ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
Contig1051_LTR-Caulimovirus_1 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus120557676+
Contig110_LTR-Caulimovirus_2 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus116150237150352-
Contig1110_LTR-Caulimovirus_3 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9041914280-
Contig1113_LTR-Caulimovirus_4 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus139628814276+
Contig1126_LTR-Caulimovirus_5 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus13811525916639-
Contig1126_LTR-Caulimovirus_6 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus31201773720856-
Contig1134_LTR-Caulimovirus_7 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1212039120511+
Contig1171_LTR-Caulimovirus_8 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2342945229685-
Contig1180_LTR-Caulimovirus_9 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus32228642589646+
Contig1180_LTR-Caulimovirus_10 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1818971789897+
Contig1180_LTR-Caulimovirus_11 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3289174792074+
Contig1180_LTR-Caulimovirus_12 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus10369206993104+
Contig1182_LTR-Caulimovirus_13 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus32345094831+
Contig1182_LTR-Caulimovirus_14 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus29949515249-
Contig132_LTR-Caulimovirus_15 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus173140041140213-
Contig1396_LTR-Caulimovirus_16 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4175853758953-
Contig1446_LTR-Caulimovirus_17 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3922815428545+
Contig1446_LTR-Caulimovirus_18 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus18142855630369+
Contig1462_LTR-Caulimovirus_19 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1173577735893+
Contig1512_LTR-Caulimovirus_20 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus832094321025+

< 1 2 3 4 5 > Total 31


Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1051_LTR-Caulimovirus_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

120

Start:

557  

End:

676

Strand:

+

>Contig1051_LTR-Caulimovirus_1

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig110_LTR-Caulimovirus_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

116

Start:

150237  

End:

150352

Strand:

-

>Contig110_LTR-Caulimovirus_2

GATCGACCTTGTGATTTATCGTTGTTAATAGTCGATTTTGAACTAGTGCGTTCTCTGTTTGCCAATTAAGAACTTTTTCTCCTTGGCTTAGCTGGTCTGGTCCTAGCGGATTGATG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1110_LTR-Caulimovirus_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

90

Start:

4191  

End:

4280

Strand:

-

>Contig1110_LTR-Caulimovirus_3

ATTTCTTTTTTTCAATGAGCAACGTTTTGCCAAGAAAAATTCTTCTTACAGTTGTTCTTTTAAATAAGTTGGTATATCGATGAATTCTCT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1113_LTR-Caulimovirus_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1396

Start:

2881  

End:

4276

Strand:

+

>Contig1113_LTR-Caulimovirus_4

AAAGGTCACAACATTACCATGCTTAGTTATCCCACATCCTAATGTGTTTATGATAGTAGAAATCGATGCATCAGAGATAGGATATGGGGCATCCAGAAACAAAGATTTTCAGAGTCTATCCAAGAGTCTATTGTACGTTTCCATTCAGGAGTTTGGCTAGGACGACAAAAGAATTATTCTTCAGTTAAAAAGGAAGTCTTATCAATAGTAAACTATATTTCTAAGTTCCAAGATGATTTAATAAATAAAAGATTTTTATAATGTGTTAATTGTAAATCAGCAACATATATTTTACAAAAGGATGTTAAAAACCTGATTTCTAAACAGATTTTTTGCAAGATGGCAAGCTATATTATCTGTTTTTTATTTTGATATACAATATATAAAAGTAAAAAATAATTGTTTACCTGATTTTCTAACAAGAGAATATTTACAGGGAAAATCTCAAGACCATCAAAATGAGTGAACAAAAAAAAGCTAATGTCTGCTTCAGAGTATATAAAGAATTAACCACATCTACAAGGAAAACAAGTATCAACCCAAAACTAATTTTCTTCATTAGCGAAATTCCCTCCTTCATCATATGCCAAAGCTGTTAACCCAGCACCACAGAAAATAGCACTCACCCCTTCCCCACAAAAAAACTACCGACCAAAAAACTTCCTTAAACTATAACATCAATACCTTATCACTACATCCTTTTTTAAACATATATCTCTCAAGGACTTAAACATTTTTCCCAACCGACTCTTCTAAAAAGATAGCACATTTCTTACCGATAACCTTACCAAAAACCATACCTTCTATGAGTTTATTCTCGTAGATACCAAATCAGTTGAGATTACTCATCATACTGATAAAAGAAACTCAAAACTCATTTCATACTCCACATGCAAGATCCTAAGGGTATGTACTGCTTCAGAACTCGGGTTTAGCAACCTCCATACTACAAAATATTTCTCCATCCCTGGGTACCATATTCCAAGCTTTACCTACATGGATTATCAAAAGGATATTCTACATGTCTTTTATCTACGAACCTACAACCATTCTTGGATTATATCCTTTGACTTCCATTGTCCTAAGTCAATACCATGATGGTTCTATGAATGGTGGCAGTGGTTTGGACCATGTGACCAAATTTATCCTCCCCCAATACCAAAAGTATCCTTACCCTATTATACCAAACACGAAAAATACCAACATCTAGGACCACTACCAAAAATAGCTTTCCATATAGACATGAGAGTACCCTGGATATTATCGTGTCATTTCAACGATGTAGCCTTTTTACATGATAATGTAGCCTTTTTACATGATATGCCATACTCCCTAGTCCAAGAATACCGATTAAAATTATGGAAAAATACAACTTGGGCCGTTGTACAGTCACCAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1126_LTR-Caulimovirus_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1381

Start:

15259  

End:

16639

Strand:

-

>Contig1126_LTR-Caulimovirus_5

GGACCGCCAAATGGATCTGGATCTTGCATAACCTCATCGTCATCGTCAGATGCGTCGAGTTGTTGTACCAAGTCGGCAAACATGTGTTGACGTTTGGCCTTCTTGGTGGACTTGGATATGGAGGAGCCAGTCGAGTTGGCTGGACTCGGGGTGCGTTGTATAGCTGGGGTTGAAGAAGAAGTTTTGGGATCAGCTCCGAATTTTTGAATAAGTTGTTGAGGGGTAAGAAGAGGTATGGATTTGGAGACTGCTTTAACGGCATCTTGGGATTGAGATATTATCTGGAAGTGTTTGGCTATGTTGGTTAGAGAACATCGTTCAAGATTATACTTGTCCCACCATTTCACTCTGAATTCTTTGAGTAGAGAGTAAGGCATGTTGGGTAAATATGGGGGTAGGTTAAAATGCCATGAACATATCCATGGAATACCCATGTCTATGTGAAAGGCGATTTTGGTAAAAAGGTTATTTTTTTGTTTGGGTAAGTGTTTGGTATAAAAGGGTAGGTTTGTTTTAAGTATATATGTGGGGTAAATTTCTTCAGTAGGTCCAAACCAGTACCAACATTCGCAGAAACAGCCTGGTACTTGCTTGGAGCATCTTGAGTCAAAGGACAAAAACCAGGAATGGTCAAATGCCCTTAGGAATAATGCCCGGAAGAAGGCATTTTGATAATCGACATATGTATACCCTGGAATATGAAAGCCAGGTTTTGAGAAGGATTTTGTCGTGTGTAGGTTAAAGAAACCAAGGTCTTGAATAGAATGTATTCGGAATATTTTACAGTGGTATTGGGGTTGGATTTGTCTGGATAATGAGTTATTTCAGCAGACTGAGAGTCTACTAGAATGTACTCATAGAAAGTACGGTTTTTGGTTATATTGTCTGTTTTATATTGACTATCCTCATAGAATAATCTTTGAGTATAGGATTGAAGTTGTTTTAGGATTTTGTGTATTGTGTGGTCATAAGGTGTTGTTTCTGTGGTTTAAGAAAATAAACGGATTTTTCTGGATTAGATTGGGTTGGGTGAGAATTTTTTGAGGATGTCTGGGTATTGACATCAGTGGTTACGGCTTTTGAATAGGTGAGTGGTGGATATTCAGCGAGAGCCGAAAAAGCATTTTGCGTAGATAGATTCTTTCCTTGCATATGTGATTGAGTCTTAATATAGTCCGATGCGGTCATCAGTTTTTTCTGCTTTTTATCGCTTATCTTGAATATTTCTGGATTGAATATTTGCGAATTTACCCTGTAAATATTCTTTTGTTAGGAAATCAGGTAAATAATTATTTTCACCTTTAATATATTGAATGTCAAAATCGAAAGCGGATAAAATAGCTTGCCATCTCGCAAAGATTTGTTTTGAAACTAGGTTTTT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1126_LTR-Caulimovirus_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3120

Start:

17737  

End:

20856

Strand:

-

>Contig1126_LTR-Caulimovirus_6

GTTGAGTAAGTTGGCTCGGGGTGAGTAGGGGTATCGATCTGGATACCGTTTTGACTAGTTGGGTAAGTTCTTTGTAGGTTTGGAAGAATTTTTGAATATTAGATAAGGAGCAACGGTCGAGGTTGTACTTATCCCACCACTTGACTCGGAATTCGCGAACCAAGGAGAATGGCATATTGGGTAGAAGGTTGGTTAGATGGAAATGCCAACAACATATCCATGGAATACCCATGTCAATGTGAAATTGGATTTGGTTTAGTGGAATAATGGGTTGTTGAGGAATGTGTTTAAGATAGAAAGGACGAGAGGTTTTGAGTAATTTGGTCAACGGGACCAAACCAGTGCCACCATTCGTAAAACCAGCCTGGTATTTGCTTAGGGCATTGGTGGTCAAATGTAATAAACCAGGAATGGTCATACGACTGAAGGTAAAATGTTTTGTAAAAGGCATTTGAATAATCTGTATAGGTCTAGCCGTCTATATGAAAGCCTGGGGTAGAAAAAGGTTTTAGTGTATAATGGTTAAGAAAACCAAGGTCTTTGATAGAGGCTATGCGTAGTATTTTGCATGTTGAGTAAGATATGAGATTTGGGTTATTTTTGTCTGGGTAGTGAGTACTATCTCAGCAGACTTAGAGTATACTAGAATGTACTCGTAGAAAGTACGGTTTTTGATTACGTTGTCTGTTGGGTAAAGAGAGTTTTCGTAGAAGACGGAGGAGATGTAGTGTTGTAATTGTTTAAGGGTTACCGGTTTGGTAATATTTGTGGTCATTAGGTGTTGCTTATTTCGTTTAACAAAGTATTGACACTTTCGACTAGCTGTTTGTTGAGTAGACGGCTGTCCTTTTTCAGGATTTACGGCCTTTGAGTATGTGAGGGGTGGATACTCAGCTAAGGCTGAGAAGTTATTTTGAATAGATAATGGTTTGCCTTGCATATGTGGTTGGTTCTTGATATAGTCTGATACCGTCATCGGTTTCTTGCTTTTACGATCCGTCATCTTGTATATGTGCTGGAACGTCTTGATTTTTTCCCTGCAGATATTCTCTTGTTAGAAAATCTGGTAAGGAATTGTTTTCTCCTTTAATGTATTGAATATCGAAATCGAATGCAGATAGAATCGCTTGCCATCTGACAAATATTTATTTTGAAACTAAGTTTTTACGTCTTTTTGTAATATTTCTTTTGCCGATTTACAATCGACTCTTAGTAAGAAACGTTTGTTGATTAAATCATCTTGAAATTTTGAAATGCAATTGACTATAGAAAGAACTTCTTTTTTAACTGTTGAGTATTTTGTTTGTGGTCCTAGCCAGATACCAGAATGGAATCTTACTAGAGACTCTTGTTTAGATTCGGGTATTTGTTGTTTAAGAATACCACCGTATCCAATATCGAATGCGTCGGTTTCTACTATCATATAAGCGTTTGGGTTTGGTAAGGTTAGGCAAGGGACAGTTTTGACTTTTGCCTTGACTTGTTTGACCAGGTCAGTATGAATACTGGTCCATGGTTTAGGATTTTTTTGTAATCTTTGGAATAGTGGTTGAATATTTTGTCTTAGATTTGGGAGGAAATCTGATACATAATTCAGACATCCTAAAAATCTTTGTAATTGCGTTTTTTTCCTTAATTCATTTTGGAATTTTTCCGCAAATTCAATGGATCTTGAAATAGGTGTGATTGTTCCTTGATAATTGTTGTGTCCTAAAAATCGTATTTTTGTTTGAAATAAGGACATTTTTTTGGCGGATAAAACTAATCAGTGTTTTTTGACTATATTTAAGAACGTGTTTAGATGATTTATGTGTTGGTCAATAGAGTTTGAGTACACCAGTACATCATCTATATATACTATAGTGAATTTGGAATAATTATTGAATATGTCGTTCATTATATGTTGGAATTCGGAGGGTGCGTTTTTAAGACCAAAGGGCATTACGTTCCATTCGTAATGTCCAAACGGCACAGTAAATGCGGTTTTATATTTATCTTTCCCGGTAATTTGTATTTGCCAATAACCGCTTTTCATATCGAATTTTGAATAGATTTTTGCATCGTATAATCTTTTTAATAAGTCTCTTTTATTGGGTATTGGATATCTTATCCATTGTAATACGTCATTTAGTGGTTTATAGTGGATTACTAATCGTGGTACTCCACGTTCTTTTTCTGCTTGATTATTAACATAAAAGGCCGAACAACTCCAAGGGGATTTGGACGGTCTAATAAGTTTCTTTTTTTAAGAGGTCGTTGATTTCTTGCTTACAGTGTTCTAGCTGTACGCTATTCATTTGAATAGGTCTTGCTTTTGTTGGAATAGTTTTTTCATTAAAATCTTCTATGTAGGGAAGATCAACAGTATGCTGTTTTCTTTCCCAGAAAGCGTTTGGAATATCAGAACATACTTGATTTAATAAATCGTTTTCTATCGATTTTATCTTGTCTATAATATATGGTGATTTAAGTTGTTCTTCTATTTTTTATAAGTTATTTCTTCTTGTAAAGATTGAATATGATTTTTTTTCCTTTTATAAGATTTATTGTTTTATGAATTGTGTTTTGCTGTAGTACTAATACTTCTTTCATTTTTATTGGTGATAAAAATTTGAATAATAATTCTGTTCCCATTATTTTTTGTACTGATCCCGAATTTGTTTACGTTAAACGGGTAGATTTGAGTAAAGAAAGAAGTTCCTAAAATTACTTCTTGAGATAAATTTTTTACTAGGATAAATTGGTTTTTGAAACAGTAACTGTTGTTGCATATATTTGCGCAAGGTAATTTATATTTTACATTTAGATTGCTACCGTTTGCACCACTTAAGCGTTCGGTAGTTTTTTCATAATATTTTGTTGGTATTAATCCTTCACGGATGCAATTATAATCCGCTCCAGAATCCATAAGTGCAATGATTTCAATTTGGAAATCATATCCTACATGTAGTTTAATTTTTGTATACCATTTTTGATAATTAATTTTATTAATTATTTGGATATAGTCTTCATTATTTTGATTATCAGTTTCAATTTCTTTTTCTTTTAATTTTAGATTACTAGTTGATGGTTGATTATTATTTTCTATTAATGTTAATTTAGCATCTAACTGTAGTTGAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1134_LTR-Caulimovirus_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

121

Start:

20391  

End:

20511

Strand:

+

>Contig1134_LTR-Caulimovirus_7

AACAACTTTTTACGAAGAAATGATGACGATGGTCCAACACATGATGGTTAATTCGTCCCACATCAGAAATAAAGAAGCTGAAACGGCTAACCTGAACAATCAGTTGAAAATCTCGAAAGAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1171_LTR-Caulimovirus_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

234

Start:

29452  

End:

29685

Strand:

-

>Contig1171_LTR-Caulimovirus_8

AATATTGCGGTAAAGAGTTTTTTTTTTTGATTTCATTATTAAACGTTGATATTTTTGATATAATTCTCTCGGAATTTATAATTGAATTTAGAAGGAACAAAGATAACAATAACTAACCATGATTAAACTTTTAAAGAAACGCATATTGTATAGAGACTAAACCTGTTCATATCAACATAAGGCTTGCATCGGTCTTCTACTGCCTTCTTCGGTCTCCTGCGGAACTGGAACACC

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1180_LTR-Caulimovirus_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3222

Start:

86425  

End:

89646

Strand:

+

>Contig1180_LTR-Caulimovirus_9

AAACTCTAAAAACAAACCATTTTTAGTCAGACCCAAGCCACTTCTACCTAGACGCTGTCACTTCTGGTGTTCCAGGCTGCAAGACCTCAAAGAAGGCCGTAAGACCGATGGCAAGCCGCAGACGTGCCTAAGAAGAACATGTTAGTCTCTTTTTAAATATGTGTTTCTTTTAATAGCTAATCATGGCATCCTCTTTTAGAAAAAATTTTAAAACTAATCAAGCATCATCCTCTAAATCAAAAATAAACTCTAGAGAGATCATATCAAAAATATCAACGTTTAATAATGAAATAAAAAGAAATTCTTTACCACATATTAATCCAGACTTGATATATCAAATTGGAACATTTGATTTCAAGACTGCTTACTCAATTAAAGAGCATGAACAAACCTTATCTCTTCAACATGAGTTTGAAGAAATAAAGTTATTATCATCCTTAGCTTTAGACAAATATAGACAAAAAAGATTTAATTATTTACATTTTGGGCTTATTCAAATAGCAATCAAACCTTTATCAAGAACTGGTATAGACCAACCTATACTTATGCTATTAAGAGACAAAACTCTATTAAAATTCGAAGACTCACTCCTCGGAGTAGTACAATCGAATCTATGCAACGGAGCGGTTTACTTTAACTGCGCTCCCAATTATCAAGTCAGTTTACACGACCCAACTATACTAAACACTTTAGTATTAAATATCCATTTACCGGATTTAAAATTCCAAAACGATAGACACGGATATTTATTACTTTATCGAATATACTTTAAGCAATCAAATTCCGAATTTAATCCAAAATATTTATTACAAGACGATAAAGGTGAAACCACCATATTAGCTGTACATAGTAAAGATACACCAACAGCCACTTATGCACCTAAACAATTAAATTGGAATCAAATTACTATTCCAGAACAATGGAAAATAGAAATTACGCAACCACCAAGAAATATTGAGCAAAGAAATATATCAAAAATATATGAACAACCGGATAGGAAAATATTATTAAAATTTAGTTCATTTAGGGAACCACTCCCTCCTAGGATACGTTCTTATTATTCAAAAAATCATTTTCTGAAAGTCGTATTCCATCAAGAGCTTCTTTTTCTGAATATCGTACTGGTCAATCAAGTATAGATTGAGAAACAGAAAGTATTAATCAAAACGACCCAATAAAATTTAAAGCACCTATAGCAGAACCTGAATCAAATTTGTATCCAACATCACCTACACAATCTGATTTTATTACTATCAACGTTATTTTGAAAGAATTTGTAATTAATAAAGAATATATCAAAAAATAATTTTATTCAGAAAATAACTTAAAAAAAAGAAATTGGTATTTTAATACATTTTCTAAACACCAAACAATAAAATTTAGAGAACAATGGTATAATTGTATGACAATAAAATAATTAGATATACCATTTTTTATATGGTTCGAAATCTATTCAATAGCCAATAATAGCAATTATCCATTTAAAGAAATCAACACTAGTTCGTCTTTAAGTCAAATTTGGGAACATGTAGATGGTAAAAAATTAAATCTATACATCTACCATTATCAGACTTAAAAATTCAAACTACAAATAGACAAATTATTGCAATACCCTTTAAAACAGGAGCTAATTAATTGACAAAGAACCAGTATCCAAACAAGAAATAAAAAGCATATATCAACAAAACAATTATCAAAGTCAGATACTATATACAATAGCTAAGCAAATCGATCATATAGACATAAAATTAGATACGATTAATGAAGAAAAAACTCAAATTACTCAACATTTATTTTCTTCAATATCAACACCAATGTTTAAACCAATGAAAAGGGAAATTAAATTTCCAGAAAATGAAATATTAAAATCCAATATAAGCAAGATTAGATAGTATAGATGAAGGAAAAGGAACAAACAATATAGATGAAAATAAAAATACTCAATCCTCAGAATCTGAGGAGCAAGAAATTAATAGAATAAAAACTAGAAATATGAGGTATAATAAACCATATTATTCAAGACATTCACCACCTGATGTTTTATTTGAAGAACATCATAAATTTAATCCAAACGTATATACTGGTGACGGTCTATATGAATGGAATATAGACGGTAGATCAGAATACGAAATTATGAATTTATTTTAAGAAATGGGTATGCCTGCTCTAACATTTAAAGCTAGAGGAAATACTGATAAACAAGCTTGTACAATAATATTAGCTGGTTTTACTGGCGCACTAAAATATTGGTGGGATAACACTACAGAACCACATACGCAAAATCAAATAATCAATCATACAGAAAAAATTAGAACAGAACAAGATGAAGAAGGTTTCTATGAAACCATAGAAAAAGAAAATGCTGTAGAAGTACTAATTCATACTTTAACCATGCATTTTATCGGTAATCCAGAAGAAGAATTAGAAAGTAAAAAATTAATATTAACCAATTTAAGATGTCCAACATTAGGAGATTTTAAATGGTATAAATATGTTTTTACAATAAACATATTCCAAAGAACCGACTGTAATCAATCTTTCTGGAAAGAACGGTTTATATCAGGATTACCGTCTTTCTTCGCGGAAAAAATAATCAATAAATTAAAAAAATATTCTGGAGGGCAACCAATCCTTTGGAATACAATAACTTATGGTCAATTATTTGCCTTTGTTAAAAAAAAAGGCTTAGCAATATGTCAAGAACAACGTGATAAAAAGAGAAATGATAAATTCAAATTTAAAATATCCATGGGTTCATTATGTGAACAATATGGATATCAACCTCTTAATCCACCATCTAGGCTTAATCGTAAAAAATTTAGACAAAGAAATAATCGACATTATCACAAAAATAATGATTGTAAAAAACCTGTAAATAAATATTACTCAAAAAACAAATTTTCAAAAAATAAAAAATATTCACAAAATAAAAATTATACAAAAAATAACTTTGATAAACAAAAAATAGTTTGCTGGAATTGCAAACGACCCGGACATAAGTCCACCGATTGTAAAACGAAAAGAAAGATTAACGAAATCTTTCAGGATCGACCTAATATTCAAGAAAAACTAGCTAAACTATTACTTACTTCAGAGTCAGAAACATCTGAAGAAAGCAATAGTGATAATTCAATAAATGAAGTAGAAATCCTAAGCGATTCCTCTTCAGAATCTCAACAACTATCAGATAATCTATGCAATTGTAAAATTATTAACGTAATA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1180_LTR-Caulimovirus_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

181

Start:

89717  

End:

89897

Strand:

+

>Contig1180_LTR-Caulimovirus_10

AATATTTATTAAAACTAAAAGATATAGTATCTCAAGAAAATAGATTCACTACTCAAGAATCTTTCAGTTTAAACAAAATATACGAAAATACCCTACACAAAGTTTATTTAAACAAGTTACAACAGGCGAATTACAAAATGAAATTAAACAACTAAAACCGCAAGTTAAAGAATTACAAGTG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1180_LTR-Caulimovirus_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

328

Start:

91747  

End:

92074

Strand:

+

>Contig1180_LTR-Caulimovirus_11

GTTAATCAATAATAATTAAAACAATCACAAATAGATGCTAAGTTAACATTATTATAAAATAATCACAAATATCAACCGTCATCCAGTAATTTAAAATTAAAAGAAAAAAAAATTGAAACCAATAGTCAAGACTACATTCAAATAATTAATAAAATCAATTATCAAAAATGGTAGACAAAAATTAAATTACACATAGGCTATGATTTTAAAATAGAAATCATTGCACTTATGAATTCCGGAGCGGATTATAATTGCATCCGTGAAGGTTTAATACCAATCAAATATTATGAAAAAACTATTGAACGCCTAAGTGGTGCAAACGGTAGTA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1180_LTR-Caulimovirus_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

1036

Start:

92069  

End:

93104

Strand:

+

>Contig1180_LTR-Caulimovirus_12

GTAGTACAACCGAATTATTATTCAAATTCTTATCACCAATAAAAATGAAAGAAGTATTATCATTACAACAAAGTACAATTCATAAAACGATAAATCTTATCAAAAGTAAACAAAATCATATTCAATCTTTACAAGAAGAAATAACCTATAAAAAAATATAAGAACAACTTAAATCACCATATATTATAAACAAGATAAAATCAATAGAAAATAATTTATTAAAACAAGTATGTTCAGATATTCCAAATGCATTCTTGGAAAGAAAGCAGCACACTGTTGCTCTTCCTTATATAAAAGATTTTAATGAAAAAATTATTCCAACAAAAGCTAGGCCTATTCAAATGAATAGCGTACAACTAGAACATTGTAAGCAAGAAATCAACGATCTTTTAAAAACGAAACTTATAAGATCGTCCAAATCCCCTTGGAGTTGTTCGGCCTTTTATGTTAATAACCAAGCAGAAAAGAAACGTGGAGTACCACGATTAGTAATCAACTATAAACCATTAAATGATGTATTACAATGGATAAGATATCCAATACCCAATAAAAGAGACTTATTAAAAAGATTATACGATGCAAAAATCTATTCAAAATTTGATATGAAAAGCGGTTTTTGACAAATACAAATTATCGAAAAAGATAAATACAAAACCGCATTTACTGTGCCGTTTGGACATTACGAATGGAACGTAATGCCCTTTGGCCTTAAAAACGCACCCTCTGAATTTCAACATATTATGAACGATATATTCAATAATTATTCCAAGTTCACTGTAGTATACATAGACGATGTATTGGTTTATTCAAACTCTATAGATCAACACATAAATCATTTAAACACGTTTTTAAACATAGTCAAAAAACACGGATTAGTTTTATCCGCTAAAAAAATGTCCTTATTTCAAACAAAAATAAGATTTTTAGGACATAATATTTATCAAGGAACAATCACAGCTATTTCAAGATCTATTGAATTTGCGGAAAAATTTTCTAATGAATTAAGGGAAAAAAACGAAATTACAAAGAATTTAGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1182_LTR-Caulimovirus_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

323

Start:

4509  

End:

4831

Strand:

+

>Contig1182_LTR-Caulimovirus_13

GTTTCAGAGCCTCGACTTGTGTTTTGATGGAATGAATCATTGTTTATGATTGATTATTTTGAATGTTCTGGAAAACACCCTCTCATCATGTCTACTACAGATCCACCTACTATCGATTCCCAATTTGCAATTTCTACTTTACCTAAAAATAAAAGCCAAAAAAATAGTTCCTTTTCATCTTCATCTTCTATTAATTCCCTTTATGACATCGAGTATGTTCCAGGAGATCGTTTGCCTGAAACAACTCTTCCCCTTGTAAATCCATACGAATACTTTGCAAAAAAGCCTAGCGCCTTTTCTGTCAAAGGAGTTCGAGATCTCAT

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1182_LTR-Caulimovirus_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

299

Start:

4951  

End:

5249

Strand:

-

>Contig1182_LTR-Caulimovirus_14

CGGAGACGTCGTATTGACAAAGTCAAACAGACTTGACGCGGGGTAGGATTCCAGGTAAAGGGAGCTCTTTACGGGCACTCTTGGCCACTGATACGCTCAACCCACTATTAGGAATTGCCTATACCTCTCCACGGAAGTTCTGTAGACCGTCGTATTGACGAAACCGGAAAACTCTATCGACCACCGCAAAGGGGCAGATCGTCAACTTGCGAATGACAGAAAGAAATCAGAGCTTATGAAAGATACTCTGAAGTCTGGAAAACTTAGAGAGAATTTAGAAACTCATTTTAGAGAGAGAA

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig132_LTR-Caulimovirus_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

173

Start:

140041  

End:

140213

Strand:

-

>Contig132_LTR-Caulimovirus_15

ATCGGTGCTTGCGCCGCTTGATGCATTTTTTCGTAGCTTGTTACCCATGACTCTGGTAATCGTTTGAGTAGCTCTTCGCGAGAGATTTGTCGAGGGATCTGGACTGAGCTGGGTGCTTGTGATGCGGAATTGACTTCGAGATATAATGCTTCGTCCGATGAGGGTAATACAAG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1396_LTR-Caulimovirus_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

417

Start:

58537  

End:

58953

Strand:

-

>Contig1396_LTR-Caulimovirus_16

GAACAACGGTCCAAGTTGTACTTGTCCCACCACTTTACTCGGTATTCTCGGACTAGGGAATATGACATATCTGGTAAAAAAGGTACAAGGTTGAAATACCATGATAATATCCAGGGTACTCCCATGTCGATATGGAAGGCTATTTTTGGTAATGGTCCGATGGGTTGGTATTTTCATGTTTAGTGTATAAGGGTAAGGAGAATTTTGGTATTTGTGGAGGATATATCTGGTCACAAGGTCCAAACCAATGCCACCATTCATAGAACCATCCTGGGATTGACTTAGGACAGTGAAAGTCGAATGATATGAACAATGAGTGGTTGTAGGTACGTAAATAAAAAGTATGTCAAAAGGCTTTTTGATAGTCCATGTATGTAAAGCCGGAAATGTGATACCCATGAATAGAAAAGTTTGTGG

Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1446_LTR-Caulimovirus_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

392

Start:

28154  

End:

28545

Strand:

+

>Contig1446_LTR-Caulimovirus_17

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Barbarea vulgaris (v1.0)

ID:

Contig1446_LTR-Caulimovirus_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

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LTR-Caulimovirus

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1814

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30369

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+

>Contig1446_LTR-Caulimovirus_18

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Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig1462_LTR-Caulimovirus_19

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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+

>Contig1462_LTR-Caulimovirus_19

CAATTCCTAACAGTGGATTGAGCATTTCAGTGGCTAGAAAATGCCCGTTTGAGCTCCCTTTACCTGGAATCTTATCCCCGCGTTAGTCTGTCTGACTTACTCAATACGACGTCTCTG

Barbarea vulgaris (v1.0)

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Contig1512_LTR-Caulimovirus_20

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Retrotransposons

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LTR

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LTR-Caulimovirus

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>Contig1512_LTR-Caulimovirus_20

TAAGCGATATGTAATCGTTGATGAAATAATGATGTAAGCGATGATGTAATCGCTGAGGTAAGCGCTTAAGTCAACGGCTTAAA