ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig0_LTR-Copia_1 RetrotransposonsLTRLTR-Copia902334323432+
Contig0_LTR-Copia_2 RetrotransposonsLTRLTR-Copia196103406103601+
Contig0_LTR-Copia_3 RetrotransposonsLTRLTR-Copia230105784106013+
Contig0_LTR-Copia_4 RetrotransposonsLTRLTR-Copia263105995106257-
Contig0_LTR-Copia_5 RetrotransposonsLTRLTR-Copia399109025109423-
Contig1_LTR-Copia_6 RetrotransposonsLTRLTR-Copia15854855642-
Contig1_LTR-Copia_7 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1731316013332-
Contig1_LTR-Copia_8 RetrotransposonsLTRLTR-Copia5761333313908-
Contig1_LTR-Copia_9 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1061495715062+
Contig1_LTR-Copia_10 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1312926629396+
Contig1_LTR-Copia_11 RetrotransposonsLTRLTR-Copia10163052931544+
Contig1_LTR-Copia_12 RetrotransposonsLTRLTR-Copia5603154532104+
Contig1_LTR-Copia_13 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1004565645755-
Contig1_LTR-Copia_14 RetrotransposonsLTRLTR-Copia1704881848987-
Contig10_LTR-Copia_15 RetrotransposonsLTRLTR-Copia20029963195-
Contig10_LTR-Copia_16 RetrotransposonsLTRLTR-Copia19080878276+
Contig10_LTR-Copia_17 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2651032010584+
Contig10_LTR-Copia_18 RetrotransposonsLTRLTR-Copia2191870818926-
Contig10_LTR-Copia_19 RetrotransposonsLTRLTR-Copia4121892619337-
Contig10_LTR-Copia_20 RetrotransposonsLTRLTR-Copia7411932120061-

< 1 2 3 4 5 > Total 318


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig0_LTR-Copia_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

90

Start:

23343  

End:

23432

Strand:

+

>Contig0_LTR-Copia_1

TGCATCATCATAATAAACATTATCATCATCATCATCTTGATCATCATACAAGCATCATCAACATTATCACCATATCATCATAATAATAAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig0_LTR-Copia_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

196

Start:

103406  

End:

103601

Strand:

+

>Contig0_LTR-Copia_2

TTGAGGTTTAACATCCGTATAATATTAGGTGGTTTTAATGTTTTGCTAGAAGTAGATTATAATTTATAGGTCTAAAAGTTCACTGCTAATATTATACGAACCTTTAGCGTCACATGCACACCTAAACATACTGTATCATAAATGAGTTGGAGTTTCATATTAACTTATATATATATATAATATGTATATATAATTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig0_LTR-Copia_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

230

Start:

105784  

End:

106013

Strand:

+

>Contig0_LTR-Copia_3

AAAGTGTTCGTCAAAGTTTTGAGATTTGATCTCTGCCGCACTAGCATCTCGCATTGATGTGTGAGTATTGATACTGGTAGAGGCACGATGTTTGAAGTGCTACACGGGCTCGATCTAAATTAGTTTACCATTTCGGAACAGAATATCCAGATATATTCAAGACTCTGAGATTTTTATTTATTTTAATATTTGCATGAAATAATGTCAAGTAAATTCATACTAGTTTATAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig0_LTR-Copia_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

263

Start:

105995  

End:

106257

Strand:

-

>Contig0_LTR-Copia_4

AATTCATACTAGTTTATAATGATTTATGAAACTACCTATGAATTTACTTGACAGGATTTCAAGCAAATATTGAATAAATTTAAATCTTAGTGTTTTGAATATGCCTGAATATTTTGCACCAGAATAGTGAACTGATTTAGATCGAGGTTGTGTAGCACTACAAACGTCATGACTCTGCCGGTATCCACACAGACACAAAAGCTTGATCACATCGGGATGCTAGTGCTGCAGATATGACATCTCAAAACTTTGATGAACACTTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig0_LTR-Copia_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

399

Start:

109025  

End:

109423

Strand:

-

>Contig0_LTR-Copia_5

ATCCCCCACATGAATAGAAATGACTCTAGACACAAGACGACTCAAAATACTTGACCTAACTAGAAAAGACTCGACATAAGCTTTTGAGAGTACAAGCGAAACATTCACTGCATCTGATATGGTAGAATTTTTCATCTTTGAACCATCCTTTTTATTAACTGCAGGTTCTACTCGACCAACTGGTGAACATGATGTTCTTGAACCATCCGGGCTTTGATGTAAACCTAGGCAACAACTATCGTACAACTTCATTTTCTAACAGAACTAGGTTCTCTATTGTGTTCATTTTGGCCGTGAACATGCATGGTTAGTCATGAGTAAACTTAGAGAATATAGCCTAAATTTTATTCTCCTAGAAACGGCCATATTTCATACGCACAATGTGATTTTTCATTAGCT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

158

Start:

5485  

End:

5642

Strand:

-

>Contig1_LTR-Copia_6

CGTGTTGGTCGATCCGTGGTGTAAGATCGATCGATCTGTTCAGGATCGATCCATCCTGGACAGGATCGGATCGCTCTAAGCCTTGTTTGGTCGACTGAGATGTTCACGGCAAGTTGGGGATCGATCGATCAAGCAAGTCGATCGATCTGGTGTTTCAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

173

Start:

13160  

End:

13332

Strand:

-

>Contig1_LTR-Copia_7

TGTTGTGAAAAAAAGTGATGAAGGAATTGATGTGTATTATTCCATGAATAATAAAAAGTATATTAGGGATACAACTTAGAGAACAAGTAAGCTTAGGGAACAAGTAAGTCTAGAAGATTCTAGAACATGGGCATATGGGCTTATAATGGACAGCTACATAATTGTTCATAACA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

576

Start:

13333  

End:

13908

Strand:

-

>Contig1_LTR-Copia_8

CTCCCCCTTGGATGACCATTATAATAAGTTGGTATCCAATGCGCTTGAGATGCTGCCTCGTTAAAAACCTTACTTTGAAAACCCAGTGGAAAAAACCAAAATTAAAGGAAAAAGAGTGCAGTGCGCATTTACCCGCCCTGATAAAAATATCACTGATCTTTGAGACGATGCGATTCGATCTTGGTGAACTAACTCCTTGAAAATTGAAGTTTGACGCATCTTGATAAATAAGCTTGCAAAAGCTTCACTTAAACAAATCTTCAGTCCATGTACATTGCTAGTCTTTTGCAGTTCATTGGTCTCATAGATGACTCATCTTGATCATTCTTATTTTGCTACTGGCGATCTTATTAATGTCTGATAAAGGCTTTAATATAATGATAGATCTTCCTCTTTTGAATTCCACTTAGGTGTCTATCATTTTTGTGTTCTTTGTTGTCTCGTTAAAAACCTTTTCATGCCAAAACCCAAATGGGACAAAAAGCCATGATAAAGGAAAAGAGTACAACCACACATATAATCATATTGCTCCCCCTGTAAGCATCATCTTCAAGGTATATTTTCTGATCATATGCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

106

Start:

14957  

End:

15062

Strand:

+

>Contig1_LTR-Copia_9

CGATCGGTCCTGGTCAGGATCGATCGATCCCACCAAGCGTGAACGTCACCAGATCCGATCGAGAATCCTGTCCAATCGATCCGATCCTGTCCAAATCGATCGATCC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

131

Start:

29266  

End:

29396

Strand:

+

>Contig1_LTR-Copia_10

GATCGATCGTTCCAAGGTGGGATCGATCGATCCAGTTCAAGCAAAATTACGTGAAGATTCAAGATCGACCAGAGCACATCAGATCGATCGATCTGGTCCAGATCGATTGATCCAAGACCAGATCGATCGAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

1016

Start:

30529  

End:

31544

Strand:

+

>Contig1_LTR-Copia_11

GAGGACCACGAATATGTTTACCTAGTGAAGCTGAAGGAGGAACTTGTAGCGGAAAGCGAAAAAACCAAGCGGTTGGAGATTAAACTCATGGAGCACACAAAAAACTTGAAGATGCTAAACAATGGAACAAAAGATCTAGATCAAATACTGAGCATGGGAGGAACAGAGAAGACAAATTTGGGTATTGGTTATCAAGGATGTACGTCTAATTCTAAAACAGTTTTTGTTAAATAAAATATGTTGAAGCCTGCTGGAACAAAAGAAAAGCTGTTGGAGACGACAACAAAGAAAGTCATCACAACCTCGATGGATGACAGTACTGTTTAAGTCAAAAGAAACACTCCATGTGTGGTTGAATGGAAGAAGATGAGTTATGCTCTTGGATACAACAGAAGTTTACCAATTTCTGTTAGATGGAACAAGACAAATTCTGTTGGAACAAAAACCCAGAAAAATCACCAAAAGGTTACGCCAAGTTGCTATTATTGTGGAAGAAAAGGATATATCAAGGCATACTATTACAAATTCCTTGATATGGTGAGATATGCATTGAAGCAAAATAAATTTATTCAATATTCAAGGAGATCTCAAAAGATATGGATCAAAAAGGTTGATTTGTATGATGGTTTATCTTATAACTTATCATTTAGTGCTTCAAAAAAGTTATATGCTGCACATGTGGCTGTTTGAAACACATGTCAAGTGGTCAAGAACCGATTGAGAGGAAGAAATACAGAAGTATGACTGAGAATCATTGGAGAGCTCTAAGGGGAAGGCGATTCTGATTGAGAAGGTTGTTCCAAGAAGTATGGTTATGCTCACAGTGCATTTGGAGTTTTAACAGAGTTTTGCACTCAATCAGGGGGAGAATGCGGATGGAAGATCCGTGAAGATAAAATGCTACTTTCATGTTGATGTATGATTAAGGGGGAGTTTTATGTCATCACTTTGTGCTTGGTATGTATGATGGATATGGTGAGCTTGAGTTATAAAACTCAGTTAAAAAAAAGGGAGAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

560

Start:

31545  

End:

32104

Strand:

+

>Contig1_LTR-Copia_12

TGAAAGTGCATAACCTGTTGGAACAAAAAGCGGCTTGTTGGATGTTGGAACAAGTTCGAACAAACTTGAGGAGAGTCGATTGATACTCACGTAGTTCATGGAGTTGAAAATAAATGTCAAAAGATATTTGGAGATACTTTTGGAGAAGAAATTTGCAGTACAAGATATTCTTGAAGATTTAATCCTTTTATTTAAAGAGGATAATTTCTTTTTGTTAATTAAACCTAGGGAGACATATCTCATAGGTATATGGGTATATATACAAGGGAGGTGTGTGCTGCTAAGGCTAGCCGAAAAGAGAGAGAAAAATTGTTTCATTTGTTTCGGTCAGTTGTAGGCAAGTTGAGTTACTTGTTGGAACACAGGTCTGGTTGTTCCACGACTGTGTATAACTAGATATTGTTTGGTGACGAGCTAATGGGTGTCTTAGTGTCATGTAATACCAATTAGGCAAGGTCTTGTTGTAAGATTGTCTAAGTGAATCTAGTTGGTGGTTTGAGGACGTAGACACTTTGCCGAATCTCGTTAATTCTCGTGTGCATCATCTATCTCTGCTTTTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

100

Start:

45656  

End:

45755

Strand:

-

>Contig1_LTR-Copia_13

GCTGGATCGATCGATCCTGATAGGGATCGATCGATCTTGATGGCTGAGTGTTGTTTCGCGGTTGTGGAGTGGATCGATCGATCCATGCTAGATCGATCGA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1_LTR-Copia_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

170

Start:

48818  

End:

48987

Strand:

-

>Contig1_LTR-Copia_14

TGGTACACTAAAAGTTTACGAGAGTCGTTCTTAGCTGAAGAGAATGGTTTTTGGTTTATGATTTCAAACTTGTAAATAAAAAAAGCAAAGAGATCAAGATTAAGATATATATTAAAAAAAGCATTGGGTCATAGGGTAATTCAGAGATCAATGGTTAATGAAACAACCAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig10_LTR-Copia_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

200

Start:

2996  

End:

3195

Strand:

-

>Contig10_LTR-Copia_15

TTTCTTTTTCTTTCTTCTCTTTTTTTTTAAATTCAAAGGTGTAGTGAATAATGATGTCATGGGAAAATTTCCTACCCCTCAGTTCCACCACTGAGTGATCATCTCAATCTCAAGTAAAATAATGAGGTCACGAGAAATTTTCATACCCCTTTACTCAAAACGAGAATCATATCATCTTTTATGCTATTTTTCTTTTCTTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig10_LTR-Copia_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

190

Start:

8087  

End:

8276

Strand:

+

>Contig10_LTR-Copia_16

AAAGAAAAAAAAATATAAAGAAAAGCAGAAAAGGTCATACGTCTTAAGTAAACGGGTAGAAAAATTTCACGTGACCTCATTATTTTACTTAAGATTGAGATGATCATGCAGAGGTGGCAGTGAGGGGTAGGGAATTTTCTGTGACCCCATTATTCGCTACACCTTTGAATTATAAAAATAAAATAAAAAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig10_LTR-Copia_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

265

Start:

10320  

End:

10584

Strand:

+

>Contig10_LTR-Copia_17

TGGTTCTTAATTATTAAACCCCATACTTCATATTTTCATTTGTCATTGATATCCTAAAACCCCTTTAGCCCAATGTTTTTAAATCGCAAAGTTTACCGTTTAAATTTCCCGTATTTTTATTTACATGCCTACAAAACCAACCAACCATTTCGCTCTAGCTAATTTCGACTCTCGTAAATCCTTAGAGTACCATTGGTTCTTGTGGATCGACCCCGTATATACTACCTAGCGGTTAAGTGTATCGGGTTAAATACTCGAGCAATCA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig10_LTR-Copia_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

219

Start:

18708  

End:

18926

Strand:

-

>Contig10_LTR-Copia_18

AGGCAAACGATTAGCAAAACCTAACTACCTGTGATCAGAGCTAGTTTGTTTCATCCACAATAATTGGGTGCAACAACTTCCCATGGCAATATACTCTGATTCAGCAGTTGAGAGAGATACAGAGTTTTGTTTCTTACTGTGCCATGCAATCAGATTGTTACCCAAAAAGAACCAACCTCCAATTGTGCTACGACGATCATCAAGGTTGCCAGCCCAGTC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig10_LTR-Copia_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

412

Start:

18926  

End:

19337

Strand:

-

>Contig10_LTR-Copia_19

CTTTGACATATTTGATGATACGTTTCACATCAACAAGGTGGGACATGCGAGGATTCGCCAGAAAACGAGCACATACATCTACACTGTGACATAGATCCGGTATGCTGGCTGTAAGGTACAATATGCTCCCAATCATTGCACGATAGAGTGTCGGATCCACGGCTTCGCATGTTTCATCTTTCAATAGTTTACAGGTTGTGCTCATAGGAGTCCGTGCTGTTTTGCTTGGCTGCATCTCAAATCGTTGAATCAGATTTTTGGCATAAGTTCTCTGTGAGATAAAGATACCTTCGTTAGACAGTGTGATTTGCAAACTCAGAAAATAACTAGCAACTAGTCAACAGCTTCAGCCCAAAATCTTTGTGGCACATTATTTCCATGTATCATTGCTCTGGCAATCTTCACTAGACTC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig10_LTR-Copia_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Copia

Length:

741

Start:

19321  

End:

20061

Strand:

-

>Contig10_LTR-Copia_20

CAATCTTCACTAGACTCTGAACGTGTATGTGCCCAAGTCGTTTGTGCCACAACTCCAGTTCTGATATGACAGGCGACAGACATGTATCTGAAGCCTTCCAGATGTAGCAGTTATCTCCTGATCTAACACCATACAAAAAAGTGTTGCCATTTTCATCAACAACTTGACATTTGGTTTTTGTGAAGATCACTTTCGAGCCATCGTCACACAGCTGAACGATACTGATCAAATTCTCATTCAAGCCTTCTACATAGTAGACATTTTCTAATAGTGGTTGATCATCACTCTCAAGACATCCTTTGCCCTTGATAAAACCTTTTCCTCCATCCCCAAACGTGACATTTCCTCCAACAGCAGTATCATATGATGATAAAGAGCTGACATCACCAGTCATATGTCGCGAACAGCCACTGTCAAAGTACCATGAATTATTGCATGCTTCACTTGTTGAGGTGTATGCTACCTTGGCTGACATGTCTGTGAGCTCCCCAGGTTCGTCTAATTGAACGATTGTAAAATTGCACACCAGATTGACTTCTTCAGTTTCTTTAAGATTCTCACAATGATCCTTCTCATCCATTTCTGGGTGTTTACTGTAGAGATCTTTCTTGGCAATCCATACATGACATAATCTAGATAGTTCAATGAAACATTTTCGAGCTTGCCAGAGATGTCTAATCGTATTCTTAAACCTGTAGCACACTGACCTGGTATGGCCCGTCTTTCCACAGTGAAAGCATT