ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig00008_LTR-Caulimovirus_1 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2752084921123+
Contig00022_LTR-Caulimovirus_2 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2752353323807-
Contig00152_LTR-Caulimovirus_3 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus41115501960+
Contig00152_LTR-Caulimovirus_4 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus22919532181+
Contig00152_LTR-Caulimovirus_5 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus49934363934-
Contig00152_LTR-Caulimovirus_6 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2611546415724-
Contig00152_LTR-Caulimovirus_7 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus17061654618251-
Contig00152_LTR-Caulimovirus_8 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus6511831418964-
Contig00152_LTR-Caulimovirus_9 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus14481946820915+
Contig00152_LTR-Caulimovirus_10 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1752092621100-
Contig00152_LTR-Caulimovirus_11 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus7902110721896-
Contig00190_LTR-Caulimovirus_12 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus12763666492+
Contig00190_LTR-Caulimovirus_13 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3239697710215+
Contig00190_LTR-Caulimovirus_14 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus33241028613609+
Contig00444_LTR-Caulimovirus_15 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus32441470317946+
Contig00444_LTR-Caulimovirus_16 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus33191801521333+
Contig00444_LTR-Caulimovirus_17 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9482229423241+
Contig00444_LTR-Caulimovirus_18 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus8872420725093+
Contig00573_LTR-Caulimovirus_19 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus106177408800+
Contig00573_LTR-Caulimovirus_20 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus53387989330+

< 1 2 3 4 5 > Total 17


Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00008_LTR-Caulimovirus_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

275

Start:

20849  

End:

21123

Strand:

+

>Contig00008_LTR-Caulimovirus_1

GTCAACACGATCACCCATCTTAGCGTCCATAGCCTAAGATAATCGTATTAGAGCCAATACTTGCAGAAATAAATTGAATGAATCATTATTCATGATAAATTATTTTTGAATGTTATGGAAAACAAATCCTAGTCATGGCTAATTCCAGCCTTCAAATAATTGATTCCCAATTTGCAATATCTACTTTACCCAAAAGCAAAAGTCGTTCCTCAACATCTCATATAAACTCTATTTACCAAATCGAATATGTTTCTGAGAATTGATCTCCAGGAACA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00022_LTR-Caulimovirus_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

275

Start:

23533  

End:

23807

Strand:

-

>Contig00022_LTR-Caulimovirus_2

TGTTCCTGGAGATCAATTCTCAGAAACATATTCGATTTGGTAAATAGAGTTTATATGAGATGTTGAGGAACGACTTTTGCTTTTGGGTAAAGTAGATATTGCAAATTGGGAATCAATTATTTGAAGGCTGGAATTAGCCATGACTAGGATTTGTTTTCCATAACATTCAAAAATAATTTATCATGAATAATGATTCATTCAATTTATTTCTGCAAGTATTGGCTCTAATACGATTATCTTAGGCTATGGACGCTAAGATGGGTGATCGTGTTGAC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

411

Start:

1550  

End:

1960

Strand:

+

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_3

GGTGTTCCAGGCAGCAAGTCTTTGAGGAGGCAGTAAGACCGTTGGCAAGCCCGACCTAGAACTGGTTAGTATCCCTTCTAGTATGTGTTTAAATCTAGATTAGTCATGGCGTCATCGTTTATAAAACTTTTTAAATCTAAACATGCAGTATCTACTTCTAGCACAACAATTAATTCGAAAGAAATAATGTCTAAAATAACCTCTTTTAACAATGAAATATCAAGAAATCAATTACCAAATATTAATCCAGATAATATATACCAAATCGGTAATTTTGACTTTAAAACAGCTTACGTAATAAAAGAACATGAACAAAAAATATATCTTCAAAATTAATTTGAAGAAATTAAACTATTATCATCAATTGCTTTAGAAAAATATAAAAAAAAAGGATTTAATTACATTCATTTC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

229

Start:

1953  

End:

2181

Strand:

+

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_4

TTCATTTCACATCGACATGGGGATCCCATGGATATTATCCTGGCATTTTTATCTCATCATAGCTTTAGCAGATATGCTTTACTCCTTAGTCAAAGAATACAGAATAAAATGGTGGGATATATAACCTAGACCAATGCTCCCTTACCAATTTTCAAAAATACTTTCAAATAACCCAACAACTTACCAACGCCATCTGAGCAGTATCCAAATCTATACCACTTCTTACTCC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

499

Start:

3436  

End:

3934

Strand:

-

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_5

ATAAATTTGGATACTGCTCGGATGGCGTTGGTAAGTTGTTGGGTTATGTGGAAGTATTTTTGAATACTGGTAAGGGAACATTGGTCTAGGTTATACTTATCCCACCATTTTATTCTGTATTCTTTGACTAAGGAGTAAGGCATATCCGCTAAACTAAGATGAGGTTAAAATGCCAGGATAATATCCAAGGGATCCCCATGTCGATATGAAAGGATATTTTGTTTAACGGACCTACCGGTTGCGGTGGTATTTGTTTAAGGTAATAAGGTAACGATGTTTTGCATACCTCTTGTGGATAAATTTGGTCCGATGGTCCAAACCAGTACCACCATTCATGGAACCATCCATGTATTTTCTTGGGACATTTTTGGTCAAAGGAAATAAACTATGAATGGGTATACGGTCAAAGGTAGAAGGTGTTGAAGAAGGCATTTTTGTAATCAACATAAGAATAACCTTGAATATGGTATCCGGGTTTAGAAAAGGGTTTGGTAGTATG

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

261

Start:

15464  

End:

15724

Strand:

-

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_6

CAACACATATGTTGTTTTCTTTCCCAAAAAGCATTTGGTAAGTCTGAACATACTTGACTTAATAGTTCTTTTCTATTGATTTTATTTTTCTTATTACATAAAATGTAGCTAATTGATCTTTTGTTTTTTTTTATGTTATTTCATCTTGTAAGTATTGAATATGATTTTTTTTGCCTTTTATTGAATTAACTTTTTTTTAATTGTGTTTTGTTGTAAATTTAAAACTTCTTTAGTTTTCATAGGTGATAGGATTGCAAACAG

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1706

Start:

16546  

End:

18251

Strand:

-

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_7

ATTACATTTATCATCTTACAATTGCATAAGTCATATGATAATTCTTGTGATTCTTCTAAAGAATCGATTGAATTATGAATTTCATTTACTAAGTAATCACTATCTGATTCAGTTTCTTCTGATACTTCAGTTTCTGATATTAATAGCTTATATAGTTTTACTTGAATATCAGGTTGATCTTCAAATATTTCATTAATTTTCTTTTTCATTTTACATTCTGTGGACCTATGTCCATGTTGTTTATAATTCCAACATACAATTTTTTGGGCATTTGATTAATATTTCTTATTTTTTGAATAAGGTTGATTATTTTGTTTTTTTATCATATTTCCTTTCTTTTTGATAATATTTATTATTAGATTTTATTTGCTTATGTTTTATTCTCTTAACTTTAGAAGGTAGATTAAATTGCTCATAACCATATTGTTTACAGAATGAACCATTGTTGTTGTACATTTAAATTTATCATTTTGTTTTTTATCTTTTTGCTCTTGATATATTGTTAATCCTTCTTTTTTGATAAATGCAAATAATTGACCATAAGTTATAGTATTCCACGGGATAGGTTGTCCCCCGGAATAATCTTTTAATTTGCTAGCTACCCTTTCAGCAAAGAAAGACGGTAATCCTGAGATAAACCGTTCTTTCCAAAAAAGTTGATTACAATATTGTCTTTGAAATATATTGGTTATAAAAACATCTTTATACCATTTAAAATCACCTAGTGTTGGACATTTTAAGTTTGTTAATACAATTTTTTTACTTTCTAATTCTCTGCTGGACTACCAACATAATGCATAGTCATAATATGGATTAATACTTCTTCAGCATTTTGATGTTCTATTTCTTCATATAAACCATCTTCACATTCCACTCTTCTAATTTCTACATAATTAAGTATATTATCTTATGTAATACTATCTAAGGAATTATCCCACTAATATTTTAATGCTCTTGTAAAACCAGTTACTAATATTACACAAGCTTGCCTATCATTATGACCTCTAGCTTTAAATGCTATTGCTGCCATACCCATTTCTTGAAATAAATTCATTATTTCATATTCAGAATGTCCATCAATATGCCACTCAATTATACCTTCTCCGGTATATACATTGTTAGAATATTTATGGTGTTCTTCAAATAATAAATCAGGTGGGATATGTCATTTATAATAGGGTTTATTTGATCTCATAATTTTGTTTTTTATCCTGTTAATTTCTAAGCTATCTTCTTTTGATTGAGTATTATCTTGAATAGATATATTATCATTTTCATCAATAGTATTAATTCCTTTTCCTTTATCTAATTTATCTCATCTATTTGCTATGGATTTTAAATTTTCATTTTCTGGAAATTTTACTTGTCTAGCTATCGGTTTAAATATTGATGTTGTTACCGATGCAAAAGGGTGTTGAATACCAAAGTTATATTGTTCTAACTTATTATTTTCGTTATAATCTAATTTATTATCTATATGATCTATTTGCTTAGAAATTGTATGTAATAATTGACTTTGATAGTTATTTTGTTGATAAATTGATTTTATATCTTGCATAACTATTTGATCCTTATCATCTTTATTAGCTTCTATTTTAAATGGCTTCGCTATTACTTGTCTATCAGTCATTTTTAATTATATATCACTTAAAGGTGGATGCACTGATTTAATTGTATTACCATCTAATTTTTCCAAATTTAACTTA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

651

Start:

18314  

End:

18964

Strand:

-

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_8

AATTTCATTTCAGGTAAATGTACATTTAATAGTAAAGTGTTGAATATAGTTGGATCATGTGGACCTATTTGATAATTTGGTGCACAATTAAAATAAATAGCTCCATTACATAAATTTCATTGTAAAACTCCTAAAAGTGAATCTTCATATTTTAGTAAAGTTTTATCTCTTGATAGCATAAGAATAAGTGAATCTATTCCAGTTCTCGATAACGGTTTTATTGCTATTTGAATAAAACCAAAATGAAGATCATTAAAACCTTTTTGTTCATATTTATCTAAGGCTATTGATGATAGTAATTTAATTTATTCAAATTAGTTTTGGAGAGATAATGTTTGTTCATGTTCTTTTATTGAATAAGCTGTTTTAAATCAAAAGTACCAAGTTCATAAATATTTTCTGGATTAATATACGATAATTGATTTTTTTTATCAAAAGAAGTAATTTTTGTTATCATTTCCCTTGAATTAATTGTTGATGCAGAACTAGATGCATGTTTAGTTTTAAAGAGTTTTCTAAAAGAAGACGACATGACTCATTCTAAATTAAGACACATACTAGAGGGATACTAACCTGTACTGCTTTGACACAGCTTCTGGCTTGCCAAAGGTCTTCCTGCCACTACGTCGGGACTTGCTGCCTGGAACACCT

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1448

Start:

19468  

End:

20915

Strand:

+

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_9

TCTGCAGAGATATTGTTGCTTTAGGTGTTCCAGGCAGCAAGTCCCGAAGTAGTGGCAGTAAGACCTTTGGCAAGCCAGAAGTTGTGCCAAAGCAGAACCGGTTAGTATCCCTCTAGTATGTGTCTTAGTTTAGAATGAGTCATGTCGTCTTCTTTTAGGAAACTCTTTAAAACTAAACATGCATCTAGTTCTGCATCAACAATTAATTCAAGAGAAATAAAAATTACTTCTTTTGATAAAAAAATCAATTACCGCATATTAATCCAGAAAATATTTATGAAATTGGTACTTTTGATTTTAAAACAGCTTATTCAATAAAAGAACATGAACAAACATTATCTCTCCAAAACGAATTTGAAGAAATTAAATTACAATCATCAATAGCCTTAGATAAATATAAACAAAAAGGTTTTAGTTATCTTTATTTTAGTCTTATTCAAACAGCAATAAAACCATTATCGAGAACTGGAATAGATTCACCTATTCTTATGCTATTAAGAGATAAAACTTTACTAAAATTTGAAGATTCACTTTTAAGAGTTGTATAATCAAATTTATGTAATGGAACAATTTATTTTAATTGTGCACCAAATTATCAAATAAGTCTACATGATCCAACTATACTCAACACTTTAGTATTAAATGTATATTTACCTGAAATAAAATTTCAAAGTGGTAGACATGGATATTTATTACTATATAGAATTTATTTTAAACAATTGATATCTGAATTTAATTCTAGATGTTTATTAAAAGATAATAGAGAAGAAACAACAATTTTAGCTGCACATAGCAATGATACACCAACATCAACTTATGCACGTAAACAATTAAAATGGACAGAAATAATTATACCAAAACAATGAAAAATTGATATTACACAATCACCTAGAAGTTTTGAATAAAGAAATATTTCAAAAGTAATAGAGCAACCAGATGGTAAAATATTATAACGATTTGGATCATATAGAGATCCACTTCCACCTAGGATTAGTACATGTAGTTCAAGACCTTCATTTTCTGAATATCGTACTGGACAATCTAGTACAGATTCAGAAACTGAAAGTGTAAATCAAAATGTTAAACAAGACATTAAATTTAAAGCACCAATAGCGGAACCAAAAATAGATAATTATCCAACATCACCTACACCTTCTGATTTTAGATCATTAAATGTTATAACCAAAGAATATACAATTATAAATAATATATTAGAAAAGATTTTTATTCATTAAAAAATAAAAAATTTTCGTATTTCAACAACTTTTCTAAGCAAGAAGTTGATGAACTAAGAAGCAAATGGTATGACAGCATGATAAAGAAAGAAATAGACATCCCATTTTTCATTTGGTTTGAAGTTTATGCAATATCACATAAAATAAATTATCCGTTTAAAACAATTAATGTTAGCACATCTTTAAGTCAAATTTGAAAAAATTAGATGGTAA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

175

Start:

20926  

End:

21100

Strand:

-

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_10

ACTACCTTCGTGGTTATTCCTATTTCGGTTACTTTGAATGGATAAATTTGCGAAAAAATGGTGTCCCTATATTACCTCTAGTGTTAAGTTTTGTACAAGGATAAATGGGTTTTTAAAGCAATATCCTTGATTACATATTTTTGCACACGATAATTTGTATTTTACTTATAAATTA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00152_LTR-Caulimovirus_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

790

Start:

21107  

End:

21896

Strand:

-

>Contig00152_LTR-Caulimovirus_11

TATTACATTGATTATTTTGCAATTGCATAAATTATCTGATAATTCTTCAAATCACATGAATTTTCTATCTCATTAATTGAAACACTCACTGTTGGTTTCTTCTGATTCTTTTGCTTCAGATATTAATAATTTAGTTAATTTTTCTTGAATACCTGGTTGATCTTGGAATATTTCATTTATTTTCTTTTCCATTTTGCATTATGTGGACTTATGTCCAGGTCTTTTACAATTCCAACAAACAATTTTTTGTTATTTTTCTGGTTTATATTTTTTATTATTATTTGAATAATATTGATTAGTTGGTTTTTTGCTAAAATTTTTGTCTTTATGATAATGTTTTATATTATTAGATTTTCTTTGTCTATATTTTAATCGTTTGATTCTAGAAGGTGGATTAAATTTATTATAGCCATAATGTTTACAAAATGATCCCATGGTTACTTTAAATTTGAATATATCATTGCGTTTTTTAGCTTTATGTTCTTACATATTGCTAATCCTTTTTTTTTAACAAACGCAAATAACTGACTATATGTAATTGTATTCCAAGGGACAGGTTGTCTTCCAGAATAATCTTTTAATTTATTAATTACTCTTTCTGCAAAGAAAGATGGTAATCTTGAGATAAACCGTTCTTTCCAGAAATGTTGATTACAATCATGTCTTTGAAATATGTTGGTTGCGAATTTGTACCATTTAAAATCTCTTAGTGTTGGGCATCTTAGATTTGTTAATACAATTTTTTTACTTTCTAGTTCTTCAGCCGGATTACCAATAAAATGCATGGTTA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00190_LTR-Caulimovirus_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

127

Start:

6366  

End:

6492

Strand:

+

>Contig00190_LTR-Caulimovirus_12

GGTGTTCCAGGCCGTAAGACCCCAGGGAGGCAGCAAGTCCGTTGGCAAACCATAAAGGTATTGACGTAGAACCTGATTAATATCTTTCTAGCATGAGTCTGAGTCTAGATTAAATCATGGCGTCTTC

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00190_LTR-Caulimovirus_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3239

Start:

6977  

End:

10215

Strand:

+

>Contig00190_LTR-Caulimovirus_13

AATTTTCAAAACAAGACTTCGTGTTTTAAAATAAACAAAGATTCCCTAGAAAGACTTCAATCCCTCTACCAGATACCGTTGGTGTTCCAGGCCGTAAGACCCCAGGGAGGCAGCAAGTCCGTTGGCAAACCATAAAGGTATTGACGTAGAACCTGATTAATATCTTTCTAGCATGAGTCTGAGTCTAGATTAAATCATGGCGTCTTCTGTTAGAAAATTATTTAAATCCAAACATGCATCAACATCTGCATCAACAATTAACTCAAGAGAAATTATGACAAAACTAACTTCGTTTAATCAAGATATTACAAAAAATTGTTTACCCCATATTAATCCAGAAAATATATATCAAATCGGAACTTTTGATTTCAAAACAGCTTATTCTATTAAAGAACACGAACAGATCCTATCTCTTCAAAATGAATTTGAAGAAATCAAATTATTATCTTCAATAGCTTTAGATAAATATAAACAAAAAGGATTTAATTATATTCATTTCGGTTTAATACAAATAGCAATAAAACCCTTATCAAGAACCGGAATAGATTCACCAATATTAATGCTTTTAAGAGATAAAACACTATTGAAATTTGAAGACTCGCTCCTTGGAGCAGTTCAATCGAATTTATGCAACGGAGCAATATATTTTAATTGCGCTCCTAATTTTCAAGTTAGTCTTCATGATCCAACCATACTCAATACATTGGTATTAAATGTCCACTTACCAGAAATTAAATTTCAAAGTGATAGACACGGATACTTATTATTATACAGAATTTATTTCAAACAATCAACATCTGAATTTAATCCAACATGTTTACTATATGATGATAAAGGAGAAACTACTATTTTAGCAGCCCATAGTAAAGATACCCCAGCAGCTACTTACGCTCCTAAGCAATTAAAATGGAATGAAATAACCATTCCAGATCAATGGAAATTAGAAATAACTCAACCACCTAGGAATTTTGAACAAAGAAATATTTCAAAAATAATTGAACAAGTAGATGGAAAAATACTATTACAATTTGGATCTTTTAAAGAACCACTCCCTCCTAGGATCAGTTCTTATTACTCAAGACCCTCTTTCTCTGAATATCAAACGCCATCAAGAGCCTCTTTTTCTGAATATCGTACTAGACCTTCTAGTGCAGATTCAGAAACAGAAAGCATAAACCAAAATGTTAAACAAGATGTTAAATTTAAAGCACCTATAGCAGAACCTACAACAGATAATTTTCCAACTTCTCCAAGTTCATCAGATTTTGGACAAATAAATGTTATATTAAAAGAATATGAAATAAATAAACAACTTATAAAAGAAGATTTTTATTCAATAAAAAATAAAGAAAAACGTGAGTGGTATTTTGAAACATTCTCTAAACAACAAGTAAATGAATTTAGAGAAAAATGGTATAATTGTATGACACTTAAAGAATTAGATATTCCATTCTTTACATGGTTTGAAACATATGCAATTGCTAATGATATAAATTACCCATTCAAAACCATTAATACAAGTTCATCCTTAAGCCAAGTTTGGGAACAAACGAATGGTAATAAAATTAAATCAGTACATCCTCCTTTAACTGATTTAAAAATAAACACGGCTAATAGACAAGTTTTAGCTACTCCATTTAAAACTGGAGCCAATAAAGATGATAAAGAACCATTAATTATGCAAGACATAAAATCAGTTTATCAACAAAATAATTATCAAAGTCAATTATTATATACTATCTCTAAACAAATAGACAATATAGATAATAAAATTGACAACAATGAAAGTAATAAATTAGAACACTTTAATAGTAATATTCAACATCCTTTTTCATCTGTAACTACACCAATCTTTAAACCTATAACTAGACAAATTAAATTCCCAGAAAATGAAATTTTAAAATCAATAGCAACTAGATTAGAAAATCTGGATAGAGGAAAAGGAATCAATAATATAGATGAAAATGATAATGAATCTATTCAAACCAGTACTCAATCAGAAACCGATGATTTAGAAATTAATCGTATAAAATACAGAAATAATAATAAAATTATGAAATCTAGAAAACTATATTATTCAAGACATACACCACCTGATTTGTTATTCGAAGAACACCACAAATATTCTCATAACGTATACCGGTGAGGGAATATACGAATGGAATATTGATGGACGTTCGAGTACGAAATAATGAATTTATTTCAAGAAATGGGTATGGCCGCTATTGCCTTTAAGGCAAGAGGACACACTGATAAACAAGCATGTGTTATGCTAATAACAGGTTTTAATGGAACCTTAAAATACTGGTGGGACAATTCATTAGATCAAATTAAACAAGATTCAATAATTAATCATGTAGAAATAAGAAGAGTAGAAAGAGAAGATGGTTTATATGAAGAAGTAGAATATCAAAATGCAGTAGAAGTATTAATTCATACATTAACCATGCATTTTATTGGTAACCCAAATGAAGAATTAGAAAGTAAAAAAATAATATTAACCAATTTAAGATGTCCAACATTAGGAGATTTAAATGGTATAAAGATGTATTCGTAACCAATATATTCCAAAGAACGGATTGTAATCAACCTTTCTGGAAAGAAAGATTTATCTCAGGATTACCATCCTTTTTCGCAGAAAAGGTAATCAACAAATTAAAAGATATTCAGGAGGTCAACCTATACAATGGAACTCAATTACTTACGGTCAGTTATTCGCCTTTATCAAAAAAGGAGGTTTAGCAATATGTCAAGAACATAAAGATAAAAAAAGAAATGAAAAATTCAAATTTAAAACAACTATGGGATCATTTTGTAAACAATATGGTTATGATAAACTAGATCCTCCCTCTAGAATTAAAAGAATAAAATATAGGCAAAGAAAAGCCAGAAAATCAAAACATTATCAAAAAAATTTTGATAAAAAACCAACAGATAAATATTATTCGAAAAACAAAAAATATAAATCTAAGGATAAACAAAAGATAGTATGCTATAATTGTAAAAGACCAGGACATAAATCAACAGAATGTAAAATGAAAAGAAAAATAAATGAAATTTTTCAAGATCAACCTGATATTCAAGAAAAATTAACTAAGTTATTAATATCAGAATCAGAAATATCTGAAGAAAATAATAGTGATTACTTAATCAATGAAATCGAAAATTCTAGTGATTCATCCTCTGAATCACATGAATTATCCGATAATTTATGCAATTGTCAAACTATTAACGTAATA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00190_LTR-Caulimovirus_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3324

Start:

10286  

End:

13609

Strand:

+

>Contig00190_LTR-Caulimovirus_14

AATACTTAATAAAATTAAAAGAAATAATCTCTCGAGAAAATCAATTATCTACTCCACAACCTTTTAGCTTAAATAAGATATTTGAAAAATATCCTACTCAAAATTTGTTCAAACAAGTAACTACAGGAGAACTTCAAAATGAAGTAAAACAACTAAAAGCTCAAGTAAAAGAATTACAATTAACAATTAATCAACAAGAGTTAAAACAACTACAAGTAGATGCTAGATTATCTTTAATAGAAAATAAAGATAATTCTCAGGCATGCTCAAGTAATCAAAGTCCAGAATCGGATAAACATGATAATAATGATGAAAATTATATTCAAATAATTGATAGAATAATTTACCAAAAATGGTACACAAATATTACTCTTCATATTGGACGAAATTTTAAAATTGATATAATTGCCCTAATGGATACAGGAGCAGATTACAACTGTATTCGTGAAGGAATTATACCAACAAAATATTATGAAAAAACCACTGAACGTTTAAGCAGTGCCAATGGCAGCAGCTTGAAAGTACAGTATAAATTACCTTGTGCAAAAATATGCAACCAAGGATATTGTTTCATAAACCAATTTATTCTAGTTAAAAACCTTTCACAAGAAGTAATATTAGGAACCCCATTTTTTACGCAAATATATCCATTTAAGGTAACCGAAACAGGAGTAACCACTAAAGTAATGGGTACAAAATTATCCTTTAACTTTCTATCTCCTATGAAAGCTAAAGAAGTTTTGCAATTACAACAAAATACAATCCAAAAAACGATTAACCTAATAAAAGGAAAACAAAATCATATTCAGTATTTACAAGAAGAAATAGCCTATAAAAAAATCGAAGAACAATTAAAAACATCATATACAATAAGTAAAATTAAATCAATAGAAAATGAACTTTTAAAACAAGTATGCTCAGAATTGCCAAACGCATTCTGGGAAAGAAAACAGCATACAGTAGAACTCCCTTATATTAAAGAATTTAATGAAAAAAATATACCAACCAAAGCTCGACCTATTCAAATGAATAAGGAATTACTAGAGCATTGTAAACAAGAAATAGCCGATTTATTAAAGAAAAATCTAATTAGGCCATCCAAATCTCCTTGGAGCTGTTCAGCCTTTTATGTAAATAATCAAGCAGACAAAGAACGAGGAGTACCACGATTAGTAATCAATTATAAGCCACTAAATGACGTTTTACAATGGATTAGATATCCGATACCCAACAAAAGAGATTTATTAAAACGACTTTATAATGCAAAAATCTATTCAAAATTCGATATGAAAAGTGGATTTTGGCAAATCCAAATAGCTGAAAATGATAAATATAAAACAGCTTTTACAGTACCGTTTGGACATTACGAATGGAATGTAATGCCATTCGGATTAAAAAATGCACCATCTGAATTCCAACATATAATGAATGATATATTCAACAACTATTCTAATTTTACTATAGTATATATCGATGATGTACTCGTATATTCAACATCAATCGACCAACACATTAGTCATTTAAACACTTTCATAAATATAGTTAAAAAACATGGATTAGTTCTATCCGCTAAAAAAATGTCTTTATTCCAAACAAAAATAAGATTTCTAGGACATAATATATATCAAGGAACCATAACACCAATATCTAGGGCAATAGAATTTGCCGATAAATTTCCAGATGAACTAAAAGAAAAATCTCAGTTACAAAGATTTTTAGGATGTCTGAATTATGTTTCAGATTTCCTGCCCAATCTTAGAAAATCCATTCAACCTTTATTTCAAAGATTACAAAAAAATCCAAAACCTTGGACAAATACACATACCAAATTAGTTCAACAAATAAAGCAAAAGGTTAAAACTCTCCCTTGTTTATCCATACCAAATCCTGAAGCAAATATGATTGTCGAAACTGACGCTTCAGAAATAGGTTATGGAGGAATCCTTAAACAAAAACTTTCAGATTCTAGCCCAGAGTCCATAGTTAGATTCCATTCTGGAATCTGGTTAGGACCCCAAAAGAATTATTCTACCGTTAAAAAAGAAGTGTTATCAATAGTCAATTGTATATCAAAATTTCAAGATGATTTAATAAACAAAAAATTCTTACTACGTGTTGATTGTAAATCAGCAAAAGAAATTTTACAAAAAGATGTCAAAAATTTAGTCTCAAAACAAATCTTTGCTAGATGGCAATCCATTCTATCAGTATTCGATTTTGATATTCAATATATTAAAGGTGAAAATAATTCTTTACCTGATTTTCTAACAAGGGAATATTTACTGGGAAAAACAGGCAATCAAAATGAGTGACCAGAAAAAGAAGAAACCGATGACCGCATCGGATTACATCAAAAGTCAACCGGCTCTCCAGGGCAAGCCCCTAACTATTCAAAACTCCTATTCAGCACTTGCTGAATTTCCCCCACTTTCTTATTCAAAAGCAGTTAATGCAGAAAAAGGTCAAACATCTACGCCAAAACCTTCCCAAACAACCACTCAACCTCCTTCTAAAAAAACTACTTATATTCTAAAACCCCACAAGGAACATATCCTTACTACCAACTTTACTCAACCAATAACCTTAAAACAGCTTCAAAACTTTGTTGGTAGATATCTCTATGAAGACTGTCAATACCCAACTGACAATGTAATCAAAAACCGTACCTTTTACGAGTATATTCTAGTAGACTCTAAGTCTGTAGAAATTACTCATTACCCAGACAAAACCAATTCTGACCTCATATCCTACTCTACTTGCAAAATATTACGAATTTATTCTATCCAAGAACTCGGCTTTATTCATCATCATACAATGAAACCCTTCTCAACTCCAGGATACCATATCCCTGGTTTTACCTATGTAGACTATCAACAAGCATTCTTTCGTCTTTTTTACCTTAGGGCCTATGACCATTCATGGTTTATATCCTTCGACCATAAATGCCCAAAAACTATTCCAGGCTGGTTCTACGAATGGTGGCATTGGTTCGGACCTAGCGACCAAATCTACCCAACAGAAATAACAAAAACCTCTTTACCTTTTTACCTTAAACACGCACCTAAAACACCTATTCCACCACTATCCAAAATAAGCTTTCACATCGACATGGGCATACCATGGATATGTTCATGGCACTATAATCTCGTACCTTATTTACCCGATATGCCATACTCTCTTGTTCGAGAATTCCGTATCAAATGGTGGGATAAATACCTTTTAGACCGCTGTTCCCTAGCCAACATACAAAAATACTTCCAAATCACTGAAGAAATCCATACTGCAGTTCGTACCATCTCAAAATCAATACCTCTTGTTACACCA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00444_LTR-Caulimovirus_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3244

Start:

14703  

End:

17946

Strand:

+

>Contig00444_LTR-Caulimovirus_15

AATTTTCAAAACAAGACTTCGTGTTTTAAAATAAACAAAGATTCCCTAGAAAGACTTCAATCCCTCTACCAGATACCGTTGGTGTTCCAGGCCGTAAGACCCCAGGGAGGCAGCAAGTCCGTTGGCAAACCATAAAGGTATTGACGTAGAACCTGATTAATATCTTTCTAGCATGAGTCTGAGTCTAGATTAAATCATGGCGTCTTCTGTTAGAAAATTATTTAAATCCAAACATGCATCAACATCTGCATCAACAATTAACTCAAGAGAAATTATGACAAAACTAACTTCGTTTAATCAAGATATTACAAAAATTTTTTTACCTCATATTAATCCAGAAAATATATATCAAATCGGAACTTTTGATTTCAAAACAGCTTATTCTATTAAAGAACACGAACAGACCCTATCTCTTCAAAATGAATTTGAAGAAATCAAATTATTATCTTCAATAGCTTTAGATAAATATAAACAAAAAGGATTTAATTATATTCATTTCGGTTTAATACAAATAGCAATAAAACCCTTATCAAGAACCGGAATAGATTCACCAATATTAATGCTTTTAAGAGATAAAACACTATTGAAATTTGAAGACTCGCTCCTTGGAGCAGTTCAATCGAATTTATGCAACGGAGCAATATATTTTAATTGCGCCCCTAATTTTCAAGTTAGTCTTCATGATCCAACCATACTCAATACATTGGTATTAAATGTCCACTTACCAGAAATTAAATTTCAAAGTGATAGACACGGATACTTATTATTATACAGAATTTATTTCAAACAATCAACATCTCAATTTAATCCAAGATGTTTACTATATGATGATAAAGGAGAAACTACTATTTTAGCAGCCCATAGTAAAGATACCCCAGCAGCTACTTACGCTCCTAAGCAATTAAAATGGAATGAAATAACCATTCCAGATCAATGGAAATTAGAAATAACTCAACCACCTAGAAATTTTGAACAAAGAAATATTTCAAAAATAATTGAACAAGTAGATGGAAAAATATTATTACAATTTGGATCTTTTAAAGAACCACTCCCTCCTAGGATCAGTTCTTATTACTCAAGACCCTCTTTCTCTGAATATCAAACGCCATCAAGAGCCTCTTTTTCTGAATATCGTACTAGACCTTCTAGTGCAGATTCAGAAACAGAAAGCATAAACCAAAATGTTAAACAAGATGTTAAATTTAAAGCACCTATAGCAGAACCTACAACAGATAATTTTCCAACTTCTCCAAGTTCATCAGATTTTGGACAAATAAATGTTATATTAAAAGAATATGAAATAAATAAACAACTTATAAAAGAAGATTTTTATTCAATAAAAAATAAAGAAAAACGTAAGTGGTATTTTGAAACATTCTCTAAACAACAAGTAAATGAATTTAGAGAAAAATGGTATAATTGTATGACACTTAAAGAATTAGATATTCCATTCTTTACATGGTTTGAAACTTATGCAATTGCTAATGATATAAATTACCCATTCAAAACCATTAATACAAGTTCGTCCTTAAGCCAAGTTTGGGAACAAACGAATGGTAACAAAATTAAATCAGTACATCCTCCTTTAACTGATTTAAAAATAAACACGGCTAATAGGCAAGTTTTAGCTACTCCATTTAAAACTGGAGCCAATAAAGATGATAAAGAACCATTAATTATGCAAGACATAAAATCAGTTTATCAACAAAATAATTATCAAAGTCAATTATTATATACTATCTCTAAACAAATAGACAATATAGATAATAAAATTGATAACAATGAAAGTAATAAATTAGAACACTTTAATAGTAATATTCAACATCCTTTTTCATCTGTAACTACACCAATCTTTAAACCTATAACTAGACAAATTAAATTCCCAGAAAATGAAATTTTAAAATCAATAGCAACTAGATTAGAAAATCTGGATAGAGGAAAAGGAATCAATAATATAGATGAAAATGATAATGAATCTATTCAAACCAGTACTCAATCAGAAACCGATGATTTAGAAATTAATCGTATAAAATACAGAAATAATAATAAAATTATGAAATCTAGAAAACCATATTATTCAAGACATACACCACCTGATTTGTTATTCGAAGAACACCACAAATATTCTCATAACGTATATACCGGTGAGGGAATATACGAATGGAATATTGATGGACGTTCCGAGTACGAAATAATGAATTTATTTCAAGAAATGGGTATGGCCGCTATTGCCTTTAAGGCAAGAGGACATACTGATAAACAAGCATGTGTTATGCTAATAACAGGTTTTAATGGAACCTTAAAATACTGGTGGGACAATTCATTAGATCAAATTAAACAAGATTCAATAATTAATCATGTAGAAATAAGAAGAGTAGAAAGAGAAGATGGTTTATATGAAGAAGTAGAACATCAAAATGCAGTAGAAGTATTAATTCATACATTAACCATGCATTTTATTGGTAACCCAAATGAAGAATTAGAAAGTAAAAAAATAATATTAACCAATTTAAGATGTCCAACATTAGGAGATTTTAAATGGTATAAAGATGTATTCGTAACCAATATATTCCAAAGAACGGATTGTAATCAACCTTTCTGGAAAGAAAGATTTATCTCAGGATTACCATCCTTTTTCGCAGAAAAGGTAATCAACAAATTAAAAGAATATTCAGGAGGTCAACCTATACAATGGAACTCAATTACTTACGGTCAGTTATTCGCCTTTATCAAAAAAGAAGGTTTAGCAATATGTCAAGAACATAAAGATAAAAAAAGAAATGAAAAATTCAAATTTAAAACAACTATGGGATCATTTTGTAAACAATATGGTTATGATAAACTAGATCCTCCCTCTAGAATTAAAAGAATAAAATATAGGCAAAGAAAAGCCAGAAAATCAAAACATTATCAAAAAAATTTTGATAAAAAACCAACAGATAAATATTATTCGAAAAACAAAAAATATAAATCTAAGGATAAACAAAAGATAGTATGCTATAATTGTAAAAGACCAGGACATAAATCAACAGAATGTAAAATGAAAAGAAAAATAAATGAAATTTTTCAAGATCAACCTGATATTCAAGAAAAAATAACTAAGTTATTAATATCAGAATCAGAAATATCTGAAGAAAATAATAGTGATTACTTAATCAATGAAATCGAAAATTCTAGTGATTCATCCTCTGAATCACATGAATTATCCGATAATTTATGCAATTGTCAAACTATTAACGTAATA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00444_LTR-Caulimovirus_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3319

Start:

18015  

End:

21333

Strand:

+

>Contig00444_LTR-Caulimovirus_16

AATACTTAATAAAATTAAAGAAATAATCTCTCGAGAAAATCAATTATCTGCTCCACAACCTTTTAGCTTAAATAAGATATTTGAAAAATATCCTACTCAAAATTTGTTCAAACAAGTAACTACAGGAGAACTTCAAATGAAGTAAAACAACTAAAAGCTCAAGTAAAAGAATTACAATTAACAATTAATCAACAAGAGTTAAAACAACTACAAGTAGATGCTAGATTATCTTTAATAGAAAATAAAGATAATTCTCAGGCATGCTCAAGTAATCAAAGTCCAGAATCGGATAAACATGATAATAATGATGAAAATTATATTCAAATAATTGATAGAATAATTTACCAAAAATGGTACACAAATATTACTCTACATATTGGACAAAATTTTAAAATTGATATAATTGCCCTAATGGATACAGGAGCAGATTACAACTGTATTCGTGAAGGAATTATACCAACAAAATATTATGAAAAAACCACTGAACGTTTAAGCAGTGCCAATGGCAGCAGCTTGAAAGTACAGTATAAATTACCTTGTGCAAAAATATGCAACCAAGGATATTGTTTCATAAACCAATTTATTCTAGTTAAAAACCTTTCACAAGAAGTAATATTAGGAACCCCATTTTTTACGCAAATATATCCATTTAAGGTAACCGAAACAGGAGTAACCACTAAAGTAATGGGTACAAAATTATCCTTTAACTTTCTATCTCCTATGAAAGCTAAAGAAGTTTTGCAATTACAACAAAATACAATCCAAAAACGATTAACCTAATAAAAGAAAACAAAATCATATTCAGTATTTACAAGAAGAAATAGCCTATAAAAAAAAGAAGAACAATTAAAAACATCATATACAATAAGTAAAATTAAATCAATAGAAAATGAACTTTTAAAACAAGTATGCTCAGAATTGCCAAACGCATTCTGGGAAAGAAAACAGCATACAGTAGAACTCCCTTATATTAAGGAATTTAATGAAAAAAATATACCAACCAAAGCTCGACCTATTCAAATGAATAAGGAATTACTAGAGCATTGTAAACAAGAAATAGCTGATTTATTAAAGAAAAATCTAATTAGGCCATCCAAATCTCCATGGAGCTGTTCAGCCTTTTATGTAAATAATCAAGCAGAAAAAGAACGAGGAGTACCACGATTAGTAATCAATTATAAGCCACTAAATGACGTTTTACAATGGATTAGATATCCGATACCCAACAAAAGAGATTTATTAAAACGACTTTATAATGCAAAAATCTATTCAAAATTCGATATGAAAAGTGGATTTTGGCAAATCCAAATAGCTGAAAATGATAAATATAAAACAGCTTTTACAGTACCGTTTGGACATTACGAATGGAATGTAATGCCATTCGGATTAAAAAATGCACCATCTGAATTCCAACATATAATGAATGATATATTCAACAACTATTCTAATTTTACTATAGTATATATCGATGATGTGCTCGTATATTCAACATCAATCGACCAACACATTAGTCATTTAAACACTTTCATAAATATAGTTAAAAAACATGGATTAGTTCTATCCGCTAAAAAAATGTCTTTATTCCAAACAAAAATAAGATTTCTAGGACATAATATATATCAAGGAACCATAACACCAATATCTAGGGCAATAGAATTTGCCGATAAATTTCCAGATGAACTAAAAGAAAAATCTCAGTTACAAAGATTTTTAGGATGTCTGAATTATGTTTCAGATTTCCTACCCAATCTTAGAAAATCCATTCAACCTTTGTTTCAAAGATTACAAAAAAATCCAAAACCTTGGACAAATACACATACCAAATTAGTTCAACAAATAAAGCAAAAGGTTAAAACTCTCCCTTGTTTATCCATACCAAATCCTGAAGCAAATATGATTGTCGAAACTGACGCTTCAGAAATAGGTTATGGAGGAATCCTTAAACAAAAACTTTCAGATTCTAGCCAGGAGTCCATAGTTAGATTCCATTCTGGAATCTGGTTAGGACCCCAAAAGAATTATTCTACCGTTAAAAAAGAAGTGTTATCAATAGTCAATTGTATATCAAAATTTCAAGATGATTTAATAAACAAAAAATTCTTACTACGTGTTGATTGTAAATCAGCAAAAGAAATTTTACAAAAAGATGTCAAAAATTTAGTCTCAAAACAAATCTTTGCTAGATGGCAAGCCATTCTATCAGTATTCGATTTTGATATTCAATATATTAAAGGTGAAAATAATTCTTTACCTGATTTTCTAACAAGGGAATATTTACAGGGAAAAACAGGCAATCAAAATGGGTGACCAGAAAAAGAAGAAACCGATGACCGCATCGGATTACATCAAAAGTCAACCGGCTCTCCAGGGCAAGCCCCTAACTATTCAAAACTCCTATTCAGCACTTGCTGAATTTCCCCCACTTTCTTATTCAAAAGCAGTTAATGCAGAAAAAGGTCAAACATCTACGCCAAAACCTTCCCAAACAACCACTCAACCTCCTTCTCAAAAAACTACTTATATTCTAAAACCCCACAAGGAACATATCCTTACTACCAACTTTACTCAACCAATAACCTTAAAACAGCTTCAAAACTTTGTTGGTAGATATCTCTATGAAGACTGTCAATACCCAACTGACAATGTAATCAAAAACCGTACCTTTTACGAGTATATTCTAGTAGACTCTAAGTCTGTAGAAATTACTCATTACCCAGACAAAACCAATTCTGACCTCATATCCTACTCTACTTGCAAAATTTTACGAATTTATTCTATCCAAGAACTCGGCTTTATTCATCATCATACAATGAAACCCTTCTCAACTCCAGGATACCATATCCCTGGTTTTACCTATGTAGACTATCAACAAGCATTCTTTCGTCTTTTTTACCTTAGGGCCTATGACCATTCATGGTTTATATCCTTCGACCATAAATGCCCAAAAACTATTCCAGGCTGGTTCTACGAATGGTGGCATTGGTTCGGACCTAGCGACCAAATCTACCCAACAGAAATAACAAAAACCTCTTTACCTTTTTACCTTAAACACGCTCCTAAAACACCTATTCCACCACTATCCAAAATAAGCTTTCACATCGACATGGGCATACCATGGATATGTTCATGGCACTATAATCTCGTACCTTATTTACCCGATATGCCATACTCTCTTGTTCGAGAATTCCGTATCAAATGGTGGGATAAATACCTTTTAGACCGCTGTTCCCTAGCCAACATACAAAAATACTTCCAAATCACTGAAGAAATCCATACTGCAGTTCGTACCATCTCAAAATCAATACCTCTTGTTACACCA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00444_LTR-Caulimovirus_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

948

Start:

22294  

End:

23241

Strand:

+

>Contig00444_LTR-Caulimovirus_17

CAGGGCAAGCCCCTAACTATTCAAAACTCCTATTCAGCACTTGCTGAATTTCCCCCACTTTCTTATTCAAAAGCAGTTAATGCAGAAAAAGGTCAAACATCTACGCCAAAACCTTCCCAAACAACCACTCAACCTCCTTTCAAAAAAACTACTTATATTCTAAAACCCACAAGGAACATATCCTTACTACCAACTTTACTCAACCAATAACCTTAAAACAGCTTCAAAACTTTGTTGGTAGATATCTCTATGAAGACTGTCAATACCCAACTGACAATGTAATCAAAAACCGTACCTTTTACGAGTATATTCTAGTAGACTCTAAGTCTGTAGAAATTACTCATTACCCAGACAAAACCAATTCTGACCTCATATCCTACTCTACTTGCAAAATTTTACGAATTTATTCTATCCAAGAACTCGGCTTTATTCATCATCATACAATGAAACCCTTCTCAACTCCAGGATACCATATCCCTGGTTTTACCTATGTAGACTATCAACAAGCATTCTTTCGTCTTTTTACCTTAGGGCCTATGACCATTCATGGTTTATATCCTTCGACCATAAATGCCAAAAACTATTCCAGGCTGGTTCTACGAATGGTGGCATTGGTTCGGACCTAGCGACCAAATCTACCCAACAGAAATAACAAAAACTCTTTACCTTTTACCTAAACACGCTCCTAAAACACCTATTCCACCACTATCCAAAATAAGCTTTCACATCGACATGGGCATACCATGGATATGTTCATGGCACTATAATCTCGTACCTTATTTACCCGATATGCCATACTCTCTTGTTCGAGAATTCCGTATCAAATGGTGGGATAAATACCTTTTAGACCGCTGTTCCCTAGCCAACATACAAAAATACTTCCAAATCACTGAAGAAATCCATACTGCAGTTCGTACCATCTCAAAATCAATACCTCTTGTTACACCA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00444_LTR-Caulimovirus_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

887

Start:

24207  

End:

25093

Strand:

+

>Contig00444_LTR-Caulimovirus_18

CAGGGCAAGCCCCTAACTATTCAAAACTCCTATTCAGCACTTGCTGAATTTCCCCACTTTCTTATTCAAAAGCAGTTAAGCAGAGAAAAAGGTCAAACATCTACGCCAAAACCTTCCCAAACAACCACTCAACCTCCTTCTCAAAAAACTACTTATGCTAAAACCCCACAAGGAACATATCCTTACTACCAACTTTACTCAACCAATAACCTTAAAACAGCTTCAAAACTTTGTTGGTAGATATCTCTATGAAGACTGTCAATACCCAACTGACAATGTAATCAAAAACCGTACCTTTTACGAGTATATTCTAGTAGACTCTAAGTCTGTAGAAATTACTCATTACCCAGACAAAACCAATTCTGACCTCATATCCTACTCTACTTGCAAAATTTTTACGAATTTATTCTATCCAAGAACTCGGCTTTATTCATCATCATACAATGAAACCCTTCTCAACTCCAGGATACCATATCCCTGGTTTTACCTATGTAGACTATCAACAAGCATTCTTTCGTCTTTTTTACCTTAGGGCCTATGACCATTCATGGTTTATATCCTTCGACCATAAATGCCCAAAAACTATTCCAGGCTGGTTCTACGAATGGTGGCATTGGTTCGGACCTAGCGACCAAATCTACCCAACAGAAATAACAAAAACCTCTTTACCTTTTTACCTTAAACACGCTCCTAAAACACCTATTCCACCACTATCCAAAATAAGCTTTCACATCGACATGGGCATACCATGGATATGTTCATGGCACTATAATCTCGTACCTTATTTACCGATATGATGCATACTCTCTTGTTCGAGAATTCCGTATCAAAGTGGGATAATACCTTTTAGACCGCTGTTCCCTAGCCAACATACAAAATACTTCCAA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00573_LTR-Caulimovirus_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1061

Start:

7740  

End:

8800

Strand:

+

>Contig00573_LTR-Caulimovirus_19

GGTGCTCCATGCAACAATTCCTAATTGAGGCAGTAAGACCGTTGGCAAGCCATAGTTGTGTTGACCTAGATCTGGTGAGTATCTCTTCTAGCATGAGTTTAAACCCATAATAAGTCATGGCGTCATCGTTTAGAAAACTTTTTAAATGAAGACATGCAGCCTCTACATCTCATACAACTATTAGTTCAAGAGAAATTATGTCAAAATAACCTCATTTAATAAAGAAATATCAAAAAACCAATTACCGCATATCAATCCAGAAAATATATATCAAATTAGTACTTCTAACTTTAAAACAGCTTATGTAACCAAAGAGCATAAGCAAACTCTATCTCTTCAAAATGAGTTTGAAGAAATTAGATTATTATCATCAATCACTATATATAAATATAAGCAAAAGGGATTTAGTTATATCCATTTTGGACTTATTCAAACAACAATAAAACCTTTATCATGAACCGGTATTGATTCACCAATACTCATGTTATAAAGCGATAAAACTCTATTAAAATTGGAGGATTTGCTTCTAGGAGCAGTTCAAACTAATCTATGTAATGGAGCAGTTTATTTTAACTGCACTCATAATTTTCAAATAAGCTTACATGATCCAAATATACTCAATACTTTAGTATTAATTGTTCATTTACCATAAATGAAATTCCGAAATGAACGACATGGATATTTACTATTCTATCTTATTTTTTAAACAATGAACATCTGAGTTTAACCCCATATGTTTATTACAAAACAGTAAAGGAATAACGATATGGAATGAAATAACCATTCCAAATCAATGGAAACTCAAAATAACTCTATCTCCTAGAATTTTTGAACAAATGGATGGATATGTATTACTACAACTTAGATCATATAGCGGACCACTTCCACCTAGGATTAGTTCATATCATTCAAGAGCCTCATTTTCTGAATATCGTGCTCTTTCAAGAGCCTCTTTTTCTGAATTTCGTACTGGTCAATCTAGTGCAGATTCGAAAACAGAAAGTGTAAACCAGAATATTAAACAAGACAATTCAATTAAATTTAAAACAACCATAGCTGAA

Isatis indigotica (v1.0)

ID:

Contig00573_LTR-Caulimovirus_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

533

Start:

8798  

End:

9330

Strand:

+

>Contig00573_LTR-Caulimovirus_20

GAAATAATTATCCCATTTTTCATATGGTTTGAAAAATACTCAATCACACTTAACATTAATTATCGATTTTAAAAAATTAATACAAGTTCATCCTTATACCAAATTTGGGAACAAGTTGATGGAAATAAAATCAAATCAGTACATCCAACATTAAAGGATCTAAAAATATATACTACCAACCGCTATATTATTGTCATACCAATTAAAACTGGGACCAATAGAAATGACAAAGATCAAGTAATAATATAGGATATTTAATCAATATATGAACAAATTTTTATCAAAGTCTATTATTATATACAATTTCTAAAAAAGTAGACAATATAGGCAATAAAATAAATATTAATGAAAATAATAAAATGGATCAGTATAATCAAAATATTCAACATCCATTTTCATCTGTAACCAAACCAATAACTAGACAAGTCAAATATCCTGAAAATGAAATTTTAAAATCAATTGCAAATAGATTAGAAAAATTACACAAAGGTAAGGGAATTAATAATTGTGAGAGCCGAAACTCACACAATCAA