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Contig0_LTR-Gypsy_1

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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304

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97111  

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97414

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+

>Contig0_LTR-Gypsy_1

GTTTTATTGCTTTTAGATATTTGTTTTCATTGCTTAAGGGAGAAGAATCTCATCTCTTCAAGAAGTGCTTTCTGAACCCTTGTTAAACCGATATCTTTATTTTTGATATATTTTATGCAATCATCATTTTTTTTATCATGATTTCGTCATCTATGTTTGAGTAATTCACCAATTGGGTTTAGGGTTTGTTTAAAGGGATTCAATGATTGACTAGGTTAAATTAACGATTATGGATTTATCTTATGGTTCTTCATCTTTTGTGTTCTAAAAGCTTATGTTATTTTGATCACCTTGCACATGATAT

ID:

Contig0_LTR-Gypsy_2

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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319

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98589  

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98907

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+

>Contig0_LTR-Gypsy_2

GTAAAGGTGGTGCATGACCGTAAGGCTTATCTAACGCGATTGAGTTATTTGATGTTTGCATAGATATTGTAGGTCGTATGATCTCCTGTGGATCACGACGAAGGTTCTTGAGATTGTTGATTTTTTGCGGTATTTTTGTGTTTAATGCATTGAATAATTTTAATCGTTAGTGTGTATAGCATGTAGACGGGAGGATTGCCTCACTAAGTATTTGTTGAAATACTTATGCATCTCCTTTGTTTGATGCAGGAAAAGAGTTTGTTTGATCGTGGAATCAAGGCGAGGAAGAGGGGATGATCTAGGAACTCGTTGTGTGTTT

ID:

Contig1_LTR-Gypsy_3

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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249

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2410

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+

>Contig1_LTR-Gypsy_3

TGATATATCATGAATTTTACCGATTTTAAGCCATGATATAAGTTATTTATCGAGTCTTAACCGTGTCTTTCGAGTCTTTATCGAGTCTTTTACAGGTTTTATGCGTTGGGGACTTTTTGGATGATTATGAAGCATTATGGAGCATTTGTTGCTGAGAAGACGAAGTTGATGTTTTCAGTGATCAGTGGTGTCGATCGACACTCATCACTGGTGTCGGTCGACACCCATCATCAGGCGTCCATGCGGAAA

ID:

Contig1_LTR-Gypsy_4

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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372

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5086  

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5457

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+

>Contig1_LTR-Gypsy_4

GAGAGAAGAGTAAGTGGGAGAGCTGATTTAAGGTGGTGAGAAGGAAACAGGAGTCTTGACCTAGCAAATCGTTTGGCCAAAGTACGAATTTTGTGGCGTTTGTATGTTAAGTCTTTTATCTAGATGGTACGCGAAGTTTGCCGAATTGGATTTGAGTTATTATTCTGAAAGTTCATTCACGTTTCCCGTGAGCACGCTCTGTTTCAGACGCGACCGGACCCAACGGTGGATTCAAAGGGCAATCGCGAGTTCGTCTGTGACGGATCTCATGAAACATTTGTAGTTAGCTTCCAGCGACATGTTGAGTTTTCAAGGTGGGAGTTGAGCTTTCAAACGGTTAGTTTGTTGATTTATTCATGTTTTAGTTTTTGA

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Contig1_LTR-Gypsy_5

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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309

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14810

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-

>Contig1_LTR-Gypsy_5

AAACAACGAGTCCTTAGATCAACCCCTCTTCCTCGCCTTGATTCCACAGTCACAACTTTTCTTTCTCTGCATCAAACAAAAGAGATGCATAAGTATTTCAATAAATACTTAGTGAGGCAATCCTCCCATCTACAAGCTATACACACAAGCAATTTAAATCATTTATCATAGATAAAACACGAAAATACCGAATCAACCATCTCACGAAATACTCGATCTAGATCACCCGAGATCAAACACGGCCTATTCCATGAAACCACATCAAACAATTAAACCGCTTAGATAAGCTTATGGTCATGCACTCACCTT

ID:

Contig1_LTR-Gypsy_6

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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390

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20061  

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20450

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-

>Contig1_LTR-Gypsy_6

GAACTCTNAACCTGTTCAACCGTAGCACTCCATGCTACACTCTCCTTAACCACCAGAGCTCTTGGATTCCTCTGACCGCGACCCCTACACCCCACCAGTACCAGGACCACGACCTCCACCTCTATTACCCATCTCTACTTCCAAAAACAGAATCTAGGAACACAAAACACAAACAGAAAGCAAGGACGACTTACTGTGGAATCTCATTGATGGCTCGATGAGGATGATTCTAAAACCCATGCACAAGCAAATTGACTAACTAACACATAATCACTTTAAACACAACAACACCACGGTTCACTTAATATAATCAAGCAACACAAAAAATTAAATTAAATCCAAATTAATTTTTCTAACCATCCTACAACCGTAAACACTCTTATACTAAAT

ID:

Contig1_LTR-Gypsy_7

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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284

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20852

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-

>Contig1_LTR-Gypsy_7

TCCTAAATCATCCTCATCTCATCGCCATGATTCCACGATCACACCCTCTTTTTTCCTGCATCATAACGAAGAGATGCATAAGTATTTCAAGAAATACTTAGTGAGGCAATCCTCCCATCTACGAGATATACACTGACATGAAAATGAATATAAAACCATACAAACCAATACCAATCATCCAATCAATAACATGCCGTAGATTCAATTCTGATGGCCTCTACACATGAAAACATGATAATACACTCAAAATCCCACAGCTAATCTCATGGTTATTTACTTACTTT

ID:

Contig1_LTR-Gypsy_8

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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142

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28754

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+

>Contig1_LTR-Gypsy_8

TAATAATATCGTATTTTGGCCCAATTTTCCTATGTCTTTATTAGGTTTCTAAAGGAGAAAGCAAGTGATTATGGATACATTGAAGGCATTTCCCACCATTTGAGCCTCCAGGAGTTATTTATGATTTTTTGAGCAAAATGGA

ID:

Contig1_LTR-Gypsy_9

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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30261

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+

>Contig1_LTR-Gypsy_9

TTAGTGCTAGGCTAGGTTTGTTTGTTTAATTTCTAGATCCTAGGCATTCATATCTCAAAAGGAATTTCTGAATGCTTGATCCTAAACCTTTTGTGAGCTTTTCATATCCTAGCCAACGAGAGTTGATGTTTAGGGTGATTAGTGAACAATTGGGCTTGCGATTAATGTTCATTGGTCATTGGATCGCGGACGAGAGTCTATGACGGTTGATGATTGATGAAAGGGTTATTACCACGAGAGTGGATTAATCTAATGCTTGTGTTCCATGTTCTAGGATAAT

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Contig1_LTR-Gypsy_10

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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+

>Contig1_LTR-Gypsy_10

CAAGGATCCGAGCGACCGGCACTGGCGGACGAATCATTGGACGAGCACCCAAAGCCCGGGATAGAGGTACCACAAGTGGCACCGGGATCCGTAACCAGGAGCCGGGAAGCTGTTAAGACCCTTTGCCACAAGCTCATTGCCTTTGTAGAGTCCCACATGGAAGGCCGCGAAGCGGACGAAGACGAGCATTCACCATACCCGGAAGGAGGCCTTGGATAGAGCGTCTTCACCATCACGTCACGGTGAAGGCGCCATTAAGTCGTCGGCTAAATGTACTCTTTTTCGTGCTTCGGGTTTATCCCACGTGGTTTACCAAAGGAGATTTTAACGAGGC

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Contig10_LTR-Gypsy_11

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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351

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1001  

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1351

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_11

TGATATCATGCGTACTTTGACCTATTATATCTATTATTTTCTTATGCTTTTGAGAAGAGATTGTTGTTATATCTTGGCAAAAGATTCATTTATCACTTGTTTCAGGTTTAAGAAGGTTTTGAAAGTTTTAAGGCAAAATGGACCAAAAGATGAGGAAAACCCGTTTTTAGACAGTTTCAAACTGGCAGAAGTATGACATATTTTGAAGGATTTCCCTATACCCAAATTTGGAATTTTTGATGTCTATGAAAAGCTAGAAGTGTCAAGATTCACCTCGAACAAGAATCAATGCAATCCCTTCAGCCGTTTGGAAGATATGATCCGAGGAGTGAAGCCCTGTCACGACCGGTC

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_12

Class:

Retrotransposons

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LTR

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LTR-Gypsy

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2608

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-

>Contig10_LTR-Gypsy_12

TGATATGCTAAAATTATCCCTTAGAGCTACTTTCTCAAATTAAAAGATCACGGTAGTACTTAGAGGTCGAATCCACAAAGACTCTGTGGCTTCACAATAGACTTTTTCGCTTCAAATCCAGCTAAGCAGTAAATAAGTATTTAAAAGACAGATTGCAGAAAAGTAAATAGAGATGTAATCAATGAGGAAAAAGCGTCAGGTCTAGGGAACTTCTCAGGAAATCAATCAAAGCAAGTAAAACAACTAGTCAAGATCTAATTAAGAACCGTTCTAGAACTCAAATCACTAATATATAGCTAACCAACTGTCGTTACGAAAACTATCTATGACGTAAACCTAAGAGACCAACTGTCGTTGCGAATCCTAAAGTTCAGACAAGCTTTAAGTGCAGGTTCGATATGTTCACAAGTTATCTAATCCAACTGTCATTGCAATTATCTAACATGCTCACTAGGATTAGTTCAGATCTTAAATCACGCTGTCGCGCCAATTTAACAACCTAGTATCATACTTCTAGGTGATCAAGCTAGAACAAGCATTAAGTACAATCCTAGATGAAGAACTAACAAGTTTGAATCTTAACCTGTGCTAAACCTAACAAATCATGAAATCCCTAGTGAGAATCTCTAAACCTAACTAGAGATCTACTCAGACATATCAGATGAAACACAAGACATAGCTGAAATATATATCATATAAAACTGAATCAAAAGTAGAGTAGAAAACAGGGGTTCAAGATCTCCTCTCAAGAAGTACAAGTAGTAAGAACACCCCCAAGCTCTATAGTCTCTCCAAACTTAGCAAAATCAAGATAAAGAATGGATATTGATGGATGCATAAAACTTAACCTAAAAACATAATAAATAGTTTAAGACACGAGTTGGGTCTCTTCTGTAAACTTCTAGAACTTCTGGGGCAAAACTGCAAAAATCTTCAGAACTTGAGTCATTCCGCATGAGCGCCTGACGATGGGTGTCGAGCGACACCAATGGTGGTGTCGATCGACACCTTTGACCACTGGAACCACCGACTTCGCCTTCTCAGCAAAAAATGCTCTATATGCTCCATAATTGTCCAAAAAGTCCCCAACGTATGTAAACCTGTAAAAGACTCGATAAAGACTCGAAAGACACAGTTAAGACTCGATAAAATACTTATATCATGGCTTAAAACTGATAAAATCCATGATATATCA

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Gypsy

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-

>Contig10_LTR-Gypsy_13

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ID:

Contig10_LTR-Gypsy_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Gypsy

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-

>Contig10_LTR-Gypsy_14

TGATCATCTCAATCTCAAGTAAAATAATGAGGTCACGAGAAATTTTCATACCCCTTTACTCAAAACGAGAATCATATCATCTTTTATGCTATTTTTCTTTTCTTTGGGATAAGGGAGAGGAGTACAACTTTATTGGTGTTTACAGAAGTTGTCTTGTCCGGTATGAACGATGAGTCAAG

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_15

Class:

Retrotransposons

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LTR

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_15

TGATATATCATGGATTTTACCAGTTTTTAGCCATGATATAAGTGTTTTATCGAGTCTTAACCGTGTCTTTCGAGTCTTTATCGAGTCTTTTACAGGTTTTAATGCGTTAGGGACTCTTTGGATTATTATGGAGCATTATGGAGCATTTGTTGCTAAGAAGACAAAGTCGATGCTTTCAGTGATCAATGGTGTCGATCGACACTCATCACTAGTGTCGGTCGACACCCATCGTCAGGCATCCTTGCGGAATTTACCAAGTTCTAAAAATTTGCAGTTTTACCTCAGAAGTTCCAGAAGTTTACAAAAGAGACCCACCTCGTGTCTTAGTCTATATATTAGGTTTTTAGGTTAAGTTTGATGCATCCAGCATCTGTCGTCTTTTATCTAACTATTCTTTTGCTTAGGGGATGAACTTGCTACTTGTACTTCTGAGAGAAGATCTTGAACCCCTGTTCTTTATTCTACTTTTGATTCAGTTTTATGATATCTATTTCAGCTATGTCTTGTGTTTCATTTGATATGTCTGAGTAGATCCCTAGTTAGGTTTAGGGATTCTCATAGGGATTTCATGATTTGTTAGGTTTAACACTAGTTAAGATTCAGACTTGCTAGTTCTTCATCTAGGATTGTACTTAATGCTTCTTTTAGCTTGATCACCAAGAAGTGTGATATTAGGTTGTTAAATTAGCGCGACAACATGATTTATAATCTGAACTAATCCTAGTGAGCATGTTAGATATTCATAACAATAGTTGGTTTAGATAACTTGTGAACATATCGAACTTGTACTTAATTGTCAAAACTTTGGGATTCGCAACGACAGTTGGTCTCTTAGGTTTATGTCATAGATGTTTTCGCAATGACAGTTAGTTAGCTATGCATTAGTGATTTGAGTTCTAGAACGATTCTTAATTAGGTCTTGACAAGTTGTTTATTCCTGCTTTGATTGATTTCCCGAGAAGTTCCCTAGACGTGACGGTTTCCCCACTTGATTACATCCTTTATTTAGTTTCTTTGCATTGTCTTTTCAATACTTATTTACTGCATAGCTGAGTTTGAAGCGAAAAGGTCTATTGTGAAACCGCAGAGTCTCTGTGGATTTGATCCCCAAGTACTACCGTGATCTCTTAATTTGAGAGAGTAGCTCTAGGGTTAATTTGACCCCTATC

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_16

Class:

Retrotransposons

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LTR

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_16

AATTTGACCCCTATCGGGGACTCTTTTGACTTTCCAATAGACTTAAGTGTAGAGTTCAGTCAAGGTTATTATTTTTCAGTTTACTTACATCGTTCTTTCTTTTGGTCTGGTGCGTTTCAGGTGTATGCCTAACCGCAGAACTCGAAGCAACAAAGACAACGAGCTTGTAGTTCTTTCGAATCAAGAGCTTGCAAAGTTTGAGCGCGAGATCAGAAAAGCAAAGAAACCAGTTGAAATGGTTGGTCCAGTGGTACTACGACCAGATGAAGCTGGAGTTCTAAGAGACCAAGAGGGTCACATTTGCAATGAG

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_17

ACACTAGGAGATTACAATAGGCCTGATGAGTTCTATGCTAACAGGTCTGCGATTCGTCACCCAACCATTAAGAGGAACGAATTCGAGCTGAAGCCGTCCTATTACTCCTTAGTGGGTCAACATCCTTTCTCCGGATTGCCTCATGAGCACCCTATGGACCATATTGAGAGGTTCGAAGATTTGGTAACCAGCATGAAGGTCAATGGAGTCAGCTATGACTATATCTTTTGTAAGCTCTTCCCGAATTCTCTTATTGGTTAAGCAGCTTACTGGTTGAAGCAGTTACCGACAGGATCTCTGACTAGTTGGGAGGAGACGAAGAAGGCTTTCTTGAGAAACTTCTATGATGATGCGCGTTCAGAAGACTTAAGGAATAATATCTCTTAGTTTACGCAGAGGCCTAATGAGGCATTCAAGACGGCATAAGTTCGTTTCAGAGCTTATCAGAGAGATTGTCCGCATCATGGTTCCTCCTAGGTTCAGTTGTTGGGGATTTTCTTCAGAGGAGTTGATTGGAGGTACCAGATGGCTCTAGATTCAGCAAGCAATGGGAACTTCAATACCAGATCTCCTAAGGAAGCCTATGAGTTGATTGAGAACTTGGCGTCTAGCAATAGCACCAAGAATGCTGATTATGAGCGTCAGAAACAGCCTGGAAGCATATATGGGAAGCAAATTGCTGAGTTGAAGACAAAGTTGGATTCAGTTCACAGTATCCTGACGAACAAGAAGTCAGTTCACTTTGCTGCAGAGGTTAAGACATTTGCCCTGAGTAGGTATATGAGGAAGAGGATTGCAACTACATTGGTGGCACTAGATTTCAAGGTCAGTGTTATGGCAATCAGAAGAACCGAGGTGGTTACAGTGGGAACAATAAGCGGAGTACTTTCACCGGTAATCAGAACTCCTCTGGTTATATTCCTAAGAGCCACTATCAGAAGCCCTTCCGGAGCAACAATGACTTCAACAGGAACTATGG

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Gypsy

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_18

CTAGAGAGGTACCAACACCGGCTAGTGTCGATCGACACCCACCCATTGGTGTCGATCGACACCACTCGTCACCAGACGCATTGGTTGTTGAAGAATTGCAGAAAGTGCATGTGCATGTTTACGTACCCAAGGTTCCTTTTCCTAAGAACAACAGGAAATCTAAGCATGAGTTGTATGACGCTTAGTGCAGAGCGATCATGGATAAACTCACCATTGAGATTCCATTGATTGATGCTATCAAGACTTCGCATGTGGTAATGTGGTGCTTAAAGAAGATGCTCACGCAGGATATACGAGAAGAGGAAGGAGTTATGATGATGACTGAGGTCTGTAGTGCTGTTATTCAGAACAGGATACCTGAGAAGCTTGTTGATCCGGGTAACTTTGTCTTGGATTGTTCTATCTTCCAAGCAAGGTTTAAGAATTCCTTGTGTGATTTGGGTTCCAGAGTGAGTTGGATGCCGTATTCAGTTGCTGTGGGACTCGGGATGACAAACTTCACGCCTATTGAGATAACTCGGATCCTTGCGGATAGGAGCATTCGGACACCAGAAGGTCTTTTGGAAGATGTGCCAGTGAGAATCGGCGAATGCAGGATACCGACGGATTTTGTTGTGTTGAAGTACAGTGAGGAGCCTAAGGATCCTCTTATCCTCGGTAGACCTTTCTTAGCCACCGCTGGAGCGAATATCAACGTTAGAGGAGGCAGAATAGCTCTGAATGTGGGAGAGTCGGTCATGAATTTCGATATGGACA

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

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Start:

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8201

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_19

ACGACTCTGGTGTCGATCGACACCAACACGCATCCACGGATAAGTCTTCGTAATTTTGGTTCTAGCTTTGTTTCAGTTCTCTCTTTTATTTACTAATCTCTGGTTTGGCACCACTGGGGACAGTGTTGTTCAAGTCTGGGGGAGGTAGTTAGTAACTATGTGTTTTCTTTTCTTATGAGTCTTTCGAGTCAGTTGAGTCCGTTTTATTGAGTCAAAATCAGTTTATGAATCTATGAGTTTTTGAGGAAACCTTCACATTTGCAGGAACTTAAGTGACCATTTTATTTAAGCTTGTTAGGCATCTGAGACTAATGGAAAAACCAAAGGCTTAATGGTAGACTTGAGACGCCCATATTTCCAGCAGACATCCACTAACTTCCGAGCCAATTTCTGTTACTTCCTTTTACCTCATCAATGTGACAGGTGTTATGGGGCTTGACTCATCATTCAAACTGGACAAGACAACTTCTGTAAACACCAATAAAAGTGGTACTCCTCTCCTTTATTCCAAAGAAAAAAAAATATAAAGAAAAGCAGAAAAGGTCATACGTCTTAAGTAAACGGGTAGAAAAATTTCACGTGACCTCATTATTTTACTTAAGATTGAGATGATCATGCAGAGGT

ID:

Contig10_LTR-Gypsy_20

Class:

Retrotransposons

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LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

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Start:

8304  

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8504

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+

>Contig10_LTR-Gypsy_20

AAAAAGAATAAGTCTGGGGGAGAGAAAGAGTATTATAGCTATGTGGTTGTCTTTGTTTTGGTTTTGTACGTGAAAGAGTCTAGAAGGCTCGGGGCATCGAGATCAGAGATGAGACCCGGCGATGAAGGTATTGTGGACTATGCTGTAAAATTGTGGGTTTTATCGGGAAAGCTATGAACGTCTACGGAAGTACATGGTGGT