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A01_LTR_2 RetrotransposonsLTRLTR579349322994938091-
A01_LTR_3 RetrotransposonsLTRLTR18652059825206167+
A01_LTR_4 RetrotransposonsLTRLTR143153500875351517+
A01_LTR_5 RetrotransposonsLTRLTR11375322087532320-
A01_LTR_6 RetrotransposonsLTRLTR264282151368217777-
A01_LTR_7 RetrotransposonsLTRLTR63282177738218404-
A01_LTR_8 RetrotransposonsLTRLTR50821009392410099005+
A01_LTR_9 RetrotransposonsLTRLTR53201058055010585869+
A01_LTR_10 RetrotransposonsLTRLTR119691093849910950467+
A01_LTR_11 RetrotransposonsLTRLTR37441131470911318452-
A01_LTR_12 RetrotransposonsLTRLTR68831165694511663827+
A01_LTR_13 RetrotransposonsLTRLTR1041269740112697504+
A01_LTR_14 RetrotransposonsLTRLTR911269820412698294+
A01_LTR_15 RetrotransposonsLTRLTR6341404290514043538+
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A01_LTR_17 RetrotransposonsLTRLTR931404512614045218+
A01_LTR_18 RetrotransposonsLTRLTR1111423569514235805+
A01_LTR_19 RetrotransposonsLTRLTR1241465472314654846-
A01_LTR_20 RetrotransposonsLTRLTR1621535396715354128+

< 1 2 3 4 5 > Total 29


Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

5773

Start:

3334528  

End:

3340300

Strand:

+

>A01_LTR_1

ATTGGAGCGACCTTACCAGAGCGACAGGGAGAAGTCGCTCGCGGTTTCATCACTCGGAAACGCGAGAACGAGCCGGAGCGACCTCCCGGAGCGACACCACGAAGTCGCTCGCATCTCACACCCCTCTCGGAGCGACCTCCCAAAGCGACACCCCGAGGTCGCTCGCGTCTCTATGGCGAGACGACACGAAGCGAAGCCTGGAGCGACCTCTCAGAGCGACCCACTGAGGTCGCTCCCGAAGGCCGGAGCGACGTGCCGGAGCGATGCGAGGTCGCTCCGCGCCTATTATCTGCTCGATTTCTATTTTACTTAAGGGTCTTTTGGTCATTTCATTATGCACGTTTTACATTTCTAAAACCTATGTTTTAAACATCTTTTGTAGCCACGAGAGGCAGATTATCTTTTATCTTTGATCTATTGAGAAAGACACAAGAACTCTCTTGAGAAGTTCATCTCTTGGATTTTGATTGTTATGTTCTTGTGTTATTGTTGATTTCTTATCTATTTCTCTACATGATTAATCTGAAATCCAATATGGGTTTAAGAGGAATCATGGAGATTAGTGAGTAATCACCTTTGGAATTCATGGGTTAGGGAGATTAAGGGTGATTAGGTTAGAGCTAGGATGTTTTAGTGTAGATCATTCATATTTCCTTGCTAGTAGAGTAATCATAATGCATCTTCTGAGTTGGCCACTCAGTTGTTGATCCTTAGGCATTTCTCACCCGAAAGGTGTTCGATGAAATGCCCGAGACAACTCTCCTAGGCTTTTAGTATACTTTGCCAAAGACATTTGTTGTTAAAGATGCTAAGATAGCTAATAGACTTGTTAGTAATGATTGCTTTCATATTATTCAACCAAAGACATTTGATGTTTGAGATATGTTAGCAAATGAGCATTCATCTAGACATAGAGCTTGCTTAGAATTGTGTCTAGGCTTAAGGTTGATAGTTTGATTGATCATTTGCCATCCTTAGTTCGATACTTGATCACCCAAGGTCTAATCCCTATGCCCATGAATTCTCTTTTCCCTTAGTCAAGAAAGTATCATTCTGTTATTGCTTTTTAGTTTTAGTCATAGCTTAAAACCCATCTAAATCATTGGTTGCACTTAGATTAAGTGAGTACTTGCATTCTCAGTGCTTTGATATCCCTCAGAACTGGTTCGACAATCTTTTATACTACAACATTTGTTTTAGGAGCCTTGAAAACTCCTAACATCAAATTGGCGCCGTTGCCAAATTCTGAGTAGATTTGAACATTGAGATTTAGTCACTTGGTTGAGACTAAGTCATTTTTATTTTCTTTTGTTACTGATTCTCTTTCTTCACCTCCCTTTAATCTACAGGTGTATGAACTTGAGGAGCAGGGGTCCATCAAACCTAGTTCCAATAGCTGCAGACATCAGAGCTTTAGAGAGAGAGTGTGCTAGAAATAGAAGAGAAGAAGAGCAACAGGCTCACTTGCAGAGATTGAGTACTGATATGGGAGACATACCTCAAAACCAACAGCGAGCAGCTCGACCCATTGGCACTTACGACCGCCCCAACATTCATGGTCATAGATTGGGAATCCGAGCACCCGCTGTGGCAGCCAACAACTTTGAGATCAAATCAGGACTCCTCAACGTGATCGAGAACAACAAGTATCATGGCTTGGCTCTAGAGGATCCATTTGATCACTTGGACAGGTTCGACAGCTACTGTGGGTTGTCAAAAACCAATGGTGTGTCCGAAGATGCCTTAAAGCTCAAGCTATTCCCTTTCTCTTTGGGGGATAAGGCGCGTCAGTGGGAGAAGTCTCTACCCAGTGACTCCATCACTACTTGGGATGACTGCAAGAAAGCATTCTTGGAGAAGTTCTTCTCTACTTCAAGAACTGCTAAGCTGAGAAACGAGATTTCCAGCTTCCAACAGAAGAACTTGGAAGGCTTCAGTGAAGCCTGGGAGAGATTCAAGGGCTACCAAGCTCAATGCCCACACCATGGCTTTTCTAAGGAGAGCTTGCTGAGCACATTCTACCGTGGTGCTCTTCCTAAGTACAGAGCCAGACTGGATACAGCTAGCAATGGGTTCTTCTTGGGGAGAACTGAAGAGGATGCAGAAGAACTGGTTGACAACATGGTAAAGAGTGATGCAGTCTACAGTGGAGACCACGACAGAGGCAGTAGAACAGATGATAAGCAGACGAGGAAAGAGATCAAAGCTTTGGAAGACAAGATCGACCTACTCATTGCTGAAAAAGCAACCCAAGAGCAAGCTGAAGTTTGTTGGTAACTCCAAGCAGGAAGATCCACTTGCTGTCAATGAGGTTGAAGGTTTGGAAGGTCAAGAGGAGTTGTGTTTCATCAACAACAATGGTAGCTGGTACAAAAAGGAGCCCAACTTTCAGTACAACAACTACCAACAGAAATCCTATCCAAACAACCAACAGAGTGGCTATCCGCCAAGAAACAACCAGCAAGGCAGCTATCAGCCTCAGCAAAACCCCTCGTCTGGTTCCTCTGCTCCTCAAGAGAGCAGCACTGATACCTTACTGAAGCAAATCTTGGAGTCTCAGACTAGAAGTGAGAAGCAAGTTGGTTATGAGTTGAAGAACCTTCATTCCAAGATTGATGGGAGCTACAATGAGCTCAACAACAAATTCTCACACCTTGCTTCTACAGTCAGGAATTTAGAGAATCAATTTGCTTCCATGAACACTCACCAGAATCGCCAGCAAGGATCTCTACCTGGAAAGTCTGACCAAAATCCCAAGGAGGCCAAAGCTATCACCCTTAGGAGTGGTAAGCAGTTACCTCCTAGAACCCTCACCAAGGATGCTGAGAAATTAGGTGAGGGGGTTGCCATCAACATAGATGATGAAGTGGTGATTGTTGATGAGAAGATCAATGACGAGATCTTGGAGAAGATAGTGGAAGCCAAAGGTAAAGGAAAGGTTGGAGAGGAGAAGAAGACAGTAAAGGATGGTGAAGTTGTTACTCCAGCAAGTGAAAGTTCTTTTGTTCCTCCTCCCTATGAACCCAAACTTCCATTCCCTGGTAGATTCAAGAAGCAGCTGCTAGAGAAATACAAAGCTCTGTTTGAGAAGCAAATGAGTGAAGCTCAGGTTGCAATGCCCATCATCGATGCTTTCATGTTGATTCCTCAATACAACAAGTTCCTGAAAGATGTTGTAGCTGCAAAGAAGAAGGAGATGGAAGGCATGATGATTCTTACCCATGAGTGCAATGCCATCATCCAGAGGCTTGATGTTCCAGAGAAATTAGAGGATCCAGGAAGCTTCACACTACCTTGTGCTCTTGGACCTATGGTATTTGAGAAAAGTCTCTGCGATTTGGGAGCTAGTGTCAGCTTAATGCCTTTGTCTGTTGCAAAGAAGCTCGGATTCACTGAGTACAAGAAGTGCAGACTCTCTCTGGTGTTAGCTGATCGTTCAGTGAAGTACCCTGTGGGCATCTTAGAGGACCTCCCTGTGAAGATTGGAAGGTATGAGATACCTACAGATTTTGTGGTACTTGAGATGGGTGAGGAGGCTCAAGATCCATTGATTCTAGGAAGGCCATTCTTAGCTACAGCAGGAGCTATTGTTAATGTGAAGGAGGGCACGATTGATCTCCATTTGGGTAAAGAGAACATCCTCCACTTTGACATCAAGGGGAAAATGAGGAAACCAACTGTGTTCGGGCAAGCCTTCTACATTGAAGAGATGGACACTCCTGCTGATGAGCACCTTGAAGAGTTACCACCTGAGGACGACGAGGAGGGAGCATCTCCCTCTACTCATTCCCTATAGAAGGTAACCCACCACACTCCCTTGTATATACCATTTCATTTTTGCATATTAGTCTTCTTTTCGGTATCTCTCTCTACTTGACGACACAGAGACTGTGTAACTCAAGTTTGGGGGAGGTACCAAGTATTTGATCATGTTTGCTTTGATGTTGTTTCATTGAGTCATGCATGGCATACCTATTTGCATAGATAAAAAAAAAAAAATCAATCATTTAGTTTGCATCATTTGCATTTTTAGGAGAGTCTAGAGCATATAGGTTGCATTCACTTGCATTGGGAGCAATGATTTTGAATGCCTTGTAAAGAACACTACGTTGCACTTGACTAGCTTTTGCACCTCTCAAAAAGACTTGTATGTTTCGAGCCTTGAAAACTCTTCCTGAAACTTGTTGATTGATGAAACTCAGTCTTTGAAGCCAACTACAACCTTATTTGAACTGAACGAACTTAATGCTTCTTGCTCATGGTCCCTTGTGTACTGAGTCATGGCTATACACACTTGAGTTGTCACATCTTTTATACCAATCTTTTTTGACAAACTCCAGTGGTAGACCACTCCCAAAACCTTTTCCTCCTTTTAAGCTTTCATTGTTTGATGAGTGAGGCCTTTTTCGGAAAGTCTTACATGTGCATAATGTTGAGAGTATCGGGAACGACAATGCTTGATCTTCATTCTTGCTAGATTGGACACTCTATTGTCTAGCTATAGGTGGGGGTGAGTGTTGTGATTATGATTTGGGAGAAATGAAAAAGGAAAAGAATAGACTCTTTGTGCTTAAGTGAATTGTTTTATTGGGACCAGTATATAAGCCTCTAGCTCAAGTTTTGAAAAGTCTTGGCCCCAAGCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAAAGAAAGAAAAGGGGGCTAGCAAAGTTGTTAGGAGCTAAGAAATGTTTTGAGGTTGTGAAAAATCCCTTGTAGATTTCAAAGAGAAGGAGTTAAAGTTCTTAGGATCTTTTGGTGATAGATGTGAGTTGGGTTTGACATTTGGAAATGATTGTGTGATTTGTATGTTTGAGAAAAGGGTTGAACAATGGAGATTGAGCATTGTATGCATGAGTTGGTCCCTTTCTTAGATATATTATGTGCAATGTCAAGGCTACTTGTTTTGAGAGTAAACCACCTTAAAGATCATATGTTTTGAACCTCTTGAATCACTTGAATAAAAGCCT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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

5793

Start:

4932299  

End:

4938091

Strand:

-

>A01_LTR_2

GGAGCGACCTCAGTGGGTCGCTCTGAGAGGTCGCTCCAGGCTTCGCTTCGTGTCGTCTCGCCATAGAGACGCGAGCGACCTCGGGGTGTCGCTTTGGGAGGTCGCTCCGAGAGGGGCGTGAGATGCGAGCGACTTCGTGGTGTCGCTCCGGGAGGTCGCTCCGGGCTCGTTCTCGCGTCTCCGAGTGATGAAACCGCGAGCGACTTCTCCCTGTCGCTCTGGTAAGGTCGCTCCAATAGGGAGGTCAGAGCGACTTGGTGGTGTCGCTCCGGACTGGTCGCTCCATGCCTTGCTCGCCCAATGACCACTCTAAACACTCCTTTTTGAGCTCCAAATGCACCCAAATGTCTCCAGAAACTCGATGTGGTACTCAAATACCTGATAGAGACATATGTATGCAAAATGCAACCTAAACATGTCTAAATCCTAATCTATATGATGAAAATGTTTATGAATGAATGGATAAAACAATGTAAATATGCAAGATATCAACTCCCCCAAACTTGTTCTTTTACTTGTCCACAAGTGAACTTTCTAGAACTCATAGGGAGAGAGGTTGAAGGAGGGAGCACATAGCCAAAAGAAACACAACTAGCACACTCTCTTATTACACTCTAGCTTCTCTAGGCCTATCTTAACTCTTTTTGTTCTTACACTCATCATCAAGCATCCACACATTCAAATCAACCAACTCTCACATTCATTAAGCACAAAACATCAGGTGAATTCTTGCAAATGGTCAGTTGGTCCAAGTCATTTGGTTGGGTAAGGGAAGGCTTTTATTCAAGTGATTCAAGAGGTTCAAAACATATGATCTTTAAGGTGGTTTACTCTCAAAACAAGTAGCCTTGACATTGCACATAATATATCTAAGAAAGGGATCAACTCATGCATACAATGCTCAATCTCCATTGTTCTACCCTTTTCCCAAACATACAAATCACACAATCATTTCCCAATGTCAAACCCACTCACATCTCTCACCAAAAGATCCTAAGAACTTTAACTCCTTCTCTTTGAAATCTACAAGGGATTTTTCACAACCTCAAAACATTTCTTAGCTCCTAACAACTTTGCTAGCCCCCTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTTTCGTTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGGCTGGGGGCCAAGACTTTTCAAAACTTGAGCTAGAGGCTTCTATACTGGTCCCAATAAAACAATTCACTTAAGCACAAAGAGTCTATTCTTTTCCTTTTTCATTTCTCCCAAATCATAATCACAACACTCACCCCCACCTATAGCTAGACAATAGAGTGTCCAATCTAGCAAGAATGAAGATCAAGCATTGTCGTTCCCGATACTCTCAACATTATGCACATGTAAGACTTTCCGAAAAAGGCCTCACTCATCAAACAATGAAAGCTTAAAAGGAGGAAAAGGTTTTGGGAGTGGTCTACCACTAGAGTTTGTCAAAAAAGATTGGTATAAAAGATGTGACAACTCAAGTGTGTATAGCCATGACTCAGTACACAAGGGACCATGAGCAAGAAGCATTAAGTTCGTTCAGTTCAAATAAGGTTGTAGTTGGCTTCAAAGACTGAGTTTCAGCAATCAACAAGTTTCAGGAAGAGTTTTCAAGGCTCGAAACATACAAGTCTTTTTGAGAGGTGCAAAAGCTACTCAGGTGCAACGTAGTGTTCTTTACAAGGCATTCAAAATCATTGCTCCCAATGCAAGTGAATGCAACCTATATGCTCTAGACTCTCCTAAAAATGCAAATGATGCAAACTAAATGATTGGTTTTTTTTTTTTTTTTATGCAAATAGGTATGCAATGCATGACTCAATGAAACAACATCAAAGCAAACATGATCAAATACTTGGTACCTCCCCCAAACTTGAGTTACACAGTCTCTGTGTTGTCAAGTAGAGAGAGAGATACCGAAAAGAAGACTAATATGCAAAAATAAAATGGTATATACAAGGGAGTGTGGTGGGTTACCTTCTATGGGAAATGAGTAGAGGGAGATGCTCCCTCTTCGTCGTCCTCAGGTGGTAACTCTTCAAGGTGCTCATCAGCAGGAGTGCCCATCTCTTCAATGTAGAAGGCTTGCCCGAACACAGTTGGTTTCCTCATTTTCCTCTTGATGTCAAAGTGGAGGATGTTCTCTTTACCCAAATGGAGATCAATCGTGCCTTCCTTCACATTAACAATAGCTCCTGCTGTAGCTAAGAATGGCCTTCCTAGAATCAATGGGTCTTGAGCCTCCTCACCCATCTCAAGCACCACAAAATCTGTAGGTATCTCATACCTTCCAATCTTCACAGGGAGGTCCTCTAAGATGCCCACAGGATACTTCACTGAACGATCAGCTAACACCAGAGAGAGTCTACACTTCTTGTACTGAGTGAATCCAAGCTTCTTTGCAACAGACAAAGGCATCAAGCTGACACTAGCTCCCAAATCGCAGAGACTTTTCTCAAATACCATAGGTCCAAGAGCACAAGGTAGTGTGAAGCTTCCTGGATCCTCTAATTTCTCTGGAACATCAAGCCTCTGGATGATGGCATTGCACTCATGGGTAAGAATCATCATGCCTTCCATCTCCTTCTTCTTTGCAGCTACAACATCTTTCAGGAACTTGCTGTATTGAGGAATCAACATGAAAGCATCGATGATGGGCATTGCAACCTGAGCTTCACTCATTTGCTTCTCAAACAGAGCCTTGTACTTCTCTAGCAGCTGCTTCTTGAATCTACCAGGGAATGGAAGTTTGGGTTCATAGGGAGGAGGAACAAAAGAACTTTCACTTGCTGGAGTAACAACTTCACCATCCTTTACTGTCTTCTTCTCCTCTCCAACCTTTCCTTTACCTTTGGCTTCCACTATCTTCTCCAAGATCTCGTCATTGATCTTCTCATCAACAATCACCACTTCATCATCTATGTTGATGGCAACCCCCTCACCTAATTTCTCAGCATCCTTGGTGAGGGTTCTAGGAGGTAACTGCTTACCACTCCTAAGGGTGATAGCTTTGGCCTCCTTGGGATTTTGGTCAGACTTTCCAGGTAGAGATCCTTGCTGGCGATTCTGGTGAGTGTTCATGGAAGCAAATTGATTCTCTAAATTCCTGACTGTAGAAGCAAGGTGTGAGAATTTGTTGTTGAGCTCATTGTAGCTCCCATCAATCTTGGAATGAAGGTTCTTCAACTCATAACCAACTTGCTTCTCACTTCTAGTCTGAGACTCCAAGATTTGCTTCAGTAAGGTATCAGTGCTGCTCTCTTGAGGAGCAGAGGAACCAGACGAGGGGTTTTGCTGAGGCTGATAGCTGCCTTGCTGGTTGTTCGAGGCTGATAACCACTCTGCTGGTTGTTGGAATAGGACTTCTGTTGGTAGTTGTTGTACTGAAAGTTGGGTTCTTTTTGTACCAGCTACCATTGTTGTTGATGAAACACAGCTCTTCCTGACCTTCCAAACCCTCAACTTCATGGACAATAGCTGGTGTCTCTTGGCTTGGGTTGCCACAAAGTGCAGCTGCTCTTGGGTAGCTTTATCAGCAAGGAGGATGTCTATCTTATCCTGTAGAGCTTTCAACTCCTTCCTCGTTTGCTTATCCTCAGTTCTACTGCTTCTGTCGTGGTCTCCACTGTAGACTGCATCACTCTTTACCATGTTGTCAACCAGCTCCTCTGCATCCTCCTCAGTTCTCCCCAAGAAGAACCCATTGCTAGCTGTATCCAGTCTGGCTCTGTACTTAGGGAGAGCACCACGGTAGAATGTGCTCAGCAAGCTCTCCTTAGAGAAACCATGGTGTGGGCATTGAGCTTGATAGCCCTTGAATCTCTCCCAGGCTTCACTGAAACCTTCCAAGCCCTTCTGTTGAAAGCTCGAGATCTCGTTTCTCAGCTTAGCAGTTCTTGAAGTAGAGAAGAACTTCTCCAAGAATGCTTTCTTGCAGTCATCCCAAGTGGTGATGGAGTCGCTGGGTAGAGACTTCTCCCACTGACGTGCCTTATCCCCCAAAGAGAAAGGGAATAGCTTGAGCTTTAAGGCATCTTCGGACACACCATTGGTTTTTGACAACCCACAGTAGCTGTCGAACCTGTCCAAGTGATCAAATGGATCCTCTAGAGCCAGCCATGATACTTGTTGTTCTCGATCACGTTGAGGAGTCCTGACTTGATCTCGAAGTTGTTGGCTGCCACAGCGGGTGCTCGGATTCCCAATCTATGACCATGAATGTTGGGGCGGTCGTAAGTGCCAATGGGTCGAGCTGCTCGCTGTTGGTTTTGAGGTATGTCTCCCATATCAGTACTCAATCTCTGCAAGTGAGCCTGTTGCTCTTCTTCTCTTCTATTTCTAGCACACTCTCTCTCTAAAGCTCTGATGTCTGCAGCTATTGGAACTAGGTTTGATGGACCCCTGCTCCTCAAGTTCATACACCTGTAGATTAAAGGGAGGTGAAGAAAGAAAATCAGTAACAAAAGAAAATAAAAATGACTTAGTCTCAAGCAAGTGACTAAATCTCAATGTTCAAATCTACTCAGAATTTGGCAACGGCGCCAATTTGATGTTAGGAGTTTTCAAGGCTCCTAAGACAAATGTTGTAGTATAAAAGATTGTCGAACCAGTTCTGAGGGATATCAAAGCACTGAGAATGCAAGTACTCACTTAATCTAAGTGCAACCAATGATTTAGATGGGTTTTAAACTATGACTAAAACTAGAAAGCAATAACAGAATGATACTTTCTTGACTAAAGGAAAAGAGAATCATGGGCATAGGGATTAGACCTTGGGTGATCAAGTATCGAACTAAGGATGGCAAATGATCAATCAAACTATCAACCTTAAGCCTAGACACAATTCTAAGCAAGCTCTATGTCTAGATGAATGCTCATTTGCTAACATATCTCAAACATCAAATGTCTTTGGTTGAATAATATGAAAGCAATCATTACTAACAAGTCTATTAGCTATCTTAGCATCTTTAACAACAAATGTCTTTGGCAAAGTATACTAAAAGCCTAGGAGAGTTGTCTCGGACATTTCATCGAACACCTTTCGGGTGAGAAATGCCTAAGGATCAACAACTGAGTGGCCAACTCAGAAGATGCATTATGATTACTCTACTAGCAAGGAAATATGAATGATCTACACTAAAACATCCTAGCTCTAACCTAATCACCCTTAATCTCCCTAACCCATGAATTCAAAAGGTGATTACTCACTAATCTCCATGATTCCTCTTAAACCCATATTGGATTTCAGATTAATCATGTAAGAAATAGATAAGAAATCAACAATAACACAAGAACATAACAATCAAAATCCAAGAGATTCTTGTGTATTTCTCAATAGATCAAAAGATAAAAGATAATCTGCCACTAGTGGCTACAAAAAGATGTTTAAAACATAGGTTTTAGAAATGTAAAACGTGCATAATGAAATGACCAAAAGGCCCTTAAGTAAAATAGAAATCGAGCAGATAATAGGCGCGGAGCGACCTCGGCATGTCGCTCCGGCAAGTCGCTCCGGCCTTCGGGAGCGACCTCAGTGGGTCGCTCTGAGAGGTCGCTCCAGGCTTCGCTTCGTGTCGTCTCGCCATAGAGACGCGAGCGACCTCGGGGTGTCGCTTTGGGAGGTCGCTCCGAGAGGGGCGTGAGATGCGAGCGACTTCGTGGTGTCGTTCCGGGAGGTCGCTCCGGGCTCGTTCTCGCGTCTCCGAGTGATGAAACCGCGAGCGACTTCTCCCTGTCGCTCTGGTAAGGTCGCTCCAAT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

186

Start:

5205982  

End:

5206167

Strand:

+

>A01_LTR_3

GAATAAAAGAAAAAAAACATGAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAGCTGAGTGAATAAAAAAAAAAAAAACTCTCTAGTTGGCTAGAATAAGAAATGATAATGTGTTCATTGGGTGAGAGATGAAAGTGAGTCTATCTTTGGGTTTTGGAATGATGAAAAGAAGAAGGGTAGAGCTTGAAATCA

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

1431

Start:

5350087  

End:

5351517

Strand:

+

>A01_LTR_4

GAACAATTTTGGGTGTCTCAACATTGATATCTTGCATATTTACATTGTTTTATCCATTCATCCATGAGCATTTTCATCATATAGATTAGGATTTAGACATGTTTAGGTTGCATTTTGCATACATGAGTCTCTATTAGGTAATGGAGTACCACATGAAGTTATTTGGAGTTCAAAAGAGGTGAAAAGGTGACCATTGGACGAACCGAGCATGGGAGCGACCTCCCGGAGCGACATCACGAAGTCGCTGTGTCCCACTTCTCAGAGCGACCTCCCTAAAGCGACACCATGAAGTCGCTCGCGTTCTCATTACTCCGAACAGTCTTAGATGACCCTGGAGCGACCTCTCAGAGCGACCTACCAAGGTCGCTCCCGATCCAGAGCGACCCGTTGGAGCGACACACCAAAGTCGCTCGCGACCTCTCGCCCGGAGACACCAAAAATCGGCCCTGGAGCGATTTCCCGGAGCGACACCTGCAAGTCGCTCCGCGTTATTTTGCTGCCGAAAATCATAATTTTTTAAGGACCTTTTTGCAATTTATTTTGGACGTTTTGCACTTGGAAAAACCTATGTTTTAAACATCTTTTGTAGCCACCAGAGGCAGATTATCTTTTATCTTTAGATCTATTGAGAAATACATAAAAACTCTCTTGAGAAGTTCATCTCTTGGATTTTGATTGTTATGTTCTTGTGTTATTGTTGATTTCTTATCTATTTCTCTACATGATTAATCTGAAATCCAATATGGGTTTAAGAGGAATCATGGAGATTAGTGAGTAATCACCTTTTGATTTCATGGGTTAGGGAGATTAAGGGTGATTAGGTTAGTTCTATGATGTTTTAGTGTAGATCATTGTTGTTCCTTGCTAGTAGAGTATTCATAATGCATCTTCTGAGTTGGCCACTCAAAAGTTGATCAATAGGCATTTCTCACCCAAAAGGTGTTTGATGAAATGCCTGAGACAACTCTCCTAGACTTTTAGTATACTTTGCCAAAGACATTTGTTGTTAAAGGTGCTAAGATAGCTAATAGACTTGTTAGTAATGATTGCTTTCATATTATTCAACCAAATACATTTGATGTTTGAGATATGTTAGCAAATGAGCATTCATCTAGACATAGAGCTTGCTTAGAATTGTGTCTAGGCTTAAGGTTGATAGTTTGATTGATCATTTGCCATCCTTAGTTCGATACTTGATCACCCAAGGTCTAATCCCTATGCCCATGAGTTTTCTTTTCCCTTAGTCAAGAAAGTTTCATTCTGTTATTGCTTTCTAGTATTAGTAGTAGTTTAAAACCCATCTAAATCATTGGTTGCACTTAGATTAAGTGAGTACTTGCATTCTCAGTGCTTTGATATCCTTCAGAACTGGTTCGACAATCTTTTATACTACAACATTTGTCTTAGGAGCCTTGAAAACTCCTAACATCA

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

113

Start:

7532208  

End:

7532320

Strand:

-

>A01_LTR_5

AAAAAATCCTAAATATCCACATAATCATCCTAATCCACCTAACCCATGAATCACAATCTCACTAATCTCCATGAGAAGCCTTAAACCCTTGTAAAGATTAAGTCTAATCATGT

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

2642

Start:

8215136  

End:

8217777

Strand:

-

>A01_LTR_6

ATTTTTCAGTATCATGTTCTTCTGGAACATTTCCACTTTTGCCTTCTTTCAGACATCTTATAATATCAGGTTCTTCTGAAACCTTACCATTTATGTCTTCTTTCAGACATCTTTTAGCATCAGGTTCTCTTTGAACCTTTCCACTTATGTCTTCTTTCAGACATTTTTTTTACTATCAAGTTCTTCAGAAACTTTGCAACTTTTCTCAACCAATTTCTTTCGGGGATTTTTTTTTATCTCTAAAACCCGCTAGTCTCCCCCTCTTTAACTAAACCCTAGGTTCATTTTATTTCCATCAGTTTGTTCTTTAGGAATATCAACTCTTGATGGAATATTTTCAGCGGGTATATCATCTCGTATCTGTGAACACATTTGGTAACTGGTTTGTCAAATTATGCAAGCGCACAATTTTTTGAACTTCCAGCTCTCTTTGATATGTAGGGGGACCAAATTGCAACAATGAATGTGTACACCATGTAATTTATTTAGGAATTTCTCAAATTCCTCCCCCTAACGCTGGAATTCATTCTCATTAAAATGACAATTGGCAAATCGTGCCATAAACATATCACCAGTTACTGGTTCAAGATACCTTATATACGGCTTGTTCTAACTCTTTCAGAGTTTTATATATTCCCGAGAGTATCTTTAACTCTCCAGGGACTACTAAACATCAAGATGCAACTCAAGTTATTTTTGTCCTGCCAGACATTTCAATATATTGCATCTATTTTAAATTTTCTCCAGTGACCTCGGAACAAGCCGTTTTTCATACCTCAAGGTCATCTTTCATTTCATTCTCTGGAGAACTATACCTTGGACTTTTGATCCAAAAGTCTCTCGTTTTTCTAACGAGCTATATATCGAATTGATGGCTAATCAATTCACTCTACCCTCACACATAGAGGTAGATTCATAATCTTTATTTTTATAGCGCTTTTTCATTTATTTATTGTCGGCAATCTATTTTTTCTTTGGTTCCATCTTTTTATCCGTACTGATATGGTTAATCGAGATTTCTTTATCATCATCGATGATTTACCCAGGTACCTGACTATTATATTAACCATATCAACGGTCTTATCATGAGATTCATCCTCTATTTATATTTTTGCTCCTTTTCGAGGACTCTTTGGAACCAAAGTGGTCTATCACGTCTCTAGCGTGCCATAGACTCATATATCGTCCGTTTAGGACACTATTTTTTTTTATTGGAGCATTTTCAGTTGGAATATGAGATTTCATTAATTCATCAAAATGTCTGGCAGGCATTTTGGAAATGGATTATCCTACTTTTCATTGTAATCCATTTCACATATCTCATTCCATAACTTATCATATGCTTCTAGCAAACTTGCGAGCATATTTCTAAGTATCCATATACTTTATCCCTCTGGATTGTATATGTCTTTATTACATGCACAACTGCATGTTTACACCCGAACATAATTTCTCAATGTTCCACTCACTAGGATTCTTTAATTCTCCCCCTCGAGATGATAACACTCCATGTCTAAAATCTCGTACTGAATCCCACTCTAGAACCAATAACATATTTAGTTTTCCCATTTGGGATGAATTATGTTTCAAATCCTTTAGAGTGAGATCTTAATTTGGGGTCTGTTTATAGAAATCACATATTATGAACTTGTTTGATGATTCATCGCCATGATGGTTTTCTTTATTTTCTTGACATGCTATATGTGAAAAAACTTCTGGTTTTTCAACATTTCACAATAATGTTGATAACATTATTGGAGATGGCTATATATCAGTAAACTCTAAGTTTTCCACTCATTTATAATTTTGCGATCTTTTTCTTATGCATGTCTTTTCATCATAAGCTCCTCTAGAGCCAATAGTAATTTTTATATTACTAGATACTATACTTATTTATTTTGAGAGAAAAGAAATATTTGTTACTTTTATTAGTCATTGACGATGACCAAATATCTGCTAATTATTTCTATCTCCATCCTGAATATCAAAATCTTCATCAGGAAGATAATCATTATATCACCGATAGTCTCTGGTTCACCCAGAAAGTCTATCACATCAAGATGAGTATTCAAACTATGAAAGATGGTTCGGGTTCATAAGAGACGAAGTTTAATATACTTCCTTTCTCTTTTTCTTTTTGATTCTCAATATAGATCGGCTAAATATTTGGCGTACGACAACTACGTACCTAATTTTCTTTCTAGCCGTATCTATAGCAAACTTTTTATGTTTGCCTTTTAACACCCGACCACTTTTATTTTCGTGGAAGTTCTAATTATTTCGCATGGACGAAATATTCTTCCTCGTCCACTTCCACGACCACGATAGGGGGTTTCAACCGCATCTACACCCTCGTCCTTTTCTAATAGGACTGACTTGATGGTTTAGTATCATGATTTCGTTTTCCTTTTTTTTTTCAGTTTTCAAGGAGGGCTTTCATCAACTCCAACTATTTATTGAATCCTTTCTTACAAGGATTTAATTATTCAAAGATCTTTTAGATCTTTTCTCATGATACACCTTATCTTATGAACCATCATTGAAGTGGTGTAAATTATCATGGCTTTATTCTTTTCTCATCCGATATTGTTTCAATTTATCGATGATTTCTCAAAGCTCATTTTTTCTCAGGTGCATATTTG

Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

ID:

A01_LTR_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR

Length:

632

Start:

8217773  

End:

8218404

Strand:

-

>A01_LTR_7

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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A01_LTR_13

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Retrotransposons

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Retrotransposons

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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Brassica rapa (Chiifu_V3.0)

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