Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_1Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
369Start:
76100End:
76468Strand:
->Aa.chr1_LTR-Gypsy_1
TGAAACGACCCGACCCGTTTTTTTTTTTAAAACAGTAAACCCTTGGTCTCGGACTAGCATTCCCATAAATGCTATCTTCAACAACCAAGCATCAACAACCAACCAAATAATTCATTCCATAAAAACTAAACCAGTTCAACTCAAATTCCAATAACAATTCCAATACAATAAAACCAGCAACCTACCGGAGTTCTAAAACAGAAATGGAAAGCAATAAAACCACACAGCACGAAACCGAGACCCTAGATCATTTCCTTTTTCGTTGCCATGATTCCACGATCACAATTTGCCTTTACCTGCATCACATGGAAAAAAGAGATGCGTGAGTATTATCACAAATACCCAGTTAGACGGTCCTCCCATCTACGA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_2Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
289Start:
94423End:
94711Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_2
GCCAGTGTGAGGGCTGGTGGGGGCAGTGTGGTCCCAGGTTGGCTGCCGGGGGCCGGTGTGGGTCCTCGTGAGGTTGGTAGTGCGGTGGGCTAAGCGTCGAGTGGATCGTCTGGCGGATTGGCTTCAGCAGTTTTTGGAGCGGTTACCGAGTGCGGTACGAGTTAGGCTCTGGTGATGCCACGAGTGGCAGAGGTGCGGCTGAGGGCTGCGGTTGTTGGTAGGGTTCCGTCTTATCTACGGATAAGGGAACTGGTGCAGAGGATTGGTATAGGATTCTTTGCGAGTGGTA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_3Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
517Start:
94706End:
95222Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_3
GTGGTATGTTGCAGCTAGGAGGGTTCAGACAGTGTTGGCCTGGACGGACTTGTGGGCAGAGTGTGATGCCAAGTTCTTTCCTCGAGAGGTTGCGGATCGTTTAGAGACGAGGTTTTTGGAACTGGATCTGTGAGAGAGATCAGTTCGTGGGTATGTTTTGGAGTTAATTGGCTCATGGTTTGTGTTGGGTCATGCTGGTAGGAGCATGGAGGGCGAGGAGGCCCGGGATAAGAGGTTCTTGAGAGGACTTTGATCAGATTGAGGACACGGTGTAGAGTATCTAAGTATGCTGGGAGAGCATAGTTGGTTGAGACTGTTGGAGGCATTGTCGAGGCTCGAGAGAGCAGGCTGTGGTAGTTAGCCCAGTTGTTCAGTCTATTAAGCCTCAATAGGAGATACCTGGCATGGCGGCAAGCCTGTGCAGGGACGGAAAAAGAAGTGGGAGGATACTTCCGGGTTGAGCTAGAGTGGCCAAAGGTGCTTCGGGTGTGGAAGCATGGGTCATAGTTGGCGAGTT
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_4Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
1366Start:
95223End:
96588Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_4
TGTTAGGTTTCTTAGCACATGTGAGTTGTGTGGAGACCTTTGTAGTGGGCAGTGGTGAATTCCACGGGTTGTTCGATTCTGGAGCATGATTGCTTCATCACTCCGGAAGATACTGGGTGGAGCGGCATTCGGAGTGGCGCTAGTGAGCGGATTGGATCGACTATGGTTGTAGGAGAGAAGTCCCTATTATAAATGGCCGGGCAAGAGGCGTGAAGTTTCTAGTGACTGGTGAGTGGATGACAGCGGACTTGGTGTACAGTCTAGTGGAATTGTATGATTGGCATCTTGTGTACGGATTGGCTGGGATCAGTACAGAGTTCATCTGGATTGTCACCAGAGTCGTGATGTGTTTGAGCGTGGTGGAGGAAGTTGGTTTGTCAGGGAGTGAAACCGACGTCTGAGAGTCTCGTGATCTCTTGGGTGCAGGTTGAGGCTATGACTGAGAGGTTGCGAGGCTTACTCGGAGACTGTTTTGCTGGCGGAGTCTGTAGGTGAGGTTGCAGTGAGAGATATTCGGGTTGTCCAGGAGCGTGAGGATGTCTTTCGGTCGCTGCGGGGATTGCCGTCATCGCGGTCAGAATCTCGCACGATTGAGTTAGAGCCTGGGACGACGCCGTTATCTAAGGCACCTTACATGATGGCTCCAGCAGAGTTAGAAGAATCGGTGATGTTGGTGATGAGGAATCGTGGTAGTTTCCGGTTGTACTTCGATTATCGAGGACTTAACCGAGTCAATATGAGGAACAAGTTTCGTCTTCCGAGAATCGATAAGTTGTTGGATCAATTGTGAGGGGGTACTTAGTTCTTTAAGGATGACTTGGCATCCGGTTAACACCAGATTCTATTGATGAGGTGGTTGTCAGGAAAAAACGGCTTTCTTGACGAGTCATGAGTAGGGTGGAGTTAGTAAAGGTGCTTGTCGGGTTGACGAGTGCACCAGCTGCATTTATGAGGTTGATGAGCGAAGCCTTTCAGTGGTATCTGAATGAGTTCGTGATTAACTTTATCGATGTCATCTTGGTGTATTCGAAGAGTCTGGAGGAACATGAGGTTTATTTGAGGAGAGTTCTGAAGAAGTTGCGGGAACAGAAGCTGGTTTGATAGGATGAGCAAGTGTAGTTTCTGGTAAGTGGGAATGGGTTTTCAGGGTCTTACTGGTTCTGCAGTGGAGTTTCTGTGGATACAGTTAAGATGCAATCGACCTGAGATTTTGCCTAGACCGAAGAATGAGACTAAGTGTAGTAGTTCTCGGGTTGGCAGGTTATTTCAGGAGTTGCATCAAAAGGCCTTGAGAGTACGGCTCAGTCCATGACCAAGTGGTTAGTGGAGTAGGTTCCTTTTCGGTGGTCTTTGGTTTAGGAGGCGG
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_5Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
1411Start:
96582End:
97992Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_5
GAGGCGGAAGTGATGGGAGAAGTTGTAGCGGATTGAGTTTTCCTTTAGTTTACCGTCGCGGTGAACTTAGCTAGGGGCGGATGCTCTTAGGCGGAGGAGGTATGATTCATCTCAGGAGCGGGAATTGGAGAATTTGGTGAGCATGCTTAGTACTCTGAGGTTGTGTGTTACTTCAGAGGAACCGTTGGGGTTAGCGGCGGTGGATCAGGCGGATCTATTGAGCAGGATCCGAGTAGCTCAGGAGAAGGATCCGGTGTTGTTAGATCTCTTCAAGGTTGCCGGTTCCGTATATCAGGTTTCTGCTAACGGGACTATCTTAGTGCATGGACGAGTCTGTGTTCCTAAGGATGAGGACTTGAGGCAGGAAATTCTGAGAGAAGCTCATGCGAGTAAGTTTTCGATTCATCCGGGAGTGACTAAGATGTATCGGGATCTGAAACGATATTATCTTTGGGTCGGGATGAAGAGAGATGTGGCAGATTGGGTTGCAGCTTGCAATGTGTGTCAGTTCGTGAAGGCTGAGCACCAAGTTCCTAGTGACTTATTGCAGAGTTTACCCATTCCAGAGTGGAAGTGGGACATGATTACCATGGATTTCGTAGTAGGGTTGCCGGTTTCTCGGACCTATGACGCGATTTGGGTGATTGTGGATCGTCTGACTAAGTCAGCACATTTTCGGGCCATTAAGAAGACGGACGGAGCGGAGGTCTTGGCTAAGAAGTATGTGAAGGAAATTGTGAGGTTGCATGGAGTGCCAGCGAGTATTGTGTCGGATCGAGATCCGAGGTTTGCGTCAGTGTTCTGGAGAGCTTTTCAGGCTGAGATGGGCACTAAGGTGCACATGAGTACAGATAATCATCCGCAGACGGATGGGCAGTCCGAAAGGACGATTCAGACACTGGAAGATCTGTTAAGGATGTGCGTGCTAGATTGGGGTGGTCATTGGGCGGATCACTTGAGTTTGGTGGAGTTCGCATATAACAACAGTTTTCAGGCGAGTATCGGAATGACTCCTTTTGAGGCGTTGTATGGGAGGCCATGTCGTACTCCGCTATGTTTTACCCAAGTGGGGGAGAGGAGCGTCTTTGGTGCTGATTTTGTTCAGGAGACGACGGAGAAGATCCGTGTTGTGAAGCTGAACATGAAAGAGGCTCAGGATCGGCAGAAGAGCTATGCCGATAGGAGAAGGAAAGAGTTAGAGTTTCGCAGTCGGAGATCAAGTGTATCTCAAGATGGCTATGATGCGGGGTCTAAACAGGTCCATTTTCGAGGATAAGCTGGGTACGAGGTACATGGGTCCGTTCCGGGTTGTGGAATGTGCGGGACCAGTTGCTTATCGGTTGGAGCTGCCTCCGATTATGGAGAAATTCCATGATGTGTTTCATGTTTCGAAACTCAGGAGATGCTTGCA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_6Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
724Start:
437526End:
438249Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_6
ATGAAATCACAGGTCCACCATGCGCTAAGCTCGGCGCCGGAGCTCGACCGTGTAATCGAGGACGCGCAGCGCACCCCCTTCACTGAACGGATTACGTCCGTCCAAGTTCGGGTCACAGGGAAGCTTCGCATTTCGACCTATGAAGGGAAAACCGACCCGAAACGGCACTTGACAGCATTCTCGCACGCTATGAGCCGACAACACTTAACTACTGATCAGAAGGACGCGGCGAACTGCCAAATCTTCGTCGAGTACCTGGATGGCCCAGCCCTGGAATGGTTCTCCCGTCTCGAACCAAACTCGATCGATGATTTCCTTCAACTGTCATTCGCATTCGTAAAACACTACTCATTGTATTTACACGACACCGCATCGGACTCGGACCTCTACGACCTCGAGCCTCAAGGGTCAAAAGAAACTTTAAGAAATTACATGGGTCGCTTCAAGGCGGTCCTCTCCAAAGTAAGCGTCCCAGATTCGTCAGCAATAAGCGCGCTAAAACAAGGCTTATGGCACGAGTCAGAGTTCCGAAGAGACCTCGTGCAGCATAGGGCGTACCGACTTGACGACAAATTGCACCGCACGAGTGGTTTCATTCGCGTCGAAGAGGACCAGGCAATGAACTTGAAAAGGCAATCGGCACTCAAGCCGCCAACACCTAAACCCAAGTCAGCAAAAGAACGAATCGAGGATGACTATCAAGAACCCCGACAACACTATGATC
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_7Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
430Start:
438754End:
439183Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_7
CCGATACGAAGGGGCTTGCTATGCCTCATAACGACCCCTTGGTAATCGAACTTAGGGTAGGGGACTACGACGTATCCCGAGTCCTCATCGATACCGGGAGCTCGGTCGATATAATCTTTAAGCAGACACTCATAAGCATGTATATCCCCGAAAACCAAATCAAGCCAAGCGTGAAGCCCCTGACTGGATTCGATGGCATCACCAAAATGACCATAGGTTCGATCAAGTTGGACGTGTACGCAGGAGGTATAACTAAGGCAGTCAAGTTCCTCATCGTGGATCGACCTGCAATATACAACGTGATTATGGGCACCCCGTGGCTGATTTCGCTTCGAGCCGTGCCATCAACTTACCATTTATGTCTGAAGTTTCCCACTCAGACCGGAGTATTCACTATACGAGGCGACCAAAAGATGGCTCGAACGTGTTT
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_8Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
1387Start:
439306End:
440692Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_8
GACGCGTCAGTATCGGAACCGAGCTGATTGATCCGATAAGATCCGAGCTTATACAATTCCTCGCGAAGAACGCTGAATCCTTCGCATGGACGGTCCAGGACATGAAGGGAATAAGCCCCTCAATCACGAGCCACCGACTGAACGTCGACCCAACCTTCGAACCGATTCGGCAGAAACGAAGGAAACTCGGTTCGGAACAAGCCAAGGCGGTAAATGAGGAGGTAACAAAGTTGCTCGACGCGGGCTCAATCACCGAGGTACAATACCCCGAATGGTTGGCAAACCCGGTCGTGGTCAAGAAAAAGAACGGCAGCTGGAGGGTCTGCGTGGACTTCACCGACCTGAACAAAGCCTGTCCCAAGGATAGTTACCCACTCCCCCACATTGATCGAGTCGTGGAAGCAACGGCAGGAAACGAGTTGCTGTCATTCATGGACGCTTTCTCAGGTTACAACCAGATCGAGATGCATCCGCACGATCGAGAGAAGACTGCATTCATTACGGAGCGCGGGACATACTGCTACAAGGTTATGCCGTTCGGTCTGAAGAACGCCGGAGCGACCTACCAAAGGCTCGTAAACAAGATGTTCGCTGAGCAGCTCGGCGACACAATGGAAGTTTACATAGACGACATGCTAGTTAAATCGGAAAAGGCGGGCGACCACGTCGAGCACCTTAGGTCGTGCTTCGAAATATTGAACCAATATGGCATGAAGCTCAATCCGGCGAAGTGTACATTTGGAGTGACCTCCGGAGAGTTCCTCGGTTACATCGTAATACAGCGCGGGATCGAGGCGAATCCAAAACAGATCGCAGCCATAACCGATCTTCCTTCTCCAAAGAACAAAAGGGAGGTGCAACGCTTGACCGGTCGGATCGCAGCCTTGAATCGCTTCATCTCGAGATCCACCGATCGAAGCCTACCTTTCTATCAACTCGTACGAGGCAACAAAAGCTTCGCCTGGGACTATAAGTGCGAATCGGCCTTCCAGGATCTAAAGCAGTACTTGACTACCCTACCAATCCTCTCAAAGCCTGAGCTGGGCGAGACCTTGTACCTCTACGTATCGATCACCGACGCCGCAGTCAGTGGAGTACTCGTCAGAGAGGATCGAGGCGATCAGAAGCCAATCTTCTATGTCAGTAAAGCGCTCGATGGTGCCGAATCTCGATATCCGACGCTTGAAAAACTCGCGCTAGCCGTGGTTATGTCGGCTCGAAAACTCCGACCTTACTTCCAATCCCATACGATAGCGGTCATGTCAACACAACCACTCCGAGCTATACTACACAGCCCGATCCAGTCAGGACGGATGACACGTTGGGCGGTCGAACTGAGCGAATTCGATCTGGAATTTCGAAACAGAACAACGGCCAAGTCTCAAGT
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_9Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
812Start:
440711End:
441522Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_9
TTGCACCAAAAGAGGTACGTCATAGTCATCACCGACTACTTCACAAAATGGGTTGAGGCCGAGGCGTACGCAATGATTCGAGCTAACGACGTTCAGAATTTCGTTTGGAAATTCCTTATATGTCGGCACGGTTTACCATAGGAAATCGTCACGGACAACGGCTGGCAATTCATCTCCAACACATTCGAGGCCTTCTACGCGAGGTGGAGGATCAGACTCAACAAATCGACACCTCGGTACCCGCAGGGAAATGGCCAAGCCGAAGCAACTAACAAAGTAATCGTCAGCGAGCTCAAGAAGCGACTTGATGAAAAGAAGAGCCTTTGGGCCGACGAGCTCGATGGCGTCCTATGGGCATTCCGCACTACTCCGAGACAGTCAACAGATCGAACTCCTTTTTCTCTCGCCTACAGGCTCGAGGCTATGGCACCCGCCGAAGTCAACATCAATAGCCTTCGCAGGAGCACCATGCCCAGGAACCCCGAGGTCAACGAGATCACGCTCCTCGATAACCTTGACTTCGTCGAAGAGGAACGTATCCAGGCACTGCTTCGAATCCAGAATTACCAACAACGAGCCGCCCAGTACTACAATCGTAAAGTACAAGGTCGAATCTTCCGTGAAGGAGACATGGTGCTGCGAAAGGTATACGAAAACACCACGGAGTATCAAGCCGGTAAACTCGGAGCAAACTGGGAAGGTCCATATCTCATCTCAAAAGTCGTCCGACCCAGCGTGTACGAGCTAATGACACTTGAAGGCGTCGCAGTCCCACGGTCATGGAATTCGATGTCCCTCAAACGATACCATTA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_10Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
127Start:
578895End:
579021Strand:
->Aa.chr1_LTR-Gypsy_10
AATCCTCCCTTTCCAGAGAACCTTGTCCTCAAGGTTTGAAGCTTGCAAAACCCCATAAAAGCATAGAAGAACTCCTACGTATCTTCATCCAGAAGAACCTTAGTCATCGTAACAAGCACCATTGTAA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_11Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
264Start:
581630End:
581893Strand:
->Aa.chr1_LTR-Gypsy_11
CAAGCCACTGGTTCCTGAGTTTCACAAGTCTTCTTCGGATAAATTCCTTCATATAACTTGCCGAATATCAAACATTCTCTAATTGTTTGTGGCCGAAACATCCTCACGTTCATTTGTGTATCACTTCTCAACCCTGTCAAGTATACACCAACCAAATACTCATCTGACAAACTCAATCTTGTGCTAATCAACTCAAACCTTTTATGATAATCCTCAATTCCATCAGTTTCTTGCAATTGCTTCAACTCACCTATTGGATCTGCA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_12Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
3846Start:
943252End:
947097Strand:
->Aa.chr1_LTR-Gypsy_12
TTGTAGTAGTACCGTTTCAGGGACATCGCGTTCCATGAGCGTGGAATCATTGCTCCGTCCATAGTCATGAGTTCGTATACGCCAGGACGGACAATCTTAGAAACTTGGTACGGTCCTTCCCAATGAGCGCCGAGCTTTCCGGCCTTATACTCGGCTGTGTTCTCGTATACCTTCCTGAGGACGAGGTCGCCAACGCTGAAGCTTCGGCTCCGTACGCGCTTGTTGTAATAACGAGCAGCTATCTGTTGGTAGTTCTGTATGCGGACGAGGGCCCGACCACGTTCTTCTTCGATGTGGTCCAAATTGTCCATTAGCATCCTGTCGTTGAGGTCGGGGTCGGTTGTCATAATCTCTCTTCGTAGACTGTTGACGCTGACTTCGGCTGGGGCCATCGCTTCGATTCCGTAGGCCAAGGAGAAGGGGGTACGCTTGGTTGATTGGCGTGGTGTCGTTCGGAGCGACCATAGTACGCCATCTAGTTCATCAGCCCAGGTTCCTTTCTTTTCATCGAAACGCTTTTTCAGTTCGGATATGATAGCCTTGTTCGTCGCCTCTGCTTGTCCGTTTTCTTGCGGGAAACGCGGTGTCGACTTGTTAAGACGGATTTTCCACTTTGAGCAGAAATCTTCGAAGGTCTTGGAAATGAATTGCGACCCGTTGTCAGCGATAATTTCATAAGGCAACCCATGGCGACAGATGACGAATTTCCAGACGAAATCTTGGACATTGTCGGCCTTAATCTTTGCGAAGGATTCCGCTTCGACCCACTTTGTGAAGTAGTCGGTAACTACGATCACGTACTGCTTCTGTTTGGACCTTGGGAGTGGACCGAAAATGTCCATCGCCCATCTCATGAACGGGTAGGCAGACGTTGCGGTCGTCAGAGGTTCAGTTGGAGAGTTGATCATTGTTCCGTGACACTGGCACTTTTCGCAACGACGGGCGTAGTCTGCGCAGTCGGTGAGCATGGTCGGCCAATAGAAACCGAGCTTCTTGATTTTCATTGCGAGAGTCCGTACACCAGAGTGATTGCCACCTCCGCCTTCGTGCGTTTCGGTCAGAATGACGCTGATCGTATCGCCGTTGACACACTGAAGTAGGACTCCCGCTGCACTCCATTTATATAGCTTTCCACCCATCACTACGTAATGCGCACTCTTGGACTTTAGACGACGTGCCGCCCATTTGTCCTCTGGGACCCTTCCATCCTTGATGTAATCTGAAATTTCGTCCCGCCAATCTATCTGGTGGGCTTAGTCGGGATGGTCGGTGCGGTTGTTTTGGACGGCCTGGTCGACCTGGTCGATTCGATCGAGATCGTCGTCTGTGCCGGCAATCTCGCTGTCGTTCTTGATGACGTTCATCCGGCTGGTGCTGCAAGGTAAATCGATACTCGGGTCGGGAATGGTTTTGACTGGTATGATCCGTTTTAGGTCGAAGCCCGAACTTGTTGCCAATGAGGCCAGGTCGTCAGCGGCGAAGTTTTCAGATCGAGGGATGTCAGTGATAACGAAGTTGTCGAAGTTCGAGAGGATTAAAGCTTCGGTGAGTTTCAGGTAAGTGTTCATGCGCTCGTCTCGCGCGTCGTAGTCGTGATTTAATTGATTAGTGACGAGTCGGGAGTCGTTGTACGCGTGTACTCGTTTAACCCCGACCTCTCTAGCCAGGCGTAGCCCGGCGATGAGGGCTTCCCACTCTGCTTCGTTATTGGTAGCTTTGAACTCGAGTCGGAAACACTGTTCGAGTATTTCATTGGTCGGGGAAATCAGTCGTATCCCTGCTCCACAACCGTGTCGGGATGCCGACCCATCGATGTAAAGGCTCCAGTCTTGGCTCGTCGGTGTGATGGCGATGGCTTCCGGGGGTAGCTCGATCAAGAAATCAGCCAAGGCTTGCGACTTGGTACTCGTGCGGTTGCGATATTCGATGTCGTATTCGCTGAGCTCGACCGCCCATTTTGCCATGCGCCCTGACTGACTAGGACTGTGGAGGATTGTTCGCAGCGGCTGGGTAGACATTACAGCGATCGTATGTGACTGAAAGTAAGGGCGGAGTTTCCGAGCGGCGACCACGATAGCTAAGGCTAATTTTTCTAAGGTCGGGTATCGACTCTCCGCTCCGTTGAGCGACTTACTGACGTAGAAAATGGGTTTCTGGTCTCCTCGGTCTTCTCGAATTAGGACGCCGCTCACTGCCGCGTTTGTGACGGAGACGTACAGGTATAGTGTTCCGCCGTGCTCGGGTTTCGACAGAACAGGAGGCGATGTTAGGTATGACTTCAATTCATTGAAAGCTGCTTCGCACTTGTCATCCCAAACAAATGTTTTGTTCCCGCGGAGGAGCTGGTAGAAAGGAAGGCTACGGTCGGTGGATCAAGATATGAAGCGGTTGAGCGCCGCTATTCTGCAGGTCAGCCGCTGTACCTCTCTTTTGTTTTTCGGAGACGGTAGATCGATGATTGCGGTGATCTGCTTTGGGTTTGCTTCTATTCCCCTTTGTGTAACAATGTAACCAAGGAATTCGCCTGAGGTTACCCCGAACGTGCACTTGGTTAGGTTAAGCTTCATCCCGTACTCGTTGAGAATTTTGAAGCAGTCCCGAAGGTGTCCGACGTGGTCGGTGGCATTTTGAGACTTAACCAGCATATCGTCTATGTACACTTCCATCGTATCTCCCAGTTGGTCGGCAAACATCTTGTTCACCAGTCTTTGGTAGGTTGCTCCCGCGTTTTTCAATCCGAAAGGCATGACTCGATAGCAGAATGTTCCTCGGTCGGTTATGAAAGACGTTTTTTCGCGATCGTCGGGATGCATTGCGATCTTGTTGTATCCGGAAAAAGCATCCATGAATGATAATAGCTCATTCCCGGTCGTAGCTTCTACCACGCGGTCGATGTGGGGCAAGGAAAGCTGTCTTTTGGGCATGCTTTGTTCAAATCTGTAAAATCGATGCAGACACGCCATTTGCCGTTCTTCTTTTTAACTACGACCGGATTGGCCAGCCATTTGGGGTATTGAACTTCTGTAATTGAGCCGGCTTCGAGCAGCTTGGTGACTTCCTCGTTGACAGCGCAGGCTCTCTCGTAACCGAGCTTTCTCCGTTTTTGCTTTATAGGTTTGTAGGTGGGATCAACGTGAAGCTCGTGGCTAGTGATGGCCGGTTGATGCCCTTCATATCTTCTATCGACCACGCGAACGTCGCGACATTCTTGTTCAGAAATTTGGTCAAGTCTGTCTTGATTGATTCGGAAAGCTCGGCACCTATATTAACGCATCGCTCGGGGTGCTGCGGATCGATGTTCACCGGGGTTGCAAGTTCTTGTCTCGGCTCGGTTGCGTTCGACTCTTCTGGATTGCTTATGTGTAGGTTAAACTTCTGCAGTTTCTGCCCGGTGATGAAACAGGTTCTAGCTGCCTTTTGATCTCCTCTTATGGTGTGAACCCCAGTTGGGGTCGGGAATTTGACACATTGGTGGTAGGTGGAGGCGATTGCTCTGAGAGAAAACAACCAAGGCGTTCCCATGATAACATTGTACACCGCCGATTTGTCTACGACCAGGAACTTGACATCCCTGATCAAGCCACCAGCATATACTCTCAGCTTGATCGTTCCTACGGTCATCGTGGTGATTCCTTCGAAACCGACCAATGGTCTAATGCTCGGTTTAATCTTGCCATCTGGTATGTCCATTCGTTTGAGCGTATCTTTAAAAATGACATCCACCGCGCTCCCGGTGTCGATCAAAACACGTGTGACATTGCAATCTTCGATTTTGAGTTCAATGACTAAAGGGTCGTTGTGAGGCATCGCGAGATCCTTAGTATCAGCTTCAGAAAAAATGATCGG
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_13Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
642Start:
947663End:
948304Strand:
->Aa.chr1_LTR-Gypsy_13
TCCTCTTCAAGACGGATGTATCGCGTAGACCGATGCATCGCGTCTTTTAAGCTGGTCGGTGGGGTGAGGACGAGATTCTCCCTGAACATAGATTCATACCACAATCCTTGCTTCAGTGCTGAGATCGCGGAGTTGTCACCGACCGTAACCCTCGAGAGCACCGCTTTGAACCTGTCCATGTATCCCCGCAACGTTTCGTCCTCCTTCTGGACTAGGGACCAGAAGTTGGCGTCAGAGATTCCTTCTTCGAGGTACATGGAATAATGCTTGAGGAAGGCTTGGGACAGTTGTGGAAAGCTGTCGATTGATCGCGGACGAAGACGGGCAAACCACTCTAGAGCAGGTCCCGAGAGATGTTCGACAAAATGTTGGCAGCAACCCGCATCTTTCTCCTCTAGGGAGTAATGGGTACGTCCCATCGCTAGGTTGAACTTCCTTAAGTGTTGCATCGGGTCGGTGTCTCCGGTGTAATGCGAAATGCGGAGTTTACTGGAGTCTCTGACCGGGGTCGCCATGATGCGGTCGGTGAAGGGAGTTTGCTGCGTTTCCGCCAGCACACGTTCGATTTCTGGGGCAGAGCTGATTGCGTGGTGCACCTTCGACGTTATTTCGGTAAGCTTTGCTCGGAGATCTTCCATTTCG
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_14Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
215Start:
1170569End:
1170783Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_14
TGATATATCATGGTTTTTACCGGTTTTCGACCATGATATAAGTCCTTTTATCGAGTCTTTTCGTTGTATTTCGAGTCTTTTTAGTGTCTTAACAGGTTATTGCACGTGAGGAGCTTATATGGTGAATACGGTGCATTTTGAAACGTAAACAAGGTTGGAGCCGGATTTTGCAAGAAAAGAAGTTGATATGAAGCAGCCTGTCGATCGACAGCACC
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_15Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
373Start:
1171230End:
1171602Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_15
GAATCCGGGAATGTTTGTGGTTCCTTGTTCGATCAATGGTGTAAAATTGAAGGATTCTCTATGCGACACAGGAGCCAATGTGAATGTTATGTGTGAAGCTGTTGCAAAGAAGCTAGGAATCTTGGAGTTACAACCTTCAATGACTTATATCGAGCTCATAGATAGATCATTTACATTTTGTAAAGGCTTCATTCCTGACGTGTCAATTCAAATAGGAGATTGTCTTGTTCCTACGGACTTCTACATCATTGAGAGAAAAGATGATATCTGTAAACCATTGGTTCTTGGTGCACAGTTCCTTGCAACAGTGGGAGAAATGGTGGATTTTCCTAACAAGCGGATCTCCTTCTCGAACATCAACAAGGATGTTTTC
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_16Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
146Start:
1171929End:
1172074Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_16
CTTCAGAGATCCACCTCCAGCCTGAACATCATCCGCAGTCAAGCTAATGACTGAAAACAAGCGCTTGGTGGGAGGCAACCCACCTGTAAGTTTTTCTTTTCTTTTGAGTCATTTTTCTTTCTTTGAGTCAGTTTGTTCTTTGTTTC
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_17Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
261Start:
1172266End:
1172526Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_17
CGACGAATCTGTCGATCGACACACCTGTTGGTTGTCGATCGACAGGCCAGCAGAACAGGTCCGAATTTCATTCTTTTCACAAATTTTCTGACTTTTTCTTTCTCTTTTCACCAATCTCAGATTTAATAACACTGGGGACAGTGTTGTTTAAGTCTGGGGGAGGTAGTTACTAACATTGTTTTCTATTTTGGAGTCAAAATTTTTTTTTTATTGAGTCAAAATGTAGGGAATAATGATCTTTCTTAGGAATAAAGCTTAGTT
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_18Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
277Start:
1175143End:
1175419Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_18
GTTCTAGAACGGTTCTTAATTAAATCCTGATTTTGTTTAACCTGCAATTCTGATTCATCCTGAGAATTACTCAAAAGCCTAGCACTTTGTTTAACTGAATTTTAAATCAACAATCTTTCCTGTTACCAATTGCTTTTGTTATTTATTTTACATTATTTTACTTAGCCGAATTTGAAGTCAATATTCCTATCGTTTGATTTGACTCCCAGTGATTCGACCCCTACTACGACGACCTCTTAATTTGAGAGAGTAGCTCAGGGTAAATTTGAGCATATCA
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_19Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
306Start:
1362444End:
1362749Strand:
+>Aa.chr1_LTR-Gypsy_19
CAAACCACACTGGTTTGTATTCAAGACCGTGATTAACAATTGGGTTTGTGAAACACTTGTGCTCTTTTTCCCTCTCTTTGGTTTTGTCCTCTTTGAGTTTTCCAAGATAGGTTTTTAACGAGGCAAGTGTTGTCACATTGTCATTGCCCATATTGTAAATCCAACAAACGACCAAGCTCCATTCTCTCACGCAGCTTGGAAGTTAAAGAGTTAGTTTTCAAATTATTGCTTTAATTCTCGAGATGGTCAAGGAGCATGTTCCGAGACTAACTAACTCTCTCTTTACTCCTTTTCTTTCCATCTCTT
Arabis alpina (v4.0)
ID:
Aa.chr1_LTR-Gypsy_20Class:
RetrotransposonsOrder:
LTRSuperfamily:
LTR-GypsyLength:
302Start:
1568518End:
1568819Strand:
->Aa.chr1_LTR-Gypsy_20
AAGAGATGCAAAGAAAAGGAGTAAAGAGAGAGTTAGTTAGTCTCGGAACATGCTCCTTGACCATCTCGAGAATTAAAACAATAATTTGAAAACTAACTCTTGAACTTCCAAGCCGCGAGAATGGAGCTTGGTCGTTTGTTGGATTAACAATATGGGCAATGACAATGTGACAACACTTACCTCGTTAAAAACCTATCTTGGAAAACCCAAATAGGACAAAACCAAAGAGAGGGAAAAAGAGCACAAGTGTTTCACAAACCCAATTGTTAATCACGGTCTTGAATACAAACCAGTGTGGTTTG