ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
scaffold_2_LTR-ERV1_1 RetrotransposonsLTRLTR-ERV194950622950715-
scaffold_2_LTR-ERV1_2 RetrotransposonsLTRLTR-ERV118213863521386533-
scaffold_2_LTR-ERV1_3 RetrotransposonsLTRLTR-ERV18580506508050734-
scaffold_2_LTR-ERV1_4 RetrotransposonsLTRLTR-ERV19280507358050826+
scaffold_2_LTR-ERV1_5 RetrotransposonsLTRLTR-ERV114280546008054741+
scaffold_2_LTR-ERV1_6 RetrotransposonsLTRLTR-ERV110285553258555426+
scaffold_2_LTR-ERV1_7 RetrotransposonsLTRLTR-ERV111787931048793220-
scaffold_2_LTR-ERV1_8 RetrotransposonsLTRLTR-ERV110592901239290227-
scaffold_2_LTR-ERV1_9 RetrotransposonsLTRLTR-ERV114193830549383194-
scaffold_3_LTR-ERV1_10 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1134692811692944+
scaffold_3_LTR-ERV1_11 RetrotransposonsLTRLTR-ERV12091217167412171882-
scaffold_3_LTR-ERV1_12 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11901271186612712055+
scaffold_3_LTR-ERV1_13 RetrotransposonsLTRLTR-ERV1931408039814080490-
scaffold_4_LTR-ERV1_14 RetrotransposonsLTRLTR-ERV114639104743910619-
scaffold_4_LTR-ERV1_15 RetrotransposonsLTRLTR-ERV111472301947230307-
scaffold_48_LTR-ERV1_16 RetrotransposonsLTRLTR-ERV11772965829834-
scaffold_5_LTR-ERV1_17 RetrotransposonsLTRLTR-ERV19724943852494481-
scaffold_5_LTR-ERV1_18 RetrotransposonsLTRLTR-ERV110948346914834799+
scaffold_5_LTR-ERV1_19 RetrotransposonsLTRLTR-ERV19967616156761713-
scaffold_5_LTR-ERV1_20 RetrotransposonsLTRLTR-ERV110167722716772371-

< 1 2 > Total 2


Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

94

Start:

950622  

End:

950715

Strand:

-

>scaffold_2_LTR-ERV1_1

TACATTATTGATCTATATGTTATACGTACACATGTATGCGTGCATGTATGGATGTATGTAATAAATCAATGTATGCATCCTTAATTTTATATAT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

182

Start:

1386352  

End:

1386533

Strand:

-

>scaffold_2_LTR-ERV1_2

AATGTATAATGTATGTATGAATGTATGATGTATGTATGAAATGTATGAATGTATGTATGTATGCATGTATGAATGTATGTATGTATGAATGTATGTATGAATGTATCAAATGTATGAATGTATGTATGGATGCTTGAATGTGTGAATGTATGTATCAATGTATGACTGCACGAATTGTATGT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

85

Start:

8050650  

End:

8050734

Strand:

-

>scaffold_2_LTR-ERV1_3

ATACACACATCCATAAATGCATACATAGATACATGTATTCATTCATGCATACATACATACATACATACATACATACAAACATTTG

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

92

Start:

8050735  

End:

8050826

Strand:

+

>scaffold_2_LTR-ERV1_4

TACATACATACATGTATTCATTCATGCATACATACATACATTCATTCATACATACATACATACATACATGCATACATATATGCATACATACA

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

142

Start:

8054600  

End:

8054741

Strand:

+

>scaffold_2_LTR-ERV1_5

ATGCATACATTCATGCATACATGCATGTGTTCATTCATGCATACAATCATACATTCATGCATACATTCATACATTCATACATACATTCATACATTCATGCATACATACATTCATGCATGTGTGCAGACAGACATCATATGTT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

102

Start:

8555325  

End:

8555426

Strand:

+

>scaffold_2_LTR-ERV1_6

ATACATGCATTCATACATTCATACATGCATTCATACATTCATACATGCATTCATACATTCATGCATTCATGCATTCATACATACATACATGGATACTTGTAT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

117

Start:

8793104  

End:

8793220

Strand:

-

>scaffold_2_LTR-ERV1_7

TATATATATATATATATATAATACAAAACCATATATATATATTAGCACTAGATATATATTGTATATATTATATACATCCTCATACAAATAGATATATATTGTATATATTATATACAT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

105

Start:

9290123  

End:

9290227

Strand:

-

>scaffold_2_LTR-ERV1_8

TGTATGTATGCATCAAGAAAGAAAATATGCATGAATGGATGTGTGAATGTATGCACATGTGAATGTATGCATGCATGTCTATATGTATGAATGTATGCAGACATG

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_2_LTR-ERV1_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

141

Start:

9383054  

End:

9383194

Strand:

-

>scaffold_2_LTR-ERV1_9

TATATATATATATACTTATATGTGCACAGTTACAATATACTTATATTTGCACAGTTACAATATATATATATATATAATGTATATATATATTGATCAATTAGGAGTAGAAACTATATGCACATAAATTATATATATATAGAT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_3_LTR-ERV1_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

134

Start:

692811  

End:

692944

Strand:

+

>scaffold_3_LTR-ERV1_10

TATACGTAATTACGTATATACATATATATATATATATATTTCTTTCAACAATACTGATTATGTATACTGAATATATTACGTAATTATGTATATATATATATACTCGGTATTGTATATACGTATATCGGTATTGT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_3_LTR-ERV1_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

209

Start:

12171674  

End:

12171882

Strand:

-

>scaffold_3_LTR-ERV1_11

TTGTTTAACATTTGAACAAATTATTATATGTACATATATATTCTATTGTATATATATACAATATACATATATGTATAGTTGTTTACTATATGTACATAAAGATGTATGTACAAAAGTATAGAACTAGACATAATTATATTTGTATAAACTGTTTGTACATAAGAATATATGTACAAATACAACTGTACATATACGACTGTACATATACA

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_3_LTR-ERV1_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

190

Start:

12711866  

End:

12712055

Strand:

+

>scaffold_3_LTR-ERV1_12

ACACAAACACAAACACAAACACACATATAGCTGCACAAACACACATATAGCTACACAAACACAAACACACATATAACTACACAAACACACATATAACTACACAAACACAAACACACTTATAACTACACAAACACACATATAACTACACAAACACAAACACACATATAACTGCACAAACACACTTATAACT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_3_LTR-ERV1_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

93

Start:

14080398  

End:

14080490

Strand:

-

>scaffold_3_LTR-ERV1_13

ATTACATCCACACATTGTATATATATGAGTGAGAGTATATGATTGCAATCTCATGTATGTATGTATGTATTGCATGTGTGCATGTGTTTGTGT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_4_LTR-ERV1_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

146

Start:

3910474  

End:

3910619

Strand:

-

>scaffold_4_LTR-ERV1_14

TATATATATATATATATATAGATATATATATATATATACATATTATAGTTAATATTGATTATGTGTTTGACATTATATATATATATATATATATACATATATATCTATACGCTTCCAACACGTACCCGCTTCCTATTTTTTTTTTA

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_4_LTR-ERV1_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

114

Start:

7230194  

End:

7230307

Strand:

-

>scaffold_4_LTR-ERV1_15

CATTTGTGTCTGCATTAATAAAAGTATGTATGAATGTATGCATGTATGTATGAATGTGTGCATGAATGTATGCATGAATGTATGAATGCATCCATGAATGTATGAATGCATGTA

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_48_LTR-ERV1_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

177

Start:

29658  

End:

29834

Strand:

-

>scaffold_48_LTR-ERV1_16

CACTATGTATATACATATATATATATGTGATATAAGTAGTTATATACATAAATTATACATAAATTATACATAAATTATACATAAATTATATATGTATTATACATAAATTATATAAATTATACATAAATTATATATATAAATAATATAAATTATATAAATTATACATAAATTATATGT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_5_LTR-ERV1_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

97

Start:

2494385  

End:

2494481

Strand:

-

>scaffold_5_LTR-ERV1_17

ATATATATCTTCGTATGTATATATGTCTATATATATGGGGGCATGCATGTATGTATGTATGTATGTGTACGTATGTTAATTTGTTTGCATGTATATA

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_5_LTR-ERV1_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

109

Start:

4834691  

End:

4834799

Strand:

+

>scaffold_5_LTR-ERV1_18

CAATTGTACATATATAGCTTCAACTGTACATATACTATATATATATATAAATTATGTATAACAATGGACATAAGAATGTATGTACATATATAATTATATATATTTAGAC

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_5_LTR-ERV1_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

99

Start:

6761615  

End:

6761713

Strand:

-

>scaffold_5_LTR-ERV1_19

ATGGATGTATGTATGTATGCACATGTGAATGTATGCAAGAATGGATGTATGTATGTATGCACATGTGAATGTATGCATGCATGTCTAAAATGCATTCAT

Capsella rubella (v1.1)

ID:

scaffold_5_LTR-ERV1_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-ERV1

Length:

101

Start:

6772271  

End:

6772371

Strand:

-

>scaffold_5_LTR-ERV1_20

TGCATGTATGTATGAATGTATGTTTGCATGAATGTATGTATGCATGAATGTATGTATGGATGTATGTATGTATGCATGAATGTATGCATGGATGTATGTAT