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Aa.chr1_LTR-Gypsy_2 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy2899442394711+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_3 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy5179470695222+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_4 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy13669522396588+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_5 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy14119658297992+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_6 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy724437526438249+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_7 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy430438754439183+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_8 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy1387439306440692+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_9 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy812440711441522+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_10 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy127578895579021-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_11 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy264581630581893-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_12 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy3846943252947097-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_13 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy642947663948304-
Aa.chr1_LTR-Gypsy_14 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy21511705691170783+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_15 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy37311712301171602+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_16 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy14611719291172074+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_17 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy26111722661172526+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_18 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy27711751431175419+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_19 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy30613624441362749+
Aa.chr1_LTR-Gypsy_20 RetrotransposonsLTRLTR-Gypsy30215685181568819-

< 1 2 3 4 5 > Total 2847


Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_1

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

369

Start:

76100  

End:

76468

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_1

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_2

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

289

Start:

94423  

End:

94711

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_2

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_3

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

517

Start:

94706  

End:

95222

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_3

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_4

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

1366

Start:

95223  

End:

96588

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_4

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_5

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

1411

Start:

96582  

End:

97992

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_5

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_6

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

724

Start:

437526  

End:

438249

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_6

ATGAAATCACAGGTCCACCATGCGCTAAGCTCGGCGCCGGAGCTCGACCGTGTAATCGAGGACGCGCAGCGCACCCCCTTCACTGAACGGATTACGTCCGTCCAAGTTCGGGTCACAGGGAAGCTTCGCATTTCGACCTATGAAGGGAAAACCGACCCGAAACGGCACTTGACAGCATTCTCGCACGCTATGAGCCGACAACACTTAACTACTGATCAGAAGGACGCGGCGAACTGCCAAATCTTCGTCGAGTACCTGGATGGCCCAGCCCTGGAATGGTTCTCCCGTCTCGAACCAAACTCGATCGATGATTTCCTTCAACTGTCATTCGCATTCGTAAAACACTACTCATTGTATTTACACGACACCGCATCGGACTCGGACCTCTACGACCTCGAGCCTCAAGGGTCAAAAGAAACTTTAAGAAATTACATGGGTCGCTTCAAGGCGGTCCTCTCCAAAGTAAGCGTCCCAGATTCGTCAGCAATAAGCGCGCTAAAACAAGGCTTATGGCACGAGTCAGAGTTCCGAAGAGACCTCGTGCAGCATAGGGCGTACCGACTTGACGACAAATTGCACCGCACGAGTGGTTTCATTCGCGTCGAAGAGGACCAGGCAATGAACTTGAAAAGGCAATCGGCACTCAAGCCGCCAACACCTAAACCCAAGTCAGCAAAAGAACGAATCGAGGATGACTATCAAGAACCCCGACAACACTATGATC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_7

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

430

Start:

438754  

End:

439183

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_7

CCGATACGAAGGGGCTTGCTATGCCTCATAACGACCCCTTGGTAATCGAACTTAGGGTAGGGGACTACGACGTATCCCGAGTCCTCATCGATACCGGGAGCTCGGTCGATATAATCTTTAAGCAGACACTCATAAGCATGTATATCCCCGAAAACCAAATCAAGCCAAGCGTGAAGCCCCTGACTGGATTCGATGGCATCACCAAAATGACCATAGGTTCGATCAAGTTGGACGTGTACGCAGGAGGTATAACTAAGGCAGTCAAGTTCCTCATCGTGGATCGACCTGCAATATACAACGTGATTATGGGCACCCCGTGGCTGATTTCGCTTCGAGCCGTGCCATCAACTTACCATTTATGTCTGAAGTTTCCCACTCAGACCGGAGTATTCACTATACGAGGCGACCAAAAGATGGCTCGAACGTGTTT

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_8

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

1387

Start:

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End:

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Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_8

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_9

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

812

Start:

440711  

End:

441522

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_9

TTGCACCAAAAGAGGTACGTCATAGTCATCACCGACTACTTCACAAAATGGGTTGAGGCCGAGGCGTACGCAATGATTCGAGCTAACGACGTTCAGAATTTCGTTTGGAAATTCCTTATATGTCGGCACGGTTTACCATAGGAAATCGTCACGGACAACGGCTGGCAATTCATCTCCAACACATTCGAGGCCTTCTACGCGAGGTGGAGGATCAGACTCAACAAATCGACACCTCGGTACCCGCAGGGAAATGGCCAAGCCGAAGCAACTAACAAAGTAATCGTCAGCGAGCTCAAGAAGCGACTTGATGAAAAGAAGAGCCTTTGGGCCGACGAGCTCGATGGCGTCCTATGGGCATTCCGCACTACTCCGAGACAGTCAACAGATCGAACTCCTTTTTCTCTCGCCTACAGGCTCGAGGCTATGGCACCCGCCGAAGTCAACATCAATAGCCTTCGCAGGAGCACCATGCCCAGGAACCCCGAGGTCAACGAGATCACGCTCCTCGATAACCTTGACTTCGTCGAAGAGGAACGTATCCAGGCACTGCTTCGAATCCAGAATTACCAACAACGAGCCGCCCAGTACTACAATCGTAAAGTACAAGGTCGAATCTTCCGTGAAGGAGACATGGTGCTGCGAAAGGTATACGAAAACACCACGGAGTATCAAGCCGGTAAACTCGGAGCAAACTGGGAAGGTCCATATCTCATCTCAAAAGTCGTCCGACCCAGCGTGTACGAGCTAATGACACTTGAAGGCGTCGCAGTCCCACGGTCATGGAATTCGATGTCCCTCAAACGATACCATTA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_10

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

127

Start:

578895  

End:

579021

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_10

AATCCTCCCTTTCCAGAGAACCTTGTCCTCAAGGTTTGAAGCTTGCAAAACCCCATAAAAGCATAGAAGAACTCCTACGTATCTTCATCCAGAAGAACCTTAGTCATCGTAACAAGCACCATTGTAA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_11

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

264

Start:

581630  

End:

581893

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_11

CAAGCCACTGGTTCCTGAGTTTCACAAGTCTTCTTCGGATAAATTCCTTCATATAACTTGCCGAATATCAAACATTCTCTAATTGTTTGTGGCCGAAACATCCTCACGTTCATTTGTGTATCACTTCTCAACCCTGTCAAGTATACACCAACCAAATACTCATCTGACAAACTCAATCTTGTGCTAATCAACTCAAACCTTTTATGATAATCCTCAATTCCATCAGTTTCTTGCAATTGCTTCAACTCACCTATTGGATCTGCA

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_12

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

3846

Start:

943252  

End:

947097

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_12

TTGTAGTAGTACCGTTTCAGGGACATCGCGTTCCATGAGCGTGGAATCATTGCTCCGTCCATAGTCATGAGTTCGTATACGCCAGGACGGACAATCTTAGAAACTTGGTACGGTCCTTCCCAATGAGCGCCGAGCTTTCCGGCCTTATACTCGGCTGTGTTCTCGTATACCTTCCTGAGGACGAGGTCGCCAACGCTGAAGCTTCGGCTCCGTACGCGCTTGTTGTAATAACGAGCAGCTATCTGTTGGTAGTTCTGTATGCGGACGAGGGCCCGACCACGTTCTTCTTCGATGTGGTCCAAATTGTCCATTAGCATCCTGTCGTTGAGGTCGGGGTCGGTTGTCATAATCTCTCTTCGTAGACTGTTGACGCTGACTTCGGCTGGGGCCATCGCTTCGATTCCGTAGGCCAAGGAGAAGGGGGTACGCTTGGTTGATTGGCGTGGTGTCGTTCGGAGCGACCATAGTACGCCATCTAGTTCATCAGCCCAGGTTCCTTTCTTTTCATCGAAACGCTTTTTCAGTTCGGATATGATAGCCTTGTTCGTCGCCTCTGCTTGTCCGTTTTCTTGCGGGAAACGCGGTGTCGACTTGTTAAGACGGATTTTCCACTTTGAGCAGAAATCTTCGAAGGTCTTGGAAATGAATTGCGACCCGTTGTCAGCGATAATTTCATAAGGCAACCCATGGCGACAGATGACGAATTTCCAGACGAAATCTTGGACATTGTCGGCCTTAATCTTTGCGAAGGATTCCGCTTCGACCCACTTTGTGAAGTAGTCGGTAACTACGATCACGTACTGCTTCTGTTTGGACCTTGGGAGTGGACCGAAAATGTCCATCGCCCATCTCATGAACGGGTAGGCAGACGTTGCGGTCGTCAGAGGTTCAGTTGGAGAGTTGATCATTGTTCCGTGACACTGGCACTTTTCGCAACGACGGGCGTAGTCTGCGCAGTCGGTGAGCATGGTCGGCCAATAGAAACCGAGCTTCTTGATTTTCATTGCGAGAGTCCGTACACCAGAGTGATTGCCACCTCCGCCTTCGTGCGTTTCGGTCAGAATGACGCTGATCGTATCGCCGTTGACACACTGAAGTAGGACTCCCGCTGCACTCCATTTATATAGCTTTCCACCCATCACTACGTAATGCGCACTCTTGGACTTTAGACGACGTGCCGCCCATTTGTCCTCTGGGACCCTTCCATCCTTGATGTAATCTGAAATTTCGTCCCGCCAATCTATCTGGTGGGCTTAGTCGGGATGGTCGGTGCGGTTGTTTTGGACGGCCTGGTCGACCTGGTCGATTCGATCGAGATCGTCGTCTGTGCCGGCAATCTCGCTGTCGTTCTTGATGACGTTCATCCGGCTGGTGCTGCAAGGTAAATCGATACTCGGGTCGGGAATGGTTTTGACTGGTATGATCCGTTTTAGGTCGAAGCCCGAACTTGTTGCCAATGAGGCCAGGTCGTCAGCGGCGAAGTTTTCAGATCGAGGGATGTCAGTGATAACGAAGTTGTCGAAGTTCGAGAGGATTAAAGCTTCGGTGAGTTTCAGGTAAGTGTTCATGCGCTCGTCTCGCGCGTCGTAGTCGTGATTTAATTGATTAGTGACGAGTCGGGAGTCGTTGTACGCGTGTACTCGTTTAACCCCGACCTCTCTAGCCAGGCGTAGCCCGGCGATGAGGGCTTCCCACTCTGCTTCGTTATTGGTAGCTTTGAACTCGAGTCGGAAACACTGTTCGAGTATTTCATTGGTCGGGGAAATCAGTCGTATCCCTGCTCCACAACCGTGTCGGGATGCCGACCCATCGATGTAAAGGCTCCAGTCTTGGCTCGTCGGTGTGATGGCGATGGCTTCCGGGGGTAGCTCGATCAAGAAATCAGCCAAGGCTTGCGACTTGGTACTCGTGCGGTTGCGATATTCGATGTCGTATTCGCTGAGCTCGACCGCCCATTTTGCCATGCGCCCTGACTGACTAGGACTGTGGAGGATTGTTCGCAGCGGCTGGGTAGACATTACAGCGATCGTATGTGACTGAAAGTAAGGGCGGAGTTTCCGAGCGGCGACCACGATAGCTAAGGCTAATTTTTCTAAGGTCGGGTATCGACTCTCCGCTCCGTTGAGCGACTTACTGACGTAGAAAATGGGTTTCTGGTCTCCTCGGTCTTCTCGAATTAGGACGCCGCTCACTGCCGCGTTTGTGACGGAGACGTACAGGTATAGTGTTCCGCCGTGCTCGGGTTTCGACAGAACAGGAGGCGATGTTAGGTATGACTTCAATTCATTGAAAGCTGCTTCGCACTTGTCATCCCAAACAAATGTTTTGTTCCCGCGGAGGAGCTGGTAGAAAGGAAGGCTACGGTCGGTGGATCAAGATATGAAGCGGTTGAGCGCCGCTATTCTGCAGGTCAGCCGCTGTACCTCTCTTTTGTTTTTCGGAGACGGTAGATCGATGATTGCGGTGATCTGCTTTGGGTTTGCTTCTATTCCCCTTTGTGTAACAATGTAACCAAGGAATTCGCCTGAGGTTACCCCGAACGTGCACTTGGTTAGGTTAAGCTTCATCCCGTACTCGTTGAGAATTTTGAAGCAGTCCCGAAGGTGTCCGACGTGGTCGGTGGCATTTTGAGACTTAACCAGCATATCGTCTATGTACACTTCCATCGTATCTCCCAGTTGGTCGGCAAACATCTTGTTCACCAGTCTTTGGTAGGTTGCTCCCGCGTTTTTCAATCCGAAAGGCATGACTCGATAGCAGAATGTTCCTCGGTCGGTTATGAAAGACGTTTTTTCGCGATCGTCGGGATGCATTGCGATCTTGTTGTATCCGGAAAAAGCATCCATGAATGATAATAGCTCATTCCCGGTCGTAGCTTCTACCACGCGGTCGATGTGGGGCAAGGAAAGCTGTCTTTTGGGCATGCTTTGTTCAAATCTGTAAAATCGATGCAGACACGCCATTTGCCGTTCTTCTTTTTAACTACGACCGGATTGGCCAGCCATTTGGGGTATTGAACTTCTGTAATTGAGCCGGCTTCGAGCAGCTTGGTGACTTCCTCGTTGACAGCGCAGGCTCTCTCGTAACCGAGCTTTCTCCGTTTTTGCTTTATAGGTTTGTAGGTGGGATCAACGTGAAGCTCGTGGCTAGTGATGGCCGGTTGATGCCCTTCATATCTTCTATCGACCACGCGAACGTCGCGACATTCTTGTTCAGAAATTTGGTCAAGTCTGTCTTGATTGATTCGGAAAGCTCGGCACCTATATTAACGCATCGCTCGGGGTGCTGCGGATCGATGTTCACCGGGGTTGCAAGTTCTTGTCTCGGCTCGGTTGCGTTCGACTCTTCTGGATTGCTTATGTGTAGGTTAAACTTCTGCAGTTTCTGCCCGGTGATGAAACAGGTTCTAGCTGCCTTTTGATCTCCTCTTATGGTGTGAACCCCAGTTGGGGTCGGGAATTTGACACATTGGTGGTAGGTGGAGGCGATTGCTCTGAGAGAAAACAACCAAGGCGTTCCCATGATAACATTGTACACCGCCGATTTGTCTACGACCAGGAACTTGACATCCCTGATCAAGCCACCAGCATATACTCTCAGCTTGATCGTTCCTACGGTCATCGTGGTGATTCCTTCGAAACCGACCAATGGTCTAATGCTCGGTTTAATCTTGCCATCTGGTATGTCCATTCGTTTGAGCGTATCTTTAAAAATGACATCCACCGCGCTCCCGGTGTCGATCAAAACACGTGTGACATTGCAATCTTCGATTTTGAGTTCAATGACTAAAGGGTCGTTGTGAGGCATCGCGAGATCCTTAGTATCAGCTTCAGAAAAAATGATCGG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_13

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

642

Start:

947663  

End:

948304

Strand:

-

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_13

TCCTCTTCAAGACGGATGTATCGCGTAGACCGATGCATCGCGTCTTTTAAGCTGGTCGGTGGGGTGAGGACGAGATTCTCCCTGAACATAGATTCATACCACAATCCTTGCTTCAGTGCTGAGATCGCGGAGTTGTCACCGACCGTAACCCTCGAGAGCACCGCTTTGAACCTGTCCATGTATCCCCGCAACGTTTCGTCCTCCTTCTGGACTAGGGACCAGAAGTTGGCGTCAGAGATTCCTTCTTCGAGGTACATGGAATAATGCTTGAGGAAGGCTTGGGACAGTTGTGGAAAGCTGTCGATTGATCGCGGACGAAGACGGGCAAACCACTCTAGAGCAGGTCCCGAGAGATGTTCGACAAAATGTTGGCAGCAACCCGCATCTTTCTCCTCTAGGGAGTAATGGGTACGTCCCATCGCTAGGTTGAACTTCCTTAAGTGTTGCATCGGGTCGGTGTCTCCGGTGTAATGCGAAATGCGGAGTTTACTGGAGTCTCTGACCGGGGTCGCCATGATGCGGTCGGTGAAGGGAGTTTGCTGCGTTTCCGCCAGCACACGTTCGATTTCTGGGGCAGAGCTGATTGCGTGGTGCACCTTCGACGTTATTTCGGTAAGCTTTGCTCGGAGATCTTCCATTTCG

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_14

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

215

Start:

1170569  

End:

1170783

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_14

TGATATATCATGGTTTTTACCGGTTTTCGACCATGATATAAGTCCTTTTATCGAGTCTTTTCGTTGTATTTCGAGTCTTTTTAGTGTCTTAACAGGTTATTGCACGTGAGGAGCTTATATGGTGAATACGGTGCATTTTGAAACGTAAACAAGGTTGGAGCCGGATTTTGCAAGAAAAGAAGTTGATATGAAGCAGCCTGTCGATCGACAGCACC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_15

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

373

Start:

1171230  

End:

1171602

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_15

GAATCCGGGAATGTTTGTGGTTCCTTGTTCGATCAATGGTGTAAAATTGAAGGATTCTCTATGCGACACAGGAGCCAATGTGAATGTTATGTGTGAAGCTGTTGCAAAGAAGCTAGGAATCTTGGAGTTACAACCTTCAATGACTTATATCGAGCTCATAGATAGATCATTTACATTTTGTAAAGGCTTCATTCCTGACGTGTCAATTCAAATAGGAGATTGTCTTGTTCCTACGGACTTCTACATCATTGAGAGAAAAGATGATATCTGTAAACCATTGGTTCTTGGTGCACAGTTCCTTGCAACAGTGGGAGAAATGGTGGATTTTCCTAACAAGCGGATCTCCTTCTCGAACATCAACAAGGATGTTTTC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_16

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

146

Start:

1171929  

End:

1172074

Strand:

+

>Aa.chr1_LTR-Gypsy_16

CTTCAGAGATCCACCTCCAGCCTGAACATCATCCGCAGTCAAGCTAATGACTGAAAACAAGCGCTTGGTGGGAGGCAACCCACCTGTAAGTTTTTCTTTTCTTTTGAGTCATTTTTCTTTCTTTGAGTCAGTTTGTTCTTTGTTTC

Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_17

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

261

Start:

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_18

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

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277

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>Aa.chr1_LTR-Gypsy_18

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_19

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

306

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>Aa.chr1_LTR-Gypsy_19

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Arabis alpina (v4.0)

ID:

Aa.chr1_LTR-Gypsy_20

Class:

Retrotransposons

Order:

LTR

Superfamily:

LTR-Gypsy

Length:

302

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>Aa.chr1_LTR-Gypsy_20

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