ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
scaffold_1_LTR_1 RetrotransposonsLTRLTR50396326209633122-
scaffold_1_LTR_2 RetrotransposonsLTRLTR10911050420710505297-
scaffold_1_LTR_3 RetrotransposonsLTRLTR10111136603211367042+
scaffold_1_LTR_4 RetrotransposonsLTRLTR8951143890611439800+
scaffold_1_LTR_5 RetrotransposonsLTRLTR27801144853111451310-
scaffold_1_LTR_6 RetrotransposonsLTRLTR37641145130111455064-
scaffold_1_LTR_7 RetrotransposonsLTRLTR22351194448111946715+
scaffold_1_LTR_8 RetrotransposonsLTRLTR12441204858912049832+
scaffold_1_LTR_9 RetrotransposonsLTRLTR11931234467412345866+
scaffold_1_LTR_10 RetrotransposonsLTRLTR22521235377212356023-
scaffold_1_LTR_11 RetrotransposonsLTRLTR1611235818512358345-
scaffold_1_LTR_12 RetrotransposonsLTRLTR1811235837912358559-
scaffold_1_LTR_13 RetrotransposonsLTRLTR53001242920012434499+
scaffold_1_LTR_14 RetrotransposonsLTRLTR47021304132313046024+
scaffold_1_LTR_15 RetrotransposonsLTRLTR12111455186314553073-
scaffold_1_LTR_16 RetrotransposonsLTRLTR9181480519314806110-
scaffold_1_LTR_17 RetrotransposonsLTRLTR16201531479715316416-
scaffold_1_LTR_18 RetrotransposonsLTRLTR14941564166215643155-
scaffold_1_LTR_19 RetrotransposonsLTRLTR28491564313215645980-
scaffold_1_LTR_20 RetrotransposonsLTRLTR20291632246216324490-

< 1 2 3 4 5 > Total 23


Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

503

Start:

9632620  

End:

9633122

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_1

AAGGTTGTAGGTGAATAATGGGGTCATAGGAAATTTTCCTACCCCTCACTTCCAATCCTTGTGTGATTATTTCTCTCTAAAGTAAAATAGTGAGGTCACAGGAAATTTTCCTACCCCTTTACTTTGAAAGAAAATCATCTCATCTTTTTAGCTTTAGTTAACGCTTAGAATAAGGGAGAGGAGTACCAGATTTTTTCATCACACAGGTTTTTGTTTTCAGGTATGAATGAGGAGTCAAGCCCTGTGAACACCAGTCACATCGGTCAGGTAAAAGGTAGAAATCAGAAATTAGCTCAGGTCAATGGATTTTGTCAGAAACATGGACGCCTCTAGTACGCTGGTCAGTCGTTGGGTTTTCCATTAGTCTGGTCTGGACTGATTCTACAGCAATGGTCACTAAAAAGAACATGGTCAAAATTCAAAAATGGTATAAACTCATCACAGATTTGGTCCTAGTTCCCACAAGTTTTGACTCATATTATCGACTGACTCAAAGAAACAAA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1091

Start:

10504207  

End:

10505297

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_2

CTCCTAAACACTACAATCCTTTGATAAGGCCTCTAAATCACCTGAAACTTCCTGAAAAGACTCCAAAAACTCCTAAAACAATCAGTAAACACAAGTTAGAATGAGTCAAAATCTCCACTCATCAATTCCCCCGAACTTGAATCCTTGTTTGTCCTCAAACAAACTCAAATTCAACTCCAAAAAAATGACTGGATAAAGCTGGGAACTCGCAAAACTCAAAAGACCGTAAACCTGACCAAGGCATGTGACAATCTGCTGCAAAATCAATCAAAAATCTAACCTCCATTTACTTCTCCGTAGACGCTGCAGCTTTCCAGATTAGTCCTTCAATTTCATAACATCATCCATGTCCCATCATCGCTAAGTCTCATCGATAAAACCAGTGCTAAGGACCTTCTAGACTCGTTCCCATACTTATACCTCAACAAATTGACCATACTACACAAAAGTACCTTTCCTCTCCCCCGAACTTATTCACTTTTCAAGCTGTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCGGCACATATAACAAGGTTCAAAGACGCGAGTATTGATGGTGATTGCCACCGAATCCCCGGTTTGTCCCCTCATCATATATCAAAGGTGTAGGCGAATAATGGGGTCACAGGAAATTTTCCTACCCCTCGCTTCCATCCCTTGTGTGATCATTCCACTTTAGAAGTAAAATAATGGGATCCTTGGAAATTTTCCTAACCCTTTACTTCTAAAAGAAAATCATTTCAATCTTTTCTGCCTTTTGATCATATTTTTTTAGAAACAGCCTGAAACAATGCTTAGAACATAAGAGAGGAATACCAAATCTATCACACAGGTCTTTATTTGTCAGGTAAGAATGAGGAGTCAAGCCCTATGAGCACTAACCTGATCGATGAGGAAAATGAAAAGCTGAAAAATGTAGCTCAGGTTCTACTGCTTTGTCTTTGGATTTTCCATTAGTCGATCTAGATGATTCTGCAGCAATAATCACTAGAAGAAGGTGGTCAAGATTCACAAATGGTTCTGAAATCATCATAGAATTGGTCCTCATTCCCACAAGCTTTGACTTGACTCATATAACCCAACTGACTCAAAGAAA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1011

Start:

11366032  

End:

11367042

Strand:

+

>scaffold_1_LTR_3

TGACCATCTTCTTCTAGTGATTATTGCTGCAGAATCATCCAGATCGACTAATGGAAAATCCAAAGACAAAGCAGTAGACTAGAGGAGCCCACAATTCTTGACTAATCCATTGAACCTGAGCTAATTTCTCAGCTCTTCATTTTCCTCATCGATCAGGTTAGTGCTCATAGGGCTTGACTCCTCATTCTTACCTGACAAATAAAGACCTGTGTGATAGATTTGGTATTCCTCTCTCATGTTCTAAGCATTGTTTCAGGCTGTTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCAGAAAAGATTGAAATGATTAGGAAAATTTCCAATGATCCCATTATTATACTTCTAAAGTGGAATGATCACACAAGGGATGGAAGCGAGGGGTAGGAAAATTTTCAGTGACCCCATTATTCGCCTACACCTTTGATATATAATGAGGGGACAAACCGGGGATTCGGTGGCAATCACCATCAATACTCGCGTCTTTGAACCTTGTTATATGTGCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCTTGAAAACTGAATAAGTTCGGGGGAGAGGAAAGGTACTATTGTGTAGTATGGTCAATTTGTTAAGGTATAAGTATGGGAACGAGTCTAGAAGGTCCTTAGCACTAGTTTTATCGATGAGACTCAGCAATGATGGGACATGGATGATGTTATGAAATTGAGGGACTAATCTGGAAAGCTGCAGCGTCTACGGAGAAGTACATGGAGGTTAGATTTTTGATTGATTTTGCAGCAGATTGTCACATGTCTTGGTCAGGTTTACGGTCTTTTGAGTTTTGCGAGTTCCCAGCTTTATCCAGTCATTCTTTTGGAATTGAATTTGAGTTTGTTTGAGGACAAACAAGGATTCAAGTTCGGGGGAGTTGATGAGTGGAGATTTTGACTCATTCTAACTTGTGTTTACTGATTGTTTTATGAGTTTTTGGAGTCTTTTCAGGAAGTTTCAGGTGACTTAGAGGCCTTATCAGAGGATTGGAATGTTAGGAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

895

Start:

11438906  

End:

11439800

Strand:

+

>scaffold_1_LTR_4

AGTGATTGTTGCTGCAGAATCATCTAGATCGACTAATGGAAAATCCAAAGACAAAGCAGTAGACTAGAGGAGCCCAAAATTCTTGACTAGTCCATTGAACCTGAGATAATTTCTCAGCTCTTCATTTTTCCTCATCGATCAGGTTAGTGCTCATAGGGCTTGACTCCTCATTCTTACCTGACAAATAAAGACCTGTGTGATAGATTTGATATTCTTCTCTCATGTTCTAAGCATTGCTTTAGGCTGTTTCTTAAAAAAAAAATGATAAAAGGCAGAAAAGATTGAAATGATTTTCTTTTAGAAGTAAAGGGTTAGGAAAATTTCCAAGGATCCCATTATTTTACTTCTAAAGTGGAATGATCACACAAGGGATGGAAGCGAGGGGTAGGAAAATTTCCTGTGACCCCATTATTCGCCTACACCTTTGATATATAATGAGGGGACAAACCGGGGATTCGGTGGCAATCACCATCAATACTCGCGTCTTTGAACCTTGTTATATGTGCCGAAAAATTAAAAAAAAAAACGAAACAGCTTGAAAAGTGAATAAGTTCGGGGGAGAGGAAAGGTACTTTTGTGTAGTATGGTCAATTTGTTAAGGTATAAGTATGGGAACGAGTCTAGAAGGTCCTTAGCACTGGTTTTATCGATGAGACTCAGCGATGATGGGACATGGATGATGTTATGAAATTGAGGGACTAATCTGGAAAGCTGCAGCGTCTACGGAGAAGTACATGGAGGTTAGATTTTTGATTCATTTTGCAGCAGATTGACACATGCCTTGGTCAGGTTTACGGTCTTTTGAGTTTTGCGAGTTCCCAACTTTATCCAGTCATTGTTTTGGAATTGAATTTGAGTTTGTTTGAGGACAAAGAAGGATCCAAGTTCGGGGGAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

2780

Start:

11448531  

End:

11451310

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_5

CTGATCTGCTCAAAGTTTAATCCCTAGAGCTACTCTGCAAGAGCACAGATGTGTAGTTGTAGTATGCAGGGGTCGAACCACAGAGACGAGAGATTCACTCAATAAACCTATTATGAATTGAATTACGCTAAGCAGATTAATGAGAATCAAATAGCGATGCAAATAAAGATAAACGAATGCAGTAAAAACGTTTGTAAAGTTTAGATGGGTGGAGATTAGGTCTAGGGTGTTTCTCAGGAAATCAATGAATGCAGAACAATCGATTAATCAGGGCTCAGGTTTAAGCACGGTTCTTAAACTCAAATCACGAAATTATAACTAACCAACTTCCGTTGCGAGAATTATCTAAGTCTAAATCTCAAATTCCAAATTCCTTTGCAAATCCTAAAGACATAAACCAGCTTTAACCACAAGTTTGATATGTTCACAAAGCAGCTAAACCAAATTCCTTTGCGAATAGCTACTTTGCTCACTCTAGGTTCTTTCCAGTTATTCAATTACACTTCCGTATCAATCAATTAACCTAAGATCTAAGTTCTAGGTGGTCAGTCCAGAATTAGCTTTAAGAACAACCTATGGTGAAGAACTAAATAGATTATGAACCCTAACTAAATCAATTAATCAAACATCCAGAGAAAATCTTTATGAGAACCCTAAACCTAACAAGCAAACTACTCAGACATGGAGATTGAAGCAATAAACATGAATGAATAGATTGCAGTAAGCAGTAAATAGATTAATAAACAGGGGTTCGAAATCTTCTCTCTCCGGAACAGAGTTTCAGACTTGTCTCCCCAAAAGCTCTCAAAAACAAAAGTTCTCTCTCAGAAAATCTAAGGTATCGATATAAGGTGGCTAAAAACCCTATTTATAACTTAAAAACACGTTTTGGGCTTCCTTGTAACTATTGGAGACTTTTGGGTCCAACTCCTTCTTCAAACAGGAAACAAAATCACGTTTTCCTTATTTCTGCAACAAGTGTCGAGCGTCACTCTCCATGGTGTCAAGCGACACTAAAGCACATGATTCATCCTTGACGAATTTGATCCTGATTAAGCTCCAAAGTGCTCCAAAGTCTCCAGTTAAGCTCCAAACGTACTTATGACCTGTAAAGACTCCAAAAGACTCGAGAAACACTAGAAAGACTCTATAAATAAGACATATACCATGGTTAAAAACCATAAAAACCATGATATATCAACTCCCCCAGACTTAGCATTTGCTTGCCCTCAAGCAAACAGAACACCAAATAAGAGAAAGAGGTTTGAAAACACAAAGACTCAACCTTTCATTGGAACATCGCTTTTGACCAATCATCCTGCAACTCAACTACTGCTTCATCACTCCAAATCGAACCACCATGTACTTCTCCGCAGACATTCACTGCTTCCCAGATTGAGTCCAAAATTTCACAACATTGTCCATAAACCCTCATCGCTGGGTCTCACTGATGATTCAGATGCCAAGAACCTTCTAGATTCTTTCCCGTACTATACTCAAACAAATCAGCCATACACCCGTTGGTACTTTTCTCTCCCCCAGACTTATTCTTTTCACACACTCATCATCTTTTTTTTAATGGCATATACTCGATAAGGGTAAAGCTGCGAGTACTGATGGTGTTTGCCATCGAGTCCCCGAGTTGTCCCCTTATCTTGTATCAAAGGTTTTCAGCGAATAGTGGGGTCATGAGAAACTTTCCTACCCCTCACTTCCTTCCTTTGTGTGATCATTCCAACTTAGAAGTGAAATAATGAGATCATTGGAAACATTCCTAACCCTTCACTCCTAAGCGAAAATCATCTCAATCTTTTCGCCCTTTTCTTTTTTCCTTTCTTCTTCTTAGCTCATTACAGGGAGAGAAACACCAACATTAAATTTCACACAGGCTTTCATTGATCAAGTACGAACGAGGAATCAAGCTCTAAGGCATCAGTCACATCAACGAGGTAAAAGAAAGAGTTCAGAAATTAGCTCAGGTTAATGGATTCTGTTGGAAACATGGACGCCTCTAGTCAACTGGTCAGCCTTTGGATTTTTCATTAGTCGGATCTAAACTGAATCTGCAGCAGTGGTCACTTAGATGAAAGGTCAGCACAATGATTCCAAGAAAAACATCATAATCTCCAACAGGTTTTGACTCAAAAACGTTTTGACACGACTGACTCTTAAGAAAAACAAACACAATGTCAGCAACTACCTCCCCCAGACTTAAACAACACTGTCCCCAGTGTTATCTAGTCCGAAGTTGGTGAAACAAAAGAAATGAAACAGAGAAACGCAGGAAAAACAGAGAATTTACCTGGCCGCAATGATGGTGTCGAGCGACACTGATGATAGTGTCGTGCGACACTTGTTCTCTTCGTACCAAATTGCAGCAGATTCATCCGAATTTCTGGTTTGACTCCGGTTTCCTGATTTCCTAATTTTTGTTTTTTTTGACTGGTGTCGACTGACACTGATGGTGGTGTCGCTCGACACCAACCACTTCGTATCTATTACACCTAAAACACAAAACCAAAAAACGAAAATCAAAAGAAACAAAAAGACTTATGTACAGACTTACCAGTGGATTTCCTTCCACCAAGCGCTTGTTTTAAGTCATTAGTTTGACTATGGATAGACTATGCATCTGGTGGTTCAGACAGTGGCAAAGAATGCCTCTGTGAAAGTCGTCTCATCCATGGTGGTGTGTAAGCATTGTGCGCATGAGGTCGTCCAAGGAATACGGGAATAACAACAAGGTGGGATCTGTGTTTGTGTGGCCTTGACCTTTGCTT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

3764

Start:

11451301  

End:

11455064

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_6

ACCTTTGCTTTGGTGGAGATGAATAGAGTGAGATGTTTTGAACTCCCTGATCAACAGCAGTCACTGGTTCTGTAGACGTTTTCTTCAACTCAGGTTGATCTCTCACCTTCTCAGCATCAAACACGTTCTGATCTCCAACTATCACTTCAGGTATTGCACTGACTTGGAATGTCTGACCATCTATGGTTGAATCCTTCAGCCTCTCCATCTTGAAAGTCATGATGGTATCTCCCAAGTGGAGATCAAGGTTACCATGCTTGACATCAATTACCGCTCCAGCTGTAGCTAAAAACGATCTTCCCAGGATAAGAAGATCTTTGGGTTCCTCTCCATATTCCAGAACCACGAAATCTGTAGAATTTATGCAATCACCAACTTTAATCGGAACATCTTCCAAGACACCTTTTGGGATTCTTTTAGATCGATCTGCTAGGATCAAAGAGATCTTAGTTGGCTTGAAATCAGTCATTCCAAGGTTAACAGCTACTGAATAAGGCATGAGGTTAACACTTGAACCAAGATCACACAGCGATCTCTTGAACCTCTCTGAGAAGATAGAGCAGTCCAAAACAAAGCTTCATGGGTCTGAGAGCTTCTCTGGAATCTTATTCTGAATTACAGCACTGACCTGTTCAGAGATCATCATCACTCCTTCCTCATGACTCAGATTATTAGTCACCATCTTCTTCACATAGTGTCTGAGAGTGGGAGCAATCTTCACAGCATCAACCAAAGGAATCTCAATCACAAGTTTCTCCATCAAAGCCTTGCATCTGGCATCATCTATCTCCTACTTGGACTTCCTAGGAATCCTTGGGTAAGGAACCTTAGGTTTGTAAACCTTTTCCTCAGCAGATTTCGGACTTTGAGCAATATCAGCTTCGCTCTGCAATTGGTGACGCGCGACACTGGTTATGGTGTCGCTCGACACCGGCTCTGCAACTTCGAAATTTTCTGCAGATTCGTCCAACTCCACGATTTCATCCTTAGAAACACCCTTTTTAAGCACATGAGTCAACTTTTTATCACTCCTTGACGAGATGGCACTGCAGTAATGCCTAGGATTGGTGTCAGTCTTCCCAGGAAGGAATCCTTCTTGCCTTTTTACAGATTCTGCAGTTTGAGCAACCTGAGTATCAAGCTTCTTGACATGAGTGTTCAGAACTTCAATTTTTCCATTCAGATCAAGGTAGAGAGCATCCATCTTTCCATTAAAGTCCACGGTGAGCTTCTGCTGACCTTCCAAAATTTGTTCCAGCATAGACTTCATCTCATTGTCAGGATTTTGAGGTTGAGATGAAGGAGTGCTGTAATTTCTAGAGAAACTGTTGTTGGAAAAGGGTGTCTGGTACTGAGGTTTGGAGCTGTAACCAAAAGAGTTCTGATTACCTGTGAAGGTACTCCTCTGATTATTTCCACTGTAATTCGTGTTTCCTGGCTGAGTACCAAATCTCTGACCCTGAAATCCAGCTCCATTGATGAAGTTAACATCCTCTTCCTCAAGTGCTTCATCTGGTTCGAAATTCTTAACCTCTGCAGCATATCGGACGGACTTCTTACCCACTAGAAGGCTATGCACAGAGTCAAGCTTAGCCTTCACCTCAGCAATCTGCGATCCATCCATGTTTCCACCCTGCTTCTTTCACTGATAGTCTGCATTCTTGGTACTATTGCTAGATGCCAAGTTCTCAATAAGCACAACAGCGTCTTCAGGGTATCTGGTGTTGAAGTTCCCATTGCTTGCTGCATCAACACCCATCTGATATCTCCAATCAACACCTCTGAAGAAAATACCCAACAGCTGAACATCACTGAAACCATGATGTGGACAATCTCTTTGATATGACTTGAATCTCACCCAAGCAGCCTTGAATGCTTCAGTTAGTCCTTGAGAAAACGTTGAGATTTTGAGTCTCAGTTCCTCAGACCTCGCATCATCATAGAAATTGTGCAGAAAGGCGTTCCTGGTCTTCTCCCAAGTAGTTAGTGATCCTGGCTCCAACTGCTTCAACTAGTTAGCTGCTTCTCCAGCAAAAGAGTAAGGAAACAGCTTGCAGAAGGGGAAATCATTGGACACTCCATTGTACTTGATGCTGGTGACTAAGTCCTCAAACCTCTCAATATGATCCATCGGGTGATCATGAGAAAGACCATGGAAAGGATGCTGACCCACAAGAGTGTAGTACACAGGCTTCAGCTCAAAGTCATTCGTCTGAAACGCAGGGGCGCGAATCGCGGACCGATTTGCATAGAATTGCTCAGGCCTGTTGTAGTCACCCAGCGTCCTGATGATGTTACCCTCTCCATCAAGTCGCTGGCCTCTCTCATTACACACATGACCATCTTGGTCTCTCCAGACTCCAGCATCATCACGAACCAATACCAATCTGTTCTCCATCTTTGCTAATTTCTGAGACAAAGAGAAAGAGCAATGTAAGTAACAAAGTAATAATAAAATTAAACGAAAACGACTGGTGTCGCTCGACACTAAGAAAAACTTAGTCGAAACTCAAGAACTAAAGTTTAATGGCGAAAATCAAGTCCCCGGCAACGGCGCCAAAACTTGATCTGCTCAAAGTTTAATCCCTAGATCTACTCTGCAAGAGCACAGACGTGCAGTTGTAGTATGTAGGGGTCGAACCACAGAGACGAGAGATTCACTCAATAAACATATTAGGAATTGAATTACGCTAAGCAGATTAATGAGAATCAAATAGCGATGCAAATAAAGATAAACGAATGCAGTAAAAACGTTTGTAAAGTTCAGATGGGTGGAGATTAGGTCTAGGATGTTTCTCAGGAAATCAATGAATGCAGAACAATCGATTAATCAGGGCTCAGGTTTAAGCACGGTTCTTAAACTCAAATCACGAAATTATAACTAACAAACTTCCATTACGAGAATTATCTAAGTTTAAATATCAGAATTCCAAATTTCTTTGCAAATCCTAAAGACATAAACTATCTTTAAGCACAAGTTTGATATGTTCACAAAGCAGCTAAACCAAATTCCTTTGCGAATAGCTACTTTGCTCACCCTAGGTTCTTTCCAGTTATTCAATTACACTTCCGTGTCATTCAATTAACCTAAGATCTAAGTTCTAGGTGGCCAGTCCATAATTAGCTTTAAGAACAACCTATGGTGAAGAACTAAATAGATTATGAACCCTAACTAAATCAATTAATCAAACATCCAGAGAAAACTTTTATGAGAACCCTAAACCTAACAAGCAAACTACTCAGACATAGAGATTGAAGCAATAAACATGAATTAATAGATTGCAGTAAGCAGTAAATAGATTAATAAACAGGGGTTCGAAATCTTCTCTCTCCGGAACAGAGTTTCAGACTTGTCTCCCCAAAAGCTCTCAAAAACAAAAGTTCTCTCTCAGAAAATCTAAGGTATCGATATAAGGTGGCTAAAAACCCTATTTATAACTTAAAAACACGTTTTGGCTTCCTTCTAATTATTGGAGACTTTTGGGCCCAACTCCTTCTTCAAACAGGAAACAAAATCACGTTTTCCTTATTTCTGCAACAAGTGTCGAGCGTCACTCTTCATGGTGTCGAGCGACACTAAAGCACATGATTCATCCTTGACGAATTTGATCCTGATTAAGCTCCAAAGTGCTCCAAAGTCTCCAGTTAAGCTCCAAACGTACCTATGACCTGTAAAGACCCCAAAAGACTCGAGAAACACTAGAAAGACTCTATAAATAAGACATATACCATGGTTAAAAACCATAAAAACCATGATATATCAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

2235

Start:

11944481  

End:

11946715

Strand:

+

>scaffold_1_LTR_7

GGGAACAGTGTTGTTTAAGTCTGGGGGAGGTAGTCGCTGACATTGTGTTTGTTTTTCTTAAGAGTCAGTTGTGTCAAAACGTTTTTGAGTCAAAACCTGTTGGAGATTATGATGCTTTTCTCGGAATTATTGTGCTGACCTTTCATCTAAGTGACCACTGCTGCAGATTCCGTCTAGATCCGACTAATGAAAAATCCAAAGGCTGACCAGTTGACTAGAGGCGTCCATGTTTCCAACAGAATCCATTAACCTGAGCTAATTTCTGAACTCTTTCTTTTACCTCATTGATGTGACTGATGTTCATAAAGCTTGATTCCTCGTTCATACTTGACAAATGAAAGCCTGTGTGAAATTTAATGTTGGTGTTTCTCTCCCTGTGACGAGCTAAGAAGAAGAAAAAGAAAGAAAAAGGGCGAAAAGATTGAGATGATTTTCGCTTAGGAGTGAAGGGCTAGGAATGTTTCCAATGATCCCATTATTTCCCTTCTAAGTTGGAATGATCACACAAAGGAAGGAAGTGAGGGGTAGGAAAGTTTCCCATGACCCCACTATTCGCTGAAAACATTTGATACAAGATAAGGGGACAACTCGGGGACTCGATGGCAAACACCATCAGTACTCGCAGCTTTACTCTTATCGAGTATATGCCAGAAAGAAAAAAAAAATATGATGAATGTGCGAAAAGAATAAGTCTGGGGGAGAGAAAAAGTACCAAAGTTTGTATGGCTGATTTGTTTGAGTATAGAATGGGAAAGAGTCTAGAAGGTTCTTGGCATTGGAATCATCAGTGAGATCCAGCGATGAGGGTTTATGGACAATGTTGTGGAATTTTGGACTTAATCTGGAAAGCTGTGAATGTCTGCGGAGAAGTACATGGTGGTTCGATTTGGAGTGATGAAGCAGTAGTTGAGTTGCAGGATAATCGGTCAAAAGCGATGTTCCAATGAAAGGTTGAGTCTCTGCATTTTCAAACCTCTTTCTCTTATTTGGTGTTCTGTTTGCTTGAGGGCAAGCAAATGCTAAGTCTGGGGGAGTTGATATATCATGGTTTTTATGGTTTTTAACCATGGTATATGTCTTATTTATAGAGTCTTTTTAGTGTCTTTCGAGTCTTTTGGAGTCTTTTCAGGTCATAGGTACGTTTGGAGCTTAACTGGAGACTTTGGAACACTTTGGAGCTTAATCAGGATCAAATTCGTCAACTATGGATTTTGTGCTTTAGTGACGTTCGACACCATGGAGAGTGACGCTCGACACTTGTCAGAGAAATAAGGAAAAGGCAATTTTGTTTCCTATTTGAAGAAGGAGTTGGGCCTAAACGTTTCCAAGGAAGCCCAAGACGTGTCTTAGAGATATATATAGGATTTTTATTCTTTTTTTACGAGAACCTTAGATTTTTGAGAGAGAGATACTCTGAGTTTTCGGCTTTTGCGATTTCTGAGCTTGGGGAGACAAGTCTGAACTCTGTTCGTTTATAGAGAAGATTTCAAACCCCTTTATCTATTTCGACTTAATCTATTGCTTTCTATTCATCATGTTTGTTGTTTCGATAACCATGTCTGAGTAGATCACCTGTTAGGTTTAGGGTTTAATTAGGGTTTTCTTTGAATGTTTGATTAACTTGCTAGTTAGGGTTCATATCTATTATTTTTTCACTTTAGGTTGTTCTTAATGCTAATTCTAGACTGATCACCTAGAACTTAGATCTTAGGTTGCTTGATTGACACGGAACTGTAATTGAATAACTGGAAAGAACCTAGGTTGAGCAAAGTAGCTATTCGCAAAGGAATTTGGTTTATATGCTTTGTGAACCTACCGAACTTGTGCATTAAAGCTGGTTTAAATCTGTAGGATTTGCAAAGGAATTTGAAATTCTAGGATTTTAACTTAGATAATTCTCACAACGGAAGTTGGTTAATTATAATTCTGTGTTTCGAGTTCAAGAACTGTGCTTAAACTTGAACCCTGATTAGTTAAGTCGATCTGCATTCATTGATCTCCTGAAAATGCCCTAGACCTAATCCTTACCACATCGAACTTACAAACCGTTTTCCTTGCTGTTTTATTTATCTCTGTCGCATTGCTAGTTGTTTCGCATATTTTGGCTTAGCGTAACTCCATCTACATAAGGTTTATTGAGTGATCTCTTGTCTCTGTGGTTCGACCCCTAGATACTACAACTGCACATCTGTACTCTTGCAGAGTAGCTTAGGGATTAAACTTTGAGCAGATCAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1244

Start:

12048589  

End:

12049832

Strand:

+

>scaffold_1_LTR_8

TATCATGGTTTTTATGGTTTTTAACCATGGTATAGGTCTTATTTATAGAGTCTTTTTAGTGTTTTTTGAGTCTTTTGGAGTCTTTACAGGTCTTAGGTACGTTTGGCGCTTAACTGGAGATTTTAGAGCACTTTAGAGCTTAATCAGGATCAAATTCGTCAAGGATGGATTTTGTGCTTTAGTGTCGCTCGACACCATGGAGAGTGACGCTCGACACTTGTCAAAGAAATAAGGAAAAGGCGATTTTGTTTCCTGTCTGAAGAGGGAGTTGGGCCCAGAAGTTCCCAAATAATTCTAAGAAGGCCCAGAACGTGTTTTAGAGATATATATAGGATTTTTATTCCCTTTTTATCGACACCTTAGATTTTTGAGAGAGAGATACTTTGAGTTTTTGCTTTGGGCGATTTTGAGAGCTAGGGGAGACAAGTCTGAACTCTGTCCGTTTAGAGAGAAGATTTCGAACCCCTTTATCTATTTCGATTTAATCTATTGCTTTCTATTCATCATGTTTAATGTTCCAATAATCATGTCTGAGTAGATCACCTGTTAGGTTTAGGGTTTAATTAGGGTTTTCTTTCAATGTTTGATTAACTTGCTAGTTAGGGTTCGTATATGTTAGTTCTTCATCTTAGGTTGTTCTTAATGCTAATTCTGGACTGATCACCTAGAACTTAGATTTTAGGTTGCTTAATTGACACGGAAGTGTAATTGAATAACTGGAAAGAACTTAGGGTGAGCAAAGTAGCTATTCGCAAAGGAATTTGGTTTAGATGCTTTGTGAACATATCAAACTTGTGCATTAAAGCCGGTTTAAATCTGTAGGATTTGCAAAGAAATTTGGAATTCTAGGATTTTAACTTAGATAATTCTCACAACGGAAGTTGGTTAATTAAAATTCTGTGTTTCGAGTTCAAGAACCGTGCTTAAACCTGAACCCTGGCTAATCGATTGATCTGCATTCATTGATTTCCTGAAAAATGCCCTAGACCTAATCTTTCTCCAATCGAATTTACATCCTTTTTCTGTTGCCTATTTATTTTATCTGCATCGCTGTTTTTATCTCTCATTGTTTTGCTTAGCGTAATTCGAATTCTAATAGGTTTATTGAGTGACTTCTTGTCTCTGTGGTTCGACCCCTACATACTACAACTGCACATCTGTGCTCTTGCAGAGTAGCTTAGGGATTAAACTTTGAGCAGATCAAACAAAAGAGAGAAGGAGAAGTCAAAGAGATAAGGCTAAAG

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1193

Start:

12344674  

End:

12345866

Strand:

+

>scaffold_1_LTR_9

TATCATAGTTTTTATGGTTTTTAACCATGGTATAAGTCCTATTTATAGAGTCTTTTTAGTGTCTTTCGAGTCTTTTGGAGTCTTTTCAGGTCATAGGTACGTTTGGAGCTTAACTGGAGACTTTGTAGCACTTTGGAGCTTAATCAGGATCAAATTCGTCAAGTATGGATTTTGTGCTTTAGTGTCGCTCGACACCATGGAGAGTGACGCTCGACACTTGTTGCAGAAATAAGGAAAACGTGATTTTGTTTCCTGTTTGAAGAAGGAGTTGGGCCCAAAAGTCTCCAATAATTACAAGGAAGCCCAAAACGTGTTTTTAAGTTATAAATAGGGTTTTTAGCCACCATATATCGATACCTTAGATTTTCTGAGAGAGAACTTTTGTTTTTGAGAGCTTTTGGGGAGACAAGTCTAAAACTCTGTTCCGGAGAGAGAAGATTTCGAACCCCTGTTTATTAATCTATTTACTGTTTTCTGCAATCTATTCATTCATGTTTATTGCTTCAATCTTCATGTCTGAGTAGTTTGCTTGTTAGGTTTAGGGTTCTCTTAAAGGATTTCATTGGATGTTGGATTGATTGATTAGTTAGGGTTCATAATCTATTTAGTTCTTCACCATAGGTTATTCTTAAAGCTAATTCTGGACTGGCCACCTAGAACTTAGATCTTAGGTTAATTGATTGACACGGAAGTGTAATTGAATAACTGGAAAGAACCTAGGGTGAGCAAAGTAGCTATTCGCAAAGGAATTTGGTTTAGATACTTTGTGAACATCGAACTTGAGCATTAAAGCTGGTTTATGTCTTTAGGATTTGCAAAGGAATTTGGAATTCTAGGATTTAGACTTAGATAATTCTCGCAACGGAAGTTGGTTAATTATAATTTCAAGATTTGAGTTCAAAAACTGTGCTTAAACCTGAACCCTGACTAATCGATTGATCTGCATGCATTGATTTCCTGAGAAACGCCCTAGACCTAATCTCCATCCATCTGAATCTTACAAACCGTTTTTATTGCTGCTTAGTCTAATTCTGTTGCATTGCTATTTATTTACAATATTTCTGCTTAGCGTAATTCGATCTCTATAAGGTTTATTGAGTGATCTCTCGTCTCTGTGGTTCGACCCCTACATACTACAACTGCACATCTGTGCTCTTGCAGAGTAGCTTAGGGATTAAACTTTGAGCAGATCA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

2252

Start:

12353772  

End:

12356023

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_10

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

161

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12358185  

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12358345

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-

>scaffold_1_LTR_11

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

181

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End:

12358559

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_12

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

5300

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Strand:

+

>scaffold_1_LTR_13

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

4702

Start:

13041323  

End:

13046024

Strand:

+

>scaffold_1_LTR_14

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1211

Start:

14551863  

End:

14553073

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_15

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

918

Start:

14805193  

End:

14806110

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_16

CTCCCCCGAACTTGAATCCTTGTTTGTCCTCAAACAAACTCGAATTCAACTCCAAAAGAATGACTGGATAAAGCTGGGAACTCGCAAAACTCAAAAGACCGTAAACCTGACCAAGGCATGTGACAATCTGCTGCAAAATCAATCAAAAATCTAACCTCCATGTACTTCTCCGTAGACGCTGCAGCTTTCCAGATTAGTCCCTCAATTTCATAACATCATCCATGTCCCATCATCGCTGAGTCTCATCGATAAAACCAGTGCTAAGGACCTTCTAGACTCGTTCCCATACTTATACCTCAACAAATTGACCATACTACACAAAAGTACCTTTCCTCTCCCCCGAACTTATTCACTTTTCAAGCTGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCGGCACATATAACAAGGTTCAAAGACGCGAGTATTGATGGTGATTGCCACCGAATCCCCGGTTTGTCCCCTCATCATATATCAAAGGTGTAGGCGAACAATGGGGTCACAGGAAATTTTCCTACCCCTCGCTTCCATCCCTTGTGTGATCATTCCACTTTAGAAGTAATATAATGGGATCCTTGGAAATTTTCCTAACCCTTTACTTCTAAAAGAAAATCATCTCAATCTTTTCTGCCTTTTGATCATATTTTTTTTTAGAAACAGCCTGAAACAATGCTTAGAACATAAGAGAGGAATACCAAATCTATCACACATGTCTTTATTTGTCAGGTAAGAATGAGGAGTCAAGCCCTATGAGCACTAACCTGATCGATGAGGAAAATGAAAAGCTGAAAAATTAGCTCAGGTTCATTGGATGTGTCAAGAATTTTGGACTCCTCTAGTCTACTGCTTTGTCTTTGGATTTTCCATTAGTCGATCTAGATGATTCTGCAGCAATAATCACTAGAAGAAGGTGGTCA

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1620

Start:

15314797  

End:

15316416

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_17

TGATCTGTTCAAAGTTTAATCTCTAAGCTACTCTGCAAGAGCATAGATATGCAATTGTAGTATTGCAGGGGTCGAACCACAGAGACAAGAAATCACTCAATAAACCTAATAGAATTCGAATTACGCTAAACAGAATTATAAAAAATAAATAGCGATGCAACAGAAATAAACTAAGCAGCAGTTAAAACGTTTGTAAGATTCAGATGGATTGAGATTAGGCTTAGGGCGTTTCTTAGGAAATCAATGAATGCGGATCAATCGATTAGTCAGGGTTCAGGTTTAAGCACGGTTCTTGAACTCGAATCACAAAATTATAATTGACCAACTTCCGTTGTGAGAATTATCTAAGTTAAAATCCTAGAATTCCAAATTCCTTTGCAAACCCTAAAGATTTAAACCAGCTTTAATGCTCAAGTTCAATATGTTCACAAAGCATCTAAACCAAATTCCTTTGCGAATAGCTACTTTGCTCACCCTAGGTTCTTTCCAGTTATTCAATTACACTTCTGTGTCAATTAAGCAACCTAAGATCTAAGTTCTAGGTGATCAATCCAGAATTAGCTTTAAGAACAACCTATGGTGAAGAACTAATCAGATTATGAATCCTAACTTAATCAATTAATCAAACATTCAGAGAAAACCTTAATGAGAACCCTAAACCTAACAAGCTAACTACTCAGACATGGATATTGAAACAACACACATGATTGAATAGATTGCAATAAGAAGATAAATAAAATAAATAAAAGGGTTCGAAATCTTCTCTCTAAACGAACAGAGTTCAAACTTGTCTCCCCAAGCTCTCAAAATCGCAAAAGCCTAAAGCAAAAGATGTGTTCTCTCGAAAATCTAAGGTAAGGTTCAAAAGAGACGAAACACCCTATTTATATCTTTAAAACACGTATTGGGCTTCTTTGGAGACTTCTGGGCCCAACTTCTTCTTCAAACAGGAAACAAATTCGCGTTTTCCTTATTTCTTTAGTGTCGAGCGTCACTCTCCATGGTGTCGTGCAACACCAATGCACATGATTTTTCCTTCGCGAATTTGATCCTGATTTAGCAACAAAGTGCTCCATAATCTCCAATTAAGCTCCAAACGTACCTATGACCTGTAAAGACTCCAAAAGACTCGAAAAACACTAAAAAGACTCTATAAATAAGACATATATCATGGTCAAAAACCATAAAAACCATGATATATCAACTCTCCCAGACTTAGCATTTGCTTGCCCTCAAGCAAATAGAATACCAAATAAGAGAAAGAGGTTTGAAAAACACGGAGACTCAACCTTTCACTGGAACATCGCTTTGAACGATCACCTTGTAACTCAAATACTGCTTCATTATTCCAAATCGAACCACCATGTACTTCTCCGCAGACATTCACAACTTCTCAGATTAAGTCCAAAATTCCACAACATTGTCCATAAACCCTCATCGCTGGATCTCACTGATGATTCAAATGCCAAGAACCTTCTAGACTCTTTCCTGTACTATACTCAAACAAATCAGCCATACAATCCTTTGGTACTTTTCATTCCCCCAGACTTATTCTTTTCGCACACTCATCATCATTTTTTATGGCATATACACGATAAGGTTAAAGCTGCGAGTACTGAT

Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1494

Start:

15641662  

End:

15643155

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_18

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

2849

Start:

15643132  

End:

15645980

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_19

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Eutrema salsugineum (v1.0)

ID:

scaffold_1_LTR_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

2029

Start:

16322462  

End:

16324490

Strand:

-

>scaffold_1_LTR_20

AGGAGATCAATGAATGCAAATCAACTTAACAAGTCAGGATTCAGTTATTAAGCACGGTTCTTGAACTCGAAACACAGAACTATAATTAACCAACTTCCGTTGTGAGAATTATCTAAGTTAAAATCCTAGAATTCCAAATTCCTTTGTAAATCCTACAGATTTAAACCAGCCTTAATGCACAAGTTCGATATGTTCACAAAGCTCCTAAACCAAATTCCTTTGCGAATAGTTACTTTGCTCAACTCAGGTTCTTTCCAGTTATTCAATTACACTTCCGTGTCAATTAAGCAACTTAAGATCTAAGTTCTAGGTGATCAGTCTAGAATTAGCTTTAAGAACAACCTAAGGTGAAGAACAAATAGATATGAACCCTAACTAGCAAGTTAATCAAACATTCAAAGAAAACCCTAATTAAACCCTAAACCTAACAGGTGATCTACTCAGACATGGTTATTGAAATAACAAACATGATGAATAGAAAGCAATAGAATAAATCGAAATAGATAAAGGGGTTCGAAATCTTCTCTCTAAACGAACAGAGTACAGACTTGTCTCCCCAAGCTCAGAAATCGCAAAAGCCGAAAACTCAGAGTATCTCTCTCTCAAAAATCTAAGGTGTGTGTAAAAAGGGAATAAAAATCCTATATATATCTCTAAAACACGTCTTGGGCTTCCTTGAAAACGTTTGGGCCCAACTCCTTCTTCATATAGGAAACAAAATCGCCTTTTCCTTATTTCTCTGACAAGTGTCGCGCGTCACTCTCCATGGTGTCGAGCGTCACTAAAGCACAAAATCCATACTTGACGAATTTGATCCTGATTAAGCTCCAAAGTGCTCCAAAGTCTCCAGTTAAGCTCCAGACGTACCTATGACCTGAAAAGACTTCAAAAGACTCGAAAGACACTAAAAAGACTCTATAAATAAGACATATACCATGGTTAAAAACCATAAAAACCATGATATATCAACTCCCCCAGACTTAGCATTTGCTTGCCCTCAAGCAAACAGAACACCAAATAAGAGAAAGAAGTTTGAAAACACAGAGACTCAACCTTTCATTGGAACATCGCTTTTGACATATCACCCTGCAACTCAACTACTGCTTCATCATTCCAAATCAAACCACCATGTACTTCCCTGTAGACATTCACAGCTTTCCAGATTAAGTCCAAAATTCCACAACATGGTCCATAAACCTTCATCGCTGGATCTCACTGATGATTCCAATGCCCAGAACCTTCTAGATTCTTTCCCATTCTGTGCTCAAACAAATCAGCCTTACAAACTTTGGTACCTTTTCTCTCCCCCAGACTTATTCTTTTCGCACATTCATCATCTCTTTTCTTCTCTTTTTCTTATGGCGCATACTCGATAAGGATAAAGCTGCGAGTACTGATGGTGTTTGCCACCAAGTCCCCGAGTTGTCCCCTTACCTTGTATCAAAGGTTTTCAGCGAATAGTGGGGTCATGGGAAACATTCCTACCCCTCACTTCCTTCCTTTGTGTGATCATTCCAACTTAGAAGTGAAATAATGGGATCATTGGAAACATGTCTAGCCCTTCACTCCTAAGCGAAAATCATCTCAATCTTTTTGCCTTCTTTTAGCTCGTTACAAGGGAGAGAAATCACTTCATTAAATTTCACACAGGCTTTCATTGATCAAGTACGAATGAGGAATCAAGCTCTAAGGCATTAGTCACATCAGCGAGTTAAAAGTGAAGTTCAGTACTTAGCTCAGGTTAGTGGATTCTGTTGGAAACGTGGACGCCTCTAGTCAACTGGTCAGCCTTTGGATTTTTCATTAGTCGGATCTAGACTGAATCTGCAGCAGTGGTCACTTAGGTGAAAGGTCAGTACAATAATTCCAGGAAAAGCATCATGATCTCTAACAAGTTTTGACTCAAAAAAAAAGTTTTGACACAACTGACTCTTAAGAAAAACAAACATAATGTCAGCAACTACCTCCCCCAGACTTGAACAACACTGTCCCCAGTGTTATCAAATCCGATGTTGGTGACAAAAGAGAA