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scaffold_10_SINE_4 RetrotransposonsSINESINE6971604316739+
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scaffold_10_SINE_6 RetrotransposonsSINESINE3382357623913+
scaffold_10_SINE_7 RetrotransposonsSINESINE6952441625110+
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scaffold_10_SINE_9 RetrotransposonsSINESINE6632680427466+
scaffold_10_SINE_10 RetrotransposonsSINESINE694225371226064+
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scaffold_10_SINE_12 RetrotransposonsSINESINE697227686228382+
scaffold_10_SINE_13 RetrotransposonsSINESINE696244642245337+
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scaffold_10_SINE_17 RetrotransposonsSINESINE256248480248735+
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scaffold_10_SINE_19 RetrotransposonsSINESINE691249879250569+
scaffold_10_SINE_20 RetrotransposonsSINESINE394251069251462+

< 1 2 3 4 5 > Total 47


Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_1_SINE_1

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

122

Start:

1595063  

End:

1595184

Strand:

+

>scaffold_1_SINE_1

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_2

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

357

Start:

14119  

End:

14475

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_2

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_3

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

665

Start:

14798  

End:

15462

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_3

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_4

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

697

Start:

16043  

End:

16739

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_4

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_5

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

696

Start:

17081  

End:

17776

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_5

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_6

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

338

Start:

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End:

23913

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_6

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_7

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

695

Start:

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End:

25110

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_7

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_8

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

668

Start:

25592  

End:

26259

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_8

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_9

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

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Start:

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End:

27466

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_9

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Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_10

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

694

Start:

225371  

End:

226064

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_10

GGCTGATGGGCAGGGATTAAAGCAGGTTGTGGGCGCTTCTCTTCTATGGTGGTGTAAGGCGTGGTTAGATATGTCGTTCGATACCAGACTATTTATCTCTTTCACGGCGACCTGAGATGATGTTCCAGCGATCTGCTGGTTAAAGGCTATGGCGGATCTGTATCGAATTTCTCTTGGCTAAGTGGCTTGTGAGCGGTAGATCTGTCTTGCGGCGGAAGTTAAGCTTCAGACCAGTGGGTTCACCACTTTGTGAACAGACTAACAGTTGATCTGTGACCAGATCCTTGATGGCTAGTCACAAGTATCCTAAACCAGATTTTGATGGTTGATGGCTTACTTGAGCTAGCGTCCATCCTCCACTGCGTGATTGGTTTTCTCTTCGCCGGATCGGAAGGGAGGTTGCTTTGAAAGTAAAGGTAAGTGTTATACGTTGGATCAGAGGGTTCGTTGCAAGGCTTCTTTTTGCTTGGTCCGGGAGAAGAAGCTATTGGATCTCTGGTTGTGGCGAATCTTCCTTGTCCAAAAGGAAAGCTCCAGGTTGGGTGTGATTTCAGTCACCATTTGCGGCGGGGTTTACGAGCTCTAGCCTTATAATTGATATCAAGTCTTAGTTGCAAACGAGCCGTCCTTGCTAGCGTCGGATTTAGCAGTAAATTGTGTTTCCGGTGTACTGCCTGTTTTCAGAACTCTTTTC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_11

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

696

Start:

226490  

End:

227185

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_11

GGCTGATGGGCAGGGATTAAAGCAGGTGGTGGGCGCTTCTCTTCTATGGTGGTGTAAGGCGTGGTTTGATTTGTCGTTCGATGCCATACGATTTCTCTCTTTCAAGGCGACCTGAGATGATGTTCCTGCGATCTGCTGGTTAACGGCTATGGCGGATCTGAATCGTATATCTCTTGGCTAAGTGGCTTGTGAGCGGTAGATCTGTATTGCGGTGGAAGTGAAGCTTTAGACCGGTTGGATCACCACTTTGCGAACAAATTAACCGTTGATCTGTGACCAGATCTTTGATGGCTAGTCACGGGTATCCTTAACCGGATTTTGATGGTTGATGGCTTGCTAGAGCTAGCGTCCATCCTCCACCGTCGTGATTGGTTTTCTGTTCGCCGGATCGGAAGGGAGGTTGCTTTGGAAGTAAAGGTAAGTGTTATACATTGGATCAAAGGGTTTGTTGCGAGGCTTCTTTTTGCTAGGTCGGGGAGAAGAAGCAATTGGATCTTTGGTTGTGGCGGATCTTCCTTTTCCAAATGGAAAGTTCCGGGTTGGGTTTGATCTCAGTGACCATTAGCGGTGGGGTTTGCGAGCTCCAGCCTAAGAATTGATGTGAAATCTTAGTCACAAACGAGTCATCCTTCCTAGCGTCGGATTTAGCAGGTAAATTGTGTTTCCGGTGTACTGCCCGTTCTCTTATCTCTTTTC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_12

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

697

Start:

227686  

End:

228382

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_12

GGCTGATGGGCAGGGATTAAACCAGGTGGTGGGCGCTTCTCTTCAATGGTGGTATAAGGCGTGGTTGGATCTGTCGTTCGATACTAGACAATTTCTCTCTTTCACGGCGACCTGAGATGATGTTCCAGCGTTCTGCTGGTAAAAGGCTATGGCGGATCTGGATCGAATTTCTCTTGGCTAAGTGGCTTGTGAGCGGTAGATCTGTCTTGCGGCGGAAGTTAAGCTTCAGACCAGTGGGTTCACAACTTTGCAAACAGATTAACGGTTGATCTGTGAACTGATCCTTGATGACTAGTCACGGGTATCCTTAACCGGATTTTGATGGTTGATGGCTTGCTTGTGCTAGCATCCATCCTCCACCGCCGTGATTGGTTTTTTGTTCGCCGGATCGGAAGGGAGGTTGGTTTGGAAGTAAAGGTAGGTGTTATACGTTGGATCAGAGGGTTTGTTGCGAGGCTACTTTTTGCTAGGTCGGGGAGAAGAAGCTATTGGATCTCTGGTTATGGCGGATATTCCTTTTCCAAAAGGAAAGTTCTGGGTTGGGTTTGATCTCAGTGACAATTTGCGGCGGGGTTTGCGAGCTCCAGCCTAAGAACTCATGTCAAATTTTAGTCACAAACGAGTCATCCTTCCTAGCAACGGATTTAGTAGGTAAATTTTGTTTCAGGTGTACTGCCCGTTTTCTGATCTCTTTTCG

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_13

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

696

Start:

244642  

End:

245337

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_13

GGCTGATGGGCAGGGATTAAAGCAGGTGGTGGGCGCTTCTCTTCTATGGTGGTGTAAGGCGTGGTTTGATATGTCGTTCGATGCCATACGATTTCTCTTTTTCACGGCAACCTGAGATGATGTTCCTACGATCTGCTGGTTAAAGGCTATGGCGGATCTGAATCGTATATCTCTTGGCTAAGTGGCTTGTGAGCGGTAGATCTGTATTGCGGTGGAAATGAAGCTTTAGACCGGTTGGATCACCACTTTGCGAACAGATTAACCGTTGATCTGTGACCAGATCCTTGATGGCTAGTCACGGGTATCCCTAACCGGATTTTGATAATTGACTGCTTGCTTGAGCTAGCGTCTATCCTCCACCGCCGTGATTGGTTTTCTGTTCGCCGGATCGGAAGGGAGGTTGCTTTGAAAGTAAAGGTAAGTGTTATACATTGGATCAAAGGGTTTGTTGCGAGGCTTCTTTTTGCTAGGTTGGGGAGAAGAAGCAATTGGATCTCTTGTTGTGGCGGATCTTCCTTTTCCAAAAGGAAAGTTCCGGGTTGGGTTTGATCTCAGTGACCATTAGCGGTGGGGTTTGCGAGCTCCAGCCTAAGAATTGATGTGAAATCTTAGTCACAAACGAGTCATCCTTCCTAGCGTCGGATTTAGCAGGTAAATTGTGTTTCCGGTGTACTGCCCGTTCTCTGATCTCTTTTC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_14

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

270

Start:

245892  

End:

246161

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_14

GGCTGATGGGCAGGGATTAAAGCAGGTGGTGGGCGCTTCTCTTCTATGGTGGTGTAAGGCGTGGTTTGATGTGTCGTTCGATGCCAGACGATTTCTCTTTTTGACGACGACCTGAGATAATGTTCCTGCGATCTCCTGGTTAAAGGCTATGGCGGATCTGAATCGTATATCTCCTGGCTAAGTGGATTGTGAGCGGTAGATCTGTCTTACGGTGGAGTTAAGCTTTAGACCGGTTGGATCACCACTTTGCGAACAAATTAACCGTTGATC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_15

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

686

Start:

246998  

End:

247683

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_15

GGCTGATGGGCATGGATTAAAGCAGGTGGTGGGTGCTTTTCTTCTATGGTGGTGTAAGGCGTGGTTGGATCTGTCGTACGATGCATGACGAGTTCTCTCTTTCACGGCGACCTGAGATAACGTTCCTGCGATCTGCTGGTTAATGGCTATGGTGGATCTGGATCGGATTTTTCTTGGCTTGTGAGCGGTAAATCTGTCTTTCGGTAGAAGTTGAGGTTTTGACTGGTGGGTTCACCACTTTTCGAACAAATTAATGGTTGATCTGTGACCAGATCCTTTATGGCTAGTCACGGGTATCCTTAACAGGATTTTGATGGTTGATGGCTTGCTTGAGCTAGCGTCCATCCTTTACCGCGAGATTGGTTTTCTGTTTGCCGGATCAGAAGGGAGGTTGCTTTGAAAGTAAAGGTAAGTGTTATAAGTTGGATCAGATGGTTCGTTGCGAGGCTTATTTTTGCTAGGTCGGGGAGAAGAACCTATTGGATCTCTGGTTGTGGCGGAATTTTCTTGTCCAAAAGGAAAGCTCCCGGTTGGGTTTGATCTCAGTCACCATTTGTGGCGGGTTTTGCGAGCTCTGGCCTAAGAATTGATGTCAAGTCTTAGTTGCAAACGAGCCGTCCTTGCTATCGTCCGATTTAGCAGTAAATTATGTTTCTAGTGTACTACCCGTTTTCAGATCTCTTTTC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_16

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

268

Start:

248121  

End:

248388

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_16

TGATGGGTAGGGATTAAAGAAGGTAGTGGGCGCTTCTCTTCTATTGTGGTGTACGGCGTTGTTTGAAGTGTCGTTCGTTGCCAGACGATTTCTCTCTTTAACGGCGACCTGAGATGATGTTCCTGCGATCTGCAGGTTAAAGGCTATGGCGGATCTGAATCGTATATCTCTTGACTAAGTGGCTTGTGAGCGGTAGATCTTTCTTACAGTGGAAGTTAAGCTTTAGACCGGTTGAATCACCACTTTGCGAACAGATTAACCGTTGATC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_17

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

256

Start:

248480  

End:

248735

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_17

AGGGTTTGTTGCGAGGCTTCTTTTTGCTAGGTCGGGGAGAAGAAGCTATTGGATCTCTGGTTATGGTGGATCTTCCTTTTCCAAAAGGAAAGTTCCGGGTTGGGTTTGATCTCAGTGACCATTTACGGTGGGTTTTCCTAGCTCTAGCCTAAGAATTGATGTTAATTCTTAGTCGCAAACGAGCCATCCATGCTAGCGTCGGATTTAGCAAGTAAATTGTGTTTCCGGTGTACTGCCCGTTTTAAGATCTCTTTTC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_18

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

386

Start:

249084  

End:

249469

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_18

GCTGATGGGCAGGGATTAAAGCAGGTGGTGGGCGCTTCTCTTCTATGGTGGTGTAAAGCTTGGTTGGATCTGTCGTTCGCTGTCAGACAAATTCTCTCTTTCACAGAGATCTTAGATGATGTTCTTGTGTTCTGCTGGTTAAAGGCTATGACGGGTCTGGATTGGATTTCTCTTGGCTAAGTGGCTTGTGAGAAGTAGATCTGTCTTGTCACGGAAGTTAAGCTTCAGACCAGTGGGTTCACCAATTTGCGAACAGATTAACGGTTGATCTGTGACCTGATCCCTGATGACTAGTCAACGGTATCCTTAACCGGATTTTGATGGTTGATGGCTTGCTTGAGCTAGCGTCCATCCTCCACCGCCATGATTGGTTTTCTGTTTGCCGG

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_19

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

691

Start:

249879  

End:

250569

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_19

GGCTGATGGGCAGGGATTAAAAAAGGTGGTGGGCGCTTCTCTTCTATGGTGGTGTAACGCGTGGCTCGATCTGTCGTTCGATGCTTGACGTGTTCTCTCTTTCACGGCGACCTAAGATGATGTTCCTGCGATCTGCTGGTTAATGGCTATGGCGGATCTGGTTCGGATTTCTCTTGGCTAAGTGGCTTGTGAGTGGTACAACTGTCTTGCGGCGGAAGTTGAGCTTCATATCGGTGGGTTCACCACTTTGTGAACAGATTAACGGTTGATCTATGACCAGATCCTTGATGGCTAGTCACGGGTATCCTTAACCGGATTTTTTATGGTTAATGGCTTGCTTGAGCTAGCGTCCATCCTCCACCGTCTTAGATTAGTTTTCTGTTCGCCGGATCGGAAGGGAGGTTGCTTTGGAAGTAAAGGTAAGTGATATACGTTGGACCAGAGGGTTTGTTGGAAGGTTTCTTTTTGCTAGGTCGAGGAGAAGAAGATATTGGATCTCTAGTTGTGGCGGATCTTCCTTTTCCAAAAGGAAAGTTCCGGGTTGGGTTTGATCTCAGTGACCATTTGCGGTAGGGGTTTGCAAGCTCTAGCCTAAGAATTGATGGCAAGTCTTAGTCGCAAACAAGCCGTCTTTGCTAGCGTTGGATTTAGCAGGTAAGTTGTGTTTCCGGTATACTGCCTGTTTTCAGAT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_10_SINE_20

Class:

Retrotransposons

Order:

SINE

Superfamily:

SINE

Length:

394

Start:

251069  

End:

251462

Strand:

+

>scaffold_10_SINE_20

GGCTGATAGGCAGGGATTAAAGCAGGTGGTGGGTGCTTTTCTTCTATGGTGGTGGAAGGCGTGGTCTGATCTGTTGTTTGATGCCAGACGAGTTCTCTCTTTCACGGCGACTTGAGATGATGTTCTTGCGATATGCTGGTTAAAGGCTATTGCGGATCTAGATCTGATTTCTCTTCGCTAAGTTGCTTGTGAGCGGTTAATCTGTTTTGTGGCGGAAGTTGAGCTTCAGACCGGTGGGTCCACCACTTTGCGAACATATTAATGGTTGATCTGTGACCAGATCCTTGATGGCTTGTCACGGCTATCCTTAACAGGATTTTGATGGTTGATGGCTTGCTTGAGCTAGCGTCCATCCTCCACCGCGTGACTGGTTTTCTGTTTGCCGGATCGGAAG