ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig00028_LTR-ERV1_1 RetrotransposonsLTRLTR-ERV18637333818+
Contig00725_LTR-ERV1_2 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11516223762387+
Contig00894_LTR-ERV1_3 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11341217912312-
Contig01067_LTR-ERV1_4 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1863596136046+
Lachesis_group0_LTR-ERV1_5 RetrotransposonsLTRLTR-ERV112095725449572663+
Lachesis_group0_LTR-ERV1_6 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11171569875215698868-
Lachesis_group0_LTR-ERV1_7 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1872694451126944597-
Lachesis_group0_LTR-ERV1_8 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11513336005933360209-
Lachesis_group1_LTR-ERV1_9 RetrotransposonsLTRLTR-ERV18566951436695227+
Lachesis_group1_LTR-ERV1_10 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1891309301413093102-
Lachesis_group1_LTR-ERV1_11 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11241310012413100247-
Lachesis_group1_LTR-ERV1_12 RetrotransposonsLTRLTR-ERV12171400094914001165-
Lachesis_group1_LTR-ERV1_13 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11021410211214102213+
Lachesis_group1_LTR-ERV1_14 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1882776703027767117+
Lachesis_group1_LTR-ERV1_15 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1903117390131173990+
Lachesis_group2_LTR-ERV1_16 RetrotransposonsLTRLTR-ERV18377519467752028-
Lachesis_group2_LTR-ERV1_17 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1961498460214984697-
Lachesis_group2_LTR-ERV1_18 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1881997139319971480-
Lachesis_group2_LTR-ERV1_19 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11103055441730554526-
Lachesis_group2_LTR-ERV1_20 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1993323381133233909-

< 1 2 > Total 2


Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00028_LTR-ERV1_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

86

Start:

3733  

End:

3818

Strand:

+

>Contig00028_LTR-ERV1_1

GAATGCATATTTAGATTCATACATCTGCATTCATACGTACACATACATACTGTGTATATTCATCATATGTGCATACATACTACATA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00725_LTR-ERV1_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

151

Start:

62237  

End:

62387

Strand:

+

>Contig00725_LTR-ERV1_2

AACTATGGAGTAAAAAGAAACGTATAGACCTTTCTTGACGTAAACAGATACGTATACATATGTGGGATCATGTGTGTATATATATATATACCTATATACTGTGTAAACTATATGTATGCATAGATACATACATACATATATCTATATAAAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00894_LTR-ERV1_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

134

Start:

12179  

End:

12312

Strand:

-

>Contig00894_LTR-ERV1_3

TGTCTGTCGGTTTGATGATCAATCAGTCTATATGCATATGCATATCAGCATATATATATATATATTATAGATGTATGTAAGTGTATGTACATGTGTTTTGATCCCTACTATGCTTCTTGTCGTTTCTTATATGT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig01067_LTR-ERV1_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

86

Start:

35961  

End:

36046

Strand:

+

>Contig01067_LTR-ERV1_4

GAATGCATATTTAGATTCATACATCTGCATTCATACGTACACATACATACTGTGTATATTCATCATATGTGCATACATACTACATA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group0_LTR-ERV1_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

120

Start:

9572544  

End:

9572663

Strand:

+

>Lachesis_group0_LTR-ERV1_5

ACATACATGATACATACACACGCGCGCACACACACACACACACACATATATATATATATATTATATATATATAATCTGTCTTTGAATAGACGTGCAAGTAATTATTTACAATTATGTGAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group0_LTR-ERV1_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

117

Start:

15698752  

End:

15698868

Strand:

-

>Lachesis_group0_LTR-ERV1_6

TATGCAGGAATATGAATATGAATGCATGTATGCATGAATATGAATGCATGTATGCATGAATATGTATGCATGAATATGAATGCATGTATGCATGAATATGTATGTATATATGTATAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group0_LTR-ERV1_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

87

Start:

26944511  

End:

26944597

Strand:

-

>Lachesis_group0_LTR-ERV1_7

GCTTCTACCCACTTGGAGACATAGTCTACAGCAACGAGAATGTACTTATTCCCATGAGAGGAGGGGAAAGGACCCATGAAATCAATT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group0_LTR-ERV1_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

151

Start:

33360059  

End:

33360209

Strand:

-

>Lachesis_group0_LTR-ERV1_8

ATTTATATAGATATATGTATGTATGTATCTATGCATACATATAGTTTACACAGTATATAGGTATATATATATATACACACATGATCCCACATATGTATACGTATCTGTTTACGTCAAGAAAGGTCTATACGTTTCTTTTTACTCCATAGTT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

85

Start:

6695143  

End:

6695227

Strand:

+

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_9

TCATTGCATGATGTAGATATTAGTTTAAAAACAACCAACGATACGGGTTGAGGTCACCAAGTATACAATTCGGTAGAAGATCACA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

89

Start:

13093014  

End:

13093102

Strand:

-

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_10

TGAATGTATGTATGCATGAATGAATGTATGTATGTATGCATGAATGAATGTATGTATGCATGAATGTATGTATGCATGAATGAATGCAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

124

Start:

13100124  

End:

13100247

Strand:

-

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_11

TGCATTCTTATTGTATATATGCATGTATGTATATATGTATATATGCATGTATGTATAGATGCATGTATGTATATATGCATGTATGTATATATGCATGTATGTATAGATGCATGTATGTATATAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

217

Start:

14000949  

End:

14001165

Strand:

-

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_12

ATACATATATGCATTCACACATGCATACATATATGCATTCACACATGCATACATACATGTATTCATACATGTGTATATATGCATTCATACATACATGTATTCATACATGTGTATATATGCATTCATACATACATATATGCATACATATGTATAGTAAGCATATATATATATATATTACTTGCAACATGCATATTCGTTATTTATTTACTTCCTTATT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

102

Start:

14102112  

End:

14102213

Strand:

+

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_13

ATATACGTCTACTTATATATATATATGTATATATATATATATTTAAAATATACAGCAAATATATGTCTACTTAAATATATACATATATATATATATATAGAT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

88

Start:

27767030  

End:

27767117

Strand:

+

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_14

GAATGCATATTTAGATTCATACATCTGCATTCATACCTACACATACATACATGTGTACATTCATCATTATGTGCATACATACTACATA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group1_LTR-ERV1_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

90

Start:

31173901  

End:

31173990

Strand:

+

>Lachesis_group1_LTR-ERV1_15

CATACTTATTCTTGCATGCATAAATGCATACATTCATCAAATGCATACATCATGACATTCATAAAATGCATACATTCATACATACCTACA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group2_LTR-ERV1_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

83

Start:

7751946  

End:

7752028

Strand:

-

>Lachesis_group2_LTR-ERV1_16

GCATATATGCAAGTGCATATACGCAAGTAAACAAACATATACGTACACATTACATTAGTATGTATGTATGTATGTATGTATCC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group2_LTR-ERV1_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

96

Start:

14984602  

End:

14984697

Strand:

-

>Lachesis_group2_LTR-ERV1_17

GTAATGTATGCTTTTATGTATGTATGAATGTATGTACTATGTAGCATGAATGTATGTATGTATGTATGAACGTATGTATGCATGAATGAATGCGTG

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group2_LTR-ERV1_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

88

Start:

19971393  

End:

19971480

Strand:

-

>Lachesis_group2_LTR-ERV1_18

TATGTAGTATGTATGCACATATTGATGAATATACACATGTATGTATGTGTACGTATGAATGCAGATGTATGAATCTAAATATGCATTC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group2_LTR-ERV1_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

110

Start:

30554417  

End:

30554526

Strand:

-

>Lachesis_group2_LTR-ERV1_19

CATATATATATGCACAAATATGTAGACATATACATTTAAACATACATTGGTATTACCATAAATGCCAATATGTGTATGTATATACATGTCTAACTATCTACATACACACA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Lachesis_group2_LTR-ERV1_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

99

Start:

33233811  

End:

33233909

Strand:

-

>Lachesis_group2_LTR-ERV1_20

GTAAATATGCACGAATGTATGTAATGTACGCATGCATGCATAATGTATAAACACATGAATATACGAACACATGAACGTATGCGACATGTTCAGATATCA