Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold10|size7684569_LINE-Penelope_1Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
88Start:
1410474End:
1410561Strand:
->scaffold10|size7684569_LINE-Penelope_1
CATGCAATATACAAACACATATATATATATATATATGTGTGTGTATATGTAACAATTTAAGTGCATGTGATACACATATATATAGACA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold10|size7684569_LINE-Penelope_2Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
175Start:
7278317End:
7278491Strand:
->scaffold10|size7684569_LINE-Penelope_2
CACATGCATATATATATTTGTGGACATACATTCAAGGTTGTGGACATACATGTATGGTTATGGACATATATATTCGTTCATAGACATACATATATGCTCGTAGACACATATACGTTCGTGGACATACATAGCCGGTCGTGGACATACATATTCGCTCGTGGACATATATAAATGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold13|size3762591_LINE-Penelope_3Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
156Start:
1567947End:
1568102Strand:
+>scaffold13|size3762591_LINE-Penelope_3
ATGTGATATATTTGTGTCTATATAAATGTATATTTATATATATATATATTACATGTTCATGTCCCAGACATGTGTATATAAATATAGCATAATTCTTGTGAATTTTTTTAACATTTACACTATGTGATATATATGTATATAAATGTACATATACAT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold1673|size2083_LINE-Penelope_4Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
99Start:
810End:
908Strand:
->scaffold1673|size2083_LINE-Penelope_4
AAGATCTATATATATCTATATCTATAGTATTTTACTATTTTTTCATCGTCATATATAGTATATTATATATGTTTGTACATATATATACCTATATGTATA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold1818|size1722_LINE-Penelope_5Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
101Start:
1278End:
1378Strand:
->scaffold1818|size1722_LINE-Penelope_5
AAGATCTATATATATCTATATCTATAGTATTTTACTATTTTTTCATCGTCATATATAGTATATTATATATGCTTGTACATATATATATACCTATATGTATA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold18|size2296484_LINE-Penelope_6Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
149Start:
52859End:
53007Strand:
+>scaffold18|size2296484_LINE-Penelope_6
ATATATGTATGATGTAGAATATGTTACTGAATTATATAATACATATGTGTGTCTCTGTATCTATATCTATATATGTAGTGTAGGTATGTATATATACATAGACATTATAAATGTGTACATGCATACCAATATATATTTGTATTCATACA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold18|size2296484_LINE-Penelope_7Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
92Start:
2045137End:
2045228Strand:
->scaffold18|size2296484_LINE-Penelope_7
ATATATGTGTTCATAATACATACATTGATACACACATTACACATATACATAGGCCTAAATGGCAATGCACATATATATATATATATATGTGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold19|size3101341_LINE-Penelope_8Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
153Start:
802936End:
803088Strand:
+>scaffold19|size3101341_LINE-Penelope_8
TATATTTATATAAATATGTGTGTGTGTGGAGGTCTAAACATACATGTACATGCAAGATATATATATATCATGAACTTGTATGTGTATATGGACATTAACGAAACGTAAATACTCCTTATGATCATTATTTTCCTTCTCTCTCTCTCTCATCTC
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold1|size8101256_LINE-Penelope_9Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
113Start:
4815382End:
4815494Strand:
+>scaffold1|size8101256_LINE-Penelope_9
ATGCATATATAATATATTATCAATCTAATTACATGTATATTAATATATATATATATATAGTGTGTATGTGTGAGACCAAACATAAATACATACATCCATGTGACCATGTTTAT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold22|size2017577_LINE-Penelope_10Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
212Start:
883578End:
883789Strand:
+>scaffold22|size2017577_LINE-Penelope_10
TACATGAATGTGTATGCACATGCATGAATGTATGCATGTATGCTTATGCATGTATGTGCTTATGCATGTATGTGCTTATGCATGAATGTATGCATGTATATGCTTATGCATGAATGTATGCATGTATATGCTTATGCATGTATAGATGCACGTGTATGCTTATGCATGTATAGATGCACGTGTATGTAATATATGTATATGCTTATGCATGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold23|size1898914_LINE-Penelope_11Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
227Start:
1674608End:
1674834Strand:
+>scaffold23|size1898914_LINE-Penelope_11
TATACATGTATGCATGTATGAATGTATGCATGTATGTATCCATGAAAGTATATATGAATGTGTATGAATGTATGCATGTCTGTATGAATGAATGTATGTATGTATGTATGCATGGGTGCATGAATGTATGCATGTATGTATGAATGCATGAATGTATGAATGCATGAATGCATGATGAATGTATGCATGTATGTTATGCATGTATGTATGAATGCATGAATGTATGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold2446|size1181_LINE-Penelope_12Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
99Start:
83End:
181Strand:
->scaffold2446|size1181_LINE-Penelope_12
AAGATCTATATATATCTATATCTATAGTATTTTACTATTTTTTCATCGTCATATATAGTATATTATATATGCTTGTACATATATATACCTATATGTATA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_13Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
103Start:
603068End:
603170Strand:
+>scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_13
TACATGTATGTATAAATATCCATGTATGTGCATAGATGTATTGTAATGCATGTGTTGCAACTTATAAGTATGTATATATCATATATATCACATATGTATGTGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_14Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
103Start:
605434End:
605536Strand:
+>scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_14
TACATTTATGTATAAATATCCATGTATGTGCATAGATGTATTGTAATGCATGTGTTGCAACTTATAAATATGTATATATCATATATATCACATATGTATGTGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_15Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
103Start:
608682End:
608784Strand:
+>scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_15
TACATGTATGTATAAATATCCATGTATGTGCATAGATGTATTGTAATGCATGTGTTGCAACTTATAAATATGTATATATCATATATATCACATATGTATGTGT
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_16Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
100Start:
611049End:
611148Strand:
+>scaffold33|size1474841_LINE-Penelope_16
TGTATGTATAAATATCCATGTATGTGCATAGATGTATTGTAATGCATGTGTTACAACTTATAAATATGTATATATCATATATATCACATATGTATGTGTG
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold35|size2995437_LINE-Penelope_17Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
158Start:
1178990End:
1179147Strand:
->scaffold35|size2995437_LINE-Penelope_17
ATATATATATACATATACATATATATACAATAAATAATTTTCTAATAAATATACTTCTTTGTATATTATACATATATATATATATGGATATGAATAGAGACATATATACATATATATATATGATTTTTACCAATATATATATATATATATATATGTTA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold38|size1256534_LINE-Penelope_18Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
119Start:
976378End:
976496Strand:
->scaffold38|size1256534_LINE-Penelope_18
ATAAATATATATATGTGTGTGTGTATATATGTATATGTATATACAAATTCATATATATATATAAAGAAACATATATATATGTATATATAAATCTGGAGTGAATCACATATCTGCATATA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold39|size1397634_LINE-Penelope_19Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
103Start:
135492End:
135594Strand:
+>scaffold39|size1397634_LINE-Penelope_19
AATATGTACCATATGTCCAATTTCTATACTTATATATATATATATGTGCATATATATAGAGAGTTATAACTTATAAATACGTGCAAATGTGCATATATATATA
Boechera retrofracta (v1.0)
ID:
scaffold3|size6152117_LINE-Penelope_20Class:
RetrotransposonsOrder:
LINESuperfamily:
LINE-PenelopeLength:
119Start:
611070End:
611188Strand:
+>scaffold3|size6152117_LINE-Penelope_20
TATAGAACAGTTGTTATACATTCATGTGTATGTGTATAAATGCATATATATTACGCATATAGTATAGTTGTTATACATTCATGTGTATGTTTCGTCCCTATATGTATATATGTATAGAT