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scaffold_1_LTR-Copia_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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1674

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38939  

End:

40612

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-

>scaffold_1_LTR-Copia_1

CCCCTGAAAACTCGAGGTGGGTGGCAAGTCAACTCCGAGTTTGAACCGAAGAGAAGTGAATGCAGCTTGAGGGAGAGACTTGGTAAAAATATCGGCGAGCTGGTGACTTGAGGGAACATGTTTGATGACCAGAGAACCCAAAGCAACCTTTTCCCGAGCAAAGTGAAAGTGTGTTTCAAAGTGTTTTGTTCTGGGATGAAACACTGGATTTGCCGTGAGTTGAACAGCAGACAGGTTATCACAATAAACCTCTGCTGGTTCATTCTGTGGAACTCCTACATCACGAAGTAGATTAGAAATCCAAGCAAGCTCTGCAGCTGTATCTGATAAGGATCTGTACTCGGCCTCTGTAGAGGAACGAGCAACTGTAGACTGTCTTTTAGCTGACCATGAAATGATATTGGAGCCTATGAAAGTGCAGAAACCACCGGTTGATCTTCGTGTGTCTCGACAACCGGCCTAGTCTGAGTCGCTATAAGCTCGAAGAGTGTAATCAGACTCAGCTGTAAAGTAAAGACCCATTGCTAGTGTACCCTTTATGTATCGCAGGATTCGTTTTAGAAGGGTAAAGTCTGAAACCGATGGTTTGTGCATCTTCTGACAGACAAAGTTCACGGCATATTGAACATCAGGTCTTGTCAAGGTAAGGTATTGAAGTTTACCTGCAAGACTCCTGAAGTATGTCGGATCAGAGAACTCCTCATCCTGATTAGGAACTTTGTCAAGCTGTAGAGGAAGCGGAGTAGGCATTGGGGAGCAGTCAAGCATTCCTGCATTGATGAGTAAGTCAGTCGCATATCTTTCTTGATTGAGAAACAGCCCCGATGGAGTAAACTGAGCCTGAATCCCCAAGAAGTAGCTTAAAGGCCCCATATCCTTCATCCTGAATTTTGCACTTAATGAATCAATAAAGGCCTGCATCAGTCTTGAATCATTTCCTGTTAAGACCATATCATCAACATATAGAAGAAGGAGCATCACTTGATTGTTGTGTATGTATACAAACAGAGAAGGATCGGATGGACTACAGATGAACCCAAAGGCAAGCAAATACGTGCTAAATTTATCAAACCATGCCCTGGGCGCCTGTTTAAGTCCATAAATGGCCTTGTTCAACTTACAGACATAATCCGGATGATCTTTATCTGCAAATCCTGGGGGCTGTGTCATATACACAGTTTCTTGTAAATCGCCATGTAAAAAGGCATTCTTTACATCTAGTTGCTTAAGAGGCCAACCTTCAACTGTTGCAGTGTGAAGAACCATTCGAACTGTTGCAGTCCGAACAACAGGGCTGTAAGTCTCCAAGAAATCAACCCCTTCTTCTTGATCAAAGCCTTTGGCTACCAGGCGAGCACGGAGTTTATCCAGAGTACCATCTGCATTCAATTTGGTTTTAAAAACCCAACGACAACCAAGAAGGTTTGCATCAGCTGGAGGTGGGACAAGAGTCCAAGTATCTGTCTCATGACAAGTTTCGAGTTCTTCTTCACAAGCTGCAGTCCAACCTGGATGTTTGAGAGCTTGAGCCACTGTTTTTTGGTTCCTGAGGAATGTCCTTTACGGCAAAGAGTATGTAACGAGGATTGGGTTTGCGTATACCATCCTTTCCTCGAGTTCGCATTGGATGCATATTGGTGTTGGTATCTCCAGGATCCTCAGAGCTGTTGTCTT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

2274

Start:

40879  

End:

43152

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_2

AGAGGAGTTGTAGCTTCAGGTATCAAGGCTTGGTAAGTATCCATGAAAGGAAACCTTGACTCATCAAACAAGGCATGGCGACTGATATAAACTCTTCCGGTTGGTGGATGGAGACAACGGTAGCCCTTGTACTTTTCATTGTATCCAACAAAAACACAGAGAAGCGACTTGGGGTCAAACTTATTGTGAGAATAAGGACGAAGGTTGGGATAACAAGCACAACCAAACACACGAAGAGCCGTGTAAACAGGTGCTTCACCGTGTAGAACTTGATAAGGGCTCACCATATCATCATGAACTGATGTAGGAAGAAGATTTGAAAGGAAGTTTGCAGTGAACAAAGCTTCAACCCACAGATATTGTGGCAAGTGGCTTTGAAAGAGCATAGACATTCCCAACTCCATGATATGCCTATGTTTTCTTTCTGCAAGGCCATTTTGCTCAGGAGTATGTGGACATGAGATATGGTGTTTAATACCACACACTGCAAAGTGCTCAATGAACGATTTGTTTATGAACTCTCCACCTCCATCGCATTGAAACACCTTGATTTTGTGATTGAATTGATTCTCGACAAGTTGTTGGAACGTTTTAAAGATAGAGAACACATCAGATTTCATTTTAAGAGGATAGAACCAACAGAACCTTGAGTAATTGTCGATGAATACAACATAATATTTGAACCCCTGAACTGATACAATAGGTGCAGGACCCCAGACATCACAATGTATCCTCTCAAGAGGTCTACTGGAATGAAAAAGAGACTTAGAAAAAGGTAGTTTGCAGGTCTTTCCCAACTGGCATGACTCACACATCGATGAGGTGACTTTATTGAAAGAGATAGCTTTGATAGAAGATAGATGTCGCAGGACTTGATGGTGAGGATGGCCAAGCCTCTGGTGCCATACGGAGTCACTTGTTTGTTGTTGCCATGACGAGTAATACACCATTGGAGAAGTCTCCTCTAACCGATACAGCCCTTCAACTTTGTTGCCCTGACTGAGAAGCTGATTTGTGCTCTTGTCCTTAACACACACAGAATGAGAATCAAAGACAAATTTGCAGGGATAGTCATCTGTAAGCTTTGAGACAGAGAGAAGAGACTTAGTAATCCCAGAGCAAACAAGAACATCTGTAAGAGGCAATTTACCTGAAACAGATGGAAGAGCAACAGACCCAATATGAGTTATAGGGAGAAAATCACCATTACCAACAATAACGCCCTCTGAACCGGTGTAAGGCTGAGTAGTGTCAAGGTGGTGAGCCGAACTGGTGACATGATGGGTTGCACCAGTATCCGGGTACCACTCAGCTCCAGGATTTGGTTGTGGAGGTCCAGAAAGCTTCATTGCAGCCATAGCTTGAGGAAGAGATTCAGATGGTGTTTCGTATTCCTTATCAAAGCGCTTGAAGCACCTCTCAGCACTGTGACCATATTTGTGACAGATTTGACATGTAGGCCGTTGTCCAGTGGGAGTAGAGCCTCAGCCACTTCCCTGACCAAACTGTTGAGGGAAGCCGCGTCCTTCGGTGGAGTAAGAGCCACGTCCACGATATCCACCGCCAGCTGAGCCTCGACCTCTGTTGTTGTAACCTCCTCTAGCTGTATAGAAGGCCTGATGTGGATTAACCTCAGTCGTTGCAGAGTACTTTTGCAGCTTCTCATCAAATCCTGTGAGTTTGTACACCACATCTTCGAAGCTAAGTCCATATTGAGAGTCCATTGTGTGTTCAATGACTGTGACTATGGACTCATATTCTCTACCAAGACCAGTTAAAATGCCATAGATCTTCTCATGTTCAGTGATTGGAGACCCAATAGAGTCAAGCTGGTCACAAAGCGACTTTATTTCTGCAATGTATTGAGCTAAGGGCCGGTTTCCCTTTGCAGTTGTCTGAATCCTACTCTGGATTTCCAACTTTCTAGTAGCAGAGACTCGGTTGTACTTCTTGGCCAAGGAAAACCACACCTCCTGAGAAGAATGGAGGCCGTAAATACTTTTGAGAGCATCTTCAGACAGAGATCCATAGATCCAGGCCATAATGAGTTGATCTGTGTGAACCCATTTGAGAAAGTCTGGGTTACTCACTTCAGAAACCATCTCACCATTTCGAACCATGACTGTTGGTGAAGGTCTTGGAACAGCACCGGTCACATACCCCAAAAGGAGCTGACTTTGTAGAAACTGTTCAAACTGAAGCTTCCATGACAAGTAGTTGGAGTCATTGAGCTTAAGAGTGACAACCTGCGTGATAGACAAGGCCGCCGGAGTG

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

309

Start:

442239  

End:

442547

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_3

CAACACCAAGATTACGACTTTAAACAAGAAATGAAACAGAGTAAAGAGAAAGGAAGAGATGAAAAACACACACGAGTTTTACGAGTTCACGCCCAAACCGGGTCGCTACGTCTCGCCGGGATCTTTCTCCCAGAATCCACTAGATCAATAGAGGTTATAAGAGTTTAGACACAATCCCGAGTTCCCCTTTTACAAAGGCTCACTCTCTGTTCTACTTTACCCCTTTTGTTATCCCGAGAAAACCCTTACACAAGTTTACACTCTGTAAATAAGAGTTTCTCTATCACACTCTATTTCTCAAAATGTCTC

ID:

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Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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4264

Start:

442810  

End:

447073

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_4

CTTCTTTATTTGTCTTGATCTTTAGTACTATATTTCAACAAATCTCCACCTAGTAGTGAACGATCAAGCCTGCAAAACAACACTAAACGAATTTCTTGAGAGTGAGAGATAGACTTCTCATTGAACTAGTTTACTGGATTCCAGATCCCGGATTCCTGAGTCTTATTACTCAGCCTTTACACGCAGTAAGTCTAGAGCTGCTTGGAGCTTACTTGCGGGTAAAATCTTGGTGAAGATATCAGCTGGATTCCTCAATGTTGATATCTTTAAAACCTCCACAATACCATCTGCAATTGTATCCTGAATCTTGTGGTACTTGACAGCGATGTGCTTAGTTCTCTAATGGAACACATTGTTCTTTGAAAGAGCTATGACACTTTGGGAATCACAAAATATTTCAACACTTCCCTGTTTATAGCCAAAGTCTTCCAGTAATCCCTTAAGCCAAATAGCTTCTTTAACAGCTTCATTCAGAGACATATACTCGGCCTCAGTAGTCGATAGAGCTACCACCTTCTGCAGAGTAGATCTCCAGCTGATTGTGTTTCCACCGAGAGTAAACACCATTCCACTAATGGACCTCCTCCTGTCGGCATCTGCAGCGAAATCAGAATCACAGTATCCCCTGATTACGAATTCTGAACCTTTGCAGTAGCACAGCTTGGTCTTTAGTGTCCCCTTGATGTATCTAAGCACCCACTTAACTCCCAGCCAGTGTTCCTTAATAGGTTTGCTCATAAACCGGCTGATTATTCCCACAGGGTATGCCAAATCTGGTCTTGTGCCTATCATAGAGTACATGATGCTCCCAACAGCATTTGCATACGGAACACTCTTCATGTATTCCTCTTCTTCAAGCAATTGCTTCTCTGTTGCTGCACACATCTTCAGATGAGCCCCGAGAGGTGTAATCACTTGCTTTGCTTCTCCCATCTTATACAAATCAAGAACTTTGCTCAAGTATCCTTCCTGGGACAGCTTCAGAACACCTTTTTCTCTGTCTCTTCTGATCTCCATGCCTAGTATTTTCTTGGCTGGTCCAAGATCCTCCATTTCGAACTTGATATTGAGTTGTTGTTTTAATTCTGAAATCACTCCTTTGTCTTTTGCAGCAACCAACATGTCATCAACATATATTAACAGATAGATCTTGGATCCATCCCCAAGCGTTTTTATATACGCACAACTATCATGAGGACTCTTTTCAAAACCAATCTCTGTCATATAACCATCGAATTTCTGATTCCACTTCCTTGGCGCTTGTTTTAAACCATAGAGTGACTTGTTTAGTAGACACACCTGATTATCCTTGAACTTGTCCTTATAGCCTTCTGGAATCTCCATATAGATCTTTTCATCTAGTTCACCATGGAGAAACGCAGTCTTTACGTCTAACTGTTCAAGTTCATAATCCTCTTCCACAACAATAGCAAGTAGTATCCTTATAGACACATGTTTCACCACTGGTGCGAAGATATCTGTGTAGTCCACTCCTTCCCTTTGAGCATATCCTTTTGCAACCAACCTCGCTTTGTATCTTGGTTCTTCTACTCCAGGAATTCCAGGCTTACGCTTGAAAATCCATTTGCAGCCAATCACACGTTGATTTTCTGGCCTTGTAACTCCGGTCCATGTGAAGTTTTTCAGTAGAGAGTCCATCTCTTCATTCATTCCTTCTTTCCAAAGTTCCCAGTCCTCATCCCTTCTCGCTTCCTGATAGTTAACTGGTTCCAGTTTGTCTCCATCGACTGTAGTGATCAGAGCTTCTGCAGAAAAGACTTCATCTTCCTCATCGGCATCTTCACCATAATATCCCTCAATGTCAAATCTTTTTGGAGCCCTTAATTCTCTTCTTTGTCTATCTCGAGCTAGATGATAACTTTTTGGTGTATCTTCTGTACTCTCTTCTGCAACTTCTTTATTTTCTTCTTGAACCGCTTCATGGTTAGCTTGGTCTGGTGAGTGATCTCCCAGGGATCCTATCTCTTCCGAGAGATCTCCACCAGAGGGTGTAACCACTGTTTTCCCAAGGTCTATATCCAGTAGTGAGTTTGACGATTCAGCTTGTTCCCCTAAAGACCCTTTCTTGCCTTGCATCACGTCCTTATACACTGCATTTTCTTGGAAAATCACATTTCTGCTGATAATGCATTTCTTTTCTTCTAGCAGCCAGACTTTGTATCCCTTAACCCCATCTGGATATCCCAATAGAACTCCCTTCTTTGCTCTTGGCATCAACTTCCCTTCATCTGTATGAACAAAGGACAAGCAGCCAAATCTTCTCAAGTAACTGTATATAGGGGATCTACCTGTCCATTTCTTGTCAGGTATCTCGGAGTTAATTGCAGAAGATGGAGTTTTGTTGATCAAATTCACAGCGGTGTGAGTTGCTTCGGCCCAGAATGTCTTAGGTAGCCCTGATTCACTCAACATACATCGAACTTTCTCCATAATGGTTCGGTTCATCCTCTCTGCAACGCCATTTTGCTGAGGCGTGTAGGCACAGGTTCTGTGTCTTACTATTCCCTTTTCTTTACAGAAATTGTTGAACTGGAGGTTGCAGAACTCGAGACCATTATCAGTCCTTAACACCTTGATTTTTTTCTCAGTTTGATTCTCCACCATGACACTCCATTCAACAAAAGACCTGAATGCTTCATCCTTGTGCTTCAGAAAATATACCCATGTTTTCTTTGAGTAATCGTCTATGAGCGATATGAAGTATTGGCATTTTCCCAAAGAAAATGGAACTGTAGGAGCTCCCCACAGGTCTGAGTGAATGTAGTCTAGTTTGTCTCTTGTGTCATGAGTTGCATAGTCAAAACCGGTTCTTCTAGCTTTACCATAGACACAGTCTTCACACATCTCTAATGTGGACACTTTCTTCTTGTCAAGAAAGCCTTTCTTTACCAGAATATCCATATTCCTTTGACTCATGTGGCATAATCTCCTGTGCCATAAGACTGTGTCGTCCACTCTTCTTTCAACAGCCAGAGATTGACCGTTCTCAGGTTTTCCTTGAAGTATGTAGAGCTTTTCATACCTCCTTCCTGTCATGATGATCTTTCCTTCTTGCTTGATATTGAGAATCCCATTCATTGATTCAAAACCGCACCCTTGCTCTTCTAAGGTCCCCATAGATAGCAGATTCCGGTCCATGTCTGGTATGTATCTGACGTGCTTGAGCAGAACTGTCGAGCCATCATCATTTCTGATTCTTACATTACCAATACCCTTGACCTTCGATGTGGTCTTGTTTCCCATCCGAACTGATCCTCCTGCGTCTTCACTTAAGTACTCAAACCATTCCCTTTTATGGGTCATGTGGTAGCTGCACCCAGTGTCCATAATCCATACATTTTCCAGGCTTACGTCTGTTGAATGTAGGGCTTCTGACACATAGCACCCTGCAGCATCTTCATTGTTTCCCTGTACCATTGCAGCTTCTCCTCTGCTAGAGCCCGCTTGTTCCTTCTGCTTGCTTGGAAATTTGTTGCGATTGGGACAGGAATTTTTGAAGTGTCCTTCTTCCCCACAAATCCAACAGCTTTTCTTTCCCTTGGTTTTAGATTTCTTGTTCTGTTTAGAACCTTTCTCTTTCTGTTCTCCTTTGCTTTTCTGTCCTCCCTTATCCTTGACATAAAGACTTTCTGCTTGAGCTTTTGAACCTTTTGAGTTCGATCCAAACTCTAGTTCCTTTGAGTATATGGCGGCAACAACCTCATCAAGTGTGACTGTGGTTCTTCCTGCTCCATATTTCAGTGTGTCTCGCAGAGAATCAAACTGTCTTGGGAGAGACATTAACAAAAGGATCGCTTGATCTTCATCTGAAACCTCCACATCAGCGTTCTCCAGATCTGCAATAAGACGAAGGAAGTCATCTATATTGTTCTCAACTGATGAGCCTTCCGACATCTTGTAGCTGTACAGTTTTTGCTTCAGATAGATTCTGTTAGGTAGAGTCTTTTCTTGATAAAGCTTGTCTAAAGCTTGTATCATTGCAGCGGCTGTATCATTTTTCCTAATCTTCCTCAGAACTCTATCTGTAACACTCAAAACAATGGCACTCCGTGCTTTCTTCCTCTTCTCATCCAAAGTTTCGCCCTTTTCATCTGGTTTTTCTGGATCTGAGCCTTTTGACGTTTCTTCAAGAGCTTTGCTCAATCCCAACATGTCCAGATGAGCCATGAACTTGTCTTTCCATAAAGTGTAATCCCCATTCCCGTCGAACTTCTCCATCTCTGTCTTTGACGAAGACATGACT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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309

Start:

447205  

End:

447513

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_5

CAACACCAAGATTACGACTTTAAACAAGAAATGAAACAGAGTAAAGAGAAAGGAAGAGATGAAAAACACACACGAGTTTTACGAGTTCACGCCCAAACCGGGTCGCTACGTCTCGCCGGGATCTTTCTCCCGGAATCCACTAGATCAATAGAGGTTACAAGAGTTTAGACACAATCCCGAGTTCCCCTTTTACAAAGGCTCACTCTCTGTTCTACTCTACCCCTTTTGTTATCCCGAGAAAACCCTTACACAAGTTTACACTCTGTAAATAAGAGTTTCTCTATCACACTCTATTTCTCAAAATGTCTC

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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84

Start:

479948  

End:

480031

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_6

ACCATCATGACGTTGATGATGATGATGATCATCAATACCACCGCCATCACCAACATCATCATCAATATCGTCTACATCAATCTC

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_7

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

96

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920972

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_7

TATATATAGAGTACATAAGGAATCTAGGTTAAGTACAATGCCCTGATGGGCCTAATGGGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

ID:

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Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

3583

Start:

920973  

End:

924555

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_8

CTCCCCCTTGGACGAGTGAACCGGGTCAGCTACTCAATCGGGATCTCGATAATGCGCTGGGGAATGTTGCCTCATTAAAACCTTACCAGGAAAAACCCAGTGGGACAAAACCATGGTGAAGGAAAAGAGTACAACACGCATTACTCCTCCTGATTGTAGCATCACTGCAGATCTCTAAGTCTATACATTCCTATCTGTTTGACGAGCTTCCGGTGTGTTGAAGTAGGCAATGATTTGGTGAAGAGGTCAGCTGAATTCTCACTGGATCGGACCTGCTGAACGCTGAGAGTGCCGTCCTTCTGCCAGTCTGAGGTTGAGAAGAACTTCGGTAGAATGTGCTTCGTCCGATCTCCTTTGATATATCCTTCCTTGAGCTGAGCTATGCATGCCGCGTTGTCTTCATACATCACCGTGGGCTGTGTGTCTTCGTCCATACCACAATCTCTGCGGATGTGCTGAGTCATGGAGCGCAGCCAGACGCATTCCCTACTAGCCTCATGAATGGCTAGGATTTCAGCATGGTTTGATGAAGTGGCAGTGAGTGTCTGCTTCATTGATCTCCAAGAGATGGCTGTTCCTCCATGCGTAAAAACGTAGCCAGTTTGAGACTTGGCAGTGTGCGGATCTGATAGATATCCTGCATCGGCGAAGCCGACTAACCCATCTTTATTTTGGTTAGTATAGAAGAGTCCTAAGTCTTGAGTACCTCGAAGGTATCTTAGAAGATGTTTTATACCGTTCCAGTGCCTCTGAGTTGGAGATGAACTATATCGAGCGAGGAGGTTCACGGTGAAACATATGTCTGGTCTAGTGTGACTAGCCAGGTACATTAACGCTCCTACAGCACTGAGGTATGGCTTTTCAGGACCAAGGATTTCTTCATCATCCTTTTTGGGACCAAGAGGGTCATCACTTAAGCTTCTAACTACCATTGGGCTGGTCAATGGGTGAGCTTGGTCCATATTAAATCGCTTGAGTACCTTTTCGATATAAGCCGATTGATGCACAAGGATTCCTCCTTTGATGTACTCAAGTTGTAATCCCAAACAGTACTTTGTTTTGCCTAGGTCTTTCATTTCGAATTATGCTTTTAAGCAGTCGACTGTTTGGGAGATCTCACCTGATGTTCCGAGGATGTTTAGATCATCCACGTATACTGCTATGATTACAAATCCTTTGTTTGAGTACTTCTTGATGAAGATGCATGGACTGATGGGGTCATTTTTGTAGCCTTCTTTGATGAGGTAATCGCTGAGGCGGTTGTACCACATACGCCCACTTTGTTTCAGTCCATACAAGGATTTGTTCAGCCTGATGCAGTATTGATCTCGAGATGCATTTTTGTCTTTTAGTTCAATGCCATCTGGGAGTCTCATATATATTTCGTTGTCCAGGGGCCCATAGAGATATGCGGTTACAACATCCATTAACCGCAGATCAAGATTTTCTCTTATGGCCAGACTTATGAGGAATCGGAATGTTGTTGCATCCACCACTGGAGAATAAGTCTCCTCATAATCGATTCCGGGTCTCTGTGAGAATCCTTGTGCTACAAGCCGTGCTTTGTATCGTTCCTTTTGCGCACAAAGACCCATTTGTGGCCCACTGGCTTGATGTGTGATGGGGTCCGGATGATCGGACCGAACACGTTTCTGAGTTTGAGACTCTTTCACTCCACGTTTATGGCTTCTTTCCATTTTAGCCAATCTGTTCGATGTGTACACTGTGTTATTGACGTGGGTTCTAGATCCTCTTGCGTGAGCGCAACATCAAGTGCTACTTTGTATGCAAAGAGTGCATTTAAGTCGACTTCTTTTCGATTCCATTGTATTCCGGACATATTGTAATTGATGGAGATCTCATTGTTATCTTCTGAACCTGGAGATTCGGCGTCCCGAACTTCCATTGAGGGTTCATTAGATTGAGTCTCAGCCGCGGCTATGTCTGATATTGCAGGAATTCCGGTTTCGGTTATTGCACCTTTCTTTGATTTCCGGGGATTCTTATCTTTGGAACCGAGAGGTCTGCCCCGTTTGAGACGTGGTGCAGACTCTGTAGCAACTTGGATCTGTCCCGTTGGGACAGCTATTCGTACTGGTGCATTACAAGCTGGGATGTACGATTTGGTTACTTTGGTCGGGTCAGCAAAGGAATCTGGCAATTGATTAGCTAGCTTTTGATAATAAATAATCTTTTGGATCTCTGAATCACATTCTAGAGTCCGAGGATCTTGCCAATTTAATGATGTTTGATTCCATGAAAGATCTTTGACCAGCTTGTTTGTCTCACCACCTAAAGAGAGATATACCGATTCATCGAATTGGCAATCCGCATATCTGGCCTTGAAGAGATCTCCAGTGGTTGGCTCGAGATATCTTATGATGGTGGGAGAGTCAAAACCAACATATATTTCCATCCTTCTTTGAGGTCCCATTTTGGTTCGATGTGGTGGAGCAATGGGTACATATACTGAACACCCAAATGTTTTGAGATGGGAGATGTCTGGCTCATGACCCGAGAGTAGTTGGGATGGGGAATATTTGTGTTCACTAGATGGCCAGATGCGTATGAGTTCAGCAGCATGTAATACTGCATGTCCCCATGCTGAGGCCGGGAGCTTTGATCTCATGAGTAATGGTCGGGCTATCCATTGAATGCGTTTAATGAATGATTCAGCCAATCCATTTTGAGTATGGACATGTGCTACAGGATGTTCCACGGTTACCCCCATGGCCATACAGTAGTCATTAAACGCTTGTGAGGTAAATTCACCAGCATTGTCAAGGCGGATAGTCTTTAGTGGGAAGTCAGGGAAATGGGCCCGCAATTGTATGATTTGGGCCAAGAACCTAGCGAAGGCTTGGTTCCGAGAGGACAAGAGACAAACATATGACCAACGGGTCGATGCGTCTATAAGGACCATGAAGTACCGGAATGGGCCGGAAGATGGATGTATAGGTCCACAGATATCGCCCTGGATTCTTTCTAGGAAATGAAGTGTTTGTTTAGAGATTTTAACTGGTGAAGGCCGAGTGATCAATTTGCCTTGAGAACAAGCTGTGCACATGAGGTGTTGAGGATAAGCTCGGTTTTCTTTGAGGGTATGCCCTTGAGAGTTTTAAATTAGTTTACGCATCATATTTGCACCGGGATGACCGAGCCGGTCGTGCCAAATAGTATAATCAGTAAACCGGGCTTTGAGAGTGGTATTAGCTTCAATCATACTGACTTTAGCATGGTAAAGTCCAGTAGAGAGCGCGGGTATGGTTTCGAGGATTTGTTTATGGCCGTCTACGGTTTTAGTGACTAGGAGGGATTCTTTGTTCCCTTGACCTTGGGTTTCTATGTGGAAACCATTCTGTCTTATATCCTTGAAGCTCAGAAGATTTCTCTTCGAACTAGGAGAATATAGAGCATCTGGTATTTCAAATTGTGTGCCATTTGATAGCAACACATAGGCATGGCCATATCCTTCGATAAGGTTTGAGGGACCCGCGATGGTGCTAATATTTGCGGTTTGATAGGTTAGGTTTATGAAGTAACTTTTGTTTCTTAAGATAGTGTGGCTGGATCCACTATCTAC

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1390

Start:

924739  

End:

926128

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_9

TTCAGATGATTGAATTAATCGAGGAGATCAGCTGTTTCATAGTCCATGGGGTCGGTCTGCTCGTTTGTGGTGTTCTCATCATCAAGGAGGTCGTCACCTTCCAGGTTAGCAGCATCGACTGGCTGAGTCATGTTGGCTTCAGCAGGAGCTTTTCCGTACTTCTGGTATAAATCGCAGTGGATCTTGGGGGTGCGACATTGCTTTGTTGGGTGGTTGAACATCCCACATCTGGTACAAGCAGAGTGATCGGGGTTGGTGTGGCGGGTCGGCTTGGTGATGCCTCGACCACGACCAGGACCATAACTGAGGTTAGGTCGGTTGCCACGACCATGTCCGCGTCCACGTCTTCCACGTCCATGTCCTCGGCCATTACCACGTCCATTACCACGTCCACGGCGGTGATCTGAGGATCTATCGGGTTGAACATGGTAGGACTCTTGACGAGAAGCTGGGACAGGAGCCGATCCCGGGGGCCTCATAGCGCTGTTCCTCATAAGCAGCTGTTTATTCTTCTCAGCGAGGAGAAGACAGGACAACAAGTCTTCGTACAATGTGTGTTTCATTGCACGGTATTGTTGTTGGAGCACAACATTCTCTGTGCTGAATGTGGATAATGTTTTCTCGAGGAGATTATTATCTGTCACATCCTCGCCACAGAGTTTCCGGATGGCAACAATACGAAAGAGTTCGTTGTTGTAATCATCTACGGATTTGTAGTCCTGGAACCGAAGGTTCTTCCAGTCGAAATCTGCCTGAGGAAACTGGGCCATTTTCTGATGGTCATATCGCTTTTTCAGCGCTTGCCACAATTCAAGTGGATTCTCAAGAGTGAGATATTGCTGCTTAAGGCTCGGGGCCAGATGATGGCGTATGTGACATATCGTCTGAGACTGTCCCTTACGGGATGCGGTGTTACCGTCGGTAATACACGCATCGAGTTCTTTCGATGCGAGGAACAAGCGCATGTCTAGGGCCCACTCGAGGTAGTTATCCCCGGAGACGTGAAGGGCCTCGAATTCACATTTCTGAATGTTTGACATCTGAAACATGAGATTGATTTTGTTAGGGATTGTTTTGAGAAAATTTTGAATGCTGATGATGAAACTTTCTATTTTGAGAATATTTCTATTTTAGGAAAGTTTCTAAATTTGGAAAGTTTCTAATTTGGGTAATTTTCTAAATGAGGAAAGTTTCTATGTCGGGAAAATTTCTATATGAGGAAAGTTTTTATATGAGGAAACTTTCTATTAGAGGGAACTTTCTCGGAAATAGTAAATTTTAAAGGGTATGGTTTTAGTTACCCCGAACATGATGTCGGTTTAATAGCTGTGATTTAATCGGTTAAAGCCGAATATAATTTCGGTTAATGAGAACCAGGTTTAGCCGGTTT

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

96

Start:

927129  

End:

927224

Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_10

TATATATAGAGTACATAGGGAATCTATGTTAAGTACAATGCCCTGATGGGCCTAATGTGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

ID:

scaffold_1_LTR-Copia_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

4583

Start:

1007071  

End:

1011653

Strand:

+

>scaffold_1_LTR-Copia_11

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ID:

scaffold_1_LTR-Copia_12

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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110

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End:

1011764

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+

>scaffold_1_LTR-Copia_12

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ID:

scaffold_1_LTR-Copia_13

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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1075646

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-

>scaffold_1_LTR-Copia_13

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scaffold_1_LTR-Copia_14

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Retrotransposons

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LTR

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+

>scaffold_1_LTR-Copia_14

ATCGTCGTCATCATCATCATCATCATCATCAACAACGTGGTAATCATGATCACGTGGATGATGATCATAGTGATTATCGTCTTAATGATGATCAT

ID:

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Retrotransposons

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LTR

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-

>scaffold_1_LTR-Copia_15

TATATATAGAGTACATAGGGAATCTAGGTTAAGTACAATGCCCTGATGGGCCTAATGGGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

ID:

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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-

>scaffold_1_LTR-Copia_16

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ID:

scaffold_1_LTR-Copia_17

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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1389

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Strand:

-

>scaffold_1_LTR-Copia_17

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ID:

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Copia

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96

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1223914

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-

>scaffold_1_LTR-Copia_18

TATATATAGAGTACATAGGGAATCTAGGTTAAGTACAATGCCCTGATGGGCCTAATGGGCCGGTATAAGAGTCCATATATGATATGTGTTATAACA

ID:

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Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Copia

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LTR

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