ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Chr1_LTR-Cassandra_1 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3871059398910594375+
Chr1_LTR-Cassandra_2 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1631197902811979190+
Chr1_LTR-Cassandra_3 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1051197928811979392+
Chr1_LTR-Cassandra_4 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1851197939411979578+
Chr1_LTR-Cassandra_5 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3581355061813550975-
Chr1_LTR-Cassandra_6 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3581355108313551440-
Chr1_LTR-Cassandra_7 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1981405821414058411+
Chr1_LTR-Cassandra_8 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1071405843214058538+
Chr1_LTR-Cassandra_9 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1761405854014058715+
Chr1_LTR-Cassandra_10 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3591501295715013315+
Chr1_LTR-Cassandra_11 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra911567767415677764+
Chr1_LTR-Cassandra_12 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3612205818622058546+
Chr1_LTR-Cassandra_13 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3552205864722059001+
Chr1_LTR-Cassandra_14 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3522205900822059359+
Chr1_LTR-Cassandra_15 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3322205946722059798+
Chr1_LTR-Cassandra_16 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra1822266073022660911+
Chr1_LTR-Cassandra_17 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3162266091022661225+
Chr1_LTR-Cassandra_18 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra3552586596525866319-
Chr2_LTR-Cassandra_19 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra354561458561811-
Chr2_LTR-Cassandra_20 RetrotransposonsLTRLTR-Cassandra345948437948781-

< 1 2 3 4 5 > Total 14


Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

387

Start:

10593989  

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10594375

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_1

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

163

Start:

11979028  

End:

11979190

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_2

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

105

Start:

11979288  

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11979392

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_3

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

185

Start:

11979394  

End:

11979578

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_4

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

358

Start:

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End:

13550975

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_5

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

358

Start:

13551083  

End:

13551440

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_6

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

198

Start:

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End:

14058411

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_7

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

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Start:

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End:

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Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_8

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

176

Start:

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14058715

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_9

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

359

Start:

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End:

15013315

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_10

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

91

Start:

15677674  

End:

15677764

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_11

TGTGAGTGAGGTCAAAACTCGAGAAAATATCATATGGCAGTTAGTAGGAATAGTAACAAGTATTTTAAACCTCCTGAGATAGTGCACCGGC

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

361

Start:

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22058546

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_12

TGTAACCTCCCAGATTCTGGTATATGGTGCTGTATGTGGAGAGGGTTACGAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGAACTTATATTTTCCGTCACTCCTCTAGTTAGAACTCCAAAGTTAAGCATGCTTGAGCTGGAGTAGCACTAGAATGGGTGACCTATCGAGAAGTGATTCTCGGTACGGTGTGAGTGACGCCAAAGCACGGGGAAAGATCATGTGGGGATTTGTAGGGATAGTAACAAGTATTTAGAGCCTCTAAAAAATAATAACGGACAGACCATCAGATAGAAGTAGGGCCCACATGCCTGAGAAATGACGTGGGTGCTTACTGGTAGGGACGGTCAGGGTGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

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Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_13

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

352

Start:

22059008  

End:

22059359

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_14

TGTAACATCCCGGTTTTTGGTATATAGTGGTGCATGAGAAGAGTTTAAGAGATTTGATTTGGCTACCTATATCACCAAAGTGCACTTATCTTTTCCGTCACTCTTCTAGTTAGAACTTCAGAGTTAAGTGTGCTTGGGCTGGAGTAGCACTAGAATGGGTGAACTATCGGGAAATGATTCCCGGTACCGTGTGAATGAGGCCAAAACATGGGGTAAAATAATGCGGTGATTTGTAGGGATAATAACAAGTCTTTAGAGTTTCTTAATGCACCGACCGTCAGACAGGGGTGGGGCCCATGTGCTCGAGAGAGGACGTGGGTGCTCCACTGGTAGGGACGGTCGGGGCGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

332

Start:

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Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_15

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

182

Start:

22660730  

End:

22660911

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_16

TGTAATATCCCGGTTTCTGGTATATGGTAGTGTATGTGGAGAGGGTTAAGATATTTGATTTGGCTACCTATTGCACCAAAATGCACTTATCTTCTCTGTCAGCCATCCTTTGAGAATTGTAGAGTTAAGCGTGTTTGGGCTGGAGTAGTATTAGGATGAGTGACCTATCGGGAAGTGATTGT

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

316

Start:

22660910  

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22661225

Strand:

+

>Chr1_LTR-Cassandra_17

GTGTAAGAGATTTGATTTGGCTATCTATATCACCAAAGTATACTTATCTTTTCTGTCAGCCATCCTGAGAGAACTCCAGAGTTAAGCGTGCTTGGGCTGTAGTAGTATTAGGATGGGTGACCTACCGGGAAGTGATTGTCGGTACCATGTGAGTGAGGCCAAAACATGGGGAAAGATCATGTGATGATTTGTAGGGATAGTAACAAGTATTTGAAGCCTCTTAAAAATTAACGGACCGACCGTCAGACAAGGATGAGGCCCACAAACCCAAGAGAGGACGTGGGTGCTCACTGGTAGGGACGATCGGGGTGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr1_LTR-Cassandra_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

355

Start:

25865965  

End:

25866319

Strand:

-

>Chr1_LTR-Cassandra_18

TGAAACATCCCGACCACCAACGTATATGGGCCCCCATGCACACCCTCTCTTGGCATGTGGATTCATACCCGTCTACGGTTTTATATCAAGAGGTCGAAAAATTTGTTATTGTCTCTACAAATTACCACGTGACATTTTTCTGTGTTTTTTGACTTCATTCACATGATACCAAAACTGATTTTTCTATAGGTCACCCATCTTAGTACTGGTTTACTCCAGCCCAATTCCCAAGACACTTAACTCTAGAGTTCTCTTTGGACAAGTGATAGCAAAAGATAAGTGCACTTTAGTAGGAAAAAATCAAATCTTTAAGCACTCTTATGCACCACCATAGACAAGAAATCAATATGTTACA

Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

354

Start:

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End:

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Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_19

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Cardamine hirsuta (v1.0)

ID:

Chr2_LTR-Cassandra_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Cassandra

Length:

345

Start:

948437  

End:

948781

Strand:

-

>Chr2_LTR-Cassandra_20

CGCCCTCTCTAGGCCCGTGAAACCCCACATCCTCTCTAGGCCTGTGGGTTCCACCTTCGTCCGAGGGTCGGTGCATTATTTTTAGAGGTTCTAAAGACTTATTACTATTCTTATAAATTACCACATCATATTTTTTTGTGTTTTGGCCTCACTCACACGATACTGCAGTCACTTCCCGGTAGGTCAGCCATCATAGTGCTACTCCAGTCTAAACACGCTTAACTCTAGAGTTCTAACTAGACAAGTGGCAGAAAAGATAAATGCACTTTAGTGATATACGTAACCAAATCAAATCCCTTAAACTCTCTTCATACACCCCTATATACCAGAAACTGATATATTACA