10

AACTAAGTGCCCTCTCGAGTCGTTATATCTACGTGACTCAACTAAGTCACGCCTGCTATAAAATATACGCTAGACATGGAGAATTACGGAACCCCATAATCCACCACGGCCACCATAGTATCTAAAGCGACTAACATATCAATATGAAAAGATACTCACCGTGATCTGCTGAGTCTCGCTCCTCTCTCCGACGTCTACGCCCCTGATAATCACTCCCAGTGCGGTCGTGTCTCACCTCAGCAGTAATGCCCCTCGAACTCGAGTCAATCTCGGCTAGTCGAGGACAGTCTCTCCGAATGTGTCCCACCTCCTGGAAGTAATAACACACCGAATCCGTCCTCGGGCACTCTGCCACCACATGTCCTCTAACACCGCACCTATAGCAGCGTATCATCGTCTCGGCCGCTCTGGAGGTACTACCCTGCTCATGCCTTGGGTCGTCCTGAGGATACCTCCTATCCTCCCAACCCAAAACCTCATATCTCTCCGCAGGATCAATCCTCCCTGGTCCCATACCCTGTGGCGCGGTCTGT

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C23059_LTR_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

182

Start:

429  

End:

610

Strand:

+

>LA_C23059_LTR_11

AGTGAGTATCAGGGACGTAGACGTCGGACAGAGGAGAGGGACTCAGCGAACCACGGTGAGTATATTTTTTATGTTTATATGCATAGTTGTTTCAGATACTATGGTGGACTGTGGTGGATTCTGGAGTTCCTCAATTCTCCATGTCTAGCTTATATGTTATAGTAGGTGTGACTTAGTGGAGT

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C23877_LTR_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

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Start:

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End:

721

Strand:

+

>LA_C23877_LTR_12

AGCAGGGTGGTACCTCTAGGGTTACAAGATCGAGGATACGTTGTTATAGGTGCGGTATGAGAGGGCATATGGTACCAGAGTGCACGAGGACATACCAGTTATGTTATCATTGCCAGGAGGCAGGGCATGTTCAGAGGGAATGTCCTCGACTAGCCGGGATTGGTTTGAGTTCTAGGGGCACTGCTTCCAAGGCTAGATATGACCTCATTGGGAGTGAGTATCACAGGCATAGACGTTGGAGAGATGAGCGGGAGTTGGTAGACCGTGGTTAGTATCTTGTTTGATGTAATGATACATTATTGGTTTCAGATACTATGATTGACTATGACGGATATCGGAGTTCCGTAATTCACAATGTCTAGTGCTGGATGATATAATAGGTGTGACTTTGTAGAGTTACATGTTCGTATCGGCTCGAGAGGGCACTTAGTT

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C23891_LTR_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

221

Start:

1  

End:

221

Strand:

+

>LA_C23891_LTR_13

GAAACAAATTTCCAAGTGCAAGTAAGTAACTCCTATGAGTTGATTAATTATTGGAAATTTTTTACACAAACTCGAAGTCTTCAGAAGTTTTGTTTGAGTATCTATGTTCCAGATTTAAAACATTTGATTTTTCCTGTAAGTGTCAAAGAAAGAATAGGTAGTTTAGAAAGCATCAAAGAGTTTGAAGTGGTCATGTTCACCACAGAATTAGAAAGCACCAA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C24327_LTR_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

87

Start:

461  

End:

547

Strand:

+

>LA_C24327_LTR_14

GAAGTCTTAAGAGTGCTGGTATAAGCCTTTATTATCAAGATTTAATGCACTTGATTTTCCCTGTGAGTGTCAAAGAAAGCATAGGTA

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C24685_LTR_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

605

Start:

798  

End:

1402

Strand:

-

>LA_C24685_LTR_15

TTGGTGCTTTCTAATTCTTTGGTGAACATGACCACTTCAAACTCTTTGACGCTTTCTAAACTACATATTCTTTCTTTGACACTTCAGGAAAAATCAAGTGATTTAAATCTAGAACATAGATACTCAAAAAAAACTTCTGAAGACTTCGAGTTTGTGTAAGAAATTTCCAATAATTAATCAACTCATAAGAGTTACTTACTTGCTCTTGGAAATTTGTTTCTGAATGATGTGTCCTAGATTTTAATCTTCTCTCAGCTTCTTTAAATTTATGGTTCATGATATAATCTGCATTATCAATCTTTGGCATAGACAAGTGCATTATACTAGAACATGAAATTTCTAAACATTCTTTAATACCACTTGTATCCGGTTTTGAATTCATCAAAGACGACTTATTTAATATCCTTGTCGGACATGTAGCAGCAAAATGACCTATTTGATGGCATCTATAGCATATTATTTGGAGAGATTTATTAGTTGTTGAAGACTTACATTGATGTTTCTTACTGTGAGGCTCAACTATTGCTGTTGAGCTTTGTTTAGGTCCTACGGCTGTTTGTTCCTGATTCTCAACATGCACTTGAGTGATTACTGTGGCCTCAGTC

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C24729_LTR_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

211

Start:

454  

End:

664

Strand:

+

>LA_C24729_LTR_16

GAGTATCTGGGGTGTAGACATCGGAGAGAGGAGAGGAACTCAGAAGACTACGGTGAGTATCTTTTTATATTGATATGGTAGTCGTTTTAGATACTATGGTGGCCGTGGTGGATTCTGGAGTTCCATAATTCTCCATGTCTAGCGTATATTTTATAGCAGGCTTGACTTAGGGGAGTCACGTAGATATATCGACTCGAGATGGCACTTAGTT

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C26213_LTR_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

616

Start:

361  

End:

976

Strand:

-

>LA_C26213_LTR_17

TTGGTGCTTTCTAATTCTGCGGTGAACATAACCACTTCAATCTTATTGATGTTTTCTAAACTATCTATTCTTTCTTTGACACTTACAGGAAAAATCAAGTGATTTAAATCTGGAATATAGATACCAAAACAAAACTTCTGAAGACTTCGAGTTTGTGTAAGCAATTTCCAATAACTAATCAACTCATAGGAGTTACTTACTTGCACTTGGAAATTTGTTTCTGAATGATGTGTCCTATATTTTAGTCTTCTCAGCTTCTTTAAATTTATGCCCCATGATATAATCTGCATTATCAACCTTTGGCATAGACAAGTGCATTATACTAGAACATGAAATTTCTAAACATTCTTTAATACCACTTGTATCCGGTTTTGAATTCATCAAAGACGACTTACTGAATATCCTTGTTGGACATGTAGCAACAAAATGAACTCTTTGATGGCATCTATAGCATATTATTTGAAGAGATATATTAGTTGTTGAAGACTTACATTGATGTTTCTTACTGTGAGGCTCAAGTGTTGCTGTTGAGCTTTGTATAGGTACTACGGCTGTTTGTTCCTGATTCTCAACATGTACTTGAGTGATTACTGTGGCCTCAGTCCTCTTACTTGGT

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C27119_LTR_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

92

Start:

1472  

End:

1563

Strand:

+

>LA_C27119_LTR_18

ACCAAGTAAGAGGACTGAGGTCACAGTAATCACTCAAGTACATGTTGAGAATCAGGAACAAACAGCCGTAGTACCTAAACAAAGCTCAACAG

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C27301_LTR_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

349

Start:

1018  

End:

1366

Strand:

-

>LA_C27301_LTR_19

AACCAAGTGAACTCTCGAGTCGATACAACTACATGACTCCACTAAGTCACGTCTACTATAACATATATATACTAGACATGGAGAATTACCGAACTCCAGAATCTACCACAGTCCACCATAGTATCTAAATTAACTATGTGTATCAACATAAAAAGATACTCACCGTGGTCCGCTGCGTCTCGCTCTTCTCTCCGACGTCTACGCCTCTGATACTCACTCCCGGTGTGGTCACGCCTAACCCCAGCAGCAGTGCTCCTCAATCTAGAGTCCAACCCGACTAGCTGAGGACAATCTCTCCGAATATGTCCCGTCTCTTGGCAGTAATAACACACCGGATCTGTCCTCCGGC

Leavenworthia alabamica (v1.0)

ID:

LA_C27751_LTR_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

538

Start:

57  

End:

594

Strand:

+

>LA_C27751_LTR_20

ACAGGCCGCGCCACAGGTTTTGGGACCAGGAAGGACTGACCCTGCAAGTAGATATGGGGATCTGGATTGGAAGGATATGATGTATCCTCATGATGAGCCGAGGCATGAGCGGGTTGGTACCTTCGGGGCAGTTAAGACGATGATACGTTGCTACAGGTGCAGCGTTAGAGGGCACATAGCAGCCAAGTGCCTGGGGGTAGACCGAGTATGTTTTTATTGCCAAGAGACGGGACATGTTCGGAGAGATTGTCCTCAACTAGCCAGGATTGTTTCGAGTTCAAGGAGCATGGCTGTTGAGGCCAGACACGACCGCACTGGGAGTGAGTATCAGGGACGTAAACGTCAAAGGGAAGAGTGGGAGTCAGCAGACTACGGTGAGTATCGCATTTATGTTGATGTACATGGTTATTTTAGATACTATGGTGGACTATGGTGGATCCGGGAGTTTCATAATTCACCATGTCTAGTATATATATGTTATAGTAGGCGTGACTTAGTGGAGTCATGTGGTTGTATCGACTTGAGAAGGCACTTGGTT