ID Class Order Superfamily Length Start End Strand View
A01_LTR-Caulimovirus_1 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus60772813977282003-
A01_LTR-Caulimovirus_2 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4141345062013451033-
A01_LTR-Caulimovirus_3 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus1181345112813451245-
A01_LTR-Caulimovirus_4 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus8171345859213459408-
A01_LTR-Caulimovirus_5 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus36711596192115965591-
A01_LTR-Caulimovirus_6 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4011596599615966396-
A01_LTR-Caulimovirus_7 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus9081596650415967411-
A01_LTR-Caulimovirus_8 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4471596744215967888-
A02_LTR-Caulimovirus_9 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus360350200350559-
A02_LTR-Caulimovirus_10 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus340494238579427260-
A02_LTR-Caulimovirus_11 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus213794274159429551-
A02_LTR-Caulimovirus_12 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus221794299219432137+
A02_LTR-Caulimovirus_13 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus339794322929435688+
A02_LTR-Caulimovirus_14 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus10062105964521060650-
A02_LTR-Caulimovirus_15 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2362106069621060931-
A03_LTR-Caulimovirus_16 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus962685323926853334-
A03_LTR-Caulimovirus_17 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus2002685333926853538-
A03_LTR-Caulimovirus_18 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4592685867426859132-
A03_LTR-Caulimovirus_19 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus3212685911526859435-
A03_LTR-Caulimovirus_20 RetrotransposonsLTRLTR-Caulimovirus4242835379328354216-

< 1 2 3 4 5 > Total 37


Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

607

Start:

7281397  

End:

7282003

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_1

TAACAGTCGAAAGCTTTGCATGCCCAGAGAAAGTTAGTTGTTGAGACTACTCCTTGTCTCACTAGCTGGTCGCATTCATCGTTTGCTTGTTGTAGCAGTGTGGGTGGCATTCCTGCATGACTCGCTTTTGTCCGGATCGTTTGAATATTTTCCTTGAAAGGCAAGGAAACAAAGAACTCTGAGTTTAACCACAGTGGGTTGTTGCATTTTTGGAGGAAATCTGTATGTGAGTCTGCACATGATGTTCCCGTCATTTCTTCTCAAAATTTTGTAAACTCTTGAGAGACCAATCTTTCAATTGCGAAAAGTCGAGGAATTGTTGTGAAGCCTTTGTAGAGGTTGTTCCACCTTAATCCTTGTGGTTTGAATTGGTTATCGAATGCTTTCTTGAAAGCGTAATAGGAATCTCATCCTAATATTAAATCCTTTCCAGGTGCAGTAGAGCCGAGACGATTTTGCAACACAAAGCTCATGTTGATAAGGTATCCACATGGATGGAGAAAGAAATTGGGATTTATAATCGTTGTATGGCCTCTGGTGTCTATGAATGCAATGGTGTGAACTGGATTTTCTTGACAGGATGGGTCGAAGATCGTCACTGTCGATG

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

414

Start:

13450620  

End:

13451033

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_2

TTCCTTTATTGTTATATAATTTATCTGATCTAGTTCCAACTGATTTAATGATTTCGTTTTCATGAAATTTTATTTGTCTTGTTATTGGTTCAAATATTGGAGTGGTTACAGATGAAAATGGATGTTGAGTACTTTGGTTAAATTTATCCAATTTATTATTTTCATTAGTAGTTATTTTATTGTCTATGGTGTCTGCTTGTTTAGAAACTGTATAATATAACTGACTTTGGTAATTATTTTGTTGATATATTGATTTAGTATCTTGTAAAATTAATGGGTCTTTGTCATCCTTATTAGCTCCAGTTTTAAAAGATGTGGTTATTATTTCTTGATTTGAGGTATTTGTTTTTAAATATTCTAATAGTGGATGAATTGATTTAATCTTATTACCATCTACTTGTTCCCATACTTGAC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

118

Start:

13451128  

End:

13451245

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_3

ATATTAATTTTTTTAATGGGTAATTGATATTATAGGCGATTGAATATGTTTCAATCCATATAAAAATGGAATATTTATTTCTTTTAGCATCATGCAATTATACCATCTTTATATATAA

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

817

Start:

13458592  

End:

13459408

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_4

ATATTAATAATTTTAAATGGATAATTGATATTATAAGCGATTGAATATGTTTCGAACCATATACAAATGGAATATTTATTTCTTTTAGCATCATGCAATTATACCATTTTATCTAAACTCAATAGTTTGTTGTTTAGGGAATGTTTTGAAATACCAATTACGTTTTTCTTCATTTTCTTAGCGCAAAGGTCTTCTTTGATATATTGTTTTGTTAATTTCATATTCATTACAGATTTATAATCTGATGTTGTTGGAGATGTTGGATACGTATCTTGTTCAGGTTCAGCTATAGGTGCTTTACATTTAATTGAATTATCTTGTTTAATATTTTTGTTTACACTTTCTGTTTCTAAATCTGCACTAGAGTGACCATGCCATATTTAGAAAGGAAGCTCTTGAATGATACAAAGTAATTCTTGGTGGAAGAGGTTCTTTGAATGACCCGGAATGTAATACTATTTTTACATTTCTTTGTTCAATTATCTTTGAAAAAAATTCTTGTTTGAAATTTCTAAGTGGTTGAGTAATTTCAGTTTTCCATTGATCTGAAATAGTTATTTCATCCCATTTTAATTTTTTAGGAGCGTATGTAGCTGTTGGAATATCTTTAATTAAACATCTAAAATCGTTGTTTCTCTTTTGTCTTCTTGTAATACACATCTTGGGTTAAATTCAGAAGTTGATTGTTTACAATAAATTCTTAAACTAATAAATATCCATGCCTTTCATTTTGGAATTTAATTTTTGGTAAATGAACATTTAATGCTAAAGTATTGACTATAGTTGGATCATGTAGGTTTACTTGAAAATTAGGAGC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3671

Start:

15961921  

End:

15965591

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_5

GTCGTGTTAACAAAACCGCTTATGCTTAATTAATGCAACGTACATCACCGAGACTTGCAATCGGAAGATAGAAATCAAAGCTTATTAAAGATGTGATAAAGTCTGGAAAATTTGAGAATTTAGAAGAACAAGAGAGAAAAAAACTAAGAAAGAGGTTTTTATAAAATTATTTGATGATATTTTACAATGGGGGTACACACATATTTATTGGGAGGATAAGACGCTCACATAAGCGCTTACATTAGCGATTACATCATCGCTTACATCATGCGTACATAAGCTCACATCGATTATATCATCGCTTACATCATTATTGATTACACTTATTGTACATAATTAAACACACTTATTTTACATAATTATTATTGCTGATAACTTACTTAGTGGCCTATCTCAAACTTAATGATGTGTTTGTCACAACATCTGCAGTGATCGTATGGACATATGTACTCTTCTTCTAGCTCTTCGTAAGGCTGCTGCGAATCGTCTTTGACTTCGATGTTGAACATTTTTCCAACTTCATCAATGTTCATTGAGTCATCCGAGAGCTGGGCGTCTTGAAGTACTTAGGTGGGCATTTTTGGGATTGAAGGTCGCGTTTTTCCTTCTTCGGGATATCTTGAACAACTGGTGGATTAACACGTTTATCCATATAGAAGTGAAGATTTCCGTCAAGACTCATTTGGTAATCAATTGGATAGTATATCCAATTGGGGATGAAAGTAATAGGGAAATGTTTGTTTGGCACTGTTGAGTCAGAATGCATGTGTTTGAAAGTCTTCATATGCCTTGTTGTCATTGAGGTTGAAATCTGGTCTAACTCTTCGTTGATAGTCGTTTTGGTGAATGAGAATAAGTAGCGCGTGGATTTTGCCGGTTTTGTTGTTGACTTGAAAGGGGCAGTGAAAGATGTATGTCGTATGAGGGTTAAAGAAAAGGTTGAGACCTCCTTAACTCTTTAACTTTTTGAACGATAAGCCCGTCGCTTTTGCTGATTTCCTCAATTTACCATCCCAAACAGATAATGGCGCAAACCATGTTACAAATGTTGAGAAGAATTCCGTACATCCTTGTTGAGGGTCGGTAAATTGGATGTTGATGTACTGGTATAACCAATGAATATCAAAAGTTAAAACGATGGTGTAGATTGAGCAGATGTACAAGAGAAAACAGAGAACTTCTACTGGCATATACGCGTTTTGATCATGTAGATATCAGCGAATAGGTAATCAGGGTGAATTTCCTTCGGTGAAATGAGATGATTACGGACTCCGTATTTTAACATGATGATGGATTGATAGAAGAAAATCTTGTCGCGGAGGTGTTCGTGTAGGGCTTCTCTGTTGATGAGCGTATGCGCGTCGTCCAGCATGTTGGAAGCAAAGTCATAGAAGCTTCTTGCGGAATAGCTTTCCATCATTTGTATTTCTTTCACTGGGTTTTTACTGGTATATCTAAGAGAGTGTTCTTCGATCCCTTTAAATAGACGGATTTAAAATCGTACTTGGAGAACCATTCATTCCATCATAATAATTACTGATGTGGGATCATTTTCTGCTTGAATAATAACATCTTTGGGAAAGATGACATGTCCATTTCGATGCAAAATCGATGTCCTAACATATGGAACTCGAACTTCTCTATAGCCTTATTGACCGCCAGTATTTCTTTGAACGTGGAGTGATAATGCATTTCAGAATTTTTAAAGCGTCCACTTTGGTATCCACAGATTTGACGTTTCCCATTTATTTATTCAAATAAAATGACTCCCCTATATTTGTCACTCGCGTCAGTCTATAAAATGCATGTTCGAGTGGAGGGAATATTTAAAGGTGTTAGCTTTTGCACCTCTATTTTTAGGTTTCTGACAGCTTCGGTTTGTCAATTTGTCCACTGCAGTGGATTCTTTGTCAACATTTTCTGTTGCGGTCTTGTCAGTTGTGAATGTTGCGGGATAAAGTCGCTAACATAATTGATTACACCAAGGAATTGCTGAACTTGTCATTTTGTGAGATTTCCGTCAGGAAAATCTAAGAGTATCGTAGCAAGATGGGCTTGTGGTGTAAAATTGTCATTTGTGATTTCATTTCGAAGGAAGTCGATGTTGGACTGGGCTATAACCATTTTTCGGGCCGGAAGCATAATTCCATATTGTATGACGATGCGTTGAAACCATTGAAGAAGCTGAACGTGTTCCTTCTCAGTTGATGAGAATAGAAGTATATCATCGATATATATCAAGGTTGTGTGGAGTACAGGCTTGAATATACAGACCATCTTTTGTTGGAATAATGAGGGTGCGGTCTTGAGACCAAAAGGCAAGACGTTCCATTGAAGATGTAAATTTGGGAGGCAAAATGAAGTTTCGTATCTTTTGTTTGAAAAATATTGTTGCTCCTTGAAAATATTGAAGAAGCGCGCTTTTGTTTGGTAGCGGAAATTTGATGTCTTGCAGATACTGATTCAATGGCTTATAGTTGATGACTAGTCTGAGTTTTCCTCTTGCTTGTTCGGCACGATTATTGACGTGTTGGTCGCATTCTTCATTTGCATGTTGTAGTAGTGGGGCGGTTTGAATATTTTCTTTGAATGGAAAGGAAACGAAGAACTCTGAATTTAACCACATCGAGTTACTACGTTTTTGGAGGAAATCTGTATGTGAGTCTGCACATGATGTCGCCGTCATTTCTTCTTTGATTTTTGTAAACTCTTCAGAGATCAATCCTTCAATTGTGAAAATTCGTGGAATTGTTGTGAAGCCGTAATAGGAATCTCATCCTAACATTAAATCATTTCCAGGTGCAGTAGAGCCGACTACTTCCGTAGTGATGTGGCACCCGGAGAAAAGTTCAATTTTGATTGGTTTTGGCTTGAGCTTTATCGTCAATGACCCCGAGTTTGCAATACGAAACTCCCGTTGATGAGGTAGCCACATGGACGGAGAAATAATTTTGGGATTTATAATCGTTGTATTGGCTCTTGTGTCTATGAATGCAATGGTGTGAACTGGGTCTTCTTGACAAGATGAGTCAAAGATTGTCACTTGTAAATGCAGAGATTGTATCTCGTATTATCGCAGCATTTTTTGTGATCTTGAAACAAGAATCATTATCTTCATCAGGAGATGACTTGGAAGAATTGTCATAATCCGAGTAACAACAAGTAGCGTCGTTGTTGTCACTGCTATAAGATAGAACCGACTCTAAGTTGTTGCCTTCGAGGTCAATATCTGGTGTGATTTCAGATATCGAGTTGATTATGTATTGCTTCTTCTTGGCGGATTTGTTAGGACAGTTTTTTTGTGAAATGTCCTTCCTTTCGGCATAGAAAACATTTTGTTGATTTCTTGAAGCTCTGTTTTTTTTGGAAGAATCTCCTGCACCTAAATTTGTCAGAGAGCTTAGAGAATTGATTTTTAAATTTTCGACGTCTCTCATGTGTATCGCACGAGCAAGATTTCTTGGATTTTGAACACTTGAATGATAGATCTGATCTTGCACATATTTTTGATAGCTGTTTGATCTTTCCATGATCTATCAATGTTCTGAAAATATATTGCTGGATTTGACCGATATAAACTTCTTCGATTGTTTGTCCTTGATCCATGATGTATAGCTTAGTCAGATGACTAAGATAGTCTACTGACCAAGATAGATTTCTTTTAGATTTGG

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

401

Start:

15965996  

End:

15966396

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_6

CAATGAATTCTCTATGAATTTCTCCAAGGAGCAATGGTATTGTCGTTTGATAGACTTGTTGATGTCTATATTCACCGAGTGAATTCCCCCATTCTTTAAGTACTCCAGATAGTCTTGTAGTGAATAGTTGGATCACCATTTGTAAAGGAGATGTAATGGCTTCAGAATTCATCCATGCATGAAATTCGTCGAGAAGGTCATTCCATTTTCGAACGGAATGTCATCGAATGTGAACACCATGATTTTTGAAGCAAATTGCTTAGTTGGAATCTCCTGTCTAGGAGGCACATAATTCATTTCTTCATCGCTGGAATAAATTTCGTTGATACTTGGCTCCTTTTTTGGTGTGTTTGATCCTTCTCCAGTTACAAACGTCTTGGTAGAGATTCCTCGTTTGATTC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

908

Start:

15966504  

End:

15967411

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_7

GAGATTATTGAGCAGACTGGCCATAAAAATTTTGATTATCCTGATGTCTTGTCCTTTCTTCTTGTTATCTTCAACAGAATTGTGACTAGAGGACGAAGTAAGAGTTGGTTTCTTATTTGGGTTGACTTGAAATTCTAATTCTTTTTGACGCTGAGGCTTTGAACAAGTCTTCTTGGGATGATAGATGTTTGAGTTAAGCCATAGCGAGATGTAAAGACTTCGCCGGAGGATAAAAACCGGTAATGGAGATCTTGTATTTTGGGTATGATGGCCAAAGAGGAACCCAGAAAAGTAGGATCCTTGATACATTGGCATACCTGACGATGTTCTTCCAGGGTGATCAAAGTATGTATTAGCTTGTTGTTGATTATGAACCATACTTTCTAGGCATTTTTGGAGATCTTTCAACTGATTTTTAAGACTAGTCGTCTTTGCTTCTTTATTGCAGAATTGAGTCGTGTGTGCAATCATATGTTTTGCCATGGTCATCATTTCTTGATGGAGATTGCCAAGACGACCATGTATCTTTGTGATCGAATTTTGAAGACCGAGTAATCTGTTTTTGTATCCTTCCGTCAATTGATCAACTTTATGATTTATTGTTGATTAAAGTTGATTCTGAGGAAGCGAATTCTCCGTTTGCCAGTTGAGGACCTTTTCTGCTTGACTTAGCTGGGTCAGACCAGAAGAGTCGATAGCTTGAGAAAGAATCTTTGAGTTATGTGCGATGTTCTTTATGAAATTATCTTATGGAGAGAACTCATCATGATTTATCATCATAATCTTATGTCTTGGCTCTTCCTTCTTGTCAGACTATTGGACTATAAAGTTGTACTTTCCCTCACCGAGCGGACCAACATAAGTATCTCTTTCGAGATATCTTTTGTAGAGCGGGTCTTTCTTTTTTC

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A01_LTR-Caulimovirus_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

447

Start:

15967442  

End:

15967888

Strand:

-

>A01_LTR-Caulimovirus_8

TTATCATCATGATCTGATGTCTTGGCTCTTCCTTCTTGTCAGAGTATTGGACTATAAAGTCGTACTTTCCCTCACCGAACGGACCGACATAAGTATCTCCTTCGAGATATCTTTTGTAGAGCGGATCTTTCTTTTTTCTTCTACATGTGTAAATATCTTCATCAGATTCGTAGTTTGCTTCTTCACAAGCAATACATGAGCAAACATTAAAGTAACATTAGATTATTGTTTCATCTCTTTCAAAAGAACTTGGTTTGGGAATTTGTTCTTTTGCTGGACCGTAGTAGCTTCCTTCATCAATCTGTATCACAAATTGAATGAACAATTGCTTTTGAAATGGTGATGATCGTGGTTTTTCAAATCTTCTTTTGGCTATTCCATCATTTCGAGAATGAAAACTGACTTCAGATGATTGGATAAGCGACTGGGTAGCTTCATAAAGCTTTT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A02_LTR-Caulimovirus_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

360

Start:

350200  

End:

350559

Strand:

-

>A02_LTR-Caulimovirus_9

TTTAAAGCATAACTGAGACTTCCAAATAACCTTTGTAATTGGGTTATATCAATATTTTTGTCTAAAATTTTATTTGTAAATTTTCAAGATCTTTCAATAAGTGTTATGATACTTTGTGTAGTAATCTAGAAATATGATTTTAGTTTGGAATAAATACATTTTGTTTGAAAACAAGTAGACCATTTTTATTGCAACATAATAAAATTCAGATTTTTGAAGCGTTCATCAATAGGGTTTGAAAATATTATAATAACATCAATATAGACTATGCAAAATCTTGAATAGTTAAAGAATATATCATTTATGATTATTTTAAATTCATAAACTGCATTTTTAAAACAAATAGCATTACACTATATT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A02_LTR-Caulimovirus_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

3404

Start:

9423857  

End:

9427260

Strand:

-

>A02_LTR-Caulimovirus_10

GGGACTTGGATTTGTTTGGGATATTTGGTTGGGTTGTGTTGAGAAGACGTATAGATATGGATATAGTTTGGATTGCTGTTTTGGCTTGATTTGTAATTTGGAAATATTTTTGGATACCTGCGAGGGAACATCTGTCAAGGTTATATTTTCCCCATCATTTGACTCTGAATTCTCGGAGGAGAGAATAAGGCATGTCTTGAAGAGCGATAGCGAGGGTAAAATGCCATGAACATATCCATGGGATTCCCATGTCAATATGAAACCAGATTATGTTTAGAGGCCCAACTGGTTGAACAAATACGTGTTTCTTGTAGAATGGGTAGGATGTCTTGAGTACTTGGTCGGGGTAGATCGGATCTGCTGGTCCGAACCAGTACCACCATTCGTTGAACCATCCTGGTATCCTCTTTGTGCAGTTTTGATCAAAACTGAAGAACCAAGAGTGGTCATAGGGTCTGAGTAAAAAAGCTCGGAAAAAGGTATTTTTGTAATCTGTATAGGTGTAGCCGTCGATATGATAGCCTGGGGTAGAAAAAGGTTTTGTTGTATGATGATGTATAAAACCAAGGTCTTGGGTAGAACAAATTCGCAGGAATTTGCAGGTTGAATAGTTTATGAGGTTTGGGTTTGTCTTGTCTTTATAATGGGTGATTTCTATAGATTTAGTGTCTACTAGAATATACTCATAAAAGGATTGGTTTTTGGTTATGTTGTCTGTTGGCCAGGGACTGTCCTCGTAGAAGACTCGATTGATGAAGGTTTTGAGTAGAGTAAGGTTGATTGGTTTGGTGAATGGGGCCGTCATCAGGTGTTTCTTATAAGGTTCGGTGTAGTAGACTGGTTTAGTGTTTGGGGTAGTGTTTGAGGTTGTATTTGGGGTTGCTGTAGATGATTGTGTTTCCGCCTTTGATGACTTTTCAGAGACTGCTTTTGAATAAGATAGAGGAGGATATTCAGCTAATGCTGAGTAAGGTTTTGGAGTTAAAGTCCTTCCTTGGAGATGTGGTTGGTTTTTGATATAATCTGATGCTGTCATCGGCTTTTTCATCTTCTGGTCACTCATTTTTGAATATCTTGTTGTTGTTGATTATCTGTGAATTTTTCCTGCAAATATTCTCTTGTTAGAAAGTCGGGTAAAGAATTTTTTTCTCCTTTACTATATTGAATATCAAAATCGAAAACGGATAATATTGCTTGCCATCTAGCAAATATTTGTTTTGATACTAGGTTTTTGACATCTTTTTGTAATATTTATTTTGCTGATTTGCAATCTACTCGCAATAAATTTTTTTTGTTGATTAAGTCGTCTTGGAATTTTGAGATACAATTAATAATTGAGAGAATTTCTTTCTTAACTGTTGAATAATGCTTTTGTGGTCCTAACCAGACTTCTGAATGGAATCGAACTATAGATTCTTGTTTTGACTGTGGTAATTTTTGCTTAAGAATTCCTCCATAACCTATTTCTAAAGCATTAGTTTCAACTATCATGTCAGCTTCAGGATTTGGTATGGAAAGGCATGAGAGGGTTTTAACCTTTTGCTTAACTTGTTTGATTAAAAGAGTATGTTGTTTAGTCCATGGTTTTCGATTCTTTTGCAACCGTTGAAATAATGGTTGAATTGTTTTCCTAAGATTGGGTAAGAAGTCCGAAACATAGTTTAGGCATCCCAAAAATCTTTGTAATTTGGTCTCTTCTCTTAATTCGTCAGGAAATTTATCTGCGAATTCAATTGATCTTGAAATAGGTGTGATTGTTCCTTGATATATATTATGTCCTAAAAATCTTAATTTTGTTTGGAATAAAGAAATTTTCTTGGCTGATATAACTAATCCATGTTTTTTAACTATATTGAGGAATGCATTTAAGTGACTAATGTGTTGGTCTATTGAAGTTGAATATACTAATATGTCATCTATGTAGACAATTGTAAATTTTGAATAATTATTGAATATATCATTCATTATATGTTGAAATTCAGAAGGTGGGTTTTTAAGGCCAAAAGGCATTACATTCCATTCATAATGTCCAAATGGTCCGATGAATGCTGTTTTATATTTATCTTTTTCGGCAATTTGTATTTGCCAAAAGCCACTTTTCATGTCAAATTTTGAATAAATTTTTGCATTATAAAGTCGTTTTAATAAATCTCTTTTGTTAGGTATTGGATATCGTATCCATTGTAATACATAGTTTAATGGTTTATAATTTATTACTAATCGTGGTACCCATGCTCCTTTTCAGCTTGATTATTTACATAAAAGGCCGAACAGCTCCATGGAGATTTGGATGGCCTGATTAATTTTTTGTCTAATAAATCTTTTATTTCTTTTTTACAGTGTTCTAATAATTCCTTATTCATTTGAATAGGTCTTGCTTTAGTTGGTATATTTCTTTCGTTAAAATCTTTTATATACTGGAGTTCAACCGTATGTTGTTTTCTTTCCCATAAAGCGTTTGGCAGTTCTGAGCAGATTTGTTTTAATATATCATTTTCAATAGCTTTTATCTTGCTTATTATGTAAGGCATTCTATTTTTTTGTATGCTATTTCATTTTGTAGATATTGTATATGATTTTTTTTTCTTTTTATTAAATTAATTGTTTTTTGAATGGAATTTTGTTTTAAGTTTAGTATTTCTTTGGTTTTCATAGGTGATAAGAATTCAAACGATAATTTTGTTCCTACTACTTTAGTGGTTACTCCTATTTCTGTTACTTTGAATGGATATATTTGAGTAAAAAATGGAGTTCCTAATATTACTTCTTGTGTTAAGTTTTTTACTAGAATAAATTGATTTTTGAAGCATTATCCTTGGTTACATATTTTGCACATGGTAGTTTGTATTGTACTTTTAAATTACTTCCGTTTGCTCCACTTAATTTTTCAGTAGTTTTTTCATAATATTTAGTTGGTATAATTTCTTCACGAATACAGTTGTAATCAGCACCTGTATCCATTAATGTTATTATATTTATTTTGAAATCATGTCCCACATGTAAGGTAATATTTGTATACCATTTTTGATAATTTATTTTGTTAATTATTTGAATATAATCTTCGGTAGGTCCAATTTGTTTATTTTCATCGTTTTCTAGATTTGTATTACTTGTGGATGCTTGATTTAAACTACTTGTAGATGTTGAAGTAGTATTTTTTGCTTCTATTAATGATAATCTAGCATCTGTTTGCAATTGTTTTAATTCGTGTTGATTTACTATTAATTGTAATTCTTTAATTTGCGTCTTTAATTGCTTAACTTCATTTTGTAGTTCTCCTGTAGTTACTTGCTTAAATAAACTTTGTGTAGGGTATTTATCAGATATTTTATTTAAACTAAAGGGTTGAAGGCTAGATAATTGGTTTTCTTGATATATTATATCTTTTAGTTTAGTTAAATATT

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A02_LTR-Caulimovirus_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2137

Start:

9427415  

End:

9429551

Strand:

-

>A02_LTR-Caulimovirus_11

ATCTATAGAGTTATGTCCAGGTCTTTTACAATTCCAGCATACTATATTTTGCTTATTATTTGATTTGTGCTTATTATTCTTTGTATAGTATTGATTTGTTGATTTTTTATTAAATTTATTATTTTTATGAAAATACTTAGTTTTATTATGTCTATGCTTTAGTCGTTTAATTCTTGATGGAGGGTTAAGTTGATTATAGCCATACTGATCACAAAATGATCCCATAGTTATTTTAAATTTAAATGTATCATTTCGTTTTTTATCTTTATGTTCTTGACATATAGCTAATCCTTCTTTCTTAGGATTTCTTTATAAATGCAAATAATTGACCGTAAGTAATTGTATTCCAAGGGATTGGTTGTCCTCCTGAATACTCTTTTAATTTACCAATTACTCTTTCTGCAAAGAAAGATGGTAATCCTGAGATAAACCGTTCTTTCCAAAATGCTTGATTACAATCGTTTCTTTGGAATATGTTTGTTATAAAAACATCCTTGTACCATTTAAAATCTCCTAATGTTGGACACCTTAAATTTGTTAATATAATTTTTTTACTTTCTAATTCTTCTTTAGGATTTCCAATAAAATGCATTGTTAAAGTATGTATTAATACTTCTACTGCGTTTTGTACTTCTATATCATTCATAAATCCTTCTTCATCTTCTTGTTGTTTTATTTCAAAATGATTAATTATAGATTCTTGTGTAATTGCGTCTAATGAGTTATCCCACCAATATCTTAATGCTCCGGTAAATCCAGCTATTAATAAAATGCATGCTTGTTGATCATTATTTCCTCTACCTTTGTAAGCCATTGTAGCCATTCCCATTTCTTGAAATAAATTCATCATTTCATATTCTGATCATCCATCTATATTCCATTCGTATATACTTTCTCCAGAATATTCTTTATTACTATATTTGTGATGTTCTTCAAATAATAAATCAGGTGGAGTATGCCTAGGATAATATGGTTTTCTTGATTTATTTTTTATTCGATTTATTTCTTGTATATCGTTTTCTGATTGTGAGGAGGTTTGGATAGATTCATTGTCATCTTCATCTATAGTGTTTATTCCTTTTCCTTTATCTAACCTGTCTAATCTGGTCGAGATTGATTTTAAAATTTTATTTTCAGGAAATTTGATTTGTCTTGTTGTTGGTTTAAAGATTGGGTAGGTCGTTGATGAGAAAGGGTGTTTTGAGTGTGTTGGTCCACTTTTTCTTTTTCATTAATATTTATTTTATTATCAATGCTATCTGTCTGTTTAATTGTATGTAGTATTACTTTGATAATTGTTCTTTATAATTAAATCTATACTGTTTATTTGTAGCTTCAGTTTAAAGGGTGTAGCTAAAATTTGTCGGTTTAAAGTATTTATCTTTAAATCATTTAAAGGTGGATGAATTGCTTTAATTTTATTTCCATCCACTTGTTCCCATACTTGGCTTAATGATGTACTTGCATTAATCGTCCTGAATGGATAATTGATATTATGAGCTATTGAATAAATTTCAAACCATACGAAAAATGGAATATTCATTTCTTTTAGTATCATACAATCATACCATTTTTCTCTATCCTCATTGGTATGTTGTTTAGAAAAAGTTTTAAAATACCAGCTTCGTTTTTCTTCATTTTTTTTTGAATAAAATTCTTCTTTTATATATTGTTTATTAATTTCGTATTTTTTAGTTATAACATTTATTGATCTAAAATCTGATGGAGTACGTGATGTTGGATACGCATCTTGATCTGGTTCTGCTATAGGTGCTTTAAATCTTATGGTTCATCTTGTTTAGTATTTTGATTTACACTTTTTGTTTCTGAATTTGTACTGGATTGACCCGCACGATATTCAGAAAAAGAGGCTCTTGAATGATATGAACTTATTCTAGGTGGAAGTGGATCCCTATAAGATCCAAACCTTAATAATATTTTTCCATCTTTCTGTTCAATTATTGTAGATATATTATTTTGTTCAAAATTTCTAGGAGGTTGAGTAATTTCAATTTTCCATTGATCTGGAATAGTTATTTCATCTCATTTTAATTGCTTTGGTGTGTATGTAGCTGTTGGTGTATCTTTACTATGGACTGCTAGAATTGTTGTTTCTCCTTTATCATCTTGTAATANA

Brassica juncea (Tumida_V1.5)

ID:

A02_LTR-Caulimovirus_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Caulimovirus

Length:

2217

Start:

9429921  

End:

9432137

Strand:

+

>A02_LTR-Caulimovirus_12

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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Brassica juncea (Tumida_V1.5)

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